FuNGI

C6H5A0

Protein Details

Accession

C6H5A0

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-51	GPPMKIRRLKVDPLVRPKKKRIPLSPGPGQGH	Basic
531-550	GTDTARKKPKNKHADVQVES	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-47	RPPPGPSGPPMKIRRLKVDPLVRPKKKRIPLSPGP
474-487	ERGKKEKGKESDKN
499-524	SGRLKHTDPLGKKAASRAARKRPGSP
535-542	ARKKPKNK
572-576	KKRGR

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto 4, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSSTPPNRPPVTRPPPGPSGPPMKIRRLKVDPLVRPKKKRIPLSPGPGQGHPGAGPVANGRVESPRPRPLQTAPRSQPSATQPKPAIPSADDLTVNGFSGPLLSKTYVDYPLVTTKRAWREGIKHHVAKFASKKNIDPRDESQFTRPVRLQRRDPRASNIGPASEKDDQPSRRHGELNEAEREELEAKKAAREKERADNLAQIAPSAAATQKKTNALKQRTQQVFKSEMNPEEIVKARIKYEEALPWHLDDFDNKGTWVGNYEAAMSETYAMFVLQNDGKMRMVPLDKWYKFTTKTPFKTLSIEEAEKFMAKKIKDPRWFMEKEQDRAQKKALEEYAKQSRLFTGRKEGHTRVSEGFEGDDLDFEEDRFADDEEHVGIFDEDEDAKTAEKRIKEDQLKANIFDLKDERMYDEEENQEKKEKEALKNFGKHVRKALQRREKNFDYSSGSDANPYSDESSDDSETEQLKEEKPEEERGKKEKGKESDKNSGISTKGTNTPSGRLKHTDPLGKKAASRAARKRPGSPNLSEASGTDTARKKPKNKHADVQVESRPMSPGPSGQRKPNVAADQASKKRGRNGPPGSGSDGERGAGSGAEMSDSAAAGTKKLKLNPPGVLSKMGTPRGSRPGSPRANSPVPPTRTSSPGLTTPVSTNLAFPTALEIHSAIPATGIASAELLKIFRPRIGDSKENHRKFIAIVRDVSIYGKEDKLLRPGVLKEGTG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.66
3	0.65
4	0.63
5	0.59
6	0.59
7	0.56
8	0.6
9	0.59
10	0.62
11	0.66
12	0.67
13	0.69
14	0.67
15	0.69
16	0.69
17	0.74
18	0.73
19	0.76
20	0.82
21	0.82
22	0.83
23	0.86
24	0.87
25	0.86
26	0.87
27	0.85
28	0.84
29	0.85
30	0.85
31	0.84
32	0.82
33	0.77
34	0.68
35	0.61
36	0.52
37	0.44
38	0.34
39	0.27
40	0.19
41	0.15
42	0.15
43	0.13
44	0.16
45	0.14
46	0.14
47	0.14
48	0.18
49	0.23
50	0.3
51	0.35
52	0.4
53	0.44
54	0.47
55	0.5
56	0.54
57	0.59
58	0.6
59	0.64
60	0.61
61	0.66
62	0.66
63	0.62
64	0.6
65	0.58
66	0.62
67	0.53
68	0.55
69	0.49
70	0.51
71	0.55
72	0.5
73	0.44
74	0.35
75	0.37
76	0.31
77	0.33
78	0.27
79	0.23
80	0.24
81	0.21
82	0.19
83	0.14
84	0.12
85	0.08
86	0.1
87	0.1
88	0.09
89	0.11
90	0.12
91	0.13
92	0.15
93	0.19
94	0.2
95	0.2
96	0.2
97	0.2
98	0.28
99	0.29
100	0.28
101	0.27
102	0.33
103	0.4
104	0.43
105	0.43
106	0.41
107	0.48
108	0.56
109	0.64
110	0.65
111	0.62
112	0.6
113	0.63
114	0.56
115	0.56
116	0.56
117	0.54
118	0.54
119	0.51
120	0.55
121	0.59
122	0.68
123	0.64
124	0.61
125	0.57
126	0.58
127	0.59
128	0.55
129	0.5
130	0.48
131	0.46
132	0.46
133	0.45
134	0.45
135	0.52
136	0.57
137	0.62
138	0.65
139	0.74
140	0.76
141	0.75
142	0.73
143	0.71
144	0.64
145	0.6
146	0.52
147	0.45
148	0.38
149	0.36
150	0.35
151	0.31
152	0.3
153	0.27
154	0.33
155	0.34
156	0.36
157	0.44
158	0.43
159	0.42
160	0.45
161	0.42
162	0.44
163	0.47
164	0.49
165	0.46
166	0.41
167	0.38
168	0.35
169	0.36
170	0.28
171	0.21
172	0.17
173	0.15
174	0.15
175	0.2
176	0.25
177	0.28
178	0.33
179	0.39
180	0.42
181	0.48
182	0.54
183	0.52
184	0.48
185	0.47
186	0.42
187	0.39
188	0.34
189	0.24
190	0.18
191	0.15
192	0.13
193	0.1
194	0.1
195	0.11
196	0.13
197	0.16
198	0.2
199	0.27
200	0.3
201	0.37
202	0.44
203	0.48
204	0.53
205	0.56
206	0.63
207	0.63
208	0.65
209	0.61
210	0.56
211	0.55
212	0.5
213	0.49
214	0.43
215	0.37
216	0.36
217	0.34
218	0.29
219	0.26
220	0.25
221	0.23
222	0.21
223	0.2
224	0.18
225	0.18
226	0.19
227	0.17
228	0.19
229	0.21
230	0.22
231	0.24
232	0.24
233	0.23
234	0.23
235	0.22
236	0.19
237	0.14
238	0.16
239	0.14
240	0.14
241	0.13
242	0.13
243	0.13
244	0.13
245	0.14
246	0.11
247	0.1
248	0.09
249	0.1
250	0.1
251	0.1
252	0.1
253	0.08
254	0.07
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.07
262	0.07
263	0.09
264	0.1
265	0.11
266	0.11
267	0.11
268	0.11
269	0.12
270	0.13
271	0.13
272	0.19
273	0.28
274	0.28
275	0.31
276	0.33
277	0.34
278	0.35
279	0.39
280	0.43
281	0.42
282	0.46
283	0.48
284	0.5
285	0.47
286	0.48
287	0.44
288	0.39
289	0.33
290	0.31
291	0.26
292	0.23
293	0.22
294	0.19
295	0.18
296	0.16
297	0.16
298	0.14
299	0.21
300	0.29
301	0.38
302	0.44
303	0.49
304	0.5
305	0.54
306	0.56
307	0.51
308	0.52
309	0.48
310	0.45
311	0.49
312	0.52
313	0.46
314	0.46
315	0.47
316	0.4
317	0.35
318	0.37
319	0.33
320	0.29
321	0.28
322	0.32
323	0.38
324	0.37
325	0.37
326	0.32
327	0.3
328	0.31
329	0.31
330	0.27
331	0.28
332	0.3
333	0.34
334	0.4
335	0.39
336	0.4
337	0.4
338	0.41
339	0.33
340	0.3
341	0.26
342	0.2
343	0.19
344	0.12
345	0.12
346	0.09
347	0.08
348	0.06
349	0.07
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.05
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.05
358	0.05
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.06
363	0.05
364	0.05
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.04
369	0.04
370	0.05
371	0.05
372	0.06
373	0.06
374	0.09
375	0.11
376	0.13
377	0.16
378	0.19
379	0.28
380	0.32
381	0.38
382	0.43
383	0.49
384	0.48
385	0.46
386	0.44
387	0.38
388	0.33
389	0.28
390	0.23
391	0.16
392	0.16
393	0.15
394	0.14
395	0.13
396	0.15
397	0.14
398	0.15
399	0.18
400	0.21
401	0.23
402	0.22
403	0.27
404	0.25
405	0.25
406	0.29
407	0.31
408	0.33
409	0.39
410	0.46
411	0.48
412	0.53
413	0.55
414	0.57
415	0.55
416	0.5
417	0.49
418	0.49
419	0.5
420	0.54
421	0.62
422	0.64
423	0.68
424	0.72
425	0.73
426	0.69
427	0.66
428	0.59
429	0.51
430	0.46
431	0.4
432	0.36
433	0.3
434	0.27
435	0.23
436	0.21
437	0.19
438	0.14
439	0.13
440	0.12
441	0.1
442	0.11
443	0.11
444	0.14
445	0.13
446	0.13
447	0.13
448	0.14
449	0.15
450	0.14
451	0.15
452	0.14
453	0.15
454	0.17
455	0.18
456	0.18
457	0.2
458	0.28
459	0.33
460	0.37
461	0.42
462	0.45
463	0.53
464	0.54
465	0.59
466	0.58
467	0.6
468	0.64
469	0.66
470	0.68
471	0.69
472	0.67
473	0.62
474	0.54
475	0.48
476	0.39
477	0.33
478	0.27
479	0.2
480	0.24
481	0.23
482	0.27
483	0.25
484	0.3
485	0.35
486	0.36
487	0.37
488	0.35
489	0.37
490	0.39
491	0.43
492	0.46
493	0.41
494	0.45
495	0.46
496	0.43
497	0.41
498	0.39
499	0.41
500	0.4
501	0.47
502	0.5
503	0.55
504	0.63
505	0.65
506	0.69
507	0.71
508	0.72
509	0.69
510	0.62
511	0.57
512	0.5
513	0.48
514	0.4
515	0.31
516	0.28
517	0.24
518	0.22
519	0.23
520	0.25
521	0.29
522	0.38
523	0.45
524	0.48
525	0.56
526	0.66
527	0.71
528	0.74
529	0.77
530	0.78
531	0.81
532	0.76
533	0.73
534	0.67
535	0.6
536	0.53
537	0.45
538	0.36
539	0.27
540	0.25
541	0.19
542	0.2
543	0.25
544	0.34
545	0.37
546	0.42
547	0.5
548	0.5
549	0.53
550	0.56
551	0.51
552	0.43
553	0.44
554	0.43
555	0.46
556	0.48
557	0.52
558	0.49
559	0.47
560	0.54
561	0.58
562	0.6
563	0.6
564	0.63
565	0.64
566	0.65
567	0.65
568	0.61
569	0.55
570	0.49
571	0.4
572	0.34
573	0.25
574	0.2
575	0.17
576	0.12
577	0.1
578	0.08
579	0.06
580	0.06
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.06
585	0.06
586	0.06
587	0.08
588	0.08
589	0.09
590	0.12
591	0.17
592	0.22
593	0.27
594	0.34
595	0.38
596	0.44
597	0.48
598	0.51
599	0.51
600	0.48
601	0.47
602	0.41
603	0.4
604	0.41
605	0.4
606	0.38
607	0.35
608	0.38
609	0.44
610	0.46
611	0.43
612	0.43
613	0.49
614	0.55
615	0.55
616	0.56
617	0.55
618	0.58
619	0.56
620	0.58
621	0.57
622	0.54
623	0.54
624	0.54
625	0.49
626	0.47
627	0.47
628	0.43
629	0.37
630	0.36
631	0.37
632	0.33
633	0.31
634	0.29
635	0.3
636	0.3
637	0.26
638	0.23
639	0.2
640	0.21
641	0.18
642	0.16
643	0.17
644	0.15
645	0.15
646	0.16
647	0.15
648	0.14
649	0.16
650	0.16
651	0.1
652	0.09
653	0.09
654	0.08
655	0.09
656	0.08
657	0.07
658	0.07
659	0.08
660	0.08
661	0.09
662	0.09
663	0.1
664	0.14
665	0.16
666	0.17
667	0.21
668	0.25
669	0.33
670	0.4
671	0.45
672	0.46
673	0.56
674	0.64
675	0.64
676	0.63
677	0.55
678	0.49
679	0.44
680	0.48
681	0.46
682	0.4
683	0.39
684	0.38
685	0.39
686	0.38
687	0.37
688	0.3
689	0.24
690	0.22
691	0.21
692	0.21
693	0.24
694	0.27
695	0.32
696	0.34
697	0.33
698	0.34
699	0.35
700	0.4

C6H5A0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer