FuNGI

A0A1S8A860

Protein Details

Accession

A0A1S8A860

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
402-424	KDTKDTKPTKQTKSGRKKWAANI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
389-419	MLRANPRRHAHKAKDTKDTKPTKQTKSGRKK

Subcellular Location(s)

nucl 8, mito 7, cyto 7, cyto_mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005739 C:mitochondrion GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17917 RT_RNaseH
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MIYLHKHTKLGYMSPLEPDCRGYKAEDQENALELAVHAPRTNSQRILEDLRDSTIKAGNTVTHPTGVTIYNHPDHPEYTDALYRLITEFADVFQNTGFAIVPEDEQPIFHLTPGWEKEIPKKCRVYPLNAEDQQVVKNTMSELEKTNRVSRTRQPVPFSFPVFVIWRSVSDPATGVKRKGRMVVDVRPFNKINLPDSYPMKSQDDMLQKISGMTFITMLDAIAFYYQWLTHPSTRSAMTVTTAHGQYTFNCLVMGYKNSNAYVQRQMDIILEPIPAADCYCDDICVASPEFQAHYQDLRQLLTLLRLRNISIGPSKSFVGFPNAVVLGRLVDSFGLSTTKQRLEAIAKLAFPTSLKDLETFLGMAGYLRNNIPRYAQLVEPLERRKTNMLRANPRRHAHKAKDTKDTKPTKQTKSGRKKWAANIPIDTPTEAERVAFEALRESLTRYTTLHFFSTQRPLCIDFDVSRRGIGVSVYHIAENSLPKISSPEGKLVTFPPSTAIQPIAFLSRTLANAEKNYWPTEMEVLGFVWALRKTQHWINVACSTYIFTDHRSIIGLTNHKDIVNSTALSNQNLRLVRAMEYISRFTFTVLHKPGKLHIIPDALSRLPTVTESPEPHPDLEFLPDDAEEQWAFPADVLPALRLATTFGLKGDQPSKGIALIQMSPEFKAQLRQGYKEDPKWVNTLKLVTQNMNLDAANQANLPFQLRDGLLWKIGETADRLCIPRNCAREIFELLHGDNHVGDSRFQAMASQFVINRKELKKYLRTCPECAMFRNRNHKPYGSLQPILSPPCPFHTITIDIALALPMSHQQHNAFMVAVCKLSKAPQIIPGRHDWTAFQWADKLLDRLLLATWGIPKVMLSDRDPKFLADLWKHIWTRLGTRLLYATAYHPATDGQSERFILTIKSTLRYYFHALEDPADWENAVPRLQFELHNVTSATTGQTPAEVILGFTPNFILEHVGAPNTIPDPLRLKSRIEVSDAIALSSMTAKMYYDQRHQPMFFKPGDKVLLRLHKGYNIPKAASLGRKLGQQYAGPFEVLDRIGRSAYKLKFPNHFKIHDVISVDHLEPAPPMDYFGRQLPYPGDVHLEIHNKRIIDEDHDKRKYLLEYVGLGPEYHKWVTFQELGDEAAELIVDYRRRRPATKV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.44
3	0.4
4	0.37
5	0.36
6	0.31
7	0.29
8	0.29
9	0.27
10	0.32
11	0.38
12	0.45
13	0.44
14	0.46
15	0.46
16	0.45
17	0.41
18	0.33
19	0.25
20	0.17
21	0.18
22	0.15
23	0.14
24	0.13
25	0.14
26	0.2
27	0.26
28	0.31
29	0.31
30	0.32
31	0.35
32	0.4
33	0.45
34	0.43
35	0.42
36	0.38
37	0.37
38	0.35
39	0.32
40	0.3
41	0.27
42	0.24
43	0.21
44	0.21
45	0.21
46	0.23
47	0.29
48	0.27
49	0.25
50	0.25
51	0.24
52	0.25
53	0.24
54	0.23
55	0.22
56	0.27
57	0.29
58	0.3
59	0.32
60	0.31
61	0.3
62	0.3
63	0.29
64	0.25
65	0.25
66	0.28
67	0.25
68	0.24
69	0.23
70	0.2
71	0.19
72	0.17
73	0.14
74	0.11
75	0.11
76	0.11
77	0.15
78	0.14
79	0.14
80	0.13
81	0.13
82	0.11
83	0.12
84	0.11
85	0.06
86	0.08
87	0.08
88	0.1
89	0.11
90	0.14
91	0.13
92	0.13
93	0.15
94	0.18
95	0.17
96	0.16
97	0.18
98	0.16
99	0.24
100	0.27
101	0.31
102	0.29
103	0.31
104	0.41
105	0.48
106	0.53
107	0.53
108	0.58
109	0.56
110	0.64
111	0.67
112	0.66
113	0.66
114	0.67
115	0.69
116	0.65
117	0.63
118	0.55
119	0.51
120	0.45
121	0.37
122	0.32
123	0.21
124	0.19
125	0.18
126	0.2
127	0.2
128	0.2
129	0.23
130	0.26
131	0.31
132	0.34
133	0.4
134	0.42
135	0.44
136	0.47
137	0.51
138	0.57
139	0.6
140	0.63
141	0.64
142	0.62
143	0.67
144	0.66
145	0.61
146	0.51
147	0.42
148	0.39
149	0.35
150	0.31
151	0.26
152	0.21
153	0.19
154	0.2
155	0.22
156	0.19
157	0.17
158	0.17
159	0.17
160	0.25
161	0.27
162	0.29
163	0.33
164	0.37
165	0.39
166	0.44
167	0.43
168	0.44
169	0.47
170	0.52
171	0.56
172	0.59
173	0.58
174	0.57
175	0.55
176	0.48
177	0.47
178	0.41
179	0.35
180	0.32
181	0.35
182	0.34
183	0.37
184	0.4
185	0.36
186	0.37
187	0.36
188	0.31
189	0.3
190	0.32
191	0.36
192	0.35
193	0.35
194	0.32
195	0.29
196	0.29
197	0.27
198	0.2
199	0.13
200	0.1
201	0.08
202	0.08
203	0.08
204	0.07
205	0.07
206	0.06
207	0.06
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.04
212	0.05
213	0.06
214	0.07
215	0.1
216	0.15
217	0.19
218	0.23
219	0.25
220	0.27
221	0.28
222	0.28
223	0.25
224	0.21
225	0.2
226	0.18
227	0.17
228	0.19
229	0.18
230	0.18
231	0.17
232	0.17
233	0.16
234	0.22
235	0.2
236	0.15
237	0.15
238	0.15
239	0.15
240	0.18
241	0.21
242	0.16
243	0.18
244	0.2
245	0.2
246	0.24
247	0.24
248	0.25
249	0.3
250	0.29
251	0.27
252	0.26
253	0.26
254	0.24
255	0.23
256	0.2
257	0.12
258	0.1
259	0.09
260	0.09
261	0.09
262	0.07
263	0.07
264	0.06
265	0.06
266	0.1
267	0.1
268	0.1
269	0.1
270	0.1
271	0.11
272	0.13
273	0.14
274	0.12
275	0.12
276	0.13
277	0.15
278	0.15
279	0.16
280	0.15
281	0.17
282	0.16
283	0.19
284	0.19
285	0.18
286	0.17
287	0.16
288	0.15
289	0.19
290	0.22
291	0.2
292	0.21
293	0.21
294	0.21
295	0.23
296	0.22
297	0.19
298	0.21
299	0.22
300	0.21
301	0.23
302	0.23
303	0.21
304	0.22
305	0.2
306	0.21
307	0.19
308	0.17
309	0.19
310	0.18
311	0.17
312	0.16
313	0.15
314	0.09
315	0.09
316	0.08
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.06
322	0.07
323	0.07
324	0.1
325	0.14
326	0.16
327	0.17
328	0.17
329	0.19
330	0.21
331	0.24
332	0.26
333	0.24
334	0.23
335	0.22
336	0.22
337	0.19
338	0.16
339	0.15
340	0.13
341	0.12
342	0.13
343	0.13
344	0.14
345	0.14
346	0.14
347	0.12
348	0.09
349	0.07
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.06
354	0.07
355	0.07
356	0.11
357	0.12
358	0.13
359	0.15
360	0.15
361	0.18
362	0.19
363	0.19
364	0.19
365	0.22
366	0.24
367	0.28
368	0.3
369	0.32
370	0.3
371	0.32
372	0.35
373	0.35
374	0.41
375	0.44
376	0.49
377	0.55
378	0.65
379	0.73
380	0.74
381	0.73
382	0.71
383	0.72
384	0.72
385	0.69
386	0.7
387	0.71
388	0.68
389	0.74
390	0.71
391	0.69
392	0.7
393	0.69
394	0.65
395	0.65
396	0.69
397	0.65
398	0.71
399	0.74
400	0.75
401	0.78
402	0.82
403	0.82
404	0.81
405	0.81
406	0.78
407	0.79
408	0.73
409	0.65
410	0.59
411	0.51
412	0.46
413	0.39
414	0.32
415	0.23
416	0.2
417	0.17
418	0.14
419	0.11
420	0.08
421	0.09
422	0.1
423	0.09
424	0.08
425	0.08
426	0.09
427	0.1
428	0.1
429	0.1
430	0.11
431	0.12
432	0.13
433	0.12
434	0.13
435	0.15
436	0.16
437	0.16
438	0.16
439	0.17
440	0.2
441	0.29
442	0.28
443	0.27
444	0.26
445	0.28
446	0.27
447	0.26
448	0.24
449	0.17
450	0.19
451	0.21
452	0.2
453	0.17
454	0.16
455	0.15
456	0.14
457	0.12
458	0.09
459	0.08
460	0.1
461	0.1
462	0.1
463	0.1
464	0.09
465	0.11
466	0.11
467	0.1
468	0.09
469	0.08
470	0.08
471	0.11
472	0.12
473	0.14
474	0.15
475	0.18
476	0.19
477	0.19
478	0.21
479	0.2
480	0.23
481	0.19
482	0.17
483	0.15
484	0.14
485	0.15
486	0.14
487	0.14
488	0.1
489	0.1
490	0.11
491	0.1
492	0.09
493	0.09
494	0.09
495	0.09
496	0.1
497	0.11
498	0.12
499	0.12
500	0.12
501	0.15
502	0.17
503	0.17
504	0.18
505	0.17
506	0.15
507	0.15
508	0.15
509	0.13
510	0.1
511	0.09
512	0.07
513	0.07
514	0.06
515	0.06
516	0.07
517	0.07
518	0.07
519	0.07
520	0.08
521	0.11
522	0.14
523	0.2
524	0.22
525	0.23
526	0.26
527	0.29
528	0.29
529	0.26
530	0.23
531	0.18
532	0.14
533	0.16
534	0.13
535	0.1
536	0.13
537	0.13
538	0.13
539	0.13
540	0.13
541	0.13
542	0.16
543	0.18
544	0.17
545	0.19
546	0.19
547	0.18
548	0.18
549	0.16
550	0.15
551	0.13
552	0.12
553	0.1
554	0.14
555	0.15
556	0.16
557	0.17
558	0.14
559	0.17
560	0.17
561	0.17
562	0.13
563	0.14
564	0.14
565	0.14
566	0.14
567	0.12
568	0.13
569	0.14
570	0.13
571	0.13
572	0.12
573	0.11
574	0.15
575	0.14
576	0.21
577	0.23
578	0.25
579	0.25
580	0.26
581	0.27
582	0.28
583	0.28
584	0.2
585	0.19
586	0.18
587	0.18
588	0.18
589	0.18
590	0.13
591	0.13
592	0.12
593	0.09
594	0.08
595	0.08
596	0.08
597	0.08
598	0.11
599	0.14
600	0.16
601	0.21
602	0.21
603	0.21
604	0.21
605	0.19
606	0.17
607	0.17
608	0.15
609	0.1
610	0.1
611	0.09
612	0.09
613	0.09
614	0.09
615	0.07
616	0.06
617	0.06
618	0.06
619	0.06
620	0.05
621	0.05
622	0.04
623	0.06
624	0.06
625	0.06
626	0.06
627	0.06
628	0.06
629	0.05
630	0.06
631	0.06
632	0.07
633	0.06
634	0.06
635	0.07
636	0.08
637	0.1
638	0.12
639	0.12
640	0.12
641	0.13
642	0.13
643	0.12
644	0.12
645	0.1
646	0.09
647	0.09
648	0.1
649	0.11
650	0.11
651	0.12
652	0.12
653	0.12
654	0.1
655	0.14
656	0.14
657	0.2
658	0.22
659	0.24
660	0.27
661	0.34
662	0.38
663	0.37
664	0.43
665	0.38
666	0.38
667	0.39
668	0.38
669	0.33
670	0.3
671	0.28
672	0.23
673	0.27
674	0.27
675	0.23
676	0.24
677	0.23
678	0.22
679	0.21
680	0.18
681	0.13
682	0.12
683	0.11
684	0.09
685	0.08
686	0.07
687	0.07
688	0.07
689	0.08
690	0.07
691	0.07
692	0.09
693	0.08
694	0.09
695	0.11
696	0.11
697	0.11
698	0.11
699	0.11
700	0.1
701	0.11
702	0.11
703	0.1
704	0.1
705	0.11
706	0.13
707	0.13
708	0.17
709	0.18
710	0.23
711	0.27
712	0.3
713	0.3
714	0.3
715	0.32
716	0.31
717	0.33
718	0.3
719	0.26
720	0.25
721	0.22
722	0.21
723	0.18
724	0.15
725	0.12
726	0.1
727	0.1
728	0.09
729	0.09
730	0.09
731	0.11
732	0.11
733	0.11
734	0.12
735	0.11
736	0.12
737	0.13
738	0.13
739	0.12
740	0.16
741	0.18
742	0.18
743	0.25
744	0.25
745	0.29
746	0.32
747	0.37
748	0.42
749	0.47
750	0.55
751	0.59
752	0.61
753	0.59
754	0.6
755	0.59
756	0.52
757	0.5
758	0.5
759	0.47
760	0.5
761	0.58
762	0.58
763	0.57
764	0.58
765	0.56
766	0.51
767	0.51
768	0.53
769	0.48
770	0.45
771	0.39
772	0.39
773	0.4
774	0.39
775	0.33
776	0.25
777	0.2
778	0.21
779	0.24
780	0.21
781	0.2
782	0.2
783	0.22
784	0.22
785	0.22
786	0.19
787	0.16
788	0.15
789	0.13
790	0.09
791	0.06
792	0.05
793	0.07
794	0.1
795	0.11
796	0.13
797	0.14
798	0.16
799	0.18
800	0.18
801	0.15
802	0.12
803	0.13
804	0.12
805	0.12
806	0.1
807	0.09
808	0.09
809	0.11
810	0.15
811	0.16
812	0.17
813	0.25
814	0.33
815	0.35
816	0.38
817	0.41
818	0.41
819	0.39
820	0.38
821	0.3
822	0.26
823	0.32
824	0.29
825	0.24
826	0.21
827	0.21
828	0.23
829	0.23
830	0.21
831	0.13
832	0.14
833	0.14
834	0.13
835	0.12
836	0.1
837	0.09
838	0.09
839	0.1
840	0.09
841	0.09
842	0.08
843	0.08
844	0.1
845	0.14
846	0.16
847	0.18
848	0.27
849	0.29
850	0.33
851	0.33
852	0.3
853	0.28
854	0.29
855	0.33
856	0.26
857	0.28
858	0.29
859	0.36
860	0.36
861	0.35
862	0.36
863	0.3
864	0.32
865	0.35
866	0.37
867	0.3
868	0.3
869	0.31
870	0.27
871	0.26
872	0.22
873	0.17
874	0.17
875	0.17
876	0.16
877	0.15
878	0.15
879	0.15
880	0.17
881	0.17
882	0.13
883	0.15
884	0.16
885	0.16
886	0.16
887	0.15
888	0.13
889	0.13
890	0.16
891	0.16
892	0.18
893	0.19
894	0.21
895	0.22
896	0.25
897	0.29
898	0.28
899	0.28
900	0.28
901	0.27
902	0.27
903	0.26
904	0.25
905	0.19
906	0.16
907	0.14
908	0.11
909	0.13
910	0.13
911	0.13
912	0.11
913	0.11
914	0.14
915	0.16
916	0.17
917	0.19
918	0.24
919	0.24
920	0.25
921	0.25
922	0.22
923	0.21
924	0.21
925	0.19
926	0.12
927	0.12
928	0.11
929	0.11
930	0.11
931	0.1
932	0.1
933	0.08
934	0.07
935	0.08
936	0.1
937	0.1
938	0.1
939	0.1
940	0.09
941	0.09
942	0.09
943	0.1
944	0.08
945	0.1
946	0.11
947	0.12
948	0.11
949	0.11
950	0.13
951	0.11
952	0.12
953	0.11
954	0.13
955	0.17
956	0.19
957	0.27
958	0.27
959	0.29
960	0.32
961	0.39
962	0.38
963	0.38
964	0.38
965	0.33
966	0.37
967	0.34
968	0.3
969	0.22
970	0.2
971	0.15
972	0.15
973	0.12
974	0.06
975	0.07
976	0.07
977	0.1
978	0.18
979	0.23
980	0.29
981	0.37
982	0.43
983	0.49
984	0.5
985	0.5
986	0.5
987	0.51
988	0.48
989	0.43
990	0.39
991	0.38
992	0.42
993	0.39
994	0.37
995	0.39
996	0.45
997	0.44
998	0.46
999	0.43
1000	0.43
1001	0.49
1002	0.52
1003	0.52
1004	0.47
1005	0.45
1006	0.42
1007	0.44
1008	0.43
1009	0.43
1010	0.39
1011	0.36
1012	0.33
1013	0.37
1014	0.38
1015	0.39
1016	0.37
1017	0.35
1018	0.34
1019	0.35
1020	0.34
1021	0.29
1022	0.27
1023	0.23
1024	0.22
1025	0.2
1026	0.18
1027	0.14
1028	0.14
1029	0.15
1030	0.16
1031	0.2
1032	0.25
1033	0.27
1034	0.34
1035	0.4
1036	0.44
1037	0.52
1038	0.59
1039	0.66
1040	0.65
1041	0.65
1042	0.59
1043	0.57
1044	0.54
1045	0.49
1046	0.44
1047	0.35
1048	0.31
1049	0.32
1050	0.29
1051	0.26
1052	0.23
1053	0.19
1054	0.17
1055	0.17
1056	0.15
1057	0.11
1058	0.14
1059	0.14
1060	0.16
1061	0.18
1062	0.23
1063	0.24
1064	0.22
1065	0.25
1066	0.24
1067	0.26
1068	0.25
1069	0.23
1070	0.23
1071	0.2
1072	0.22
1073	0.26
1074	0.33
1075	0.3
1076	0.34
1077	0.36
1078	0.32
1079	0.31
1080	0.35
1081	0.3
1082	0.31
1083	0.4
1084	0.44
1085	0.52
1086	0.55
1087	0.56
1088	0.52
1089	0.55
1090	0.49
1091	0.43
1092	0.38
1093	0.31
1094	0.32
1095	0.33
1096	0.35
1097	0.31
1098	0.28
1099	0.25
1100	0.24
1101	0.25
1102	0.22
1103	0.2
1104	0.18
1105	0.2
1106	0.26
1107	0.29
1108	0.27
1109	0.25
1110	0.25
1111	0.26
1112	0.24
1113	0.23
1114	0.16
1115	0.12
1116	0.1
1117	0.07
1118	0.07
1119	0.1
1120	0.15
1121	0.18
1122	0.25
1123	0.34
1124	0.4

A0A1S8A860

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer