Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1W2TDR0

Protein Details
Accession A0A1W2TDR0    Localization Confidence Low Confidence Score 6.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1114-1138SYHTNRSDKFNRDRGQRIRRLQLSDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 8.5, mito 8, cyto_nucl 8, nucl 6.5, pero 1, golg 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
IPR039762  Nmd2/UPF2  
IPR007193  Upf2/Nmd2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF02854  MIF4G  
PF04050  Upf2  
Amino Acid Sequences MDRLRRRELLSLNQRAWSGEPDIFPLGSPLDSSLKKNTGFIRRLRTAISSSALSTFLHDIRTLSLTKYISEVVAACYEGLCKLKTPGEIDAAVEVVSALHQRFGPAEFTECLGWLLGKGMATPDKSFLKTLVPEVREKEEKDRLVRQRALLRTITELWLVGVLRTLDDVKPDDATRGLNGKNAELKIKVANSTKGGGAEPFPLEVLKDMLGHDREHVNLPLLVVFVKSFSWDILGVKPAGAEGRKTVEADGVAKSVDSSAERDADPSAVDPDDPPFSTPEMQERFRNILKKYFEDVKTHLVRDQKHIVAQKGRNSEAYVRSGEVFEDRQANFEKQLKAQERLASNAQVIADVLGAEMPDLKEAGDGFSSTNGSIGLVKTGEYLRGQSEGAGIWEDEDERRFYENLVDLKGKVPGILLEDGKKKKTDTDEAVGKRIDSSDMVDTVKAIDANDDQSTAIANKTIGAQVDVLLTGLPDLTSKEATDQTAIEFCFLNSKASRNRLIKGLTEVPRGRTDLLPYWSRLIATLGRYMADIPKGVVDYLDMEFRSLQRRKEKDFLGQVRLSNIRYLAELTKFGIVPEHVVFHCLKVSLDDFSRMNIEIICNLLENCGRYLLRNADTSPRMATLLETLQRKKSVQHIGQPERMLIENAIYYVDPPQRASIQQKERTPTELFIRKLIYVDMTKRNYTKILKQIRRLHWEEPEVVAILAKIFTRPAKVKYGSIHILAILLSAIYRYHPSFVLMVIDQVIDAVTFGLEQNEFRYNQRRIAEIKYIGELYNYRMLEHPVIFDVMYKILTFGHGGPPVPGRPNPFDMPDDFFRIRLIATMLETCGMFFSRGAAGKKLEYFLSFLQYYIYTKHPLPMDIEFIVQDTFILTRPQWKLATNLEEAAKAFHLAIAQDHKNSGADKATDHDDQSIRSSDDDRVEGDGEIGELEAESDRESESGGDDEEAEDDDGEDLDDQNDHSQSIKFSDSEEEAIVVTKKAEEFDPEAEAEFDREFAKMMSESLESRKFDRKPLFDVPLPLRSKARDPSTITDSEEQNLDNTSTMAFSLLTKRGNRQQTRNVVLPSDSTFAVAMKNQQQAEREEQQRIKNLVLNYDMRENDDLDGHDKPPSYHTNRSDKFNRDRGQRIRRLQLSDVDWT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.5
3 0.45
4 0.38
5 0.32
6 0.27
7 0.25
8 0.26
9 0.27
10 0.26
11 0.23
12 0.21
13 0.18
14 0.14
15 0.14
16 0.13
17 0.18
18 0.2
19 0.24
20 0.29
21 0.34
22 0.35
23 0.39
24 0.44
25 0.48
26 0.52
27 0.56
28 0.59
29 0.58
30 0.59
31 0.57
32 0.53
33 0.46
34 0.43
35 0.39
36 0.31
37 0.27
38 0.27
39 0.25
40 0.21
41 0.2
42 0.2
43 0.18
44 0.18
45 0.17
46 0.17
47 0.18
48 0.22
49 0.2
50 0.18
51 0.22
52 0.21
53 0.21
54 0.23
55 0.21
56 0.18
57 0.18
58 0.17
59 0.14
60 0.15
61 0.14
62 0.12
63 0.11
64 0.12
65 0.13
66 0.15
67 0.13
68 0.13
69 0.17
70 0.21
71 0.25
72 0.27
73 0.29
74 0.3
75 0.3
76 0.29
77 0.26
78 0.22
79 0.18
80 0.15
81 0.11
82 0.06
83 0.06
84 0.08
85 0.08
86 0.09
87 0.1
88 0.11
89 0.12
90 0.14
91 0.17
92 0.15
93 0.19
94 0.18
95 0.19
96 0.19
97 0.18
98 0.17
99 0.14
100 0.12
101 0.09
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.12
107 0.15
108 0.18
109 0.19
110 0.22
111 0.25
112 0.27
113 0.27
114 0.25
115 0.27
116 0.27
117 0.33
118 0.36
119 0.35
120 0.38
121 0.41
122 0.47
123 0.47
124 0.47
125 0.48
126 0.49
127 0.52
128 0.54
129 0.6
130 0.61
131 0.65
132 0.67
133 0.65
134 0.65
135 0.63
136 0.62
137 0.55
138 0.48
139 0.43
140 0.41
141 0.36
142 0.28
143 0.24
144 0.18
145 0.18
146 0.16
147 0.11
148 0.11
149 0.1
150 0.09
151 0.11
152 0.13
153 0.11
154 0.14
155 0.16
156 0.15
157 0.18
158 0.18
159 0.18
160 0.18
161 0.19
162 0.19
163 0.22
164 0.21
165 0.22
166 0.23
167 0.25
168 0.29
169 0.3
170 0.3
171 0.25
172 0.27
173 0.28
174 0.29
175 0.31
176 0.29
177 0.32
178 0.31
179 0.32
180 0.31
181 0.27
182 0.26
183 0.21
184 0.19
185 0.18
186 0.16
187 0.15
188 0.14
189 0.12
190 0.12
191 0.11
192 0.11
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.15
197 0.17
198 0.17
199 0.19
200 0.19
201 0.2
202 0.22
203 0.22
204 0.19
205 0.18
206 0.18
207 0.16
208 0.14
209 0.13
210 0.1
211 0.09
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.09
218 0.09
219 0.11
220 0.12
221 0.15
222 0.14
223 0.13
224 0.13
225 0.12
226 0.14
227 0.14
228 0.12
229 0.12
230 0.16
231 0.18
232 0.18
233 0.18
234 0.17
235 0.17
236 0.18
237 0.17
238 0.13
239 0.12
240 0.11
241 0.11
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.09
246 0.11
247 0.13
248 0.13
249 0.14
250 0.14
251 0.14
252 0.13
253 0.12
254 0.12
255 0.1
256 0.1
257 0.09
258 0.11
259 0.14
260 0.14
261 0.14
262 0.13
263 0.15
264 0.17
265 0.17
266 0.23
267 0.26
268 0.28
269 0.31
270 0.33
271 0.37
272 0.39
273 0.45
274 0.39
275 0.41
276 0.43
277 0.43
278 0.45
279 0.48
280 0.46
281 0.45
282 0.46
283 0.47
284 0.46
285 0.43
286 0.41
287 0.38
288 0.37
289 0.39
290 0.43
291 0.36
292 0.37
293 0.41
294 0.43
295 0.46
296 0.49
297 0.49
298 0.48
299 0.48
300 0.44
301 0.42
302 0.42
303 0.37
304 0.35
305 0.29
306 0.25
307 0.24
308 0.23
309 0.21
310 0.18
311 0.15
312 0.13
313 0.18
314 0.17
315 0.19
316 0.22
317 0.23
318 0.24
319 0.29
320 0.3
321 0.27
322 0.36
323 0.38
324 0.38
325 0.4
326 0.41
327 0.37
328 0.38
329 0.38
330 0.31
331 0.26
332 0.24
333 0.2
334 0.15
335 0.13
336 0.1
337 0.07
338 0.05
339 0.05
340 0.04
341 0.04
342 0.03
343 0.05
344 0.04
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.06
350 0.07
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.09
367 0.1
368 0.09
369 0.1
370 0.1
371 0.11
372 0.11
373 0.1
374 0.1
375 0.09
376 0.09
377 0.08
378 0.07
379 0.06
380 0.06
381 0.07
382 0.07
383 0.08
384 0.09
385 0.09
386 0.11
387 0.11
388 0.11
389 0.14
390 0.18
391 0.18
392 0.2
393 0.2
394 0.19
395 0.2
396 0.21
397 0.18
398 0.13
399 0.11
400 0.09
401 0.11
402 0.13
403 0.13
404 0.15
405 0.23
406 0.25
407 0.27
408 0.27
409 0.25
410 0.27
411 0.31
412 0.35
413 0.32
414 0.37
415 0.44
416 0.44
417 0.47
418 0.42
419 0.37
420 0.3
421 0.25
422 0.19
423 0.11
424 0.12
425 0.1
426 0.11
427 0.12
428 0.11
429 0.11
430 0.1
431 0.1
432 0.09
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.08
440 0.08
441 0.09
442 0.08
443 0.07
444 0.06
445 0.06
446 0.06
447 0.07
448 0.08
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.06
456 0.05
457 0.04
458 0.04
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.04
463 0.05
464 0.05
465 0.06
466 0.08
467 0.09
468 0.1
469 0.1
470 0.1
471 0.09
472 0.11
473 0.11
474 0.1
475 0.09
476 0.08
477 0.12
478 0.12
479 0.14
480 0.13
481 0.17
482 0.21
483 0.25
484 0.33
485 0.32
486 0.33
487 0.34
488 0.35
489 0.32
490 0.32
491 0.36
492 0.31
493 0.35
494 0.35
495 0.33
496 0.33
497 0.33
498 0.29
499 0.22
500 0.22
501 0.2
502 0.23
503 0.22
504 0.21
505 0.22
506 0.21
507 0.2
508 0.17
509 0.14
510 0.13
511 0.12
512 0.14
513 0.12
514 0.12
515 0.12
516 0.12
517 0.12
518 0.1
519 0.09
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.06
525 0.05
526 0.06
527 0.07
528 0.08
529 0.07
530 0.07
531 0.08
532 0.09
533 0.18
534 0.19
535 0.24
536 0.31
537 0.36
538 0.41
539 0.46
540 0.47
541 0.46
542 0.52
543 0.5
544 0.47
545 0.45
546 0.4
547 0.37
548 0.37
549 0.31
550 0.23
551 0.19
552 0.13
553 0.11
554 0.12
555 0.11
556 0.1
557 0.1
558 0.1
559 0.11
560 0.11
561 0.1
562 0.1
563 0.08
564 0.09
565 0.09
566 0.1
567 0.08
568 0.1
569 0.1
570 0.1
571 0.11
572 0.09
573 0.08
574 0.08
575 0.09
576 0.08
577 0.09
578 0.11
579 0.1
580 0.11
581 0.12
582 0.11
583 0.1
584 0.09
585 0.09
586 0.07
587 0.07
588 0.07
589 0.06
590 0.05
591 0.06
592 0.07
593 0.07
594 0.07
595 0.09
596 0.09
597 0.09
598 0.12
599 0.15
600 0.16
601 0.17
602 0.18
603 0.21
604 0.22
605 0.22
606 0.2
607 0.17
608 0.15
609 0.13
610 0.13
611 0.09
612 0.11
613 0.14
614 0.17
615 0.18
616 0.2
617 0.22
618 0.22
619 0.22
620 0.27
621 0.33
622 0.33
623 0.38
624 0.46
625 0.49
626 0.53
627 0.51
628 0.44
629 0.35
630 0.32
631 0.26
632 0.16
633 0.11
634 0.07
635 0.07
636 0.07
637 0.05
638 0.05
639 0.09
640 0.11
641 0.11
642 0.12
643 0.13
644 0.14
645 0.17
646 0.22
647 0.27
648 0.34
649 0.4
650 0.43
651 0.45
652 0.45
653 0.47
654 0.43
655 0.36
656 0.35
657 0.35
658 0.32
659 0.31
660 0.31
661 0.27
662 0.26
663 0.24
664 0.19
665 0.15
666 0.19
667 0.24
668 0.26
669 0.28
670 0.28
671 0.29
672 0.32
673 0.33
674 0.34
675 0.36
676 0.44
677 0.48
678 0.57
679 0.65
680 0.67
681 0.72
682 0.69
683 0.63
684 0.57
685 0.54
686 0.46
687 0.37
688 0.3
689 0.23
690 0.19
691 0.15
692 0.1
693 0.07
694 0.07
695 0.05
696 0.05
697 0.06
698 0.07
699 0.11
700 0.14
701 0.18
702 0.24
703 0.26
704 0.29
705 0.3
706 0.35
707 0.33
708 0.31
709 0.28
710 0.21
711 0.19
712 0.16
713 0.13
714 0.07
715 0.05
716 0.03
717 0.03
718 0.03
719 0.04
720 0.06
721 0.07
722 0.08
723 0.09
724 0.1
725 0.1
726 0.11
727 0.12
728 0.1
729 0.1
730 0.09
731 0.08
732 0.07
733 0.06
734 0.06
735 0.03
736 0.03
737 0.03
738 0.02
739 0.03
740 0.03
741 0.04
742 0.05
743 0.05
744 0.07
745 0.11
746 0.12
747 0.15
748 0.23
749 0.25
750 0.3
751 0.32
752 0.33
753 0.32
754 0.36
755 0.4
756 0.34
757 0.33
758 0.29
759 0.28
760 0.25
761 0.23
762 0.19
763 0.16
764 0.19
765 0.18
766 0.17
767 0.17
768 0.19
769 0.21
770 0.2
771 0.18
772 0.12
773 0.13
774 0.12
775 0.12
776 0.11
777 0.09
778 0.09
779 0.08
780 0.07
781 0.07
782 0.07
783 0.08
784 0.08
785 0.12
786 0.13
787 0.14
788 0.15
789 0.17
790 0.19
791 0.21
792 0.22
793 0.23
794 0.25
795 0.3
796 0.31
797 0.31
798 0.31
799 0.3
800 0.33
801 0.3
802 0.33
803 0.28
804 0.26
805 0.24
806 0.22
807 0.2
808 0.15
809 0.14
810 0.08
811 0.09
812 0.1
813 0.1
814 0.1
815 0.1
816 0.09
817 0.08
818 0.08
819 0.07
820 0.06
821 0.08
822 0.1
823 0.15
824 0.17
825 0.19
826 0.2
827 0.21
828 0.23
829 0.23
830 0.2
831 0.17
832 0.18
833 0.16
834 0.19
835 0.17
836 0.16
837 0.16
838 0.16
839 0.16
840 0.16
841 0.18
842 0.16
843 0.16
844 0.21
845 0.2
846 0.21
847 0.23
848 0.22
849 0.23
850 0.21
851 0.21
852 0.16
853 0.16
854 0.15
855 0.11
856 0.09
857 0.06
858 0.06
859 0.07
860 0.09
861 0.08
862 0.16
863 0.18
864 0.23
865 0.24
866 0.25
867 0.28
868 0.32
869 0.37
870 0.31
871 0.32
872 0.28
873 0.28
874 0.26
875 0.23
876 0.18
877 0.13
878 0.11
879 0.09
880 0.09
881 0.08
882 0.11
883 0.16
884 0.18
885 0.18
886 0.19
887 0.19
888 0.2
889 0.2
890 0.19
891 0.16
892 0.15
893 0.15
894 0.17
895 0.21
896 0.21
897 0.21
898 0.24
899 0.22
900 0.22
901 0.25
902 0.25
903 0.21
904 0.21
905 0.22
906 0.21
907 0.23
908 0.23
909 0.21
910 0.2
911 0.2
912 0.18
913 0.17
914 0.13
915 0.1
916 0.09
917 0.07
918 0.05
919 0.04
920 0.04
921 0.04
922 0.05
923 0.05
924 0.06
925 0.06
926 0.06
927 0.07
928 0.06
929 0.08
930 0.08
931 0.08
932 0.08
933 0.08
934 0.08
935 0.09
936 0.09
937 0.08
938 0.07
939 0.07
940 0.07
941 0.07
942 0.07
943 0.06
944 0.06
945 0.06
946 0.06
947 0.07
948 0.09
949 0.1
950 0.1
951 0.11
952 0.12
953 0.13
954 0.16
955 0.17
956 0.15
957 0.16
958 0.19
959 0.2
960 0.2
961 0.19
962 0.17
963 0.15
964 0.16
965 0.16
966 0.12
967 0.11
968 0.1
969 0.1
970 0.11
971 0.12
972 0.15
973 0.17
974 0.19
975 0.21
976 0.2
977 0.2
978 0.2
979 0.19
980 0.17
981 0.13
982 0.12
983 0.1
984 0.1
985 0.1
986 0.09
987 0.11
988 0.1
989 0.1
990 0.12
991 0.13
992 0.15
993 0.21
994 0.27
995 0.26
996 0.3
997 0.38
998 0.38
999 0.45
1000 0.52
1001 0.5
1002 0.52
1003 0.58
1004 0.61
1005 0.55
1006 0.61
1007 0.57
1008 0.57
1009 0.55
1010 0.5
1011 0.46
1012 0.42
1013 0.45
1014 0.46
1015 0.47
1016 0.45
1017 0.48
1018 0.52
1019 0.54
1020 0.54
1021 0.52
1022 0.48
1023 0.43
1024 0.37
1025 0.33
1026 0.27
1027 0.22
1028 0.21
1029 0.17
1030 0.13
1031 0.12
1032 0.11
1033 0.09
1034 0.09
1035 0.09
1036 0.07
1037 0.09
1038 0.14
1039 0.18
1040 0.24
1041 0.26
1042 0.33
1043 0.42
1044 0.52
1045 0.58
1046 0.61
1047 0.67
1048 0.72
1049 0.75
1050 0.75
1051 0.68
1052 0.6
1053 0.53
1054 0.47
1055 0.4
1056 0.32
1057 0.26
1058 0.2
1059 0.18
1060 0.16
1061 0.17
1062 0.16
1063 0.19
1064 0.23
1065 0.29
1066 0.3
1067 0.33
1068 0.36
1069 0.4
1070 0.46
1071 0.49
1072 0.47
1073 0.5
1074 0.54
1075 0.57
1076 0.62
1077 0.6
1078 0.55
1079 0.51
1080 0.48
1081 0.43
1082 0.43
1083 0.41
1084 0.35
1085 0.39
1086 0.37
1087 0.35
1088 0.35
1089 0.32
1090 0.27
1091 0.26
1092 0.24
1093 0.21
1094 0.23
1095 0.2
1096 0.22
1097 0.22
1098 0.22
1099 0.26
1100 0.34
1101 0.38
1102 0.45
1103 0.52
1104 0.6
1105 0.63
1106 0.71
1107 0.73
1108 0.73
1109 0.75
1110 0.76
1111 0.76
1112 0.73
1113 0.79
1114 0.81
1115 0.83
1116 0.84
1117 0.83
1118 0.83
1119 0.82
1120 0.79
1121 0.73
1122 0.7