Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6H3K2

Protein Details
Accession C6H3K2    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-25SGSKALHSKKRSHNVIEKRYRANHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 4, cyto 3, plas 2, pero 2, E.R. 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
IPR019006  Sre1_C  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0032933  P:SREBP signaling pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF09427  DUF2014  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
Amino Acid Sequences MLSGSKALHSKKRSHNVIEKRYRANLNDKIAELRDSVPSLRALAKQKNGISGQGIGDDDEIVSSSNKLNKASILAKATEYIRHLEQRNKRLEEENVGLKNRLRQLDKVQEQNLTNFTNASGSASTAGAYTSSPESRQGSSPDVFSQAEDIFPESSPNSFHPPEGLIKVPEYFKRMRATGPQQHYAESLNQPSNTNTNYASSGGRRMTLPNKFMLGTLATLMIVGGFENQSKSESSKKGLLGIPLQFPGDISRFVQMYFGGLTATSWQIRALSHFALTSVVVVGAACAVFAYLFNSAPRRAKHPTKSPAGSRSTAGVSPIEFRQEAWLTSIQTVWVPRHTFFPEWFAVTWRCLEYVLSCLLGSKLYSWLTGITEDDEKARAKAWDIAIDAQLTGGDPEPSIAALYFGEWVLQARGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.8
3 0.82
4 0.86
5 0.87
6 0.84
7 0.8
8 0.79
9 0.76
10 0.71
11 0.7
12 0.67
13 0.65
14 0.61
15 0.56
16 0.53
17 0.48
18 0.45
19 0.37
20 0.3
21 0.26
22 0.24
23 0.23
24 0.21
25 0.2
26 0.21
27 0.23
28 0.27
29 0.31
30 0.37
31 0.42
32 0.47
33 0.48
34 0.53
35 0.5
36 0.46
37 0.41
38 0.36
39 0.3
40 0.25
41 0.24
42 0.17
43 0.16
44 0.14
45 0.11
46 0.08
47 0.08
48 0.06
49 0.07
50 0.08
51 0.11
52 0.15
53 0.18
54 0.19
55 0.2
56 0.2
57 0.25
58 0.27
59 0.29
60 0.27
61 0.26
62 0.26
63 0.28
64 0.28
65 0.26
66 0.24
67 0.23
68 0.23
69 0.28
70 0.32
71 0.39
72 0.46
73 0.52
74 0.6
75 0.6
76 0.59
77 0.57
78 0.56
79 0.53
80 0.49
81 0.47
82 0.43
83 0.41
84 0.4
85 0.36
86 0.39
87 0.38
88 0.4
89 0.35
90 0.35
91 0.42
92 0.51
93 0.55
94 0.56
95 0.52
96 0.52
97 0.5
98 0.48
99 0.43
100 0.33
101 0.28
102 0.21
103 0.19
104 0.15
105 0.13
106 0.12
107 0.09
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.08
113 0.08
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.14
121 0.16
122 0.18
123 0.2
124 0.21
125 0.23
126 0.23
127 0.24
128 0.22
129 0.23
130 0.21
131 0.18
132 0.18
133 0.13
134 0.13
135 0.11
136 0.12
137 0.09
138 0.09
139 0.1
140 0.08
141 0.09
142 0.1
143 0.12
144 0.16
145 0.16
146 0.16
147 0.16
148 0.17
149 0.19
150 0.2
151 0.19
152 0.15
153 0.15
154 0.17
155 0.18
156 0.18
157 0.2
158 0.19
159 0.22
160 0.25
161 0.25
162 0.25
163 0.3
164 0.37
165 0.41
166 0.45
167 0.47
168 0.44
169 0.44
170 0.43
171 0.37
172 0.31
173 0.25
174 0.23
175 0.19
176 0.19
177 0.19
178 0.19
179 0.2
180 0.18
181 0.17
182 0.14
183 0.13
184 0.13
185 0.14
186 0.14
187 0.12
188 0.15
189 0.14
190 0.14
191 0.13
192 0.15
193 0.2
194 0.23
195 0.24
196 0.21
197 0.22
198 0.22
199 0.21
200 0.19
201 0.13
202 0.09
203 0.08
204 0.07
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.04
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.06
217 0.07
218 0.09
219 0.15
220 0.17
221 0.19
222 0.23
223 0.23
224 0.27
225 0.28
226 0.28
227 0.26
228 0.26
229 0.25
230 0.21
231 0.21
232 0.16
233 0.14
234 0.14
235 0.12
236 0.1
237 0.1
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.07
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.08
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.11
257 0.13
258 0.12
259 0.12
260 0.12
261 0.12
262 0.12
263 0.11
264 0.09
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.04
278 0.05
279 0.06
280 0.08
281 0.11
282 0.14
283 0.2
284 0.21
285 0.26
286 0.33
287 0.42
288 0.49
289 0.57
290 0.62
291 0.66
292 0.7
293 0.7
294 0.7
295 0.66
296 0.59
297 0.49
298 0.44
299 0.37
300 0.32
301 0.27
302 0.2
303 0.16
304 0.17
305 0.17
306 0.17
307 0.15
308 0.15
309 0.19
310 0.2
311 0.19
312 0.2
313 0.22
314 0.2
315 0.21
316 0.21
317 0.15
318 0.16
319 0.18
320 0.17
321 0.2
322 0.21
323 0.21
324 0.27
325 0.3
326 0.31
327 0.29
328 0.33
329 0.28
330 0.28
331 0.28
332 0.28
333 0.26
334 0.25
335 0.26
336 0.21
337 0.19
338 0.17
339 0.18
340 0.14
341 0.16
342 0.15
343 0.14
344 0.12
345 0.13
346 0.13
347 0.13
348 0.12
349 0.1
350 0.13
351 0.13
352 0.13
353 0.13
354 0.14
355 0.15
356 0.15
357 0.15
358 0.14
359 0.15
360 0.15
361 0.16
362 0.18
363 0.18
364 0.18
365 0.19
366 0.17
367 0.18
368 0.24
369 0.25
370 0.27
371 0.28
372 0.3
373 0.29
374 0.29
375 0.26
376 0.19
377 0.17
378 0.12
379 0.11
380 0.09
381 0.08
382 0.07
383 0.08
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.08
388 0.08
389 0.07
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.09