Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HD70

Protein Details
Accession C6HD70    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
267-292VTPPDRGRAKKEKRPKKPDAIAAERKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
192-202RRVFRAERKRR
272-287RGRAKKEKRPKKPDAI
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11, cyto 7.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007590  Saf4/Yju2  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF04502  Saf4_Yju2  
Amino Acid Sequences MGRYVPPDQEGLTTGNQLANKHPLGARARHLNTTGELTVRFEMPFAVWCSTCKPADSVLIGQGVRFNALKKRVGNYYSTPIYSFRMKHTVCGGWIEIRTDPKNTAYVVTEGGQRKDTGELDKGGYEEDGEITLRIPHDVGSGNSTEKDAFSKLEGKVADQKRVMTEKARMEELMKRQERDWEDPYEQSRRLRRVFRAERKRREAAQGVTKALQDRMSLGIELLEESEGDRLRAKMVDFAPAGDNAVGGAIVRHAISKPLFETKSLPVTPPDRGRAKKEKRPKKPDAIAAERKALLQKELSGNTKAAIDPFLLDDNSDWTPGVKRRKMFESAAGVSSGNRPQQEQKHDGSDDKDCHNSNIPNIVNVIGPPQLTATDADEEASNPRRVALATPLVGYEWSDDSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.22
4 0.22
5 0.24
6 0.28
7 0.27
8 0.29
9 0.29
10 0.33
11 0.38
12 0.42
13 0.44
14 0.47
15 0.5
16 0.5
17 0.51
18 0.46
19 0.41
20 0.41
21 0.36
22 0.27
23 0.25
24 0.24
25 0.23
26 0.22
27 0.2
28 0.15
29 0.14
30 0.13
31 0.16
32 0.17
33 0.18
34 0.17
35 0.18
36 0.22
37 0.26
38 0.26
39 0.24
40 0.22
41 0.22
42 0.26
43 0.28
44 0.26
45 0.23
46 0.27
47 0.25
48 0.24
49 0.24
50 0.2
51 0.19
52 0.18
53 0.18
54 0.2
55 0.26
56 0.32
57 0.32
58 0.36
59 0.41
60 0.43
61 0.45
62 0.43
63 0.45
64 0.43
65 0.4
66 0.37
67 0.32
68 0.33
69 0.33
70 0.3
71 0.28
72 0.34
73 0.33
74 0.35
75 0.38
76 0.38
77 0.33
78 0.34
79 0.3
80 0.24
81 0.25
82 0.24
83 0.21
84 0.25
85 0.25
86 0.24
87 0.25
88 0.23
89 0.24
90 0.23
91 0.22
92 0.18
93 0.18
94 0.17
95 0.17
96 0.22
97 0.23
98 0.24
99 0.23
100 0.21
101 0.21
102 0.22
103 0.22
104 0.19
105 0.19
106 0.19
107 0.19
108 0.2
109 0.19
110 0.16
111 0.14
112 0.11
113 0.09
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.13
132 0.11
133 0.1
134 0.12
135 0.1
136 0.1
137 0.11
138 0.16
139 0.16
140 0.2
141 0.19
142 0.2
143 0.28
144 0.3
145 0.33
146 0.29
147 0.29
148 0.29
149 0.32
150 0.31
151 0.25
152 0.29
153 0.28
154 0.29
155 0.29
156 0.26
157 0.25
158 0.29
159 0.32
160 0.36
161 0.33
162 0.32
163 0.32
164 0.39
165 0.41
166 0.41
167 0.39
168 0.34
169 0.33
170 0.34
171 0.37
172 0.35
173 0.33
174 0.33
175 0.35
176 0.36
177 0.4
178 0.43
179 0.45
180 0.51
181 0.59
182 0.64
183 0.7
184 0.74
185 0.78
186 0.79
187 0.79
188 0.7
189 0.66
190 0.6
191 0.53
192 0.52
193 0.45
194 0.4
195 0.37
196 0.35
197 0.3
198 0.25
199 0.22
200 0.13
201 0.11
202 0.12
203 0.11
204 0.1
205 0.09
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.1
220 0.1
221 0.14
222 0.14
223 0.19
224 0.18
225 0.19
226 0.19
227 0.17
228 0.18
229 0.11
230 0.11
231 0.06
232 0.06
233 0.04
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.04
240 0.04
241 0.08
242 0.09
243 0.1
244 0.12
245 0.18
246 0.19
247 0.19
248 0.23
249 0.22
250 0.29
251 0.29
252 0.28
253 0.25
254 0.27
255 0.32
256 0.33
257 0.37
258 0.37
259 0.4
260 0.47
261 0.55
262 0.61
263 0.66
264 0.72
265 0.76
266 0.79
267 0.86
268 0.88
269 0.87
270 0.85
271 0.84
272 0.82
273 0.81
274 0.79
275 0.72
276 0.66
277 0.56
278 0.49
279 0.44
280 0.36
281 0.28
282 0.2
283 0.21
284 0.23
285 0.26
286 0.29
287 0.27
288 0.26
289 0.25
290 0.25
291 0.21
292 0.17
293 0.14
294 0.11
295 0.1
296 0.11
297 0.12
298 0.11
299 0.11
300 0.1
301 0.13
302 0.13
303 0.13
304 0.11
305 0.1
306 0.16
307 0.23
308 0.33
309 0.35
310 0.38
311 0.43
312 0.49
313 0.54
314 0.52
315 0.52
316 0.5
317 0.47
318 0.44
319 0.39
320 0.34
321 0.29
322 0.3
323 0.27
324 0.23
325 0.21
326 0.23
327 0.3
328 0.38
329 0.46
330 0.48
331 0.47
332 0.51
333 0.52
334 0.53
335 0.49
336 0.48
337 0.44
338 0.42
339 0.43
340 0.37
341 0.38
342 0.42
343 0.41
344 0.37
345 0.41
346 0.38
347 0.33
348 0.33
349 0.3
350 0.24
351 0.21
352 0.2
353 0.13
354 0.13
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.13
360 0.13
361 0.14
362 0.14
363 0.15
364 0.14
365 0.15
366 0.2
367 0.24
368 0.24
369 0.21
370 0.21
371 0.22
372 0.22
373 0.24
374 0.26
375 0.27
376 0.26
377 0.27
378 0.27
379 0.26
380 0.26
381 0.23
382 0.18