Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HNU8

Protein Details
Accession C6HNU8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
363-392LPENVHTKKHRSKDGAHREKRRKDRGFKPYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
369-391TKKHRSKDGAHREKRRKDRGFKP
Subcellular Location(s) cyto_mito 10.333, cyto 10, mito 9.5, cyto_nucl 8.833, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR039328  WDR89  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MASPSQYRLLHGKGQSSLSLPAGSYIYSLCQSGIDALAAISSDNSLRRFDRETLKVLPNGVFANIHPGNGGGVTCVCEVDPVVAEGKTLVATSGRDGTVKLWDARDKRRDAVLTATSAKAAPITALTCGPGPCTIVAGTEFVASQSSVICWDIRSPGQPCLQYVESHNDDITELQFHHTRHNVLLSGSTDGLVNIYDTTISDEGEALLQVVNHGSIHRAGFLAEHAIYALSHDEVFSIHPFNNPDENAVEPAAIQFGDLRPVLQSDYVAQVLHGRGGAFVVSGKTSEQRLDLTPLVSSPKFDLDIGGTWRIPDAHGEEIVRSVFLDDNSNTIFTCGEDGYVRSWKLEEGRQEELSKPSIKRTLPENVHTKKHRSKDGAHREKRRKDRGFKPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.39
3 0.36
4 0.34
5 0.28
6 0.25
7 0.2
8 0.18
9 0.17
10 0.15
11 0.13
12 0.11
13 0.11
14 0.11
15 0.12
16 0.1
17 0.1
18 0.1
19 0.11
20 0.11
21 0.09
22 0.08
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.06
27 0.05
28 0.05
29 0.07
30 0.1
31 0.12
32 0.15
33 0.17
34 0.21
35 0.26
36 0.31
37 0.38
38 0.39
39 0.43
40 0.47
41 0.5
42 0.48
43 0.46
44 0.41
45 0.34
46 0.31
47 0.26
48 0.2
49 0.15
50 0.22
51 0.2
52 0.19
53 0.16
54 0.16
55 0.15
56 0.15
57 0.15
58 0.06
59 0.06
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.09
67 0.09
68 0.07
69 0.09
70 0.08
71 0.09
72 0.08
73 0.09
74 0.08
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.07
79 0.09
80 0.12
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.13
85 0.17
86 0.2
87 0.2
88 0.2
89 0.27
90 0.32
91 0.41
92 0.48
93 0.47
94 0.46
95 0.49
96 0.48
97 0.43
98 0.43
99 0.36
100 0.32
101 0.3
102 0.28
103 0.23
104 0.22
105 0.2
106 0.13
107 0.11
108 0.07
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.09
118 0.1
119 0.09
120 0.1
121 0.09
122 0.08
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.06
129 0.07
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.1
140 0.11
141 0.15
142 0.16
143 0.2
144 0.24
145 0.24
146 0.23
147 0.26
148 0.26
149 0.23
150 0.23
151 0.25
152 0.23
153 0.23
154 0.22
155 0.17
156 0.16
157 0.16
158 0.14
159 0.08
160 0.07
161 0.08
162 0.12
163 0.12
164 0.16
165 0.17
166 0.18
167 0.18
168 0.19
169 0.17
170 0.14
171 0.16
172 0.13
173 0.12
174 0.11
175 0.1
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.05
181 0.04
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.08
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.1
227 0.12
228 0.14
229 0.17
230 0.16
231 0.17
232 0.16
233 0.17
234 0.16
235 0.15
236 0.12
237 0.09
238 0.09
239 0.08
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.07
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.09
257 0.11
258 0.11
259 0.12
260 0.11
261 0.09
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.09
272 0.1
273 0.11
274 0.12
275 0.13
276 0.15
277 0.19
278 0.2
279 0.18
280 0.17
281 0.17
282 0.21
283 0.19
284 0.18
285 0.15
286 0.16
287 0.16
288 0.16
289 0.16
290 0.13
291 0.17
292 0.19
293 0.21
294 0.18
295 0.17
296 0.18
297 0.17
298 0.15
299 0.14
300 0.14
301 0.14
302 0.16
303 0.16
304 0.16
305 0.17
306 0.17
307 0.14
308 0.11
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.15
313 0.13
314 0.16
315 0.17
316 0.17
317 0.16
318 0.15
319 0.14
320 0.1
321 0.12
322 0.09
323 0.09
324 0.1
325 0.11
326 0.15
327 0.2
328 0.2
329 0.18
330 0.19
331 0.21
332 0.25
333 0.29
334 0.33
335 0.34
336 0.39
337 0.42
338 0.43
339 0.43
340 0.42
341 0.42
342 0.4
343 0.36
344 0.38
345 0.42
346 0.41
347 0.41
348 0.43
349 0.49
350 0.49
351 0.55
352 0.59
353 0.58
354 0.66
355 0.69
356 0.73
357 0.72
358 0.74
359 0.76
360 0.73
361 0.76
362 0.78
363 0.83
364 0.84
365 0.85
366 0.88
367 0.89
368 0.92
369 0.93
370 0.93
371 0.92
372 0.91