Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1W2TJI2

Protein Details
Accession A0A1W2TJI2    Localization Confidence High Confidence Score 23.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MAKKEKKASKAAKPQPNIAVHydrophilic
218-240GSSSKASKKKPQSKKIKTQDSSDHydrophilic
413-441LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYKGGPLDVHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-8KKA
188-199KAAPSKSLKRKA
224-232SKKKPQSKK
419-432KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAKKEKKASKAAKPQPNIAVQPSTTPTTSTSTPQKPPARLMDLVESFLSDQGFDGAHREFQKHRATKAWKGHTAGKGGDKQNSLVAIFEAWETFASKDATPNATARVAKVSSSDNHSSSSSSSSSDSDSDSDSSDGSSDNDDVAMADVPVAAHSSSSESSSSDSDSESDSESDSDDEEATTSGRAAPKAAPSKSLKRKAKSDSSDSSSDSDSDEEMAGSSSKASKKKPQSKKIKTQDSSDDSSSESSSESDSSSEESSDDDKEAKPKTLKTIEADSASASESGSDESSSSDSDSDSESEVKAAAKVPLPESDSDGSEAESEREESNDKAAGKSTNGAVSDSSATLEKTSPEFAPLPPNPSAFKANNRGKNGATPKKPHNQPFSRIAKDVVVDPRLSSNAYVSHGYGEQAHKDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYKGGPLDVHTSRSFKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.77
3 0.74
4 0.67
5 0.61
6 0.55
7 0.45
8 0.45
9 0.42
10 0.38
11 0.31
12 0.28
13 0.26
14 0.26
15 0.28
16 0.29
17 0.35
18 0.39
19 0.45
20 0.54
21 0.59
22 0.58
23 0.63
24 0.65
25 0.61
26 0.56
27 0.53
28 0.52
29 0.45
30 0.43
31 0.37
32 0.29
33 0.23
34 0.22
35 0.19
36 0.1
37 0.09
38 0.08
39 0.09
40 0.08
41 0.1
42 0.1
43 0.16
44 0.18
45 0.21
46 0.23
47 0.3
48 0.41
49 0.43
50 0.45
51 0.5
52 0.55
53 0.61
54 0.68
55 0.7
56 0.65
57 0.65
58 0.69
59 0.64
60 0.62
61 0.56
62 0.53
63 0.52
64 0.49
65 0.5
66 0.43
67 0.4
68 0.37
69 0.35
70 0.28
71 0.2
72 0.17
73 0.12
74 0.11
75 0.1
76 0.08
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.08
81 0.1
82 0.12
83 0.12
84 0.15
85 0.18
86 0.2
87 0.2
88 0.21
89 0.21
90 0.24
91 0.24
92 0.22
93 0.23
94 0.21
95 0.2
96 0.21
97 0.22
98 0.2
99 0.26
100 0.29
101 0.25
102 0.27
103 0.27
104 0.26
105 0.23
106 0.24
107 0.18
108 0.16
109 0.16
110 0.15
111 0.16
112 0.16
113 0.16
114 0.14
115 0.15
116 0.14
117 0.14
118 0.13
119 0.11
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.09
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.05
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.1
147 0.11
148 0.12
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.1
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.1
173 0.11
174 0.17
175 0.24
176 0.24
177 0.28
178 0.31
179 0.41
180 0.5
181 0.59
182 0.59
183 0.57
184 0.65
185 0.66
186 0.71
187 0.66
188 0.63
189 0.58
190 0.55
191 0.53
192 0.46
193 0.41
194 0.32
195 0.27
196 0.2
197 0.15
198 0.11
199 0.09
200 0.08
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.08
208 0.12
209 0.16
210 0.19
211 0.27
212 0.37
213 0.48
214 0.58
215 0.65
216 0.73
217 0.79
218 0.87
219 0.88
220 0.89
221 0.8
222 0.74
223 0.72
224 0.66
225 0.6
226 0.49
227 0.4
228 0.3
229 0.28
230 0.24
231 0.16
232 0.11
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.08
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.15
250 0.16
251 0.2
252 0.21
253 0.22
254 0.29
255 0.32
256 0.34
257 0.32
258 0.36
259 0.34
260 0.32
261 0.31
262 0.24
263 0.2
264 0.18
265 0.14
266 0.09
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.09
281 0.08
282 0.09
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.1
287 0.09
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.12
292 0.14
293 0.15
294 0.17
295 0.19
296 0.18
297 0.21
298 0.2
299 0.18
300 0.19
301 0.17
302 0.15
303 0.14
304 0.13
305 0.1
306 0.1
307 0.11
308 0.09
309 0.1
310 0.12
311 0.11
312 0.13
313 0.16
314 0.16
315 0.15
316 0.17
317 0.17
318 0.17
319 0.18
320 0.18
321 0.17
322 0.17
323 0.17
324 0.15
325 0.15
326 0.16
327 0.14
328 0.13
329 0.11
330 0.1
331 0.11
332 0.11
333 0.11
334 0.11
335 0.14
336 0.13
337 0.16
338 0.18
339 0.18
340 0.26
341 0.27
342 0.3
343 0.29
344 0.31
345 0.29
346 0.31
347 0.36
348 0.3
349 0.37
350 0.42
351 0.49
352 0.56
353 0.59
354 0.59
355 0.54
356 0.59
357 0.62
358 0.62
359 0.6
360 0.59
361 0.63
362 0.7
363 0.77
364 0.77
365 0.77
366 0.75
367 0.73
368 0.76
369 0.77
370 0.71
371 0.64
372 0.57
373 0.49
374 0.43
375 0.42
376 0.38
377 0.32
378 0.28
379 0.27
380 0.28
381 0.26
382 0.26
383 0.21
384 0.17
385 0.17
386 0.19
387 0.2
388 0.17
389 0.19
390 0.18
391 0.19
392 0.21
393 0.21
394 0.21
395 0.21
396 0.21
397 0.19
398 0.19
399 0.22
400 0.23
401 0.28
402 0.27
403 0.27
404 0.35
405 0.38
406 0.45
407 0.46
408 0.5
409 0.53
410 0.63
411 0.71
412 0.75
413 0.82
414 0.83
415 0.9
416 0.91
417 0.9
418 0.9
419 0.89
420 0.89
421 0.89
422 0.86
423 0.76
424 0.68
425 0.66
426 0.57
427 0.53
428 0.45
429 0.38
430 0.33