FuNGI

B5RTC3

Protein Details

Accession

B5RTC3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
75-97	SHLLASHKSKQKKRASGDSPPFL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005378 Vps35 IPR042491 Vps35_C
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0030906 C:retromer, cargo-selective complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
KEGG	dha:DEHA2C15312g -
Pfam	View protein in Pfam PF03635 Vps35

Amino Acid Sequences

MAVVASEQQALLQGCLNNIGHQSHLMKQCLNEGNLLQALKHCSNFLNELRINQLSPKQYYEMYVVIFDALETLSSHLLASHKSKQKKRASGDSPPFLADLYELVQYSGNIIPRLYMMIVVGTTYMSTDGAPKKELMKEMIEMCRGVQHPIRGLFLRYYLSQRTKDLLPLSNDNDLNETVEFLISNFIEMNKLWVRLQHQGHSSERELRFRERKELKILVGSNLVRLSQIIDDYTGDDEYSSIDYYKEKIFPVITEHIIQCRDPLAQSYLIDVLIQIFPDNFHFVTLDKLLSGVFINLHPMLKKSELVSSLIERFITYRKYENDLDSKVENLDLNDKAQSNNLPLSDVFDIFWAFYLKLFETDPELPPEEHSTMLQSFIQLSLAYDSQNFENLNQIYKFASEQLSNDNETQEDQQLWLNLLTSPLQHFPSVKSLLSLSYFYEFYSKLSNIQYKKSLALEVLTKVLTPTDVENNIFDTYSTVDEIDMIFKYLLILIKDTDSQKNTAKDLGVTKAIKIDGGEKSISHEFLRVQENLGKVVHLIENNDYFKNISNLMYIRKKYLSRNPDNILYTYPALISKILNQLRIIGLVNLRKSKADSNKDLLITTNFKNLSVIIDELYSHHQQFNSEVVLKLYLNAAAVADQLKQESIAYELFTQCFIVYEENVIFNSTINHSHNPHDSIGGSLPFESINMIANKLANSRYFNKENYENLITKLTLYGSKLLKKHAQCRAVYYCAHLWWWCDLFVEGSSPTVEVNPQDEQAALYRDPKRVLECLQKALRVADSCMDPYLSLKLFVEILNRCLIFNIYGNHLIDSRYINGLIDLIRTNLENFRDDNASKDDDDHESRLFNQIQAYFHRTLHYIEEQKYSEDRFQDIIV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.2
3	0.21
4	0.19
5	0.21
6	0.21
7	0.19
8	0.23
9	0.25
10	0.29
11	0.35
12	0.36
13	0.35
14	0.35
15	0.43
16	0.44
17	0.43
18	0.38
19	0.31
20	0.32
21	0.33
22	0.32
23	0.24
24	0.21
25	0.27
26	0.27
27	0.28
28	0.25
29	0.24
30	0.27
31	0.33
32	0.33
33	0.35
34	0.34
35	0.35
36	0.39
37	0.39
38	0.36
39	0.34
40	0.37
41	0.34
42	0.36
43	0.37
44	0.34
45	0.34
46	0.35
47	0.34
48	0.29
49	0.24
50	0.22
51	0.18
52	0.16
53	0.15
54	0.12
55	0.09
56	0.07
57	0.06
58	0.06
59	0.07
60	0.08
61	0.08
62	0.08
63	0.09
64	0.11
65	0.14
66	0.2
67	0.28
68	0.36
69	0.46
70	0.54
71	0.62
72	0.71
73	0.77
74	0.79
75	0.8
76	0.8
77	0.81
78	0.83
79	0.79
80	0.71
81	0.62
82	0.54
83	0.43
84	0.35
85	0.24
86	0.16
87	0.11
88	0.11
89	0.1
90	0.1
91	0.11
92	0.1
93	0.13
94	0.14
95	0.16
96	0.15
97	0.14
98	0.14
99	0.14
100	0.16
101	0.13
102	0.11
103	0.08
104	0.08
105	0.08
106	0.08
107	0.07
108	0.06
109	0.05
110	0.05
111	0.06
112	0.05
113	0.06
114	0.12
115	0.17
116	0.19
117	0.21
118	0.22
119	0.26
120	0.3
121	0.33
122	0.3
123	0.28
124	0.29
125	0.33
126	0.36
127	0.33
128	0.29
129	0.26
130	0.29
131	0.27
132	0.27
133	0.25
134	0.24
135	0.29
136	0.3
137	0.34
138	0.29
139	0.31
140	0.28
141	0.26
142	0.25
143	0.22
144	0.25
145	0.29
146	0.34
147	0.34
148	0.35
149	0.37
150	0.36
151	0.39
152	0.39
153	0.37
154	0.35
155	0.38
156	0.39
157	0.42
158	0.41
159	0.36
160	0.34
161	0.28
162	0.25
163	0.19
164	0.17
165	0.11
166	0.1
167	0.1
168	0.07
169	0.1
170	0.08
171	0.08
172	0.08
173	0.08
174	0.09
175	0.09
176	0.14
177	0.14
178	0.16
179	0.16
180	0.19
181	0.23
182	0.3
183	0.34
184	0.34
185	0.36
186	0.39
187	0.42
188	0.43
189	0.43
190	0.43
191	0.43
192	0.43
193	0.43
194	0.47
195	0.52
196	0.5
197	0.58
198	0.56
199	0.58
200	0.59
201	0.6
202	0.53
203	0.52
204	0.5
205	0.41
206	0.41
207	0.36
208	0.3
209	0.26
210	0.24
211	0.17
212	0.16
213	0.15
214	0.1
215	0.1
216	0.08
217	0.08
218	0.09
219	0.1
220	0.11
221	0.09
222	0.08
223	0.08
224	0.07
225	0.07
226	0.08
227	0.08
228	0.07
229	0.07
230	0.08
231	0.11
232	0.14
233	0.15
234	0.14
235	0.16
236	0.16
237	0.16
238	0.21
239	0.23
240	0.22
241	0.22
242	0.23
243	0.24
244	0.24
245	0.24
246	0.18
247	0.16
248	0.15
249	0.13
250	0.14
251	0.14
252	0.15
253	0.15
254	0.16
255	0.15
256	0.14
257	0.13
258	0.11
259	0.09
260	0.08
261	0.08
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.08
266	0.1
267	0.08
268	0.08
269	0.09
270	0.09
271	0.12
272	0.12
273	0.11
274	0.08
275	0.09
276	0.08
277	0.08
278	0.08
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.08
283	0.09
284	0.1
285	0.1
286	0.11
287	0.13
288	0.14
289	0.15
290	0.14
291	0.16
292	0.17
293	0.18
294	0.19
295	0.19
296	0.19
297	0.18
298	0.17
299	0.14
300	0.13
301	0.15
302	0.16
303	0.15
304	0.19
305	0.21
306	0.26
307	0.28
308	0.31
309	0.34
310	0.33
311	0.34
312	0.29
313	0.27
314	0.22
315	0.21
316	0.17
317	0.12
318	0.14
319	0.12
320	0.12
321	0.14
322	0.14
323	0.13
324	0.15
325	0.15
326	0.13
327	0.14
328	0.14
329	0.13
330	0.12
331	0.15
332	0.14
333	0.14
334	0.11
335	0.1
336	0.1
337	0.09
338	0.09
339	0.07
340	0.06
341	0.07
342	0.08
343	0.08
344	0.09
345	0.09
346	0.09
347	0.12
348	0.14
349	0.15
350	0.16
351	0.17
352	0.16
353	0.17
354	0.2
355	0.17
356	0.15
357	0.14
358	0.14
359	0.12
360	0.13
361	0.12
362	0.09
363	0.08
364	0.08
365	0.08
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.08
373	0.07
374	0.1
375	0.1
376	0.08
377	0.13
378	0.13
379	0.16
380	0.15
381	0.16
382	0.14
383	0.14
384	0.14
385	0.1
386	0.12
387	0.09
388	0.1
389	0.13
390	0.15
391	0.16
392	0.16
393	0.15
394	0.13
395	0.14
396	0.14
397	0.11
398	0.1
399	0.09
400	0.09
401	0.09
402	0.1
403	0.09
404	0.08
405	0.07
406	0.07
407	0.07
408	0.07
409	0.08
410	0.09
411	0.1
412	0.1
413	0.11
414	0.11
415	0.16
416	0.18
417	0.16
418	0.15
419	0.14
420	0.14
421	0.15
422	0.14
423	0.1
424	0.09
425	0.1
426	0.09
427	0.1
428	0.1
429	0.09
430	0.12
431	0.11
432	0.12
433	0.16
434	0.21
435	0.22
436	0.24
437	0.27
438	0.25
439	0.26
440	0.24
441	0.22
442	0.16
443	0.15
444	0.14
445	0.12
446	0.12
447	0.1
448	0.09
449	0.08
450	0.08
451	0.07
452	0.06
453	0.07
454	0.09
455	0.1
456	0.11
457	0.11
458	0.13
459	0.13
460	0.12
461	0.11
462	0.08
463	0.08
464	0.08
465	0.08
466	0.06
467	0.06
468	0.06
469	0.06
470	0.07
471	0.06
472	0.06
473	0.05
474	0.05
475	0.05
476	0.06
477	0.08
478	0.07
479	0.08
480	0.07
481	0.08
482	0.11
483	0.14
484	0.16
485	0.16
486	0.18
487	0.22
488	0.24
489	0.24
490	0.23
491	0.21
492	0.2
493	0.21
494	0.2
495	0.21
496	0.19
497	0.19
498	0.19
499	0.19
500	0.17
501	0.15
502	0.17
503	0.13
504	0.14
505	0.15
506	0.12
507	0.16
508	0.17
509	0.18
510	0.14
511	0.14
512	0.13
513	0.16
514	0.2
515	0.16
516	0.17
517	0.18
518	0.19
519	0.19
520	0.18
521	0.14
522	0.11
523	0.12
524	0.12
525	0.1
526	0.11
527	0.11
528	0.15
529	0.17
530	0.17
531	0.16
532	0.15
533	0.15
534	0.16
535	0.15
536	0.11
537	0.11
538	0.13
539	0.19
540	0.25
541	0.25
542	0.26
543	0.29
544	0.32
545	0.36
546	0.44
547	0.48
548	0.5
549	0.56
550	0.56
551	0.58
552	0.57
553	0.51
554	0.43
555	0.35
556	0.27
557	0.21
558	0.18
559	0.12
560	0.11
561	0.11
562	0.09
563	0.11
564	0.19
565	0.2
566	0.21
567	0.21
568	0.22
569	0.21
570	0.22
571	0.19
572	0.12
573	0.14
574	0.16
575	0.2
576	0.21
577	0.21
578	0.21
579	0.22
580	0.28
581	0.34
582	0.38
583	0.41
584	0.43
585	0.47
586	0.47
587	0.45
588	0.39
589	0.33
590	0.29
591	0.25
592	0.26
593	0.22
594	0.21
595	0.21
596	0.2
597	0.18
598	0.15
599	0.14
600	0.09
601	0.09
602	0.09
603	0.1
604	0.15
605	0.15
606	0.15
607	0.16
608	0.16
609	0.16
610	0.18
611	0.19
612	0.17
613	0.17
614	0.16
615	0.15
616	0.16
617	0.16
618	0.14
619	0.13
620	0.1
621	0.08
622	0.08
623	0.07
624	0.06
625	0.07
626	0.07
627	0.07
628	0.07
629	0.07
630	0.07
631	0.07
632	0.07
633	0.07
634	0.08
635	0.08
636	0.09
637	0.1
638	0.11
639	0.12
640	0.12
641	0.12
642	0.1
643	0.1
644	0.1
645	0.09
646	0.09
647	0.11
648	0.11
649	0.12
650	0.12
651	0.12
652	0.11
653	0.1
654	0.11
655	0.11
656	0.14
657	0.17
658	0.2
659	0.22
660	0.25
661	0.29
662	0.31
663	0.29
664	0.27
665	0.24
666	0.22
667	0.22
668	0.19
669	0.15
670	0.12
671	0.12
672	0.1
673	0.1
674	0.09
675	0.07
676	0.1
677	0.1
678	0.11
679	0.11
680	0.13
681	0.14
682	0.15
683	0.17
684	0.16
685	0.21
686	0.25
687	0.32
688	0.35
689	0.36
690	0.4
691	0.43
692	0.43
693	0.44
694	0.44
695	0.38
696	0.36
697	0.36
698	0.3
699	0.25
700	0.24
701	0.18
702	0.15
703	0.16
704	0.2
705	0.22
706	0.28
707	0.3
708	0.35
709	0.41
710	0.46
711	0.54
712	0.56
713	0.59
714	0.55
715	0.6
716	0.61
717	0.57
718	0.51
719	0.47
720	0.41
721	0.34
722	0.35
723	0.28
724	0.24
725	0.24
726	0.25
727	0.2
728	0.18
729	0.17
730	0.16
731	0.16
732	0.16
733	0.12
734	0.11
735	0.11
736	0.11
737	0.1
738	0.09
739	0.1
740	0.09
741	0.13
742	0.13
743	0.14
744	0.14
745	0.14
746	0.14
747	0.16
748	0.19
749	0.16
750	0.23
751	0.27
752	0.3
753	0.32
754	0.34
755	0.35
756	0.35
757	0.41
758	0.43
759	0.43
760	0.49
761	0.5
762	0.49
763	0.47
764	0.45
765	0.43
766	0.34
767	0.31
768	0.26
769	0.24
770	0.24
771	0.23
772	0.21
773	0.17
774	0.17
775	0.2
776	0.17
777	0.16
778	0.15
779	0.15
780	0.16
781	0.17
782	0.22
783	0.19
784	0.21
785	0.24
786	0.24
787	0.23
788	0.23
789	0.23
790	0.18
791	0.2
792	0.21
793	0.2
794	0.24
795	0.25
796	0.25
797	0.25
798	0.24
799	0.22
800	0.23
801	0.2
802	0.18
803	0.18
804	0.16
805	0.16
806	0.17
807	0.15
808	0.14
809	0.13
810	0.12
811	0.12
812	0.13
813	0.15
814	0.18
815	0.2
816	0.2
817	0.21
818	0.23
819	0.28
820	0.28
821	0.3
822	0.3
823	0.31
824	0.29
825	0.3
826	0.3
827	0.3
828	0.34
829	0.33
830	0.3
831	0.28
832	0.29
833	0.34
834	0.32
835	0.27
836	0.28
837	0.28
838	0.3
839	0.34
840	0.4
841	0.35
842	0.35
843	0.36
844	0.32
845	0.31
846	0.34
847	0.37
848	0.38
849	0.38
850	0.44
851	0.43
852	0.45
853	0.47
854	0.45
855	0.41
856	0.36
857	0.36

B5RTC3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer