Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HGM1

Protein Details
Accession C6HGM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
353-374PRRELPFTRKRGPMKPNPAEQGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
346-365KKTSSPPPRRELPFTRKRGP
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.5, mito 8, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014751  XRCC4-like_C  
Amino Acid Sequences MRKETILRIQRSDSLGDFVLVKVARSGRSELDLTLVATEGEAPYRGLVKSTQIDKLRAKNYQGTVDEWAGILAYALGQKQPASVPEEHKAGLEIAATVKQNEDDESDKEIVVTLRKRIDTITQRLGTISLKQDDDQAIQLFDWTGLAVTRADELEEGLTSLTAKYDAVETTINKLNSQLQELIKVKSEHDDQLIAKFAQLLNEKKLKIRNQQRLLASAKIDPATVDEMRTSDPSEIGSSRQRGKRKAEEPSISSESEDGFDTMDIDNIEKKGTASRENEEEGAGDEDNSTDSEGQETPDPLEDETASEDEVEAPTKAPSPPPAINGGKRATRASSKQPTSSAPTTKKTSSPPPRRELPFTRKRGPMKPNPAEQGDSGSDDEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.3
3 0.26
4 0.23
5 0.17
6 0.2
7 0.17
8 0.16
9 0.17
10 0.19
11 0.21
12 0.24
13 0.27
14 0.24
15 0.28
16 0.29
17 0.25
18 0.25
19 0.23
20 0.2
21 0.17
22 0.15
23 0.11
24 0.09
25 0.1
26 0.07
27 0.07
28 0.08
29 0.07
30 0.08
31 0.11
32 0.11
33 0.12
34 0.13
35 0.18
36 0.24
37 0.27
38 0.34
39 0.36
40 0.42
41 0.47
42 0.55
43 0.55
44 0.54
45 0.54
46 0.54
47 0.54
48 0.55
49 0.5
50 0.44
51 0.42
52 0.38
53 0.34
54 0.26
55 0.22
56 0.14
57 0.12
58 0.09
59 0.05
60 0.04
61 0.05
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.1
68 0.12
69 0.16
70 0.19
71 0.24
72 0.27
73 0.29
74 0.28
75 0.27
76 0.26
77 0.21
78 0.17
79 0.13
80 0.09
81 0.08
82 0.11
83 0.11
84 0.1
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.12
89 0.13
90 0.13
91 0.15
92 0.19
93 0.19
94 0.18
95 0.17
96 0.18
97 0.16
98 0.19
99 0.19
100 0.19
101 0.23
102 0.23
103 0.24
104 0.24
105 0.32
106 0.34
107 0.39
108 0.43
109 0.4
110 0.4
111 0.39
112 0.39
113 0.32
114 0.27
115 0.24
116 0.19
117 0.18
118 0.18
119 0.21
120 0.21
121 0.21
122 0.19
123 0.16
124 0.13
125 0.12
126 0.12
127 0.1
128 0.08
129 0.07
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.04
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.05
140 0.06
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.08
156 0.09
157 0.12
158 0.17
159 0.17
160 0.16
161 0.17
162 0.2
163 0.19
164 0.2
165 0.2
166 0.16
167 0.23
168 0.24
169 0.24
170 0.23
171 0.23
172 0.21
173 0.2
174 0.22
175 0.17
176 0.16
177 0.18
178 0.15
179 0.15
180 0.17
181 0.14
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.13
186 0.17
187 0.18
188 0.2
189 0.24
190 0.25
191 0.27
192 0.34
193 0.36
194 0.41
195 0.49
196 0.55
197 0.57
198 0.62
199 0.6
200 0.59
201 0.55
202 0.48
203 0.39
204 0.3
205 0.26
206 0.2
207 0.18
208 0.13
209 0.12
210 0.14
211 0.12
212 0.12
213 0.1
214 0.11
215 0.12
216 0.13
217 0.12
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.11
222 0.11
223 0.12
224 0.16
225 0.19
226 0.26
227 0.32
228 0.37
229 0.42
230 0.49
231 0.56
232 0.58
233 0.63
234 0.64
235 0.63
236 0.59
237 0.61
238 0.56
239 0.46
240 0.4
241 0.32
242 0.23
243 0.19
244 0.18
245 0.1
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.07
250 0.08
251 0.07
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.13
259 0.16
260 0.21
261 0.23
262 0.26
263 0.3
264 0.31
265 0.31
266 0.27
267 0.24
268 0.19
269 0.18
270 0.14
271 0.11
272 0.09
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.08
277 0.06
278 0.06
279 0.09
280 0.09
281 0.1
282 0.12
283 0.12
284 0.13
285 0.15
286 0.16
287 0.14
288 0.15
289 0.13
290 0.12
291 0.14
292 0.13
293 0.11
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.08
300 0.08
301 0.09
302 0.11
303 0.12
304 0.14
305 0.18
306 0.23
307 0.26
308 0.28
309 0.35
310 0.39
311 0.42
312 0.45
313 0.45
314 0.42
315 0.42
316 0.42
317 0.39
318 0.41
319 0.43
320 0.47
321 0.53
322 0.54
323 0.56
324 0.56
325 0.56
326 0.56
327 0.58
328 0.57
329 0.53
330 0.54
331 0.56
332 0.56
333 0.57
334 0.55
335 0.59
336 0.61
337 0.66
338 0.69
339 0.7
340 0.76
341 0.77
342 0.8
343 0.79
344 0.78
345 0.78
346 0.77
347 0.78
348 0.78
349 0.79
350 0.8
351 0.8
352 0.8
353 0.81
354 0.81
355 0.81
356 0.79
357 0.76
358 0.69
359 0.59
360 0.55
361 0.46
362 0.4