FuNGI

A0A1W2TTS1

Protein Details

Accession

A0A1W2TTS1

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
11-34	GQKPPPREMGHYRRQRPNAGNPMV	Hydrophilic
195-218	APVLKEAERKRQQQKNKDEKKTGT	Hydrophilic
525-544	AESTRNKKKKKLGPTNSVAG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
24-40	RQRPNAGNPMVPRKKPV
489-536	SKGPGTPQGKKAAADAAKKGKSLKRPGSPLGSDSSGAESTRNKKKKKL

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSASPSAGPNGQKPPPREMGHYRRQRPNAGNPMVPRKKPVPRPLPATTTVAHRGIGPSKIAGDSKPVPRPDQSAPRFESQRAKNGGWATPLPDGGQEFPLFVTKKALKDGLRFHVMRIVPQKRGVTQAKIDPADQEQFPRPVTLQRRDPRQPPPGHKEKEEPVEQPPPNSEEAERQAQLKAQRDAQRALDDAQKAPVLKEAERKRQQQKNKDEKKTGTQIHYQPRTEKQKKEAEIRYEEALPWHLEDADGKQIWVGQYEAPLSNLKVALVPYPETGGYRMLPLEKWYKFTPKRGAFQHMTIEEAEKLMGKKAAPTRWAIRDNDRNKAATAREESRRIMYGPTAVKQESSTFQSASRREKMEHDDIDMSGDEFQDDDETAGFEPDRDEDAKDTKERVRREQLGANLFGAADEKEVEKEEAEVQKEEEERKVFGKDLKKALRKRDKQFQYDSDSSNEDPFASSSSESGSDSEKEDEDAKADKDKNGAGSSSKGPGTPQGKKAAADAAKKGKSLKRPGSPLGSDSSGAESTRNKKKKKLGPTNSVAGSRGATPLPGGQPARGAGSTSDGEATAGEMSDGAGGKIKRRPHLGTGAKGTPAGSRASSPWATSPGVNQDSSKPVTAQEILAALPALPSGITIGGLLKVFENRVGEAGSASRKEWLQLVKENTIFTQSDKLLRRKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.57
3	0.57
4	0.59
5	0.62
6	0.65
7	0.69
8	0.76
9	0.78
10	0.79
11	0.81
12	0.83
13	0.8
14	0.81
15	0.81
16	0.76
17	0.72
18	0.69
19	0.74
20	0.73
21	0.67
22	0.63
23	0.6
24	0.65
25	0.69
26	0.73
27	0.72
28	0.71
29	0.78
30	0.78
31	0.75
32	0.69
33	0.63
34	0.53
35	0.5
36	0.47
37	0.4
38	0.34
39	0.28
40	0.29
41	0.29
42	0.3
43	0.25
44	0.21
45	0.21
46	0.24
47	0.24
48	0.2
49	0.24
50	0.28
51	0.34
52	0.41
53	0.42
54	0.43
55	0.45
56	0.5
57	0.51
58	0.55
59	0.53
60	0.54
61	0.55
62	0.59
63	0.59
64	0.58
65	0.59
66	0.53
67	0.57
68	0.55
69	0.52
70	0.49
71	0.5
72	0.48
73	0.43
74	0.39
75	0.33
76	0.29
77	0.29
78	0.24
79	0.22
80	0.21
81	0.18
82	0.2
83	0.16
84	0.14
85	0.14
86	0.2
87	0.19
88	0.18
89	0.24
90	0.25
91	0.27
92	0.31
93	0.37
94	0.35
95	0.4
96	0.47
97	0.46
98	0.5
99	0.48
100	0.44
101	0.45
102	0.42
103	0.42
104	0.45
105	0.43
106	0.39
107	0.45
108	0.47
109	0.41
110	0.5
111	0.48
112	0.44
113	0.43
114	0.45
115	0.47
116	0.46
117	0.44
118	0.37
119	0.36
120	0.34
121	0.3
122	0.28
123	0.26
124	0.27
125	0.27
126	0.27
127	0.24
128	0.28
129	0.36
130	0.4
131	0.46
132	0.5
133	0.59
134	0.64
135	0.7
136	0.7
137	0.72
138	0.73
139	0.72
140	0.75
141	0.76
142	0.74
143	0.71
144	0.68
145	0.65
146	0.64
147	0.58
148	0.51
149	0.47
150	0.51
151	0.48
152	0.44
153	0.4
154	0.35
155	0.32
156	0.31
157	0.27
158	0.23
159	0.27
160	0.3
161	0.28
162	0.27
163	0.26
164	0.28
165	0.32
166	0.33
167	0.31
168	0.34
169	0.41
170	0.44
171	0.46
172	0.45
173	0.42
174	0.37
175	0.36
176	0.33
177	0.27
178	0.24
179	0.23
180	0.22
181	0.2
182	0.18
183	0.21
184	0.19
185	0.19
186	0.28
187	0.34
188	0.43
189	0.51
190	0.59
191	0.64
192	0.7
193	0.78
194	0.79
195	0.82
196	0.83
197	0.86
198	0.86
199	0.84
200	0.79
201	0.77
202	0.76
203	0.71
204	0.64
205	0.61
206	0.6
207	0.62
208	0.65
209	0.59
210	0.54
211	0.57
212	0.64
213	0.64
214	0.61
215	0.59
216	0.61
217	0.64
218	0.69
219	0.67
220	0.62
221	0.6
222	0.57
223	0.51
224	0.43
225	0.38
226	0.3
227	0.25
228	0.18
229	0.14
230	0.12
231	0.09
232	0.08
233	0.09
234	0.1
235	0.13
236	0.13
237	0.12
238	0.12
239	0.13
240	0.13
241	0.13
242	0.12
243	0.07
244	0.08
245	0.1
246	0.11
247	0.11
248	0.11
249	0.11
250	0.11
251	0.11
252	0.1
253	0.09
254	0.09
255	0.1
256	0.1
257	0.11
258	0.1
259	0.11
260	0.11
261	0.1
262	0.11
263	0.1
264	0.09
265	0.09
266	0.09
267	0.09
268	0.09
269	0.12
270	0.18
271	0.18
272	0.21
273	0.23
274	0.32
275	0.35
276	0.42
277	0.49
278	0.47
279	0.52
280	0.53
281	0.58
282	0.5
283	0.49
284	0.47
285	0.37
286	0.33
287	0.27
288	0.24
289	0.17
290	0.15
291	0.12
292	0.08
293	0.08
294	0.08
295	0.09
296	0.08
297	0.13
298	0.18
299	0.21
300	0.22
301	0.25
302	0.28
303	0.34
304	0.38
305	0.36
306	0.38
307	0.44
308	0.46
309	0.49
310	0.46
311	0.4
312	0.36
313	0.37
314	0.31
315	0.25
316	0.26
317	0.25
318	0.27
319	0.29
320	0.29
321	0.27
322	0.27
323	0.24
324	0.2
325	0.16
326	0.17
327	0.16
328	0.16
329	0.17
330	0.16
331	0.16
332	0.15
333	0.17
334	0.13
335	0.16
336	0.15
337	0.14
338	0.16
339	0.21
340	0.24
341	0.29
342	0.31
343	0.29
344	0.29
345	0.33
346	0.37
347	0.38
348	0.35
349	0.31
350	0.28
351	0.26
352	0.26
353	0.22
354	0.16
355	0.1
356	0.09
357	0.06
358	0.05
359	0.05
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.06
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.1
375	0.13
376	0.16
377	0.17
378	0.19
379	0.23
380	0.28
381	0.31
382	0.37
383	0.42
384	0.44
385	0.47
386	0.48
387	0.48
388	0.46
389	0.43
390	0.36
391	0.27
392	0.22
393	0.18
394	0.14
395	0.09
396	0.06
397	0.05
398	0.05
399	0.06
400	0.07
401	0.08
402	0.07
403	0.08
404	0.12
405	0.15
406	0.16
407	0.16
408	0.16
409	0.18
410	0.2
411	0.2
412	0.2
413	0.18
414	0.17
415	0.19
416	0.19
417	0.19
418	0.23
419	0.28
420	0.3
421	0.38
422	0.46
423	0.53
424	0.57
425	0.66
426	0.71
427	0.74
428	0.75
429	0.77
430	0.77
431	0.75
432	0.76
433	0.71
434	0.68
435	0.63
436	0.57
437	0.49
438	0.43
439	0.37
440	0.31
441	0.26
442	0.17
443	0.14
444	0.12
445	0.12
446	0.1
447	0.09
448	0.08
449	0.09
450	0.1
451	0.1
452	0.11
453	0.11
454	0.11
455	0.13
456	0.14
457	0.13
458	0.14
459	0.15
460	0.14
461	0.14
462	0.15
463	0.15
464	0.2
465	0.21
466	0.21
467	0.22
468	0.23
469	0.25
470	0.23
471	0.23
472	0.18
473	0.2
474	0.2
475	0.22
476	0.21
477	0.18
478	0.17
479	0.24
480	0.29
481	0.33
482	0.35
483	0.39
484	0.41
485	0.41
486	0.42
487	0.42
488	0.4
489	0.37
490	0.38
491	0.4
492	0.4
493	0.41
494	0.45
495	0.43
496	0.47
497	0.53
498	0.56
499	0.55
500	0.6
501	0.64
502	0.65
503	0.61
504	0.54
505	0.48
506	0.4
507	0.32
508	0.27
509	0.25
510	0.19
511	0.17
512	0.17
513	0.19
514	0.25
515	0.36
516	0.44
517	0.45
518	0.52
519	0.62
520	0.69
521	0.75
522	0.79
523	0.78
524	0.8
525	0.81
526	0.8
527	0.73
528	0.66
529	0.55
530	0.45
531	0.35
532	0.26
533	0.22
534	0.15
535	0.12
536	0.11
537	0.14
538	0.14
539	0.19
540	0.18
541	0.17
542	0.19
543	0.2
544	0.22
545	0.18
546	0.18
547	0.13
548	0.16
549	0.16
550	0.15
551	0.14
552	0.12
553	0.11
554	0.1
555	0.11
556	0.07
557	0.06
558	0.05
559	0.05
560	0.05
561	0.07
562	0.07
563	0.06
564	0.11
565	0.11
566	0.16
567	0.22
568	0.27
569	0.31
570	0.38
571	0.43
572	0.44
573	0.55
574	0.57
575	0.6
576	0.61
577	0.58
578	0.52
579	0.48
580	0.42
581	0.33
582	0.28
583	0.23
584	0.17
585	0.16
586	0.17
587	0.23
588	0.23
589	0.23
590	0.24
591	0.25
592	0.26
593	0.24
594	0.26
595	0.29
596	0.31
597	0.31
598	0.29
599	0.29
600	0.34
601	0.36
602	0.34
603	0.25
604	0.23
605	0.27
606	0.27
607	0.23
608	0.19
609	0.17
610	0.15
611	0.15
612	0.14
613	0.1
614	0.08
615	0.07
616	0.06
617	0.04
618	0.04
619	0.05
620	0.05
621	0.05
622	0.05
623	0.07
624	0.08
625	0.09
626	0.09
627	0.1
628	0.12
629	0.12
630	0.15
631	0.16
632	0.15
633	0.16
634	0.17
635	0.16
636	0.15
637	0.18
638	0.21
639	0.2
640	0.2
641	0.23
642	0.22
643	0.23
644	0.28
645	0.3
646	0.31
647	0.37
648	0.43
649	0.46
650	0.48
651	0.48
652	0.43
653	0.42
654	0.36
655	0.3
656	0.31
657	0.27
658	0.33
659	0.4

A0A1W2TTS1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer