FuNGI

C6HNA8

Protein Details

Accession

C6HNA8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
150-191	IAEDDKKSGKKKKKQKGEQAPIFLSRRQQRKSQRMYPRPLMS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
155-168	KKSGKKKKKQKGEQ

Subcellular Location(s)

mito 14, nucl 9.5, cyto_nucl 7, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR044764 DDX52/Rok1_DEADc IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0030490 P:maturation of SSU-rRNA
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1
CDD	cd17957 DEADc_DDX52

Amino Acid Sequences

MDAFKLLTRSTKLKTGQVSRPAISNSLPSAGAAANPQLFSGRHKPDAAEAYNEQNGIKGGKRKRGSDGNELSADASAITLDFFGSGSSAHDFSNGQAKTGTQNQNEDDGKKTSVSDEIAISESPLSIEERKAVLTAHKIKVTDLRTPPVIAEDDKKSGKKKKKQKGEQAPIFLSRRQQRKSQRMYPRPLMSFQQLRTRYRISRRLSENILNQGYAVPTEVQLGALPLLLGDCQSSSARSQEDGFQLSQSTLEPDLLVVAPTGSGKTLAFMIPLINKIICHHHLGESQSRELFAVILAPTKELVSQIVNEGRKLMVGTGVKITAVRKGMRVVEDMEMEEAFLDEESGISEDEDDEAAKAKRLGGKVPVTKSDILVSTPLLLANSLSGNKSRSIAPLPTIQSLVLDEADVLLDSLFRDQTLGVWRACTNARLRVGLWSATMGSSIEELAKSTINERRRSLGLRDESFLVRLVVGLKDTAIPNISHKLVYAATEQGKLLGLRQLLNPKGASSTSDTHLRAPFLVFTQTISRAVALHSELKYDIPAEAGAV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.57
3	0.61
4	0.64
5	0.67
6	0.59
7	0.6
8	0.55
9	0.49
10	0.41
11	0.37
12	0.29
13	0.25
14	0.24
15	0.19
16	0.19
17	0.17
18	0.16
19	0.14
20	0.15
21	0.15
22	0.15
23	0.15
24	0.16
25	0.16
26	0.22
27	0.3
28	0.33
29	0.35
30	0.37
31	0.38
32	0.42
33	0.49
34	0.44
35	0.41
36	0.37
37	0.38
38	0.38
39	0.38
40	0.31
41	0.24
42	0.23
43	0.2
44	0.23
45	0.26
46	0.31
47	0.41
48	0.46
49	0.49
50	0.56
51	0.63
52	0.64
53	0.67
54	0.66
55	0.62
56	0.58
57	0.54
58	0.47
59	0.37
60	0.3
61	0.19
62	0.12
63	0.06
64	0.05
65	0.05
66	0.04
67	0.04
68	0.04
69	0.04
70	0.04
71	0.04
72	0.04
73	0.06
74	0.09
75	0.1
76	0.09
77	0.11
78	0.11
79	0.12
80	0.21
81	0.19
82	0.17
83	0.17
84	0.18
85	0.21
86	0.3
87	0.37
88	0.31
89	0.36
90	0.37
91	0.44
92	0.46
93	0.43
94	0.37
95	0.32
96	0.31
97	0.27
98	0.26
99	0.19
100	0.2
101	0.19
102	0.17
103	0.15
104	0.15
105	0.16
106	0.15
107	0.14
108	0.11
109	0.1
110	0.08
111	0.08
112	0.09
113	0.1
114	0.11
115	0.13
116	0.13
117	0.14
118	0.14
119	0.14
120	0.15
121	0.22
122	0.3
123	0.32
124	0.34
125	0.33
126	0.34
127	0.41
128	0.41
129	0.4
130	0.36
131	0.35
132	0.34
133	0.34
134	0.33
135	0.29
136	0.27
137	0.2
138	0.21
139	0.21
140	0.24
141	0.28
142	0.31
143	0.36
144	0.44
145	0.52
146	0.58
147	0.65
148	0.7
149	0.78
150	0.85
151	0.89
152	0.91
153	0.92
154	0.89
155	0.85
156	0.77
157	0.72
158	0.63
159	0.54
160	0.5
161	0.46
162	0.47
163	0.44
164	0.5
165	0.54
166	0.63
167	0.7
168	0.73
169	0.76
170	0.77
171	0.82
172	0.82
173	0.78
174	0.7
175	0.63
176	0.56
177	0.51
178	0.47
179	0.41
180	0.43
181	0.41
182	0.41
183	0.43
184	0.45
185	0.46
186	0.49
187	0.55
188	0.51
189	0.55
190	0.58
191	0.58
192	0.58
193	0.57
194	0.52
195	0.5
196	0.45
197	0.37
198	0.31
199	0.26
200	0.22
201	0.16
202	0.13
203	0.06
204	0.06
205	0.07
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.05
211	0.05
212	0.04
213	0.03
214	0.03
215	0.03
216	0.03
217	0.03
218	0.03
219	0.05
220	0.05
221	0.06
222	0.07
223	0.09
224	0.1
225	0.1
226	0.11
227	0.13
228	0.15
229	0.16
230	0.16
231	0.14
232	0.14
233	0.13
234	0.13
235	0.09
236	0.09
237	0.07
238	0.07
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.06
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.03
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.06
258	0.07
259	0.07
260	0.08
261	0.07
262	0.07
263	0.08
264	0.12
265	0.13
266	0.14
267	0.14
268	0.16
269	0.18
270	0.21
271	0.25
272	0.23
273	0.23
274	0.2
275	0.2
276	0.18
277	0.15
278	0.12
279	0.07
280	0.07
281	0.06
282	0.07
283	0.07
284	0.07
285	0.07
286	0.08
287	0.08
288	0.06
289	0.07
290	0.06
291	0.07
292	0.09
293	0.14
294	0.14
295	0.14
296	0.14
297	0.13
298	0.13
299	0.12
300	0.1
301	0.1
302	0.1
303	0.11
304	0.11
305	0.11
306	0.11
307	0.12
308	0.12
309	0.11
310	0.14
311	0.14
312	0.14
313	0.17
314	0.19
315	0.19
316	0.21
317	0.19
318	0.17
319	0.17
320	0.16
321	0.14
322	0.12
323	0.1
324	0.08
325	0.06
326	0.05
327	0.04
328	0.04
329	0.03
330	0.03
331	0.03
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.04
341	0.07
342	0.08
343	0.09
344	0.09
345	0.11
346	0.15
347	0.16
348	0.19
349	0.22
350	0.3
351	0.35
352	0.37
353	0.39
354	0.38
355	0.38
356	0.36
357	0.31
358	0.24
359	0.19
360	0.17
361	0.14
362	0.11
363	0.1
364	0.1
365	0.08
366	0.07
367	0.06
368	0.06
369	0.07
370	0.07
371	0.08
372	0.1
373	0.11
374	0.12
375	0.14
376	0.14
377	0.16
378	0.19
379	0.2
380	0.2
381	0.25
382	0.27
383	0.27
384	0.26
385	0.23
386	0.2
387	0.19
388	0.17
389	0.11
390	0.08
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.05
395	0.05
396	0.03
397	0.04
398	0.04
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.06
403	0.06
404	0.09
405	0.15
406	0.18
407	0.17
408	0.19
409	0.19
410	0.22
411	0.23
412	0.25
413	0.22
414	0.26
415	0.28
416	0.28
417	0.28
418	0.3
419	0.32
420	0.28
421	0.25
422	0.18
423	0.17
424	0.15
425	0.15
426	0.1
427	0.08
428	0.07
429	0.07
430	0.07
431	0.07
432	0.08
433	0.08
434	0.1
435	0.1
436	0.14
437	0.2
438	0.26
439	0.32
440	0.34
441	0.37
442	0.4
443	0.44
444	0.44
445	0.47
446	0.48
447	0.46
448	0.46
449	0.44
450	0.41
451	0.37
452	0.34
453	0.24
454	0.16
455	0.14
456	0.13
457	0.11
458	0.11
459	0.1
460	0.09
461	0.12
462	0.12
463	0.13
464	0.13
465	0.13
466	0.16
467	0.21
468	0.22
469	0.19
470	0.18
471	0.2
472	0.18
473	0.2
474	0.19
475	0.2
476	0.21
477	0.23
478	0.23
479	0.21
480	0.22
481	0.2
482	0.19
483	0.18
484	0.17
485	0.18
486	0.23
487	0.3
488	0.3
489	0.34
490	0.32
491	0.29
492	0.3
493	0.28
494	0.26
495	0.23
496	0.25
497	0.26
498	0.32
499	0.33
500	0.35
501	0.38
502	0.36
503	0.32
504	0.3
505	0.28
506	0.23
507	0.25
508	0.2
509	0.2
510	0.23
511	0.24
512	0.24
513	0.22
514	0.21
515	0.18
516	0.19
517	0.19
518	0.18
519	0.22
520	0.21
521	0.22
522	0.23
523	0.23
524	0.23
525	0.21
526	0.17
527	0.12

C6HNA8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer