Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HQK5

Protein Details
Accession C6HQK5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
535-561DEKLSRSAAKNKKKREAKKAKEMAEKABasic
578-600PSADRRERRAHSRSRSRGNNVNSHydrophilic
609-633GRPNRDRSRSTHHRHRSDHQNRTNGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
540-556RSAAKNKKKREAKKAKE
Subcellular Location(s) cyto_mito 11.666, mito 11.5, cyto 10.5, cyto_nucl 8.333, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011387  TIF2A  
IPR013979  TIF_beta_prop-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08662  eIF2A  
Amino Acid Sequences MAAPNQYAYRTQKGISIVDAAPVYESLPGFTRPDGNLRCCTYSPCGRYFAWAAPERVVIVDPSVGHVVTTLPSDNVYELGFSPLGTYIITWQRPSKDENGDAVKNLKVWRVIESYHGDEGNEQEHSFVGSYVQKSQTGWNLQYTADEKYCARVVTNEVQFYESGNLGKVWNKLRVEGVADFALSPGDSNSIAVFIPERKGLPASVRIFNVPQFNTPVSQKNFFKGDKVQLKWNNTGTTLIVLAQTDVDKTGKSYYGETTLYLLSANSGFDSRIDLDKEGPIHDVTWSPNSKEFGVVYGYMPAKTTIFNNRAVATHSFALAPRNTILFSPNGRFVIVAGFGNLAGQLDIYDLDRDYTKVATIEASNASVCEWSPDGKFILTATTSPRLRVDNGVRIWHVGGGLMYNEDLTELYQVCWRPQSTTVHPPENPFHPMPSPHPSALEYLATKKAPSKPAGAYRPPGARGQTTPLAFRREDEGGEKFIRDESSSSIHGTSLNGFGKNRRRVVPGAEPVTEYLPPGAAPGGGVTLPPGAEGDEKLSRSAAKNKKKREAKKAKEMAEKAGNLAADAGIDSTIPTGPSADRRERRAHSRSRSRGNNVNSPALDPNSFGRPNRDRSRSTHHRHRSDHQNRTNGGPPTGQNRPSVNTRTSQPNGTAAAAAVPSPPDVRVTSPTTPSGGAIQDKKIRGLLKKIRAIEELKLRVAGGEKLEDTQMKKIQTEDGVRKELEALGWSG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.33
3 0.32
4 0.26
5 0.27
6 0.26
7 0.22
8 0.18
9 0.17
10 0.15
11 0.13
12 0.12
13 0.1
14 0.13
15 0.15
16 0.16
17 0.18
18 0.22
19 0.21
20 0.31
21 0.36
22 0.39
23 0.44
24 0.46
25 0.5
26 0.46
27 0.49
28 0.47
29 0.49
30 0.49
31 0.46
32 0.46
33 0.42
34 0.46
35 0.45
36 0.42
37 0.42
38 0.42
39 0.4
40 0.37
41 0.38
42 0.33
43 0.3
44 0.26
45 0.17
46 0.13
47 0.13
48 0.11
49 0.13
50 0.14
51 0.13
52 0.12
53 0.12
54 0.11
55 0.1
56 0.12
57 0.1
58 0.09
59 0.1
60 0.11
61 0.11
62 0.12
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.12
67 0.12
68 0.11
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.1
73 0.1
74 0.12
75 0.2
76 0.22
77 0.24
78 0.28
79 0.32
80 0.34
81 0.39
82 0.4
83 0.4
84 0.42
85 0.46
86 0.48
87 0.46
88 0.45
89 0.43
90 0.37
91 0.32
92 0.31
93 0.28
94 0.24
95 0.24
96 0.27
97 0.27
98 0.27
99 0.3
100 0.33
101 0.34
102 0.32
103 0.32
104 0.27
105 0.25
106 0.26
107 0.22
108 0.18
109 0.14
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.11
114 0.09
115 0.1
116 0.13
117 0.15
118 0.2
119 0.22
120 0.22
121 0.23
122 0.27
123 0.31
124 0.32
125 0.33
126 0.31
127 0.3
128 0.29
129 0.32
130 0.3
131 0.27
132 0.22
133 0.22
134 0.19
135 0.21
136 0.23
137 0.2
138 0.19
139 0.17
140 0.22
141 0.28
142 0.32
143 0.31
144 0.29
145 0.3
146 0.29
147 0.28
148 0.24
149 0.17
150 0.13
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.16
155 0.19
156 0.22
157 0.28
158 0.28
159 0.28
160 0.29
161 0.3
162 0.3
163 0.25
164 0.24
165 0.17
166 0.17
167 0.15
168 0.13
169 0.12
170 0.08
171 0.07
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.1
183 0.11
184 0.12
185 0.12
186 0.13
187 0.14
188 0.16
189 0.23
190 0.25
191 0.27
192 0.28
193 0.28
194 0.29
195 0.31
196 0.33
197 0.25
198 0.23
199 0.23
200 0.23
201 0.24
202 0.25
203 0.31
204 0.29
205 0.34
206 0.34
207 0.35
208 0.39
209 0.37
210 0.38
211 0.36
212 0.41
213 0.43
214 0.44
215 0.5
216 0.51
217 0.55
218 0.56
219 0.55
220 0.47
221 0.39
222 0.38
223 0.28
224 0.23
225 0.18
226 0.13
227 0.1
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.07
237 0.09
238 0.11
239 0.12
240 0.14
241 0.14
242 0.17
243 0.18
244 0.17
245 0.17
246 0.14
247 0.13
248 0.12
249 0.1
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.08
258 0.09
259 0.11
260 0.12
261 0.12
262 0.13
263 0.15
264 0.16
265 0.14
266 0.14
267 0.12
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.17
273 0.17
274 0.17
275 0.2
276 0.22
277 0.21
278 0.21
279 0.19
280 0.15
281 0.15
282 0.14
283 0.11
284 0.14
285 0.14
286 0.13
287 0.13
288 0.12
289 0.11
290 0.11
291 0.13
292 0.16
293 0.19
294 0.21
295 0.22
296 0.22
297 0.23
298 0.25
299 0.24
300 0.19
301 0.17
302 0.14
303 0.13
304 0.13
305 0.16
306 0.13
307 0.13
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.13
315 0.13
316 0.15
317 0.15
318 0.15
319 0.14
320 0.13
321 0.12
322 0.11
323 0.09
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.04
330 0.03
331 0.03
332 0.03
333 0.03
334 0.03
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.07
348 0.08
349 0.07
350 0.08
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.06
355 0.06
356 0.05
357 0.06
358 0.07
359 0.07
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.07
365 0.08
366 0.07
367 0.07
368 0.09
369 0.15
370 0.15
371 0.16
372 0.17
373 0.17
374 0.18
375 0.23
376 0.24
377 0.26
378 0.27
379 0.28
380 0.27
381 0.26
382 0.25
383 0.2
384 0.15
385 0.08
386 0.07
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.03
396 0.05
397 0.05
398 0.06
399 0.09
400 0.09
401 0.1
402 0.13
403 0.13
404 0.14
405 0.18
406 0.23
407 0.26
408 0.35
409 0.39
410 0.41
411 0.42
412 0.43
413 0.42
414 0.39
415 0.38
416 0.29
417 0.26
418 0.23
419 0.24
420 0.25
421 0.29
422 0.29
423 0.25
424 0.25
425 0.25
426 0.24
427 0.23
428 0.21
429 0.16
430 0.15
431 0.17
432 0.17
433 0.16
434 0.19
435 0.24
436 0.27
437 0.28
438 0.3
439 0.32
440 0.4
441 0.47
442 0.46
443 0.43
444 0.43
445 0.43
446 0.41
447 0.38
448 0.32
449 0.27
450 0.25
451 0.27
452 0.28
453 0.25
454 0.27
455 0.28
456 0.3
457 0.28
458 0.27
459 0.26
460 0.22
461 0.22
462 0.22
463 0.2
464 0.2
465 0.21
466 0.2
467 0.17
468 0.17
469 0.17
470 0.14
471 0.13
472 0.12
473 0.14
474 0.15
475 0.16
476 0.15
477 0.15
478 0.14
479 0.14
480 0.13
481 0.15
482 0.15
483 0.16
484 0.17
485 0.23
486 0.32
487 0.39
488 0.42
489 0.4
490 0.42
491 0.42
492 0.48
493 0.51
494 0.49
495 0.45
496 0.42
497 0.39
498 0.36
499 0.35
500 0.29
501 0.2
502 0.12
503 0.09
504 0.08
505 0.08
506 0.07
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.06
520 0.07
521 0.11
522 0.14
523 0.14
524 0.15
525 0.16
526 0.17
527 0.2
528 0.3
529 0.36
530 0.43
531 0.51
532 0.6
533 0.7
534 0.78
535 0.84
536 0.85
537 0.87
538 0.86
539 0.88
540 0.88
541 0.86
542 0.85
543 0.78
544 0.73
545 0.68
546 0.59
547 0.49
548 0.42
549 0.34
550 0.24
551 0.22
552 0.15
553 0.08
554 0.07
555 0.06
556 0.04
557 0.04
558 0.04
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.06
563 0.07
564 0.08
565 0.15
566 0.22
567 0.31
568 0.36
569 0.41
570 0.5
571 0.54
572 0.62
573 0.65
574 0.68
575 0.69
576 0.75
577 0.79
578 0.8
579 0.83
580 0.81
581 0.8
582 0.77
583 0.75
584 0.68
585 0.66
586 0.56
587 0.5
588 0.46
589 0.4
590 0.34
591 0.26
592 0.24
593 0.25
594 0.28
595 0.26
596 0.32
597 0.36
598 0.45
599 0.53
600 0.58
601 0.55
602 0.58
603 0.68
604 0.69
605 0.72
606 0.74
607 0.75
608 0.78
609 0.8
610 0.82
611 0.83
612 0.83
613 0.84
614 0.82
615 0.8
616 0.72
617 0.71
618 0.7
619 0.61
620 0.53
621 0.46
622 0.4
623 0.38
624 0.44
625 0.41
626 0.39
627 0.38
628 0.4
629 0.44
630 0.47
631 0.43
632 0.4
633 0.42
634 0.47
635 0.47
636 0.46
637 0.41
638 0.39
639 0.39
640 0.35
641 0.31
642 0.22
643 0.2
644 0.16
645 0.14
646 0.11
647 0.09
648 0.09
649 0.1
650 0.1
651 0.11
652 0.13
653 0.16
654 0.2
655 0.26
656 0.29
657 0.32
658 0.33
659 0.33
660 0.32
661 0.3
662 0.27
663 0.25
664 0.27
665 0.27
666 0.32
667 0.37
668 0.38
669 0.39
670 0.41
671 0.43
672 0.42
673 0.49
674 0.52
675 0.55
676 0.61
677 0.64
678 0.64
679 0.63
680 0.61
681 0.58
682 0.58
683 0.52
684 0.46
685 0.42
686 0.38
687 0.34
688 0.33
689 0.29
690 0.21
691 0.21
692 0.2
693 0.21
694 0.24
695 0.27
696 0.27
697 0.31
698 0.34
699 0.32
700 0.33
701 0.33
702 0.36
703 0.39
704 0.46
705 0.47
706 0.49
707 0.51
708 0.5
709 0.49
710 0.45
711 0.39
712 0.31