Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1W2TXC0

Protein Details
Accession A0A1W2TXC0    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-87DEETARLERKQKKAAKLERKKMKKDKKEKEKKKKNKGVADEDEEEBasic
115-146EPTAATPSKKSKKDKKQKKQKKPTKTTETETTHydrophilic
332-353QEEARARDKKERLKGKAGKGTGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-78RLERKQKKAAKLERKKMKKDKKEKEKKKKNK
122-138SKKSKKDKKQKKQKKPT
270-275RRGGRG
312-354RKERIRAKNEKLNEERARRAQEEARARDKKERLKGKAGKGTGK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSSSRKRKSHDDDEPTVATAAAATATDASNTKRRRLSAAGGEDEETARLERKQKKAAKLERKKMKKDKKEKEKKKKNKGVADEDEEETPAGVQGDVEEEEAADPDEAKADTTAAEPTAATPSKKSKKDKKQKKQKKPTKTTETETTAEDPSTDADAEAGAEAEAGAETGADAKKRFIVFVGNLPYSATPAQITEHFASVHPTSVRLLHRRDDPSRSRGVAFVEFARYDHMKTALKLFHHSTFKTTTTTSTSTSSSSSSTPGSGRGGRDQRRGGRGNSNGNGGGRPPKAWEGEEERRINVELTAGGGGNTEFRKERIRAKNEKLNEERARRAQEEARARDKKERLKGKAGKGTGKGTGEGGEGEDEEEKASEADAVHPSRRGRVPGST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.61
3 0.51
4 0.4
5 0.29
6 0.2
7 0.14
8 0.08
9 0.06
10 0.05
11 0.06
12 0.06
13 0.08
14 0.09
15 0.13
16 0.22
17 0.25
18 0.32
19 0.36
20 0.39
21 0.44
22 0.48
23 0.52
24 0.53
25 0.57
26 0.54
27 0.5
28 0.49
29 0.44
30 0.39
31 0.31
32 0.22
33 0.16
34 0.13
35 0.16
36 0.24
37 0.32
38 0.39
39 0.49
40 0.56
41 0.65
42 0.73
43 0.8
44 0.83
45 0.85
46 0.88
47 0.88
48 0.91
49 0.92
50 0.92
51 0.92
52 0.92
53 0.92
54 0.93
55 0.94
56 0.95
57 0.96
58 0.96
59 0.97
60 0.96
61 0.97
62 0.96
63 0.94
64 0.93
65 0.9
66 0.89
67 0.85
68 0.81
69 0.73
70 0.64
71 0.55
72 0.45
73 0.36
74 0.25
75 0.18
76 0.11
77 0.08
78 0.06
79 0.05
80 0.05
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.07
88 0.07
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.07
93 0.06
94 0.07
95 0.07
96 0.06
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.13
105 0.14
106 0.13
107 0.16
108 0.26
109 0.34
110 0.42
111 0.52
112 0.57
113 0.67
114 0.78
115 0.86
116 0.88
117 0.91
118 0.94
119 0.96
120 0.96
121 0.95
122 0.95
123 0.94
124 0.94
125 0.93
126 0.87
127 0.82
128 0.78
129 0.73
130 0.63
131 0.54
132 0.46
133 0.36
134 0.3
135 0.24
136 0.16
137 0.12
138 0.11
139 0.09
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.05
144 0.05
145 0.04
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.02
152 0.02
153 0.02
154 0.02
155 0.04
156 0.05
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.11
161 0.11
162 0.12
163 0.1
164 0.13
165 0.13
166 0.18
167 0.22
168 0.19
169 0.19
170 0.19
171 0.18
172 0.16
173 0.15
174 0.1
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.08
179 0.11
180 0.1
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.13
185 0.13
186 0.14
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.15
191 0.19
192 0.21
193 0.23
194 0.25
195 0.31
196 0.36
197 0.39
198 0.42
199 0.44
200 0.43
201 0.45
202 0.42
203 0.37
204 0.32
205 0.32
206 0.25
207 0.21
208 0.17
209 0.16
210 0.14
211 0.14
212 0.15
213 0.14
214 0.13
215 0.13
216 0.16
217 0.15
218 0.16
219 0.21
220 0.21
221 0.21
222 0.24
223 0.26
224 0.28
225 0.31
226 0.31
227 0.29
228 0.29
229 0.3
230 0.29
231 0.26
232 0.22
233 0.22
234 0.24
235 0.23
236 0.21
237 0.21
238 0.2
239 0.2
240 0.19
241 0.16
242 0.14
243 0.14
244 0.13
245 0.13
246 0.13
247 0.14
248 0.16
249 0.17
250 0.19
251 0.25
252 0.34
253 0.38
254 0.44
255 0.49
256 0.52
257 0.57
258 0.59
259 0.54
260 0.54
261 0.55
262 0.56
263 0.51
264 0.48
265 0.42
266 0.38
267 0.35
268 0.28
269 0.29
270 0.21
271 0.2
272 0.2
273 0.22
274 0.24
275 0.24
276 0.28
277 0.3
278 0.38
279 0.45
280 0.44
281 0.41
282 0.4
283 0.4
284 0.35
285 0.26
286 0.19
287 0.11
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.1
295 0.1
296 0.11
297 0.12
298 0.14
299 0.21
300 0.24
301 0.34
302 0.41
303 0.51
304 0.58
305 0.66
306 0.73
307 0.73
308 0.8
309 0.75
310 0.75
311 0.74
312 0.71
313 0.69
314 0.67
315 0.67
316 0.59
317 0.59
318 0.54
319 0.54
320 0.57
321 0.57
322 0.61
323 0.6
324 0.62
325 0.66
326 0.69
327 0.69
328 0.69
329 0.72
330 0.69
331 0.75
332 0.8
333 0.81
334 0.81
335 0.78
336 0.75
337 0.7
338 0.66
339 0.61
340 0.54
341 0.45
342 0.37
343 0.33
344 0.26
345 0.21
346 0.18
347 0.13
348 0.11
349 0.11
350 0.11
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.09
355 0.08
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.12
360 0.19
361 0.22
362 0.24
363 0.29
364 0.31
365 0.37
366 0.41
367 0.42