Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HJ65

Protein Details
Accession C6HJ65    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
362-392PKSPWGKPAKSGYKTRPKHRVNKAVVIPRVRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
84-124WKGRPVHKLTFPKRGHGKGGRNSTGRVTVRHRGGGHKRRIR
345-400KDHPHGGGRGKSKGNVHPKSPWGKPAKSGYKTRPKHRVNKAVVIPRVRNQGKRRRG
Subcellular Location(s) mito 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR022666  Rbsml_prot_L2_RNA-bd_dom  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR002171  Ribosomal_L2  
IPR022669  Ribosomal_L2_C  
IPR014726  Ribosomal_L2_dom3  
IPR008991  Translation_prot_SH3-like_sf  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00181  Ribosomal_L2  
PF03947  Ribosomal_L2_C  
Amino Acid Sequences MLQPRLTLRSLQNSCRCLSSITARAYSSTLLQKPDGPAEPEKETPSFAFAPPPMRDKEGLGMRSYTPRTPGLRHLRRPINDHLWKGRPVHKLTFPKRGHGKGGRNSTGRVTVRHRGGGHKRRIRTVDFERKEPGPHTVERIEHDPNRNAHIALIKSKKTGKLSYIIAAEGMRAGDVVESYRAGIPDELWQSMGGTVDPGVLAARTAWRGNCLPLHMIPVGSLIYNIGLKPGKGGQLCRAAGTFATITLKATEELPEEIQQAESVSSEEGDAKLLTLQERHKLKQLADHVTIRLASGEVRLIHKDCCATIGVASNAYFKYRSLGKAGRSRWLNIRPTVRGLAMNAKDHPHGGGRGKSKGNVHPKSPWGKPAKSGYKTRPKHRVNKAVVIPRVRNQGKRRRGYN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.53
3 0.48
4 0.39
5 0.39
6 0.37
7 0.37
8 0.39
9 0.41
10 0.38
11 0.38
12 0.38
13 0.34
14 0.3
15 0.31
16 0.29
17 0.29
18 0.3
19 0.33
20 0.35
21 0.39
22 0.38
23 0.34
24 0.36
25 0.37
26 0.4
27 0.4
28 0.4
29 0.35
30 0.34
31 0.3
32 0.3
33 0.28
34 0.24
35 0.26
36 0.25
37 0.31
38 0.32
39 0.36
40 0.34
41 0.35
42 0.35
43 0.32
44 0.37
45 0.38
46 0.37
47 0.34
48 0.34
49 0.32
50 0.38
51 0.39
52 0.33
53 0.29
54 0.33
55 0.35
56 0.36
57 0.44
58 0.48
59 0.55
60 0.61
61 0.67
62 0.7
63 0.71
64 0.73
65 0.71
66 0.71
67 0.68
68 0.66
69 0.64
70 0.6
71 0.6
72 0.6
73 0.59
74 0.57
75 0.55
76 0.56
77 0.57
78 0.63
79 0.65
80 0.7
81 0.63
82 0.64
83 0.67
84 0.64
85 0.64
86 0.62
87 0.65
88 0.63
89 0.71
90 0.69
91 0.63
92 0.6
93 0.54
94 0.53
95 0.46
96 0.42
97 0.39
98 0.39
99 0.41
100 0.44
101 0.43
102 0.44
103 0.53
104 0.58
105 0.63
106 0.63
107 0.63
108 0.65
109 0.68
110 0.62
111 0.6
112 0.6
113 0.61
114 0.56
115 0.56
116 0.53
117 0.49
118 0.48
119 0.41
120 0.36
121 0.29
122 0.28
123 0.3
124 0.29
125 0.3
126 0.3
127 0.32
128 0.32
129 0.32
130 0.36
131 0.37
132 0.35
133 0.37
134 0.36
135 0.32
136 0.27
137 0.27
138 0.23
139 0.25
140 0.29
141 0.26
142 0.28
143 0.31
144 0.35
145 0.35
146 0.36
147 0.31
148 0.3
149 0.31
150 0.31
151 0.29
152 0.24
153 0.21
154 0.18
155 0.15
156 0.1
157 0.08
158 0.05
159 0.04
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.11
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.1
180 0.06
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.04
191 0.05
192 0.07
193 0.07
194 0.09
195 0.1
196 0.12
197 0.13
198 0.13
199 0.13
200 0.13
201 0.16
202 0.13
203 0.13
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.08
208 0.07
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.09
217 0.1
218 0.14
219 0.15
220 0.16
221 0.19
222 0.26
223 0.27
224 0.26
225 0.25
226 0.21
227 0.19
228 0.19
229 0.14
230 0.07
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.1
236 0.08
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.1
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.08
261 0.08
262 0.12
263 0.14
264 0.21
265 0.26
266 0.27
267 0.33
268 0.36
269 0.36
270 0.39
271 0.45
272 0.44
273 0.44
274 0.44
275 0.38
276 0.36
277 0.35
278 0.27
279 0.2
280 0.14
281 0.09
282 0.08
283 0.1
284 0.11
285 0.13
286 0.16
287 0.17
288 0.17
289 0.19
290 0.19
291 0.16
292 0.16
293 0.15
294 0.13
295 0.13
296 0.16
297 0.15
298 0.15
299 0.15
300 0.16
301 0.15
302 0.17
303 0.16
304 0.12
305 0.15
306 0.18
307 0.19
308 0.24
309 0.29
310 0.35
311 0.44
312 0.46
313 0.5
314 0.49
315 0.51
316 0.52
317 0.56
318 0.55
319 0.53
320 0.58
321 0.53
322 0.54
323 0.53
324 0.46
325 0.39
326 0.35
327 0.37
328 0.34
329 0.35
330 0.32
331 0.32
332 0.31
333 0.31
334 0.3
335 0.24
336 0.26
337 0.28
338 0.33
339 0.36
340 0.42
341 0.44
342 0.48
343 0.5
344 0.54
345 0.59
346 0.58
347 0.57
348 0.58
349 0.63
350 0.66
351 0.64
352 0.64
353 0.62
354 0.59
355 0.61
356 0.65
357 0.67
358 0.66
359 0.72
360 0.73
361 0.75
362 0.81
363 0.84
364 0.84
365 0.83
366 0.87
367 0.88
368 0.88
369 0.85
370 0.86
371 0.85
372 0.84
373 0.81
374 0.79
375 0.73
376 0.69
377 0.72
378 0.68
379 0.68
380 0.69
381 0.72
382 0.75