FuNGI

C6HA79

Protein Details

Accession

C6HA79

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
262-287	GNSETGVKKKKKKRVKKANDEYHVDS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
269-278	KKKKKKRVKK

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 10.333, cyto 10, nucl 9.5, cyto_mito 8.333, mito 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020472 G-protein_beta_WD-40_rep IPR044285 PWP1 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF11715 Nup160 PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION

Amino Acid Sequences

MSMITATTWVRRGVAAPFPERYEIDEAEINRISELAKIQLEGAKTDLKQAQHQSSKDQREGEGEEEKEEESEDDSAEPSGEGKGRAKGSDGKKSDTIDDDLKEYDLDHYDSDPVDENGEQITMFGNIRSLAYHQPNEEDPYLVVPEGVDDDDDDDDEREELQILPTDNLLLAAKVEDEVAQLEVYVYEDEADNLYVHHDIMLPAIPLCLEWLDIPVGRNSENRSYGNFVAVGTMEPDIEIWDLDIVDCMYPNAILGQSGQDGNSETGVKKKKKKRVKKANDEYHVDSVLALAANRQHRNLLASASADQTVKLWDLSTTKCAKSYANHSDKICALDWHPKESTVLLSGSYDRTVVAADMRAPDAKAARWRVESDVENVRWDPHDPNFFYVTTDGGMVYCHDVRQVSAMTENTKPVWMLQAHDSSVSSFDINPTIPGFLVTGSTDKQVKLWNVQDSKPNMVVSRKVEVGKVFSTTFAPDQEVSFRLAVAGSKGVVQIWDTSTNAAVRRTFSSRLGSSLAGEVKERMIGISQNDSSDSDDSGVAEGDGDIGRDGWESMDED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.31
3	0.33
4	0.35
5	0.37
6	0.39
7	0.38
8	0.37
9	0.35
10	0.3
11	0.29
12	0.3
13	0.28
14	0.31
15	0.32
16	0.27
17	0.22
18	0.21
19	0.18
20	0.16
21	0.17
22	0.16
23	0.15
24	0.15
25	0.17
26	0.2
27	0.2
28	0.19
29	0.2
30	0.2
31	0.2
32	0.26
33	0.28
34	0.28
35	0.34
36	0.41
37	0.48
38	0.51
39	0.52
40	0.55
41	0.61
42	0.66
43	0.64
44	0.59
45	0.51
46	0.48
47	0.5
48	0.45
49	0.42
50	0.35
51	0.31
52	0.3
53	0.28
54	0.23
55	0.2
56	0.17
57	0.11
58	0.11
59	0.1
60	0.1
61	0.1
62	0.1
63	0.1
64	0.09
65	0.08
66	0.1
67	0.11
68	0.13
69	0.15
70	0.21
71	0.22
72	0.23
73	0.26
74	0.32
75	0.38
76	0.45
77	0.46
78	0.45
79	0.47
80	0.49
81	0.48
82	0.43
83	0.4
84	0.34
85	0.32
86	0.29
87	0.26
88	0.24
89	0.21
90	0.18
91	0.16
92	0.14
93	0.14
94	0.13
95	0.13
96	0.14
97	0.14
98	0.15
99	0.15
100	0.12
101	0.13
102	0.12
103	0.12
104	0.1
105	0.11
106	0.09
107	0.07
108	0.07
109	0.07
110	0.07
111	0.07
112	0.07
113	0.08
114	0.08
115	0.09
116	0.11
117	0.16
118	0.22
119	0.24
120	0.24
121	0.27
122	0.28
123	0.32
124	0.3
125	0.24
126	0.18
127	0.18
128	0.18
129	0.15
130	0.13
131	0.08
132	0.08
133	0.08
134	0.08
135	0.06
136	0.05
137	0.07
138	0.07
139	0.07
140	0.08
141	0.07
142	0.07
143	0.07
144	0.07
145	0.06
146	0.07
147	0.07
148	0.07
149	0.1
150	0.1
151	0.1
152	0.1
153	0.1
154	0.09
155	0.1
156	0.09
157	0.06
158	0.05
159	0.05
160	0.05
161	0.05
162	0.05
163	0.05
164	0.05
165	0.05
166	0.06
167	0.06
168	0.05
169	0.05
170	0.05
171	0.06
172	0.05
173	0.05
174	0.04
175	0.05
176	0.05
177	0.06
178	0.06
179	0.05
180	0.05
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.06
185	0.06
186	0.06
187	0.07
188	0.08
189	0.07
190	0.06
191	0.06
192	0.06
193	0.05
194	0.06
195	0.05
196	0.04
197	0.04
198	0.05
199	0.06
200	0.07
201	0.08
202	0.09
203	0.1
204	0.11
205	0.13
206	0.15
207	0.19
208	0.22
209	0.22
210	0.23
211	0.26
212	0.25
213	0.24
214	0.21
215	0.16
216	0.13
217	0.12
218	0.1
219	0.07
220	0.07
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.04
236	0.03
237	0.03
238	0.03
239	0.04
240	0.03
241	0.03
242	0.04
243	0.05
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.07
249	0.07
250	0.08
251	0.08
252	0.07
253	0.14
254	0.22
255	0.28
256	0.36
257	0.45
258	0.53
259	0.63
260	0.74
261	0.79
262	0.83
263	0.88
264	0.9
265	0.93
266	0.93
267	0.88
268	0.82
269	0.74
270	0.64
271	0.53
272	0.41
273	0.3
274	0.2
275	0.14
276	0.09
277	0.06
278	0.04
279	0.08
280	0.13
281	0.14
282	0.14
283	0.14
284	0.15
285	0.17
286	0.17
287	0.14
288	0.1
289	0.1
290	0.11
291	0.11
292	0.12
293	0.1
294	0.09
295	0.09
296	0.09
297	0.08
298	0.07
299	0.06
300	0.06
301	0.09
302	0.1
303	0.15
304	0.18
305	0.18
306	0.2
307	0.21
308	0.21
309	0.22
310	0.29
311	0.34
312	0.36
313	0.4
314	0.39
315	0.41
316	0.4
317	0.4
318	0.32
319	0.22
320	0.19
321	0.23
322	0.24
323	0.26
324	0.25
325	0.23
326	0.23
327	0.22
328	0.21
329	0.14
330	0.13
331	0.09
332	0.1
333	0.1
334	0.11
335	0.1
336	0.09
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.07
344	0.08
345	0.09
346	0.1
347	0.09
348	0.11
349	0.11
350	0.13
351	0.18
352	0.21
353	0.23
354	0.25
355	0.27
356	0.28
357	0.31
358	0.3
359	0.28
360	0.31
361	0.29
362	0.29
363	0.27
364	0.26
365	0.23
366	0.23
367	0.22
368	0.19
369	0.26
370	0.25
371	0.28
372	0.29
373	0.28
374	0.27
375	0.24
376	0.2
377	0.13
378	0.12
379	0.09
380	0.07
381	0.07
382	0.06
383	0.09
384	0.09
385	0.08
386	0.09
387	0.09
388	0.1
389	0.12
390	0.12
391	0.1
392	0.13
393	0.14
394	0.16
395	0.18
396	0.19
397	0.17
398	0.17
399	0.16
400	0.13
401	0.18
402	0.15
403	0.17
404	0.2
405	0.22
406	0.22
407	0.23
408	0.22
409	0.17
410	0.18
411	0.16
412	0.12
413	0.09
414	0.1
415	0.11
416	0.11
417	0.11
418	0.11
419	0.1
420	0.09
421	0.1
422	0.09
423	0.07
424	0.08
425	0.08
426	0.1
427	0.1
428	0.13
429	0.15
430	0.14
431	0.16
432	0.21
433	0.23
434	0.28
435	0.33
436	0.39
437	0.41
438	0.43
439	0.49
440	0.47
441	0.49
442	0.45
443	0.41
444	0.35
445	0.35
446	0.38
447	0.34
448	0.34
449	0.34
450	0.32
451	0.33
452	0.32
453	0.32
454	0.28
455	0.27
456	0.23
457	0.2
458	0.21
459	0.21
460	0.21
461	0.18
462	0.19
463	0.17
464	0.18
465	0.19
466	0.19
467	0.19
468	0.18
469	0.16
470	0.14
471	0.13
472	0.13
473	0.12
474	0.12
475	0.09
476	0.1
477	0.11
478	0.11
479	0.1
480	0.11
481	0.12
482	0.13
483	0.16
484	0.15
485	0.16
486	0.18
487	0.2
488	0.22
489	0.23
490	0.21
491	0.21
492	0.26
493	0.3
494	0.31
495	0.32
496	0.37
497	0.35
498	0.36
499	0.36
500	0.32
501	0.29
502	0.3
503	0.29
504	0.22
505	0.22
506	0.2
507	0.18
508	0.19
509	0.17
510	0.13
511	0.12
512	0.15
513	0.17
514	0.22
515	0.23
516	0.23
517	0.24
518	0.25
519	0.26
520	0.24
521	0.21
522	0.16
523	0.15
524	0.15
525	0.14
526	0.13
527	0.1
528	0.09
529	0.08
530	0.08
531	0.08
532	0.08
533	0.07
534	0.07
535	0.08
536	0.08
537	0.09
538	0.07

C6HA79

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer