Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HLG9

Protein Details
Accession C6HLG9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-32LDGVPNSKKRKKESSEPKQQSSKRRVVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-22KKRKKESSEPK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR027193  Noc4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
Amino Acid Sequences MPRLLDGVPNSKKRKKESSEPKQQSSKRRVVADEDKEDKNKIQQLEDQITESRKYYNNIVTLLSLFITEYAAKSPNLTAAVSLCRVFCRLMAGGQLIKPKDASEQDLILVAWLKERYQEYQNGLINILKNGEAPAQIAALSLFMRLIKEQSVNGGTGAEIGVWKGPCFYGLIASLIEAQDGERVRSEFIKKFLNEYHDVVIYTLLQLSEFTTTNSSPKSIDTVISLLSALGQPPPPDHEFENFYTDISAFGQKHKSNLLSVSAYKQRVQATWLTVLRSNALKEQQRKTLLRLMSHLIAPWFLKPEMLMDFLTDSYNHGGSTSLLALSGLFYLIQEKNLDCPQFYPKLYSLLDADLLHSKHRSRFFRLLDTFLSSSHLPATLVASFIKRLSRLALNAPPAAIVAIIPWIYNLMKSHPTCTFMLHRVIRDDEGSQSKLQTHGMTDPFDPMEPDPTRTGALESSLWEIETLQSHYHPNVASLAKIISEQFTKQAYNLEDFLDHSYQAMMGMELGTEERGFRKAPVVEFQIPKRIFTDRLLEEDGNVDKEVGALVRCLWDFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.74
3 0.77
4 0.79
5 0.81
6 0.86
7 0.87
8 0.88
9 0.87
10 0.86
11 0.85
12 0.84
13 0.82
14 0.77
15 0.74
16 0.69
17 0.67
18 0.7
19 0.69
20 0.68
21 0.64
22 0.62
23 0.6
24 0.59
25 0.53
26 0.5
27 0.47
28 0.41
29 0.4
30 0.41
31 0.46
32 0.5
33 0.48
34 0.43
35 0.41
36 0.41
37 0.38
38 0.33
39 0.3
40 0.27
41 0.29
42 0.33
43 0.35
44 0.36
45 0.36
46 0.36
47 0.32
48 0.29
49 0.27
50 0.2
51 0.14
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.08
56 0.08
57 0.1
58 0.12
59 0.12
60 0.14
61 0.14
62 0.16
63 0.17
64 0.16
65 0.15
66 0.15
67 0.18
68 0.19
69 0.19
70 0.16
71 0.16
72 0.17
73 0.17
74 0.15
75 0.16
76 0.15
77 0.15
78 0.17
79 0.19
80 0.2
81 0.22
82 0.28
83 0.24
84 0.23
85 0.23
86 0.21
87 0.24
88 0.24
89 0.26
90 0.23
91 0.24
92 0.23
93 0.24
94 0.23
95 0.18
96 0.17
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.12
101 0.15
102 0.17
103 0.2
104 0.23
105 0.29
106 0.3
107 0.37
108 0.4
109 0.36
110 0.35
111 0.33
112 0.3
113 0.25
114 0.22
115 0.14
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.1
135 0.11
136 0.11
137 0.15
138 0.16
139 0.15
140 0.15
141 0.14
142 0.11
143 0.1
144 0.1
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.09
156 0.08
157 0.09
158 0.1
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.07
165 0.06
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.16
173 0.21
174 0.21
175 0.24
176 0.3
177 0.29
178 0.32
179 0.34
180 0.36
181 0.34
182 0.33
183 0.32
184 0.26
185 0.26
186 0.22
187 0.19
188 0.13
189 0.1
190 0.08
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.09
199 0.1
200 0.12
201 0.13
202 0.13
203 0.11
204 0.12
205 0.14
206 0.13
207 0.13
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.05
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.12
222 0.13
223 0.14
224 0.16
225 0.17
226 0.2
227 0.21
228 0.24
229 0.2
230 0.19
231 0.18
232 0.16
233 0.14
234 0.11
235 0.14
236 0.1
237 0.13
238 0.19
239 0.19
240 0.21
241 0.23
242 0.22
243 0.19
244 0.2
245 0.2
246 0.16
247 0.16
248 0.19
249 0.22
250 0.23
251 0.23
252 0.25
253 0.24
254 0.22
255 0.23
256 0.22
257 0.19
258 0.23
259 0.22
260 0.2
261 0.2
262 0.2
263 0.2
264 0.18
265 0.16
266 0.14
267 0.18
268 0.22
269 0.27
270 0.3
271 0.35
272 0.4
273 0.41
274 0.41
275 0.43
276 0.4
277 0.34
278 0.33
279 0.29
280 0.24
281 0.23
282 0.2
283 0.14
284 0.12
285 0.12
286 0.1
287 0.1
288 0.09
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.1
293 0.11
294 0.1
295 0.08
296 0.09
297 0.09
298 0.1
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.07
309 0.06
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.04
316 0.03
317 0.03
318 0.07
319 0.07
320 0.08
321 0.09
322 0.09
323 0.12
324 0.16
325 0.16
326 0.13
327 0.15
328 0.19
329 0.23
330 0.23
331 0.24
332 0.21
333 0.26
334 0.26
335 0.26
336 0.22
337 0.18
338 0.19
339 0.15
340 0.16
341 0.15
342 0.15
343 0.15
344 0.16
345 0.18
346 0.22
347 0.3
348 0.33
349 0.36
350 0.44
351 0.47
352 0.54
353 0.54
354 0.51
355 0.45
356 0.45
357 0.37
358 0.29
359 0.29
360 0.19
361 0.17
362 0.14
363 0.13
364 0.09
365 0.09
366 0.11
367 0.08
368 0.09
369 0.09
370 0.09
371 0.1
372 0.11
373 0.13
374 0.11
375 0.12
376 0.14
377 0.17
378 0.18
379 0.23
380 0.26
381 0.28
382 0.28
383 0.27
384 0.23
385 0.2
386 0.18
387 0.12
388 0.07
389 0.04
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.07
395 0.07
396 0.08
397 0.09
398 0.11
399 0.19
400 0.2
401 0.24
402 0.24
403 0.28
404 0.27
405 0.3
406 0.32
407 0.28
408 0.36
409 0.35
410 0.35
411 0.35
412 0.36
413 0.34
414 0.3
415 0.27
416 0.24
417 0.26
418 0.26
419 0.23
420 0.23
421 0.23
422 0.23
423 0.23
424 0.19
425 0.17
426 0.2
427 0.22
428 0.23
429 0.22
430 0.23
431 0.22
432 0.21
433 0.21
434 0.16
435 0.21
436 0.2
437 0.23
438 0.22
439 0.22
440 0.23
441 0.22
442 0.23
443 0.15
444 0.16
445 0.14
446 0.14
447 0.16
448 0.15
449 0.14
450 0.13
451 0.12
452 0.12
453 0.14
454 0.14
455 0.12
456 0.14
457 0.17
458 0.17
459 0.2
460 0.19
461 0.17
462 0.21
463 0.2
464 0.19
465 0.17
466 0.17
467 0.14
468 0.15
469 0.15
470 0.12
471 0.14
472 0.14
473 0.17
474 0.19
475 0.2
476 0.2
477 0.25
478 0.25
479 0.26
480 0.26
481 0.23
482 0.21
483 0.22
484 0.26
485 0.21
486 0.18
487 0.15
488 0.14
489 0.13
490 0.13
491 0.12
492 0.07
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.07
501 0.09
502 0.11
503 0.12
504 0.13
505 0.2
506 0.23
507 0.27
508 0.33
509 0.39
510 0.44
511 0.49
512 0.52
513 0.55
514 0.51
515 0.49
516 0.45
517 0.41
518 0.37
519 0.35
520 0.4
521 0.33
522 0.38
523 0.42
524 0.39
525 0.36
526 0.36
527 0.35
528 0.28
529 0.26
530 0.2
531 0.14
532 0.14
533 0.15
534 0.12
535 0.1
536 0.09
537 0.1
538 0.14