FuNGI

A0A1W2TD52

Protein Details

Accession

A0A1W2TD52

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
92-113	PGFPHKPLATRRSRRRGGGKAT	Basic
400-440	GPADQDRKASRQRRRRQRQQQRRRRRRRRRHDRRGDDAKGG	Basic
494-521	LYLPSRLTERLRRRRRRHKDEEEETEVA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
97-118	KPLATRRSRRRGGGKATPSRRP
406-438	RKASRQRRRRQRQQQRRRRRRRRRHDRRGDDAK
503-512	RLRRRRRRHK
533-559	RRLRARARGPGDRVALARRGEERARAR

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 10, mito 8, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007224 TIF_Rrn11
Gene Ontology	GO:0001164 F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding GO:0001181 F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity
Pfam	View protein in Pfam PF04090 RNA_pol_I_TF

Amino Acid Sequences

MGPFALSVPGYRVGVHSHSHKRRHPDATQDDGESRSPSPYADADSDSETRFSSSSRLPSGTINPLSHSPDTLRQLAVAGLSPEDELPSQVHPGFPHKPLATRRSRRRGGGKATPSRRPAAHHDSGDSGTETDATTTSRRNGRAEDVKGGRHSARMRHLNTMTAIMHRCLHDGDIARAKRALGLLMQTRDVDVRIDNLWAVGLEILMRDGETEGVLPEPKQSSSSTSRAHEKARARSHGSYDSGTDDDSIGKNVGEKEGEEGEEEEEEAGGTQRIPQPPDRWGSTANMPQVKAYLETLVQQHPYDAHRPHLTSAMDFWPALLSIEVYNLDAEFRAALHQIYTEHGFPSSPSSSSSPSSSSSSSSSSLSPSPSQEYDSEDDDDGGGDADRMDLDDDDDGGYGPADQDRKASRQRRRRQRQQQRRRRRRRRRHDRRGDDAKGGADRHGAADALRAETQRGALAIAARADAVLETAPYNAHAELLRLRAHVSLFVADLYLPSRLTERLRRRRRRHKDEEEETEVAVSSSYSPREADRRLRARARGPGDRVALARRGEERARARAFFARAVAAKGAVVEEWVLRFLEDGDGDEDEDEGRGREDGL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.25
3	0.31
4	0.39
5	0.48
6	0.57
7	0.62
8	0.67
9	0.73
10	0.78
11	0.75
12	0.75
13	0.74
14	0.74
15	0.7
16	0.64
17	0.58
18	0.51
19	0.47
20	0.38
21	0.31
22	0.24
23	0.21
24	0.18
25	0.19
26	0.18
27	0.21
28	0.21
29	0.22
30	0.22
31	0.26
32	0.28
33	0.25
34	0.25
35	0.21
36	0.19
37	0.18
38	0.16
39	0.17
40	0.2
41	0.25
42	0.29
43	0.3
44	0.3
45	0.33
46	0.38
47	0.42
48	0.41
49	0.36
50	0.34
51	0.36
52	0.4
53	0.37
54	0.34
55	0.29
56	0.31
57	0.35
58	0.34
59	0.31
60	0.26
61	0.26
62	0.24
63	0.22
64	0.16
65	0.12
66	0.09
67	0.09
68	0.1
69	0.09
70	0.1
71	0.09
72	0.09
73	0.1
74	0.11
75	0.14
76	0.14
77	0.16
78	0.16
79	0.23
80	0.27
81	0.27
82	0.34
83	0.32
84	0.39
85	0.45
86	0.52
87	0.57
88	0.63
89	0.71
90	0.74
91	0.79
92	0.8
93	0.82
94	0.82
95	0.8
96	0.79
97	0.79
98	0.79
99	0.79
100	0.78
101	0.73
102	0.68
103	0.61
104	0.56
105	0.54
106	0.53
107	0.53
108	0.47
109	0.45
110	0.44
111	0.43
112	0.39
113	0.31
114	0.22
115	0.15
116	0.14
117	0.12
118	0.09
119	0.09
120	0.09
121	0.1
122	0.13
123	0.18
124	0.23
125	0.26
126	0.28
127	0.31
128	0.37
129	0.44
130	0.44
131	0.48
132	0.45
133	0.46
134	0.45
135	0.45
136	0.38
137	0.35
138	0.36
139	0.33
140	0.39
141	0.44
142	0.45
143	0.5
144	0.5
145	0.47
146	0.44
147	0.42
148	0.33
149	0.29
150	0.28
151	0.21
152	0.22
153	0.2
154	0.2
155	0.17
156	0.17
157	0.16
158	0.17
159	0.2
160	0.26
161	0.26
162	0.26
163	0.26
164	0.25
165	0.23
166	0.22
167	0.18
168	0.1
169	0.14
170	0.18
171	0.19
172	0.2
173	0.18
174	0.18
175	0.18
176	0.17
177	0.13
178	0.09
179	0.09
180	0.09
181	0.1
182	0.09
183	0.08
184	0.08
185	0.07
186	0.07
187	0.05
188	0.04
189	0.03
190	0.03
191	0.04
192	0.04
193	0.03
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.05
201	0.06
202	0.06
203	0.08
204	0.09
205	0.1
206	0.11
207	0.12
208	0.16
209	0.22
210	0.27
211	0.29
212	0.3
213	0.37
214	0.38
215	0.4
216	0.42
217	0.43
218	0.47
219	0.5
220	0.53
221	0.51
222	0.51
223	0.52
224	0.49
225	0.45
226	0.36
227	0.3
228	0.27
229	0.22
230	0.19
231	0.15
232	0.11
233	0.1
234	0.1
235	0.09
236	0.08
237	0.07
238	0.09
239	0.09
240	0.1
241	0.09
242	0.08
243	0.1
244	0.1
245	0.11
246	0.09
247	0.09
248	0.09
249	0.09
250	0.08
251	0.06
252	0.05
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.06
259	0.1
260	0.13
261	0.15
262	0.18
263	0.2
264	0.24
265	0.28
266	0.27
267	0.24
268	0.24
269	0.24
270	0.25
271	0.27
272	0.27
273	0.26
274	0.24
275	0.22
276	0.22
277	0.2
278	0.16
279	0.13
280	0.09
281	0.07
282	0.09
283	0.11
284	0.11
285	0.12
286	0.11
287	0.11
288	0.11
289	0.13
290	0.17
291	0.16
292	0.18
293	0.2
294	0.2
295	0.21
296	0.24
297	0.22
298	0.17
299	0.18
300	0.16
301	0.15
302	0.14
303	0.13
304	0.09
305	0.08
306	0.08
307	0.06
308	0.05
309	0.04
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.06
326	0.08
327	0.09
328	0.09
329	0.09
330	0.09
331	0.09
332	0.09
333	0.13
334	0.12
335	0.11
336	0.13
337	0.15
338	0.17
339	0.18
340	0.19
341	0.16
342	0.17
343	0.19
344	0.18
345	0.18
346	0.17
347	0.18
348	0.18
349	0.17
350	0.16
351	0.15
352	0.16
353	0.17
354	0.16
355	0.16
356	0.18
357	0.17
358	0.19
359	0.18
360	0.2
361	0.2
362	0.21
363	0.21
364	0.18
365	0.17
366	0.15
367	0.14
368	0.1
369	0.08
370	0.06
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.05
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.06
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.04
387	0.04
388	0.07
389	0.08
390	0.08
391	0.12
392	0.15
393	0.2
394	0.3
395	0.39
396	0.46
397	0.56
398	0.67
399	0.74
400	0.83
401	0.88
402	0.9
403	0.93
404	0.95
405	0.95
406	0.96
407	0.96
408	0.97
409	0.97
410	0.97
411	0.97
412	0.97
413	0.97
414	0.98
415	0.98
416	0.98
417	0.97
418	0.95
419	0.94
420	0.93
421	0.85
422	0.77
423	0.68
424	0.59
425	0.51
426	0.42
427	0.32
428	0.23
429	0.19
430	0.16
431	0.15
432	0.12
433	0.09
434	0.12
435	0.12
436	0.13
437	0.14
438	0.13
439	0.14
440	0.14
441	0.15
442	0.12
443	0.11
444	0.09
445	0.08
446	0.1
447	0.1
448	0.1
449	0.09
450	0.08
451	0.08
452	0.08
453	0.07
454	0.06
455	0.04
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.06
460	0.07
461	0.08
462	0.08
463	0.09
464	0.09
465	0.1
466	0.13
467	0.16
468	0.17
469	0.16
470	0.17
471	0.17
472	0.17
473	0.17
474	0.15
475	0.13
476	0.12
477	0.11
478	0.11
479	0.09
480	0.09
481	0.09
482	0.09
483	0.08
484	0.08
485	0.1
486	0.13
487	0.19
488	0.28
489	0.38
490	0.48
491	0.6
492	0.7
493	0.8
494	0.88
495	0.94
496	0.95
497	0.95
498	0.95
499	0.95
500	0.93
501	0.91
502	0.87
503	0.77
504	0.66
505	0.55
506	0.44
507	0.32
508	0.23
509	0.14
510	0.09
511	0.11
512	0.12
513	0.13
514	0.14
515	0.17
516	0.24
517	0.31
518	0.38
519	0.45
520	0.52
521	0.6
522	0.66
523	0.69
524	0.7
525	0.72
526	0.71
527	0.69
528	0.66
529	0.64
530	0.6
531	0.56
532	0.51
533	0.46
534	0.44
535	0.36
536	0.35
537	0.31
538	0.34
539	0.34
540	0.4
541	0.42
542	0.46
543	0.5
544	0.47
545	0.48
546	0.49
547	0.49
548	0.43
549	0.39
550	0.35
551	0.31
552	0.33
553	0.3
554	0.24
555	0.2
556	0.18
557	0.17
558	0.11
559	0.1
560	0.09
561	0.09
562	0.09
563	0.1
564	0.1
565	0.09
566	0.1
567	0.1
568	0.12
569	0.11
570	0.13
571	0.14
572	0.14
573	0.15
574	0.15
575	0.14
576	0.11
577	0.11
578	0.1
579	0.08
580	0.09

A0A1W2TD52

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer