Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1W2TT42

Protein Details
Accession A0A1W2TT42    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-120GVWVIRKQTRRKRDPEDEIIHydrophilic
301-327KTPKTPTSGTSKLKRKRSKTGQTPVSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
289-319KKSKDGPTKAGDKTPKTPTSGTSKLKRKRSK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MKNMASQNEPPLDEIQWRHPQWAQEMQGIHSNSVLFYFAQSPFFDPTSNNAVLANQAIHNPTMYHLIQTREAFEGRLREMSGLEFIVAQEPAETAPGTGTGVWVIRKQTRRKRDPEDEIIVHSTYYIVGENIYMAPTLAQVLSFRVTTITSALNKCFPAADEARVWSPSRGHVYKIAQTTTNTRPRNIAGSKETTPRPDGKAPLNNNKGINAHETKRSDPVLSKFDLLWHAEQSMSVQMQCGGDYEDENPITGKPGAFNLSKTGRTDKLQVPGITALNTSSSILDLGGKKSKDGPTKAGDKTPKTPTSGTSKLKRKRSKTGQTPVSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.34
3 0.39
4 0.39
5 0.41
6 0.42
7 0.44
8 0.45
9 0.5
10 0.45
11 0.4
12 0.4
13 0.39
14 0.42
15 0.4
16 0.34
17 0.26
18 0.23
19 0.18
20 0.17
21 0.16
22 0.09
23 0.1
24 0.13
25 0.13
26 0.16
27 0.16
28 0.18
29 0.2
30 0.21
31 0.2
32 0.18
33 0.21
34 0.26
35 0.25
36 0.23
37 0.2
38 0.19
39 0.19
40 0.2
41 0.16
42 0.1
43 0.11
44 0.12
45 0.12
46 0.13
47 0.12
48 0.12
49 0.16
50 0.15
51 0.16
52 0.18
53 0.21
54 0.25
55 0.26
56 0.27
57 0.24
58 0.24
59 0.23
60 0.22
61 0.23
62 0.2
63 0.21
64 0.19
65 0.17
66 0.17
67 0.17
68 0.15
69 0.12
70 0.1
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.08
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.06
81 0.05
82 0.05
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.05
88 0.07
89 0.08
90 0.1
91 0.13
92 0.19
93 0.27
94 0.37
95 0.46
96 0.56
97 0.64
98 0.7
99 0.77
100 0.8
101 0.8
102 0.78
103 0.75
104 0.65
105 0.59
106 0.53
107 0.43
108 0.33
109 0.24
110 0.17
111 0.1
112 0.09
113 0.06
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.09
137 0.11
138 0.13
139 0.14
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.13
144 0.11
145 0.13
146 0.13
147 0.14
148 0.13
149 0.14
150 0.15
151 0.16
152 0.16
153 0.12
154 0.12
155 0.13
156 0.18
157 0.18
158 0.19
159 0.23
160 0.25
161 0.29
162 0.3
163 0.28
164 0.24
165 0.24
166 0.28
167 0.31
168 0.38
169 0.34
170 0.33
171 0.33
172 0.33
173 0.39
174 0.35
175 0.32
176 0.27
177 0.3
178 0.32
179 0.35
180 0.36
181 0.31
182 0.32
183 0.31
184 0.32
185 0.31
186 0.32
187 0.33
188 0.4
189 0.44
190 0.51
191 0.52
192 0.51
193 0.48
194 0.46
195 0.4
196 0.34
197 0.33
198 0.28
199 0.26
200 0.29
201 0.31
202 0.3
203 0.33
204 0.33
205 0.29
206 0.29
207 0.31
208 0.29
209 0.28
210 0.27
211 0.23
212 0.24
213 0.25
214 0.23
215 0.2
216 0.17
217 0.16
218 0.14
219 0.14
220 0.13
221 0.13
222 0.12
223 0.1
224 0.09
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.1
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.11
233 0.13
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.11
238 0.14
239 0.14
240 0.13
241 0.1
242 0.13
243 0.17
244 0.17
245 0.18
246 0.21
247 0.25
248 0.27
249 0.29
250 0.32
251 0.32
252 0.34
253 0.39
254 0.38
255 0.41
256 0.45
257 0.42
258 0.4
259 0.39
260 0.38
261 0.32
262 0.27
263 0.2
264 0.15
265 0.15
266 0.13
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.12
272 0.13
273 0.17
274 0.23
275 0.23
276 0.24
277 0.31
278 0.38
279 0.42
280 0.45
281 0.47
282 0.47
283 0.56
284 0.58
285 0.6
286 0.61
287 0.58
288 0.61
289 0.64
290 0.61
291 0.58
292 0.56
293 0.52
294 0.53
295 0.57
296 0.58
297 0.58
298 0.64
299 0.69
300 0.78
301 0.83
302 0.82
303 0.84
304 0.86
305 0.88
306 0.88
307 0.9