FuNGI

C6H2Q1

Protein Details

Accession

C6H2Q1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-25	KFQHPSHHPHHSQQHPHHQHPHS	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 9, mito 9, mito_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036691 Endo/exonu/phosph_ase_sf IPR005135 Endo/exonuclease/phosphatase IPR001611 Leu-rich_rpt IPR003591 Leu-rich_rpt_typical-subtyp IPR032675 LRR_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0046872 F:metal ion binding GO:0004535 F:poly(A)-specific ribonuclease activity GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF03372 Exo_endo_phos PF13855 LRR_8
PROSITE	View protein in PROSITE PS51450 LRR
CDD	cd09097 Deadenylase_CCR4

Amino Acid Sequences

MQKFQHPSHHPHHSQQHPHHQHPHSQATHTAIGHQPNFSSGALSSTAPHFTPTHIPNGTTTNVDEEVEEPMNEHWQQQLQLAAESRQANSPHYYARAVAQQTKGIQLTTSPAETNENGSEERSRAKTTKDPSKRQDWMALDFGGQGLRAISTPLFDYVFLEKLYLNHNKLKALPPNIGKLKGLTHLDVSGNELTELPEEIGMLINLKKLLLFDNNIHSLPYEMGYLYQLDTLGIEGNPLNEVFKSRIMQEGTKALITYLKEEMPVHLPPSERDWVVLDDSDRNPTKGQREKFTALSYNTLCDRSATHQQHGYAPSRALAWEYRRDLILNEIKGYNADIVCLQEIDQGSYHGFFREQLAYNDYKGVYWPKGRAQGMPEEEAKVVDGCATFFKGSKYILLEKNMIHFGQTAVRRPDAKGQDDIYNRLWQKDNIAVVTYLENRLSGERLIVVNVHLYWDPAYKDVKLIQAAILMEEVTQLAEKYSKIPACTDKTAFRFSEPEHSTDGGGTATPVEPAPSVEYSSGSHIPLIICGDFNSYPGSAVHELMSRGRLIEDHPDLEKRLYGNLSRVGMSYPFNLKSAYGAIGELDFTNYTPDFADVIDYIWYTSSALQVTGLLGAVDKEYLQRVPGFPNYHFPSDHLALMAEFSFKSKKGKVVEVDFGPQRDRDRDRDRDRAT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.77
2	0.79
3	0.82
4	0.8
5	0.84
6	0.85
7	0.79
8	0.78
9	0.76
10	0.76
11	0.68
12	0.62
13	0.58
14	0.54
15	0.55
16	0.46
17	0.42
18	0.37
19	0.4
20	0.39
21	0.36
22	0.3
23	0.27
24	0.29
25	0.25
26	0.22
27	0.14
28	0.15
29	0.15
30	0.16
31	0.15
32	0.15
33	0.17
34	0.16
35	0.19
36	0.17
37	0.18
38	0.26
39	0.27
40	0.33
41	0.33
42	0.33
43	0.33
44	0.36
45	0.35
46	0.28
47	0.26
48	0.22
49	0.22
50	0.21
51	0.19
52	0.16
53	0.19
54	0.18
55	0.17
56	0.14
57	0.13
58	0.18
59	0.18
60	0.18
61	0.17
62	0.19
63	0.2
64	0.21
65	0.24
66	0.2
67	0.22
68	0.23
69	0.22
70	0.24
71	0.25
72	0.24
73	0.25
74	0.26
75	0.26
76	0.28
77	0.29
78	0.27
79	0.28
80	0.28
81	0.24
82	0.25
83	0.29
84	0.29
85	0.33
86	0.32
87	0.33
88	0.33
89	0.36
90	0.34
91	0.28
92	0.24
93	0.18
94	0.2
95	0.19
96	0.19
97	0.15
98	0.15
99	0.19
100	0.19
101	0.22
102	0.2
103	0.2
104	0.18
105	0.2
106	0.21
107	0.19
108	0.24
109	0.23
110	0.26
111	0.26
112	0.31
113	0.37
114	0.43
115	0.53
116	0.58
117	0.65
118	0.67
119	0.74
120	0.74
121	0.7
122	0.7
123	0.62
124	0.56
125	0.5
126	0.44
127	0.34
128	0.29
129	0.25
130	0.17
131	0.14
132	0.09
133	0.06
134	0.06
135	0.05
136	0.07
137	0.06
138	0.07
139	0.08
140	0.09
141	0.1
142	0.09
143	0.11
144	0.12
145	0.14
146	0.13
147	0.13
148	0.12
149	0.13
150	0.19
151	0.23
152	0.25
153	0.29
154	0.31
155	0.32
156	0.35
157	0.4
158	0.42
159	0.39
160	0.42
161	0.39
162	0.46
163	0.48
164	0.47
165	0.4
166	0.34
167	0.32
168	0.31
169	0.3
170	0.23
171	0.2
172	0.2
173	0.21
174	0.2
175	0.21
176	0.16
177	0.14
178	0.13
179	0.12
180	0.11
181	0.1
182	0.11
183	0.07
184	0.06
185	0.06
186	0.06
187	0.06
188	0.05
189	0.06
190	0.06
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.1
197	0.11
198	0.13
199	0.15
200	0.2
201	0.23
202	0.23
203	0.22
204	0.2
205	0.17
206	0.16
207	0.14
208	0.09
209	0.06
210	0.07
211	0.07
212	0.08
213	0.07
214	0.07
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.05
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.07
225	0.07
226	0.07
227	0.06
228	0.08
229	0.09
230	0.11
231	0.12
232	0.12
233	0.17
234	0.19
235	0.2
236	0.2
237	0.21
238	0.2
239	0.19
240	0.19
241	0.14
242	0.14
243	0.14
244	0.14
245	0.13
246	0.12
247	0.13
248	0.13
249	0.15
250	0.15
251	0.15
252	0.14
253	0.15
254	0.15
255	0.15
256	0.19
257	0.2
258	0.17
259	0.17
260	0.17
261	0.16
262	0.16
263	0.16
264	0.12
265	0.14
266	0.15
267	0.2
268	0.19
269	0.18
270	0.19
271	0.22
272	0.29
273	0.33
274	0.36
275	0.36
276	0.42
277	0.43
278	0.44
279	0.43
280	0.4
281	0.33
282	0.34
283	0.28
284	0.24
285	0.22
286	0.21
287	0.18
288	0.14
289	0.14
290	0.14
291	0.24
292	0.25
293	0.26
294	0.28
295	0.29
296	0.33
297	0.34
298	0.33
299	0.24
300	0.22
301	0.2
302	0.18
303	0.17
304	0.14
305	0.14
306	0.14
307	0.19
308	0.2
309	0.2
310	0.2
311	0.21
312	0.19
313	0.23
314	0.24
315	0.19
316	0.18
317	0.18
318	0.17
319	0.17
320	0.17
321	0.12
322	0.07
323	0.07
324	0.06
325	0.07
326	0.07
327	0.07
328	0.06
329	0.07
330	0.07
331	0.08
332	0.07
333	0.07
334	0.08
335	0.08
336	0.08
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.08
341	0.12
342	0.13
343	0.13
344	0.17
345	0.17
346	0.18
347	0.19
348	0.17
349	0.13
350	0.13
351	0.15
352	0.14
353	0.16
354	0.18
355	0.2
356	0.27
357	0.28
358	0.28
359	0.27
360	0.31
361	0.31
362	0.31
363	0.28
364	0.22
365	0.22
366	0.2
367	0.18
368	0.11
369	0.09
370	0.07
371	0.06
372	0.05
373	0.06
374	0.07
375	0.07
376	0.08
377	0.09
378	0.1
379	0.1
380	0.11
381	0.14
382	0.19
383	0.22
384	0.24
385	0.25
386	0.24
387	0.26
388	0.26
389	0.23
390	0.17
391	0.14
392	0.12
393	0.16
394	0.18
395	0.2
396	0.21
397	0.24
398	0.24
399	0.25
400	0.33
401	0.33
402	0.33
403	0.31
404	0.31
405	0.35
406	0.36
407	0.38
408	0.32
409	0.33
410	0.31
411	0.3
412	0.3
413	0.24
414	0.25
415	0.26
416	0.25
417	0.19
418	0.19
419	0.17
420	0.15
421	0.17
422	0.16
423	0.13
424	0.11
425	0.11
426	0.1
427	0.11
428	0.11
429	0.09
430	0.08
431	0.09
432	0.09
433	0.09
434	0.09
435	0.08
436	0.08
437	0.08
438	0.1
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.1
443	0.11
444	0.12
445	0.14
446	0.12
447	0.14
448	0.16
449	0.19
450	0.17
451	0.17
452	0.15
453	0.16
454	0.15
455	0.14
456	0.12
457	0.09
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.04
462	0.04
463	0.04
464	0.05
465	0.06
466	0.06
467	0.08
468	0.14
469	0.16
470	0.17
471	0.2
472	0.27
473	0.31
474	0.36
475	0.37
476	0.38
477	0.4
478	0.44
479	0.41
480	0.36
481	0.34
482	0.31
483	0.38
484	0.33
485	0.32
486	0.3
487	0.3
488	0.28
489	0.25
490	0.24
491	0.13
492	0.11
493	0.09
494	0.07
495	0.06
496	0.07
497	0.07
498	0.07
499	0.07
500	0.08
501	0.11
502	0.11
503	0.12
504	0.12
505	0.13
506	0.13
507	0.18
508	0.18
509	0.16
510	0.15
511	0.15
512	0.15
513	0.15
514	0.16
515	0.11
516	0.1
517	0.1
518	0.14
519	0.13
520	0.13
521	0.14
522	0.12
523	0.13
524	0.12
525	0.17
526	0.14
527	0.15
528	0.16
529	0.16
530	0.17
531	0.17
532	0.19
533	0.14
534	0.13
535	0.13
536	0.12
537	0.12
538	0.19
539	0.21
540	0.21
541	0.24
542	0.26
543	0.27
544	0.27
545	0.28
546	0.21
547	0.21
548	0.23
549	0.22
550	0.25
551	0.28
552	0.29
553	0.27
554	0.27
555	0.25
556	0.23
557	0.23
558	0.22
559	0.22
560	0.22
561	0.22
562	0.22
563	0.2
564	0.2
565	0.2
566	0.18
567	0.13
568	0.12
569	0.11
570	0.11
571	0.12
572	0.1
573	0.1
574	0.08
575	0.08
576	0.11
577	0.11
578	0.11
579	0.11
580	0.12
581	0.11
582	0.1
583	0.12
584	0.09
585	0.1
586	0.11
587	0.1
588	0.09
589	0.09
590	0.1
591	0.08
592	0.09
593	0.1
594	0.1
595	0.1
596	0.1
597	0.1
598	0.1
599	0.1
600	0.09
601	0.06
602	0.06
603	0.06
604	0.06
605	0.06
606	0.06
607	0.07
608	0.1
609	0.11
610	0.13
611	0.16
612	0.17
613	0.22
614	0.29
615	0.32
616	0.31
617	0.41
618	0.44
619	0.44
620	0.43
621	0.4
622	0.4
623	0.38
624	0.37
625	0.28
626	0.23
627	0.19
628	0.2
629	0.19
630	0.12
631	0.1
632	0.12
633	0.15
634	0.16
635	0.23
636	0.25
637	0.32
638	0.36
639	0.45
640	0.5
641	0.54
642	0.59
643	0.56
644	0.59
645	0.56
646	0.53
647	0.47
648	0.42
649	0.41
650	0.42
651	0.44
652	0.47
653	0.52
654	0.61
655	0.67

C6H2Q1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer