Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8AAJ6

Protein Details
Accession A0A1S8AAJ6    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-88GNTRDRRDNRDRFRDEQPRNQDRRQRSRSRSPIGERRERHRSRSRDRRDRDRDYGRDKRRBasic
178-200DDEVPSRKRRSGKKKGKQASLGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-149PRNQDRRQRSRSRSPIGERRERHRSRSRDRRDRDRDYGRDKRRGYDGARDKIDGREREKEMGRDGRRREDSREEHTIPKGPARRGDARRSISPQRSPPAKTGRA
183-194SRKRRSGKKKGK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MADHPRRGRNRPDSRAMWEESERRSNYGGNTRDRRDNRDRFRDEQPRNQDRRQRSRSRSPIGERRERHRSRSRDRRDRDRDYGRDKRRGYDGARDKIDGREREKEMGRDGRRREDSREEHTIPKGPARRGDARRSISPQRSPPAKTGRAAHDPNSPLPTRSKHPDRDSGHSSARGDLDDEVPSRKRRSGKKKGKQASLGDGELQDRGQPRGGDGGDDPMDEDDSLAVEEDDEMSAMQAMMGFGGFGTTKGQKVAGNNTGAVYKAKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.74
3 0.67
4 0.61
5 0.57
6 0.54
7 0.51
8 0.55
9 0.49
10 0.45
11 0.43
12 0.41
13 0.41
14 0.45
15 0.45
16 0.46
17 0.53
18 0.55
19 0.64
20 0.65
21 0.67
22 0.69
23 0.73
24 0.73
25 0.76
26 0.78
27 0.72
28 0.79
29 0.8
30 0.77
31 0.76
32 0.77
33 0.77
34 0.78
35 0.81
36 0.79
37 0.79
38 0.82
39 0.82
40 0.82
41 0.8
42 0.84
43 0.86
44 0.86
45 0.84
46 0.82
47 0.81
48 0.8
49 0.81
50 0.75
51 0.72
52 0.75
53 0.71
54 0.71
55 0.71
56 0.72
57 0.73
58 0.8
59 0.83
60 0.83
61 0.87
62 0.89
63 0.89
64 0.87
65 0.86
66 0.84
67 0.81
68 0.8
69 0.82
70 0.79
71 0.79
72 0.72
73 0.66
74 0.61
75 0.59
76 0.53
77 0.53
78 0.54
79 0.52
80 0.52
81 0.5
82 0.45
83 0.45
84 0.5
85 0.44
86 0.39
87 0.39
88 0.4
89 0.44
90 0.45
91 0.41
92 0.39
93 0.44
94 0.45
95 0.45
96 0.46
97 0.49
98 0.54
99 0.54
100 0.53
101 0.53
102 0.53
103 0.52
104 0.56
105 0.5
106 0.46
107 0.46
108 0.45
109 0.37
110 0.37
111 0.37
112 0.31
113 0.32
114 0.35
115 0.42
116 0.43
117 0.49
118 0.51
119 0.5
120 0.51
121 0.53
122 0.54
123 0.51
124 0.5
125 0.48
126 0.46
127 0.46
128 0.45
129 0.46
130 0.46
131 0.43
132 0.41
133 0.4
134 0.39
135 0.42
136 0.42
137 0.38
138 0.36
139 0.35
140 0.34
141 0.34
142 0.29
143 0.23
144 0.24
145 0.25
146 0.24
147 0.3
148 0.36
149 0.4
150 0.44
151 0.53
152 0.53
153 0.57
154 0.58
155 0.54
156 0.49
157 0.44
158 0.4
159 0.32
160 0.29
161 0.22
162 0.18
163 0.15
164 0.13
165 0.12
166 0.12
167 0.14
168 0.17
169 0.2
170 0.22
171 0.26
172 0.32
173 0.4
174 0.51
175 0.59
176 0.67
177 0.73
178 0.82
179 0.86
180 0.86
181 0.84
182 0.77
183 0.73
184 0.66
185 0.57
186 0.47
187 0.39
188 0.32
189 0.24
190 0.2
191 0.15
192 0.12
193 0.12
194 0.14
195 0.13
196 0.14
197 0.18
198 0.18
199 0.17
200 0.16
201 0.2
202 0.17
203 0.17
204 0.17
205 0.12
206 0.13
207 0.11
208 0.11
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.04
215 0.04
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.03
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.08
234 0.1
235 0.11
236 0.12
237 0.15
238 0.16
239 0.2
240 0.28
241 0.3
242 0.31
243 0.3
244 0.3
245 0.29
246 0.28
247 0.27
248 0.22
249 0.2
250 0.23
251 0.28
252 0.34
253 0.41
254 0.5
255 0.57
256 0.64
257 0.68
258 0.71
259 0.74
260 0.74
261 0.71
262 0.64
263 0.56
264 0.54
265 0.51
266 0.45
267 0.4