Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1W2TNM0

Protein Details
Accession A0A1W2TNM0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-70AARVRVRNRRREWLSRHPSYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-61RPPRTPAHAARVRVRNRRR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11.5, cyto 6, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040233  CCD97-like_C  
IPR018613  Ccdc97-like  
Pfam View protein in Pfam  
PF09747  CCD97-like_C  
Amino Acid Sequences MAPLIGPPHPVPHNDHNNHTATPPPDPPSSSSSSSPYERPQPRPPRTPAHAARVRVRNRRREWLSRHPSYVRSLEHELADPLLYDALVRRFQSPEEREREGRAKGFGRALEADLLRGEARLSRLEDGAADGSRASDGSREGGGGGGGGRPASGAGSTDGGPTPEPSCSRSARAGGPELSPALDAGMSWEELETRDLEKRPAPRTAEEGRARWDEFLRLRFVAGGDDDFHYPAVDEDDEYDALERREQEDAWFDDEEPSWIGESDGDESGDEMGSKGGEKKTEIERPLIGETGVQDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.55
3 0.54
4 0.55
5 0.54
6 0.47
7 0.43
8 0.35
9 0.36
10 0.35
11 0.34
12 0.33
13 0.35
14 0.37
15 0.37
16 0.4
17 0.38
18 0.36
19 0.35
20 0.37
21 0.39
22 0.39
23 0.38
24 0.43
25 0.47
26 0.52
27 0.58
28 0.65
29 0.7
30 0.75
31 0.76
32 0.75
33 0.73
34 0.76
35 0.72
36 0.72
37 0.69
38 0.65
39 0.68
40 0.67
41 0.71
42 0.71
43 0.73
44 0.73
45 0.73
46 0.79
47 0.78
48 0.78
49 0.78
50 0.79
51 0.8
52 0.75
53 0.75
54 0.67
55 0.62
56 0.58
57 0.54
58 0.45
59 0.41
60 0.4
61 0.36
62 0.34
63 0.32
64 0.27
65 0.22
66 0.2
67 0.14
68 0.1
69 0.08
70 0.06
71 0.05
72 0.07
73 0.1
74 0.13
75 0.13
76 0.15
77 0.16
78 0.18
79 0.27
80 0.3
81 0.35
82 0.37
83 0.41
84 0.41
85 0.45
86 0.48
87 0.42
88 0.39
89 0.35
90 0.31
91 0.29
92 0.31
93 0.26
94 0.24
95 0.22
96 0.21
97 0.19
98 0.17
99 0.15
100 0.12
101 0.12
102 0.1
103 0.09
104 0.08
105 0.06
106 0.08
107 0.1
108 0.11
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.09
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.05
122 0.04
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.04
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.04
142 0.05
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.1
152 0.11
153 0.15
154 0.16
155 0.18
156 0.2
157 0.21
158 0.22
159 0.23
160 0.24
161 0.22
162 0.2
163 0.19
164 0.17
165 0.14
166 0.12
167 0.09
168 0.07
169 0.05
170 0.04
171 0.05
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.08
179 0.07
180 0.08
181 0.12
182 0.13
183 0.16
184 0.19
185 0.26
186 0.28
187 0.33
188 0.35
189 0.33
190 0.39
191 0.41
192 0.46
193 0.44
194 0.42
195 0.41
196 0.41
197 0.4
198 0.35
199 0.31
200 0.28
201 0.28
202 0.29
203 0.28
204 0.24
205 0.24
206 0.23
207 0.22
208 0.18
209 0.14
210 0.13
211 0.11
212 0.12
213 0.13
214 0.12
215 0.12
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.1
220 0.09
221 0.08
222 0.09
223 0.12
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.11
228 0.12
229 0.14
230 0.13
231 0.13
232 0.15
233 0.15
234 0.16
235 0.21
236 0.22
237 0.23
238 0.23
239 0.22
240 0.22
241 0.22
242 0.22
243 0.17
244 0.15
245 0.12
246 0.11
247 0.11
248 0.09
249 0.1
250 0.12
251 0.11
252 0.11
253 0.1
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.09
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.13
263 0.15
264 0.17
265 0.19
266 0.24
267 0.32
268 0.4
269 0.41
270 0.4
271 0.4
272 0.41
273 0.42
274 0.38
275 0.3
276 0.22