Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1W2TB42

Protein Details
Accession A0A1W2TB42    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
264-289SLPPLPPRQQQKHSRRPTPQPQPRERHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
279-280RP
284-318PQPRERGSEDERRGDGGGGSAGQPRRKEEGREGGK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039601  Rrn5  
IPR001005  SANT/Myb  
Gene Ontology GO:0000500  C:RNA polymerase I upstream activating factor complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MDVESSDDETRGLRSSSSSGSSSNKNTNSDHGFRGPQTQMHDSSPGALPIRGRAAKRRADAALLLLPPPPPLKRARGDFNAAYLGLLNRDIRDASSGLVHAAAAAADGDGDPDPADTHAPAQVGAVAWSAAEKRAFFEAVGRLGRAELAGVAARIGTKSELEVRQYLILLDDAAGRRQQRGNGSGTGGGGGEGAEARRGARHQQTRLVDVPAAAEISAECVAALEAAADAVSARQEGHEAEVERERWGARWLLTTPLAEALERSLPPLPPRQQQKHSRRPTPQPQPRERGSEDERRGDGGGGSAGQPRRKEEGREGGKGGGPDELPFLQLFSICDWLRLSDRVFMNSAVSDGNWHAVLEEPEPPAIRATAFADFHGLALSVTRRLVSAAIYVADSRLRANSSNDARRRGRRHIRIEDVAAAVSSLGMKRDSKEFWARCARRLQLNIVDDGLGEDDLTDRESEGADVDSDEGMDRDDQSHAEESGPGSIDEGEEGGEESEEDAREIMSYAEVEAALGYPVADDLRSRHSTPEPSVLATSEEEADDEDQEEDEEEEDLRGHAEDQGDDDYDYDDDDDDDGEYTEDVEMEDPQETAQDESDADLSPDAIDQDVEEAMLSLARVERAGAAPTRRALVSRIRAEHGLEREAEQLDLETSAATEAELWAVLRGDGGGSRKTKGSKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.18
3 0.22
4 0.24
5 0.24
6 0.25
7 0.29
8 0.35
9 0.38
10 0.43
11 0.44
12 0.45
13 0.45
14 0.49
15 0.53
16 0.51
17 0.5
18 0.46
19 0.46
20 0.43
21 0.49
22 0.44
23 0.4
24 0.42
25 0.42
26 0.4
27 0.39
28 0.4
29 0.32
30 0.33
31 0.31
32 0.28
33 0.24
34 0.22
35 0.2
36 0.21
37 0.3
38 0.32
39 0.33
40 0.39
41 0.46
42 0.52
43 0.55
44 0.57
45 0.5
46 0.48
47 0.46
48 0.41
49 0.38
50 0.31
51 0.28
52 0.24
53 0.22
54 0.21
55 0.24
56 0.21
57 0.19
58 0.24
59 0.31
60 0.37
61 0.44
62 0.5
63 0.53
64 0.59
65 0.56
66 0.53
67 0.48
68 0.4
69 0.33
70 0.26
71 0.2
72 0.14
73 0.15
74 0.13
75 0.11
76 0.13
77 0.13
78 0.12
79 0.14
80 0.14
81 0.12
82 0.13
83 0.13
84 0.12
85 0.12
86 0.11
87 0.08
88 0.07
89 0.06
90 0.04
91 0.04
92 0.03
93 0.03
94 0.04
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.1
109 0.11
110 0.1
111 0.1
112 0.09
113 0.07
114 0.06
115 0.07
116 0.08
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.11
121 0.14
122 0.15
123 0.14
124 0.18
125 0.19
126 0.22
127 0.23
128 0.21
129 0.19
130 0.18
131 0.19
132 0.14
133 0.11
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.08
146 0.14
147 0.17
148 0.19
149 0.21
150 0.21
151 0.22
152 0.22
153 0.2
154 0.14
155 0.12
156 0.09
157 0.08
158 0.1
159 0.1
160 0.11
161 0.14
162 0.14
163 0.18
164 0.2
165 0.24
166 0.26
167 0.29
168 0.31
169 0.31
170 0.32
171 0.29
172 0.26
173 0.23
174 0.17
175 0.13
176 0.09
177 0.07
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.07
185 0.09
186 0.15
187 0.24
188 0.31
189 0.34
190 0.42
191 0.45
192 0.48
193 0.49
194 0.45
195 0.36
196 0.28
197 0.25
198 0.17
199 0.15
200 0.1
201 0.07
202 0.05
203 0.07
204 0.07
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.03
212 0.02
213 0.03
214 0.03
215 0.02
216 0.02
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.05
223 0.05
224 0.07
225 0.1
226 0.11
227 0.13
228 0.17
229 0.18
230 0.17
231 0.18
232 0.16
233 0.14
234 0.15
235 0.15
236 0.12
237 0.15
238 0.15
239 0.17
240 0.18
241 0.18
242 0.16
243 0.16
244 0.15
245 0.12
246 0.11
247 0.1
248 0.11
249 0.1
250 0.11
251 0.11
252 0.12
253 0.14
254 0.22
255 0.25
256 0.29
257 0.39
258 0.45
259 0.52
260 0.62
261 0.71
262 0.73
263 0.78
264 0.8
265 0.79
266 0.81
267 0.83
268 0.83
269 0.81
270 0.81
271 0.79
272 0.77
273 0.73
274 0.7
275 0.61
276 0.57
277 0.54
278 0.54
279 0.49
280 0.46
281 0.43
282 0.38
283 0.36
284 0.29
285 0.23
286 0.14
287 0.11
288 0.07
289 0.07
290 0.1
291 0.12
292 0.14
293 0.15
294 0.17
295 0.22
296 0.24
297 0.26
298 0.28
299 0.36
300 0.39
301 0.4
302 0.39
303 0.35
304 0.35
305 0.32
306 0.26
307 0.17
308 0.12
309 0.1
310 0.1
311 0.09
312 0.08
313 0.08
314 0.07
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.06
319 0.1
320 0.1
321 0.11
322 0.1
323 0.11
324 0.13
325 0.14
326 0.14
327 0.15
328 0.15
329 0.16
330 0.17
331 0.16
332 0.15
333 0.13
334 0.13
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.09
347 0.09
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.09
352 0.09
353 0.08
354 0.06
355 0.08
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.12
360 0.11
361 0.11
362 0.1
363 0.09
364 0.05
365 0.06
366 0.07
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.06
374 0.07
375 0.06
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.06
383 0.07
384 0.08
385 0.09
386 0.12
387 0.19
388 0.25
389 0.34
390 0.37
391 0.43
392 0.48
393 0.54
394 0.58
395 0.61
396 0.65
397 0.66
398 0.71
399 0.72
400 0.74
401 0.68
402 0.64
403 0.56
404 0.46
405 0.36
406 0.26
407 0.18
408 0.11
409 0.08
410 0.06
411 0.04
412 0.05
413 0.06
414 0.07
415 0.09
416 0.12
417 0.14
418 0.19
419 0.28
420 0.28
421 0.34
422 0.44
423 0.45
424 0.46
425 0.51
426 0.49
427 0.46
428 0.48
429 0.46
430 0.42
431 0.42
432 0.38
433 0.32
434 0.28
435 0.21
436 0.19
437 0.14
438 0.07
439 0.05
440 0.04
441 0.04
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.05
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.05
458 0.05
459 0.06
460 0.06
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.1
465 0.11
466 0.11
467 0.11
468 0.12
469 0.11
470 0.12
471 0.12
472 0.1
473 0.09
474 0.08
475 0.08
476 0.07
477 0.07
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.05
485 0.07
486 0.06
487 0.07
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.07
492 0.06
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.06
497 0.06
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.03
505 0.04
506 0.04
507 0.04
508 0.05
509 0.07
510 0.14
511 0.18
512 0.19
513 0.23
514 0.28
515 0.33
516 0.35
517 0.41
518 0.35
519 0.33
520 0.33
521 0.29
522 0.27
523 0.22
524 0.2
525 0.13
526 0.11
527 0.1
528 0.1
529 0.1
530 0.09
531 0.09
532 0.08
533 0.08
534 0.08
535 0.08
536 0.08
537 0.07
538 0.07
539 0.07
540 0.07
541 0.07
542 0.07
543 0.07
544 0.07
545 0.07
546 0.09
547 0.1
548 0.1
549 0.11
550 0.13
551 0.13
552 0.13
553 0.13
554 0.11
555 0.1
556 0.11
557 0.09
558 0.07
559 0.07
560 0.07
561 0.07
562 0.07
563 0.07
564 0.07
565 0.07
566 0.07
567 0.07
568 0.07
569 0.06
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.07
574 0.08
575 0.07
576 0.07
577 0.09
578 0.09
579 0.09
580 0.09
581 0.09
582 0.09
583 0.1
584 0.11
585 0.1
586 0.1
587 0.09
588 0.09
589 0.08
590 0.09
591 0.08
592 0.07
593 0.06
594 0.06
595 0.07
596 0.07
597 0.07
598 0.06
599 0.06
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.05
604 0.07
605 0.07
606 0.07
607 0.07
608 0.1
609 0.11
610 0.14
611 0.18
612 0.21
613 0.24
614 0.26
615 0.28
616 0.26
617 0.26
618 0.27
619 0.32
620 0.38
621 0.42
622 0.45
623 0.46
624 0.47
625 0.49
626 0.52
627 0.47
628 0.41
629 0.33
630 0.31
631 0.31
632 0.3
633 0.27
634 0.2
635 0.17
636 0.14
637 0.13
638 0.11
639 0.08
640 0.07
641 0.07
642 0.07
643 0.06
644 0.05
645 0.05
646 0.06
647 0.06
648 0.06
649 0.07
650 0.08
651 0.08
652 0.07
653 0.07
654 0.07
655 0.1
656 0.14
657 0.19
658 0.21
659 0.23
660 0.28