Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1W2TS40

Protein Details
Accession A0A1W2TS40    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
403-432DTSSSSSSEGKKKKKKKKKTRIFQVGDFDRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
412-423GKKKKKKKKKTR
Subcellular Location(s) extr 23, mito 1, plas 1, E.R. 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013784  Carb-bd-like_fold  
IPR011013  Gal_mutarotase_sf_dom  
IPR008979  Galactose-bd-like_sf  
IPR014718  GH-type_carb-bd  
IPR029413  RG-lyase_II  
IPR029411  RG-lyase_III  
Gene Ontology GO:0005576  C:extracellular region  
GO:0030246  F:carbohydrate binding  
GO:0102210  F:rhamnogalacturonan endolyase activity  
GO:0071555  P:cell wall organization  
GO:0000272  P:polysaccharide catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF14683  CBM-like  
PF14686  fn3_3  
CDD cd10316  RGL4_M  
cd10320  RGL4_N  
Amino Acid Sequences MKAILLPIVAALAGAVPTRPHAISPFLNQVDNQTWVIGNGLWNLTQGPKYGVKLFYKDRDCVGDAVGHYVSYNGAASDLSWTSASIVDRGSHGGEDFIDIMFEASEGEMHWVIFSGLAGAYQYFVNRALPVLGEFRTLWRLDNTTFPRGKTNLRDEELPPLSDYIAANKVQDETWLRPDGNGYITKYDFTDWVRTQTYYGVYGDSFGSWYINPGKDYYNGNHLKQELMVHRESATGDAVQLNMIHGTHFMASASDAFPDGKMWGPWLWYLNDGSQGDAAARARRESSGWPYAWLRDDAYQARGSVAGRLVLSDGRPAAHAAVFLGDDGPGNKTALDMGSDYYYTAHADAEGRFAFAHVRAARYGLQAWSNGSAATADVTTTFLRDGVVVAASRETDLGRLEWDTSSSSSSEGKKKKKKKKKTRIFQVGDFDRTSYGFRYGGAPNEHALVDRCPADLVYRVGESETADWCFGQTHLGNWTIAFDVTPGAVEAAAAAGDGNATLIVSLAGYSSSASSVIWANGWPIGNLTSGAPGLLNDPSLYRSATAAGEWRYFEFAFDAAAAALREGPNEITFQMTRSTTWHGFMWDSIVLEW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.06
4 0.08
5 0.12
6 0.12
7 0.13
8 0.15
9 0.21
10 0.24
11 0.3
12 0.37
13 0.36
14 0.37
15 0.36
16 0.38
17 0.36
18 0.35
19 0.3
20 0.22
21 0.2
22 0.19
23 0.2
24 0.15
25 0.13
26 0.13
27 0.14
28 0.13
29 0.13
30 0.14
31 0.16
32 0.16
33 0.16
34 0.18
35 0.21
36 0.24
37 0.29
38 0.34
39 0.36
40 0.41
41 0.47
42 0.52
43 0.53
44 0.52
45 0.49
46 0.48
47 0.46
48 0.4
49 0.34
50 0.29
51 0.24
52 0.26
53 0.23
54 0.18
55 0.15
56 0.15
57 0.13
58 0.1
59 0.1
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.09
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.14
71 0.14
72 0.12
73 0.13
74 0.12
75 0.13
76 0.15
77 0.15
78 0.12
79 0.12
80 0.11
81 0.1
82 0.11
83 0.1
84 0.09
85 0.08
86 0.07
87 0.07
88 0.06
89 0.06
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.1
118 0.12
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.14
123 0.17
124 0.17
125 0.18
126 0.17
127 0.2
128 0.19
129 0.28
130 0.31
131 0.36
132 0.38
133 0.38
134 0.41
135 0.41
136 0.46
137 0.45
138 0.49
139 0.48
140 0.48
141 0.5
142 0.45
143 0.52
144 0.47
145 0.4
146 0.32
147 0.24
148 0.22
149 0.2
150 0.19
151 0.14
152 0.15
153 0.15
154 0.14
155 0.14
156 0.15
157 0.13
158 0.17
159 0.18
160 0.17
161 0.22
162 0.25
163 0.24
164 0.24
165 0.25
166 0.23
167 0.22
168 0.23
169 0.19
170 0.19
171 0.2
172 0.2
173 0.19
174 0.19
175 0.18
176 0.16
177 0.22
178 0.2
179 0.24
180 0.25
181 0.25
182 0.25
183 0.25
184 0.24
185 0.18
186 0.18
187 0.14
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.1
192 0.09
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.09
197 0.12
198 0.14
199 0.14
200 0.15
201 0.17
202 0.19
203 0.22
204 0.21
205 0.27
206 0.29
207 0.3
208 0.31
209 0.3
210 0.27
211 0.25
212 0.28
213 0.22
214 0.22
215 0.22
216 0.2
217 0.2
218 0.2
219 0.19
220 0.16
221 0.13
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.1
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.12
257 0.11
258 0.15
259 0.14
260 0.13
261 0.12
262 0.11
263 0.1
264 0.1
265 0.11
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.12
272 0.13
273 0.18
274 0.21
275 0.21
276 0.23
277 0.23
278 0.24
279 0.24
280 0.22
281 0.17
282 0.13
283 0.16
284 0.15
285 0.17
286 0.16
287 0.15
288 0.14
289 0.14
290 0.12
291 0.11
292 0.1
293 0.09
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.06
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.06
307 0.05
308 0.06
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.05
333 0.05
334 0.07
335 0.07
336 0.1
337 0.09
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.1
342 0.08
343 0.15
344 0.13
345 0.14
346 0.14
347 0.16
348 0.17
349 0.17
350 0.18
351 0.13
352 0.14
353 0.13
354 0.14
355 0.13
356 0.12
357 0.11
358 0.09
359 0.08
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.04
364 0.04
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.05
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.06
382 0.06
383 0.07
384 0.07
385 0.08
386 0.08
387 0.09
388 0.09
389 0.1
390 0.1
391 0.11
392 0.11
393 0.11
394 0.12
395 0.14
396 0.19
397 0.27
398 0.34
399 0.44
400 0.53
401 0.63
402 0.73
403 0.8
404 0.87
405 0.9
406 0.93
407 0.94
408 0.95
409 0.96
410 0.96
411 0.91
412 0.86
413 0.84
414 0.78
415 0.7
416 0.59
417 0.48
418 0.37
419 0.32
420 0.27
421 0.19
422 0.16
423 0.12
424 0.13
425 0.16
426 0.17
427 0.22
428 0.23
429 0.23
430 0.21
431 0.22
432 0.22
433 0.19
434 0.19
435 0.14
436 0.14
437 0.13
438 0.13
439 0.12
440 0.12
441 0.12
442 0.14
443 0.14
444 0.14
445 0.14
446 0.14
447 0.14
448 0.14
449 0.14
450 0.12
451 0.13
452 0.12
453 0.12
454 0.12
455 0.12
456 0.12
457 0.11
458 0.14
459 0.12
460 0.12
461 0.15
462 0.17
463 0.17
464 0.16
465 0.17
466 0.13
467 0.12
468 0.11
469 0.08
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.06
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.03
481 0.03
482 0.03
483 0.03
484 0.03
485 0.03
486 0.03
487 0.03
488 0.03
489 0.03
490 0.03
491 0.03
492 0.03
493 0.03
494 0.03
495 0.04
496 0.04
497 0.05
498 0.05
499 0.06
500 0.05
501 0.07
502 0.08
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.1
507 0.12
508 0.13
509 0.12
510 0.11
511 0.12
512 0.12
513 0.12
514 0.12
515 0.11
516 0.1
517 0.1
518 0.09
519 0.08
520 0.09
521 0.09
522 0.1
523 0.08
524 0.09
525 0.11
526 0.12
527 0.13
528 0.12
529 0.12
530 0.13
531 0.14
532 0.14
533 0.18
534 0.2
535 0.22
536 0.22
537 0.23
538 0.24
539 0.24
540 0.23
541 0.19
542 0.16
543 0.14
544 0.13
545 0.12
546 0.08
547 0.09
548 0.09
549 0.08
550 0.1
551 0.1
552 0.1
553 0.11
554 0.13
555 0.13
556 0.14
557 0.14
558 0.16
559 0.16
560 0.17
561 0.21
562 0.2
563 0.2
564 0.22
565 0.3
566 0.27
567 0.29
568 0.3
569 0.27
570 0.28
571 0.27
572 0.27
573 0.21