Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HTI5

Protein Details
Accession C6HTI5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
326-347SDSSVSKKRKEQTRNQSNKSATHydrophilic
417-444LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGLIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
423-435KGFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 10.5, extr 8, cyto_nucl 7, mito 4, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences NGNKKGASISGNAAVSPGLIAAISSFLTTYGFDKTSKVFAAERKAKKSIMKAGVKSNDKATTNTPFLVGIFERWELNRNAQHFVEKEGTLRCGDSDKSDTSDSEPDSNFSESSDSDVVMESARAPCSALSLSSSPCSSSESESSDEDVKKAPITQPSNLKRKHDDSSSSSCDSDSDEAHPEVKRTKLTTDKPTLNSLAKSSSTSESSSESFSGSDTGSGSSSDFDCDSSSDSNSSSSTSASVKSKLKPVTKSAEAATIAAQIPLPGSDNKGFSDSSPSSSSPFSASSSDTDNSPSCRQSADSSATLKNSSSSSNSSSDSSSNSSSSDSSVSKKRKEQTRNQSNKSATSSAILKKAASITSTSNVVSARGSNPAASTPPIKHSGTQPTPLALAGQLLHDHPSNAYIPYAYAERAYKDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGLIDIGPGKSFKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.18
3 0.15
4 0.1
5 0.05
6 0.04
7 0.04
8 0.04
9 0.05
10 0.05
11 0.05
12 0.06
13 0.06
14 0.07
15 0.08
16 0.09
17 0.12
18 0.14
19 0.14
20 0.17
21 0.19
22 0.22
23 0.22
24 0.24
25 0.24
26 0.28
27 0.38
28 0.46
29 0.52
30 0.54
31 0.57
32 0.59
33 0.6
34 0.63
35 0.62
36 0.62
37 0.63
38 0.61
39 0.66
40 0.71
41 0.7
42 0.64
43 0.59
44 0.56
45 0.49
46 0.48
47 0.43
48 0.41
49 0.39
50 0.38
51 0.32
52 0.26
53 0.24
54 0.25
55 0.21
56 0.15
57 0.15
58 0.15
59 0.16
60 0.16
61 0.21
62 0.2
63 0.26
64 0.29
65 0.29
66 0.32
67 0.32
68 0.36
69 0.32
70 0.35
71 0.32
72 0.27
73 0.28
74 0.26
75 0.27
76 0.23
77 0.22
78 0.19
79 0.17
80 0.18
81 0.19
82 0.21
83 0.21
84 0.24
85 0.25
86 0.24
87 0.25
88 0.29
89 0.26
90 0.26
91 0.25
92 0.23
93 0.24
94 0.25
95 0.21
96 0.17
97 0.17
98 0.12
99 0.16
100 0.15
101 0.13
102 0.12
103 0.12
104 0.12
105 0.1
106 0.1
107 0.07
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.11
117 0.12
118 0.13
119 0.14
120 0.15
121 0.13
122 0.13
123 0.16
124 0.14
125 0.16
126 0.17
127 0.18
128 0.2
129 0.2
130 0.22
131 0.24
132 0.23
133 0.21
134 0.2
135 0.18
136 0.16
137 0.18
138 0.19
139 0.22
140 0.26
141 0.3
142 0.38
143 0.45
144 0.54
145 0.56
146 0.57
147 0.55
148 0.56
149 0.56
150 0.51
151 0.48
152 0.45
153 0.49
154 0.5
155 0.45
156 0.41
157 0.36
158 0.31
159 0.28
160 0.23
161 0.16
162 0.13
163 0.14
164 0.14
165 0.17
166 0.17
167 0.17
168 0.18
169 0.19
170 0.19
171 0.18
172 0.22
173 0.29
174 0.34
175 0.41
176 0.46
177 0.49
178 0.49
179 0.5
180 0.49
181 0.42
182 0.37
183 0.3
184 0.25
185 0.2
186 0.19
187 0.18
188 0.16
189 0.16
190 0.16
191 0.16
192 0.15
193 0.16
194 0.16
195 0.14
196 0.12
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.08
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.08
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.11
227 0.12
228 0.17
229 0.19
230 0.21
231 0.27
232 0.32
233 0.37
234 0.38
235 0.41
236 0.43
237 0.41
238 0.41
239 0.35
240 0.32
241 0.27
242 0.24
243 0.2
244 0.16
245 0.14
246 0.12
247 0.11
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.08
252 0.06
253 0.09
254 0.11
255 0.12
256 0.13
257 0.14
258 0.14
259 0.13
260 0.2
261 0.18
262 0.19
263 0.21
264 0.21
265 0.21
266 0.21
267 0.21
268 0.16
269 0.16
270 0.14
271 0.13
272 0.13
273 0.13
274 0.17
275 0.17
276 0.15
277 0.17
278 0.17
279 0.2
280 0.21
281 0.21
282 0.17
283 0.18
284 0.19
285 0.18
286 0.22
287 0.22
288 0.23
289 0.25
290 0.26
291 0.27
292 0.26
293 0.24
294 0.2
295 0.17
296 0.16
297 0.15
298 0.16
299 0.19
300 0.2
301 0.22
302 0.22
303 0.22
304 0.21
305 0.21
306 0.21
307 0.19
308 0.17
309 0.16
310 0.16
311 0.15
312 0.15
313 0.16
314 0.15
315 0.17
316 0.26
317 0.32
318 0.36
319 0.43
320 0.5
321 0.57
322 0.65
323 0.72
324 0.74
325 0.79
326 0.84
327 0.82
328 0.83
329 0.75
330 0.7
331 0.65
332 0.55
333 0.44
334 0.37
335 0.37
336 0.32
337 0.34
338 0.3
339 0.24
340 0.24
341 0.26
342 0.24
343 0.19
344 0.18
345 0.16
346 0.18
347 0.2
348 0.18
349 0.17
350 0.17
351 0.16
352 0.15
353 0.14
354 0.13
355 0.15
356 0.16
357 0.15
358 0.15
359 0.16
360 0.17
361 0.18
362 0.2
363 0.19
364 0.23
365 0.27
366 0.28
367 0.29
368 0.33
369 0.42
370 0.42
371 0.45
372 0.42
373 0.38
374 0.37
375 0.35
376 0.29
377 0.19
378 0.15
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.13
384 0.12
385 0.13
386 0.12
387 0.14
388 0.14
389 0.14
390 0.14
391 0.12
392 0.12
393 0.13
394 0.15
395 0.13
396 0.14
397 0.15
398 0.17
399 0.19
400 0.2
401 0.19
402 0.2
403 0.23
404 0.26
405 0.32
406 0.33
407 0.34
408 0.38
409 0.38
410 0.43
411 0.47
412 0.52
413 0.56
414 0.64
415 0.71
416 0.76
417 0.85
418 0.87
419 0.9
420 0.91
421 0.9
422 0.9
423 0.88
424 0.86
425 0.84
426 0.77
427 0.67
428 0.57
429 0.53
430 0.45
431 0.38
432 0.29
433 0.22
434 0.2