Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HSD5

Protein Details
Accession C6HSD5    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
208-233LQKRQAPPATDKRRRKRKCSGSTSEPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
217-225TDKRRRKRK
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
IPR001005  SANT/Myb  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50090  MYB_LIKE  
Amino Acid Sequences MSSICRTCVKDDMTMSDTDSLSTHSNSMNDNYCASSKEDDPTELLPKQHRLSTQLFHAVSCCPLSQTPRAAAADHEDIERKDSKLQTMAAKDYSAAPCLWNTDHGPETYSHSRALMLSSAVAQFVFEMVTSCLTTAPGFTDEVLTTADTKRDYSEQTVDDLDEKRCCWMQEEDDHLMALRRVGFSWPEIVGRFPQRRLRSLQQRWYILQKRQAPPATDKRRRKRKCSGSTSEPLPTSKPPKPLETPHPYHSRQLQAADDPATPRTEPSTPSLSSTVTAMCPGCGCVVDMKASSAFSAANTRMRVREQLQFCENHQRETAQHKYQYKSVLHKKVQKHGRKILSQNVLHGTGYYGLRGHAILSQHVVRHFACDIDTLAGLDSVVSKYSTVVYTQEILVPELLEMLVREDMGVDAERARRILGESNEIGDLLNSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.36
3 0.32
4 0.29
5 0.24
6 0.22
7 0.18
8 0.18
9 0.18
10 0.18
11 0.16
12 0.18
13 0.2
14 0.25
15 0.27
16 0.26
17 0.26
18 0.27
19 0.26
20 0.26
21 0.26
22 0.25
23 0.22
24 0.26
25 0.26
26 0.25
27 0.27
28 0.28
29 0.31
30 0.31
31 0.33
32 0.33
33 0.38
34 0.39
35 0.41
36 0.4
37 0.4
38 0.42
39 0.42
40 0.43
41 0.44
42 0.42
43 0.37
44 0.37
45 0.32
46 0.28
47 0.26
48 0.2
49 0.14
50 0.17
51 0.21
52 0.26
53 0.29
54 0.3
55 0.34
56 0.34
57 0.32
58 0.31
59 0.31
60 0.29
61 0.26
62 0.25
63 0.22
64 0.21
65 0.25
66 0.27
67 0.22
68 0.25
69 0.26
70 0.28
71 0.29
72 0.32
73 0.35
74 0.36
75 0.38
76 0.33
77 0.31
78 0.29
79 0.3
80 0.27
81 0.22
82 0.19
83 0.16
84 0.15
85 0.18
86 0.18
87 0.16
88 0.16
89 0.19
90 0.2
91 0.2
92 0.21
93 0.19
94 0.26
95 0.27
96 0.27
97 0.23
98 0.22
99 0.22
100 0.21
101 0.21
102 0.15
103 0.11
104 0.09
105 0.1
106 0.1
107 0.09
108 0.09
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.04
114 0.05
115 0.05
116 0.06
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.1
128 0.09
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.1
134 0.12
135 0.11
136 0.11
137 0.12
138 0.14
139 0.16
140 0.18
141 0.21
142 0.2
143 0.21
144 0.21
145 0.2
146 0.2
147 0.21
148 0.19
149 0.16
150 0.16
151 0.16
152 0.17
153 0.17
154 0.17
155 0.18
156 0.2
157 0.23
158 0.29
159 0.3
160 0.28
161 0.28
162 0.24
163 0.22
164 0.18
165 0.14
166 0.09
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.14
178 0.2
179 0.22
180 0.24
181 0.31
182 0.33
183 0.36
184 0.41
185 0.47
186 0.51
187 0.57
188 0.61
189 0.6
190 0.6
191 0.58
192 0.61
193 0.58
194 0.51
195 0.51
196 0.51
197 0.47
198 0.52
199 0.54
200 0.47
201 0.48
202 0.54
203 0.57
204 0.59
205 0.66
206 0.69
207 0.77
208 0.81
209 0.83
210 0.83
211 0.83
212 0.84
213 0.84
214 0.81
215 0.77
216 0.75
217 0.7
218 0.62
219 0.52
220 0.42
221 0.35
222 0.31
223 0.3
224 0.3
225 0.35
226 0.34
227 0.37
228 0.41
229 0.45
230 0.5
231 0.52
232 0.53
233 0.51
234 0.56
235 0.53
236 0.52
237 0.51
238 0.46
239 0.39
240 0.36
241 0.32
242 0.25
243 0.26
244 0.24
245 0.2
246 0.17
247 0.16
248 0.15
249 0.13
250 0.13
251 0.14
252 0.13
253 0.14
254 0.17
255 0.21
256 0.2
257 0.23
258 0.23
259 0.21
260 0.19
261 0.18
262 0.15
263 0.11
264 0.12
265 0.1
266 0.09
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.09
281 0.08
282 0.07
283 0.11
284 0.12
285 0.16
286 0.18
287 0.2
288 0.21
289 0.23
290 0.27
291 0.26
292 0.33
293 0.32
294 0.36
295 0.38
296 0.38
297 0.38
298 0.45
299 0.42
300 0.37
301 0.34
302 0.3
303 0.3
304 0.36
305 0.41
306 0.37
307 0.43
308 0.47
309 0.49
310 0.51
311 0.55
312 0.51
313 0.54
314 0.57
315 0.6
316 0.62
317 0.67
318 0.7
319 0.73
320 0.78
321 0.77
322 0.77
323 0.76
324 0.77
325 0.77
326 0.76
327 0.76
328 0.75
329 0.66
330 0.61
331 0.55
332 0.48
333 0.4
334 0.34
335 0.25
336 0.2
337 0.19
338 0.16
339 0.12
340 0.11
341 0.12
342 0.12
343 0.11
344 0.1
345 0.11
346 0.12
347 0.15
348 0.18
349 0.19
350 0.2
351 0.23
352 0.2
353 0.22
354 0.21
355 0.18
356 0.16
357 0.15
358 0.16
359 0.14
360 0.14
361 0.11
362 0.11
363 0.1
364 0.09
365 0.08
366 0.08
367 0.07
368 0.08
369 0.08
370 0.07
371 0.08
372 0.11
373 0.11
374 0.11
375 0.12
376 0.14
377 0.16
378 0.16
379 0.19
380 0.18
381 0.18
382 0.17
383 0.15
384 0.13
385 0.11
386 0.1
387 0.08
388 0.07
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.1
396 0.1
397 0.09
398 0.12
399 0.16
400 0.18
401 0.18
402 0.18
403 0.17
404 0.19
405 0.26
406 0.26
407 0.3
408 0.3
409 0.32
410 0.32
411 0.3
412 0.27