Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HDQ4

Protein Details
Accession C6HDQ4    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
544-574WEAEGRGRGTKRKRGPKKKKGDKDSVNDVMKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
293-306RFKKIGSKSKKKRW
549-565RGRGTKRKRGPKKKKGD
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039896  Red-like  
IPR012916  RED_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF07808  RED_N  
Amino Acid Sequences MNNEQFRRLLFEDQSKKTSHDSTLAKKTSPVGGDAARSKPAALGSNMRPKIPMTPYLFPYSHASRTVVNRSVIGVDFARQSADHRRESQPPPAKKFRSSAAPKGTKLAEGYQDRTLLRRAGQDEEGNVEGYGSNDRGDDDLEHRVRALEDMVKLGQVDQPTFEKLREEIGVGGDVKSTHLIKGLDWKLLRRVKAGEDISAPPPSASENGVSGQPQERDIDEEFDMVLEEKEKEVKEPAQKVEKVKKGSMAPPSLDGSRRITRDEILKKLKASRAAPEVQQHISEPPASALGERFKKIGSKSKKKRWIETNEHGRRREVLLTTDSEGKTKRKVRWLDKPDDQAQRSEDSGLLPVDKHAKPLGMDVPAEVLSRANAAATVEEEDDDIFQGVGRDYNPLADMEDEDGHGSSSSDESDNEMKGNASPPRVDIVNDGHAQQEQPLPQPAKVRDYFATSSSTREDRETVNKPTSISSDPAILAALKRAAAIRQASPVDLDGGAGLDQEATLKRKKFLEEAKRREREDAMDLDLGFGGSRFGDEDDEEAGWEAEGRGRGTKRKRGPKKKKGDKDSVNDVMKVLEGRRQGEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.51
3 0.51
4 0.5
5 0.49
6 0.42
7 0.41
8 0.43
9 0.48
10 0.57
11 0.57
12 0.53
13 0.51
14 0.51
15 0.48
16 0.42
17 0.35
18 0.29
19 0.28
20 0.33
21 0.35
22 0.35
23 0.32
24 0.3
25 0.28
26 0.26
27 0.27
28 0.26
29 0.24
30 0.29
31 0.34
32 0.44
33 0.45
34 0.44
35 0.42
36 0.38
37 0.43
38 0.4
39 0.41
40 0.37
41 0.41
42 0.45
43 0.51
44 0.5
45 0.44
46 0.46
47 0.43
48 0.39
49 0.36
50 0.34
51 0.32
52 0.39
53 0.44
54 0.43
55 0.39
56 0.36
57 0.35
58 0.36
59 0.31
60 0.27
61 0.19
62 0.16
63 0.16
64 0.16
65 0.15
66 0.13
67 0.16
68 0.24
69 0.3
70 0.33
71 0.37
72 0.42
73 0.5
74 0.54
75 0.61
76 0.61
77 0.64
78 0.67
79 0.72
80 0.72
81 0.68
82 0.67
83 0.62
84 0.62
85 0.61
86 0.62
87 0.62
88 0.64
89 0.6
90 0.61
91 0.57
92 0.48
93 0.43
94 0.37
95 0.35
96 0.32
97 0.35
98 0.33
99 0.35
100 0.34
101 0.34
102 0.33
103 0.27
104 0.25
105 0.27
106 0.27
107 0.28
108 0.31
109 0.31
110 0.29
111 0.29
112 0.28
113 0.22
114 0.2
115 0.15
116 0.12
117 0.11
118 0.12
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.11
126 0.12
127 0.2
128 0.21
129 0.21
130 0.2
131 0.21
132 0.2
133 0.19
134 0.19
135 0.13
136 0.13
137 0.15
138 0.15
139 0.15
140 0.14
141 0.14
142 0.14
143 0.12
144 0.12
145 0.11
146 0.13
147 0.16
148 0.17
149 0.17
150 0.16
151 0.15
152 0.18
153 0.16
154 0.15
155 0.13
156 0.13
157 0.14
158 0.13
159 0.13
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.09
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.22
170 0.23
171 0.26
172 0.26
173 0.28
174 0.33
175 0.38
176 0.38
177 0.31
178 0.32
179 0.29
180 0.37
181 0.36
182 0.29
183 0.27
184 0.29
185 0.28
186 0.27
187 0.24
188 0.16
189 0.15
190 0.14
191 0.12
192 0.1
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.14
200 0.13
201 0.13
202 0.13
203 0.13
204 0.15
205 0.16
206 0.17
207 0.14
208 0.14
209 0.12
210 0.11
211 0.11
212 0.08
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.13
221 0.18
222 0.24
223 0.28
224 0.32
225 0.37
226 0.41
227 0.46
228 0.52
229 0.53
230 0.5
231 0.46
232 0.47
233 0.42
234 0.44
235 0.44
236 0.38
237 0.33
238 0.31
239 0.32
240 0.28
241 0.26
242 0.23
243 0.22
244 0.24
245 0.24
246 0.24
247 0.23
248 0.23
249 0.31
250 0.34
251 0.36
252 0.37
253 0.38
254 0.38
255 0.42
256 0.43
257 0.4
258 0.36
259 0.33
260 0.32
261 0.32
262 0.33
263 0.32
264 0.32
265 0.27
266 0.25
267 0.22
268 0.17
269 0.16
270 0.14
271 0.1
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.12
278 0.14
279 0.14
280 0.14
281 0.14
282 0.17
283 0.2
284 0.28
285 0.34
286 0.43
287 0.52
288 0.62
289 0.72
290 0.73
291 0.78
292 0.78
293 0.78
294 0.76
295 0.76
296 0.77
297 0.77
298 0.78
299 0.71
300 0.62
301 0.54
302 0.47
303 0.4
304 0.3
305 0.23
306 0.2
307 0.2
308 0.21
309 0.24
310 0.22
311 0.2
312 0.21
313 0.21
314 0.26
315 0.31
316 0.34
317 0.38
318 0.47
319 0.54
320 0.62
321 0.68
322 0.68
323 0.68
324 0.7
325 0.68
326 0.67
327 0.6
328 0.51
329 0.45
330 0.39
331 0.33
332 0.27
333 0.2
334 0.13
335 0.14
336 0.11
337 0.1
338 0.08
339 0.09
340 0.15
341 0.15
342 0.16
343 0.15
344 0.16
345 0.16
346 0.19
347 0.2
348 0.15
349 0.15
350 0.13
351 0.14
352 0.14
353 0.13
354 0.11
355 0.08
356 0.06
357 0.07
358 0.07
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.07
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.06
370 0.07
371 0.06
372 0.04
373 0.04
374 0.05
375 0.05
376 0.06
377 0.06
378 0.08
379 0.08
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.09
384 0.08
385 0.09
386 0.09
387 0.1
388 0.09
389 0.09
390 0.09
391 0.08
392 0.08
393 0.07
394 0.06
395 0.06
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.11
400 0.13
401 0.13
402 0.13
403 0.13
404 0.12
405 0.12
406 0.17
407 0.17
408 0.17
409 0.17
410 0.17
411 0.2
412 0.2
413 0.2
414 0.18
415 0.19
416 0.22
417 0.22
418 0.22
419 0.2
420 0.2
421 0.2
422 0.18
423 0.18
424 0.14
425 0.16
426 0.23
427 0.24
428 0.26
429 0.33
430 0.34
431 0.38
432 0.38
433 0.39
434 0.33
435 0.38
436 0.37
437 0.31
438 0.34
439 0.26
440 0.28
441 0.27
442 0.28
443 0.23
444 0.24
445 0.25
446 0.24
447 0.32
448 0.36
449 0.38
450 0.4
451 0.4
452 0.39
453 0.39
454 0.39
455 0.33
456 0.29
457 0.23
458 0.21
459 0.2
460 0.19
461 0.18
462 0.14
463 0.12
464 0.12
465 0.12
466 0.09
467 0.1
468 0.11
469 0.11
470 0.16
471 0.19
472 0.18
473 0.23
474 0.23
475 0.23
476 0.23
477 0.22
478 0.19
479 0.16
480 0.14
481 0.08
482 0.08
483 0.08
484 0.07
485 0.06
486 0.04
487 0.04
488 0.06
489 0.09
490 0.12
491 0.19
492 0.21
493 0.25
494 0.3
495 0.33
496 0.4
497 0.48
498 0.56
499 0.61
500 0.69
501 0.76
502 0.79
503 0.78
504 0.74
505 0.66
506 0.6
507 0.55
508 0.47
509 0.41
510 0.36
511 0.34
512 0.3
513 0.27
514 0.22
515 0.16
516 0.12
517 0.08
518 0.05
519 0.06
520 0.06
521 0.07
522 0.08
523 0.09
524 0.11
525 0.12
526 0.12
527 0.12
528 0.12
529 0.11
530 0.09
531 0.1
532 0.09
533 0.1
534 0.13
535 0.14
536 0.2
537 0.24
538 0.34
539 0.43
540 0.53
541 0.6
542 0.68
543 0.78
544 0.83
545 0.9
546 0.92
547 0.94
548 0.96
549 0.96
550 0.95
551 0.95
552 0.93
553 0.9
554 0.89
555 0.87
556 0.79
557 0.69
558 0.59
559 0.48
560 0.4
561 0.34
562 0.26
563 0.21
564 0.22