Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HIM0

Protein Details
Accession C6HIM0    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
524-544SPPFSSKQKANGERRKRQVTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
210-235PAAKAAKPKANSKKGRALARAARKRK
356-399RKREAERIAALKELEKQKKIEKERLYRMMTREQRLKDREEKRKL
533-541ANGERRKRQ
550-553KKSK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028938  Rsf1-like  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0031213  C:RSF complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15556  PHD_MMD1_like  
Amino Acid Sequences MVSRKRAREEAEEDDPSVRVVIKRNEPLPSSSPQDGVEHGLLHQLRNMWEFSNLIQFIYSFGKAVKISEDIDIDELESECLKPGPSEKLLDIGLTLLKFVSSHRGLTYENFEDYTRRQYLAKAPSRNPFGDAEEPIKFHDLDLFQRIRVLQQLSVWTFWNPDRIRERMPESKETDQIQWRVDEIGYDRDERLYYVLDDNRLYRRTDPPIPAAKAAKPKANSKKGRALARAARKRKLSGLQEEDDEEPKNDANGDVKHDSAGGYKWECIAITLAQYNAFLDTIRRSKDPNEEFLRDQLVENVIPVIEKAEESHRRKMERREKELLSMQLMANAKRSSRIASKQERERQEMEAAEEARKREAERIAALKELEKQKKIEKERLYRMMTREQRLKDREEKRKLHEGELTKIAEEAKKIESGESRMSERHLKAEMEKRKKDIEALQNEEQWTFDCSGCGVHGENLDDGSHIVACEKCNVWQHIKCLGIPQDEAEKDNFHFICRDCQRRIEEANLPKIPPLKFRVGASSSPPFSSKQKANGERRKRQVTSASPSFKKSKRPSTAPSQPPVTLSPLANGHPPPTFQQGHHLPTPQSNLQPGQPTLPPSPQRPLSQSKQNGFYHLLPVPQPVLNHQPQSISSSLSPSPLPPPNNMLSNGLPPPKVQLLGPAPQFLHYQPPGLYPNPNTSSFISQRPSSSPSTQGDASRFLSPIQNRPTMSPTQGNRDVGPLAGFPPSSTLLDT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.42
3 0.33
4 0.27
5 0.22
6 0.17
7 0.22
8 0.29
9 0.37
10 0.44
11 0.48
12 0.52
13 0.53
14 0.55
15 0.52
16 0.49
17 0.46
18 0.41
19 0.39
20 0.35
21 0.34
22 0.3
23 0.3
24 0.27
25 0.21
26 0.19
27 0.24
28 0.23
29 0.22
30 0.23
31 0.21
32 0.22
33 0.23
34 0.25
35 0.19
36 0.2
37 0.2
38 0.19
39 0.25
40 0.23
41 0.21
42 0.19
43 0.18
44 0.19
45 0.22
46 0.21
47 0.13
48 0.13
49 0.17
50 0.17
51 0.18
52 0.18
53 0.17
54 0.18
55 0.2
56 0.21
57 0.17
58 0.18
59 0.17
60 0.15
61 0.13
62 0.12
63 0.11
64 0.1
65 0.09
66 0.09
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.14
71 0.2
72 0.23
73 0.26
74 0.25
75 0.28
76 0.27
77 0.26
78 0.22
79 0.16
80 0.16
81 0.12
82 0.12
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.09
87 0.16
88 0.16
89 0.18
90 0.18
91 0.21
92 0.22
93 0.26
94 0.31
95 0.26
96 0.25
97 0.25
98 0.24
99 0.25
100 0.26
101 0.31
102 0.26
103 0.24
104 0.24
105 0.27
106 0.35
107 0.42
108 0.48
109 0.49
110 0.52
111 0.59
112 0.64
113 0.61
114 0.55
115 0.47
116 0.43
117 0.4
118 0.37
119 0.34
120 0.3
121 0.29
122 0.28
123 0.28
124 0.23
125 0.18
126 0.21
127 0.18
128 0.2
129 0.27
130 0.27
131 0.24
132 0.27
133 0.27
134 0.23
135 0.26
136 0.24
137 0.18
138 0.19
139 0.26
140 0.25
141 0.26
142 0.26
143 0.21
144 0.22
145 0.22
146 0.28
147 0.23
148 0.29
149 0.33
150 0.36
151 0.39
152 0.42
153 0.48
154 0.47
155 0.52
156 0.52
157 0.53
158 0.53
159 0.54
160 0.51
161 0.5
162 0.48
163 0.46
164 0.4
165 0.35
166 0.31
167 0.28
168 0.25
169 0.21
170 0.16
171 0.19
172 0.19
173 0.2
174 0.19
175 0.19
176 0.2
177 0.18
178 0.17
179 0.13
180 0.13
181 0.16
182 0.18
183 0.19
184 0.2
185 0.22
186 0.26
187 0.27
188 0.27
189 0.25
190 0.29
191 0.34
192 0.39
193 0.41
194 0.43
195 0.49
196 0.49
197 0.5
198 0.47
199 0.45
200 0.47
201 0.46
202 0.45
203 0.4
204 0.47
205 0.54
206 0.61
207 0.64
208 0.62
209 0.68
210 0.69
211 0.73
212 0.67
213 0.64
214 0.63
215 0.66
216 0.7
217 0.67
218 0.66
219 0.62
220 0.61
221 0.59
222 0.59
223 0.55
224 0.54
225 0.54
226 0.49
227 0.47
228 0.46
229 0.42
230 0.36
231 0.3
232 0.21
233 0.15
234 0.14
235 0.13
236 0.11
237 0.1
238 0.12
239 0.12
240 0.17
241 0.17
242 0.17
243 0.17
244 0.17
245 0.16
246 0.14
247 0.14
248 0.12
249 0.11
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.12
254 0.11
255 0.11
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.1
268 0.14
269 0.16
270 0.17
271 0.18
272 0.22
273 0.31
274 0.33
275 0.37
276 0.39
277 0.4
278 0.4
279 0.4
280 0.39
281 0.3
282 0.27
283 0.2
284 0.16
285 0.12
286 0.11
287 0.1
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.04
293 0.04
294 0.05
295 0.13
296 0.23
297 0.27
298 0.35
299 0.38
300 0.43
301 0.48
302 0.58
303 0.61
304 0.61
305 0.65
306 0.64
307 0.61
308 0.61
309 0.6
310 0.51
311 0.43
312 0.34
313 0.26
314 0.24
315 0.24
316 0.19
317 0.19
318 0.17
319 0.16
320 0.15
321 0.16
322 0.15
323 0.19
324 0.26
325 0.31
326 0.4
327 0.47
328 0.54
329 0.61
330 0.63
331 0.62
332 0.57
333 0.51
334 0.45
335 0.38
336 0.3
337 0.26
338 0.22
339 0.2
340 0.19
341 0.17
342 0.15
343 0.15
344 0.15
345 0.15
346 0.16
347 0.16
348 0.17
349 0.2
350 0.19
351 0.2
352 0.19
353 0.16
354 0.2
355 0.26
356 0.27
357 0.26
358 0.27
359 0.31
360 0.39
361 0.44
362 0.47
363 0.47
364 0.52
365 0.58
366 0.64
367 0.62
368 0.58
369 0.56
370 0.57
371 0.54
372 0.5
373 0.5
374 0.44
375 0.48
376 0.48
377 0.5
378 0.5
379 0.54
380 0.6
381 0.63
382 0.65
383 0.63
384 0.7
385 0.67
386 0.6
387 0.57
388 0.49
389 0.43
390 0.43
391 0.37
392 0.27
393 0.26
394 0.24
395 0.18
396 0.15
397 0.14
398 0.1
399 0.11
400 0.12
401 0.13
402 0.13
403 0.15
404 0.18
405 0.18
406 0.18
407 0.18
408 0.2
409 0.25
410 0.24
411 0.23
412 0.22
413 0.21
414 0.26
415 0.34
416 0.42
417 0.45
418 0.47
419 0.47
420 0.48
421 0.47
422 0.46
423 0.44
424 0.44
425 0.42
426 0.46
427 0.45
428 0.44
429 0.44
430 0.4
431 0.33
432 0.24
433 0.18
434 0.13
435 0.11
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.09
441 0.08
442 0.08
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.1
447 0.09
448 0.08
449 0.08
450 0.07
451 0.06
452 0.05
453 0.06
454 0.07
455 0.07
456 0.09
457 0.1
458 0.13
459 0.18
460 0.22
461 0.27
462 0.3
463 0.33
464 0.36
465 0.37
466 0.34
467 0.34
468 0.34
469 0.29
470 0.26
471 0.24
472 0.24
473 0.23
474 0.25
475 0.21
476 0.18
477 0.17
478 0.23
479 0.21
480 0.16
481 0.19
482 0.18
483 0.27
484 0.32
485 0.39
486 0.35
487 0.41
488 0.44
489 0.46
490 0.48
491 0.44
492 0.45
493 0.44
494 0.51
495 0.47
496 0.43
497 0.4
498 0.42
499 0.38
500 0.35
501 0.34
502 0.32
503 0.32
504 0.33
505 0.38
506 0.36
507 0.36
508 0.36
509 0.37
510 0.32
511 0.31
512 0.31
513 0.27
514 0.27
515 0.32
516 0.31
517 0.35
518 0.44
519 0.52
520 0.62
521 0.7
522 0.77
523 0.8
524 0.84
525 0.84
526 0.76
527 0.72
528 0.7
529 0.67
530 0.66
531 0.66
532 0.65
533 0.58
534 0.61
535 0.63
536 0.58
537 0.6
538 0.6
539 0.62
540 0.63
541 0.68
542 0.69
543 0.72
544 0.78
545 0.75
546 0.72
547 0.65
548 0.57
549 0.52
550 0.48
551 0.42
552 0.34
553 0.27
554 0.24
555 0.23
556 0.23
557 0.25
558 0.23
559 0.21
560 0.19
561 0.2
562 0.21
563 0.25
564 0.27
565 0.23
566 0.32
567 0.36
568 0.39
569 0.41
570 0.42
571 0.36
572 0.38
573 0.43
574 0.38
575 0.34
576 0.33
577 0.31
578 0.31
579 0.35
580 0.32
581 0.29
582 0.28
583 0.31
584 0.3
585 0.37
586 0.37
587 0.36
588 0.43
589 0.45
590 0.46
591 0.48
592 0.52
593 0.51
594 0.57
595 0.62
596 0.6
597 0.63
598 0.6
599 0.58
600 0.55
601 0.49
602 0.44
603 0.37
604 0.35
605 0.27
606 0.28
607 0.26
608 0.23
609 0.22
610 0.21
611 0.28
612 0.3
613 0.32
614 0.3
615 0.3
616 0.29
617 0.33
618 0.3
619 0.25
620 0.2
621 0.22
622 0.22
623 0.22
624 0.21
625 0.19
626 0.25
627 0.28
628 0.3
629 0.28
630 0.34
631 0.35
632 0.39
633 0.39
634 0.36
635 0.31
636 0.34
637 0.37
638 0.35
639 0.31
640 0.28
641 0.31
642 0.29
643 0.28
644 0.23
645 0.26
646 0.28
647 0.34
648 0.35
649 0.34
650 0.32
651 0.32
652 0.34
653 0.27
654 0.31
655 0.25
656 0.26
657 0.24
658 0.28
659 0.31
660 0.31
661 0.36
662 0.3
663 0.38
664 0.39
665 0.41
666 0.39
667 0.38
668 0.44
669 0.42
670 0.45
671 0.4
672 0.38
673 0.4
674 0.4
675 0.42
676 0.4
677 0.4
678 0.4
679 0.39
680 0.41
681 0.42
682 0.42
683 0.4
684 0.39
685 0.38
686 0.34
687 0.31
688 0.27
689 0.32
690 0.32
691 0.38
692 0.41
693 0.44
694 0.42
695 0.46
696 0.49
697 0.46
698 0.48
699 0.47
700 0.45
701 0.48
702 0.54
703 0.53
704 0.48
705 0.46
706 0.41
707 0.34
708 0.31
709 0.22
710 0.17
711 0.17
712 0.16
713 0.13
714 0.16
715 0.17