FuNGI

C6HMP3

Protein Details

Accession

C6HMP3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
238-257	LFENKQKRTVRRYWNLAKDA	Hydrophilic
1219-1239	AASPSTKPKAKSKPAPIWVWL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 19, nucl 4, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MLCRAAQRRQTLLQLGRSYEHLSSPWTSSVYPRLKCQSSRIQTLCRPVILPTLEAPNSLSLQSTRSLATATSDINIPFEGLPYGHAEIHSPLNVSPLSNSPWNERLPYPEPDDIDTSSVIIRKDFLISRPPSVRRSNGIGGELSEMLANLDVSLSAAMFRRSEILIHRVAKLIGYGTPEVLDLHNKYLRSMISHMIVHRRYGMVWWAQKWFEVDMKYAFAEPDAITYALMIKMALRMLFENKQKRTVRRYWNLAKDAEIEEEVLGLPILSEADLGLLSEICSENAYNDSTMLDESSIEPDEDFSKVKPKLHPPDDIAIVRPTDQRGLGLSSLRETLSIFDSEQAVPRPPDLTGSQEEQDLAYAQMRQHRLESDCAVYDEYLAMQLRELEKKSKPTKKISALIDKLVHKGTRKAQVQWRRIIARFEQSQRPVDWSPVVQAKIGACLASMLLSTATVPVPTKDPKTNQQKQTDQAAFRRVYQLERGFRVGYVHANDYIVEKLRREPLGELLAKHLPMVCPPRPWTSARGGGFLEYPSTVMRVKQGDISQLSYVETAAARGDLDTVFAGLTVLGKTGWKINRGVLNVMLEAWNSGEEIANLAPENPNIIEPEKPDTDDRDILKDYYRARMHATNARTGYHSQRCFQNFQLEIARAYRNETFYLPHNLDFRGRAYPMPPYFNQMGADHCRGLLLFSKGRELGASGLRWLKIHLANVFGFDKASFQEREQFAMDHLEDIRDSAINGLKGKRWWLDAGDPFQCLAACIELTNAMALEDPTKYVSHLPVHQDGSCNGLQHYAALGGDVIGAQQVNLEPSDRPSDIYTGVAEHVKQSIQKDAAKGNETAKLLEDKITRKIVKQTVMTNVYGVTFLGAIRQVRKQLVDHYPDLLHSGVAGECATYIARKIFVALGSMFTGAHDIQFWLGDCANRISQSLSSEQIEALSDERNLKVVGRFQGAKKLAKNIKDPKSHFKSTVVWTTPLKLPVAQPYRDAACVKVFSDLQQLSIRNPQASDVVNKRKQLQAFPPNFVHSLDATHMFLSAVKCDELGLSFSAVHDSFWTHAADVDTMNRVLRDAFIRKSHVSSHVQPNTQLAKAISKWRKTTKSANSKQAQLDELVNEYRRLKLLRSNDPKLQTQGREMVTAGKFVAELQDAESSLASMQSLGVAGIGQIPPDESVKPKGDRVVTSEDPLDELEESLVGDALRVDPSNQPDELSMDQGLDVAASPSTKPKAKSKPAPIWVWLPLTFRAVPAKGQFDVTKLKNSEYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.53
3	0.48
4	0.46
5	0.43
6	0.36
7	0.31
8	0.24
9	0.24
10	0.24
11	0.25
12	0.25
13	0.24
14	0.23
15	0.25
16	0.34
17	0.39
18	0.39
19	0.43
20	0.5
21	0.54
22	0.57
23	0.61
24	0.62
25	0.61
26	0.68
27	0.67
28	0.67
29	0.66
30	0.72
31	0.68
32	0.59
33	0.52
34	0.43
35	0.45
36	0.38
37	0.34
38	0.27
39	0.3
40	0.29
41	0.28
42	0.28
43	0.23
44	0.23
45	0.21
46	0.2
47	0.14
48	0.15
49	0.17
50	0.17
51	0.15
52	0.14
53	0.15
54	0.13
55	0.16
56	0.16
57	0.15
58	0.15
59	0.17
60	0.17
61	0.17
62	0.17
63	0.15
64	0.12
65	0.12
66	0.12
67	0.1
68	0.11
69	0.14
70	0.16
71	0.15
72	0.15
73	0.16
74	0.17
75	0.21
76	0.21
77	0.18
78	0.16
79	0.19
80	0.19
81	0.18
82	0.17
83	0.17
84	0.21
85	0.25
86	0.27
87	0.29
88	0.34
89	0.36
90	0.37
91	0.35
92	0.39
93	0.38
94	0.42
95	0.42
96	0.41
97	0.41
98	0.4
99	0.42
100	0.35
101	0.32
102	0.27
103	0.21
104	0.19
105	0.2
106	0.17
107	0.15
108	0.14
109	0.14
110	0.18
111	0.2
112	0.21
113	0.28
114	0.3
115	0.37
116	0.44
117	0.48
118	0.5
119	0.54
120	0.56
121	0.52
122	0.56
123	0.55
124	0.5
125	0.48
126	0.42
127	0.36
128	0.33
129	0.28
130	0.21
131	0.15
132	0.11
133	0.09
134	0.09
135	0.08
136	0.05
137	0.05
138	0.04
139	0.05
140	0.05
141	0.04
142	0.06
143	0.07
144	0.09
145	0.09
146	0.1
147	0.12
148	0.12
149	0.15
150	0.18
151	0.21
152	0.27
153	0.29
154	0.3
155	0.29
156	0.29
157	0.27
158	0.24
159	0.2
160	0.15
161	0.16
162	0.16
163	0.14
164	0.14
165	0.14
166	0.14
167	0.14
168	0.17
169	0.15
170	0.2
171	0.23
172	0.23
173	0.23
174	0.26
175	0.25
176	0.24
177	0.25
178	0.23
179	0.24
180	0.26
181	0.29
182	0.35
183	0.35
184	0.32
185	0.32
186	0.29
187	0.25
188	0.24
189	0.26
190	0.25
191	0.29
192	0.3
193	0.32
194	0.32
195	0.33
196	0.33
197	0.3
198	0.27
199	0.23
200	0.23
201	0.21
202	0.22
203	0.21
204	0.2
205	0.18
206	0.13
207	0.14
208	0.11
209	0.11
210	0.12
211	0.11
212	0.1
213	0.1
214	0.12
215	0.09
216	0.09
217	0.08
218	0.06
219	0.07
220	0.09
221	0.09
222	0.09
223	0.1
224	0.15
225	0.22
226	0.3
227	0.37
228	0.39
229	0.48
230	0.54
231	0.6
232	0.64
233	0.67
234	0.7
235	0.7
236	0.77
237	0.78
238	0.8
239	0.78
240	0.7
241	0.62
242	0.55
243	0.47
244	0.39
245	0.29
246	0.21
247	0.15
248	0.15
249	0.13
250	0.09
251	0.07
252	0.05
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.03
257	0.03
258	0.03
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.05
266	0.06
267	0.06
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.09
272	0.1
273	0.09
274	0.09
275	0.09
276	0.09
277	0.09
278	0.09
279	0.07
280	0.06
281	0.07
282	0.09
283	0.1
284	0.09
285	0.09
286	0.1
287	0.11
288	0.12
289	0.12
290	0.1
291	0.18
292	0.21
293	0.26
294	0.32
295	0.41
296	0.5
297	0.54
298	0.58
299	0.54
300	0.56
301	0.57
302	0.51
303	0.43
304	0.35
305	0.31
306	0.27
307	0.25
308	0.21
309	0.18
310	0.17
311	0.15
312	0.15
313	0.17
314	0.16
315	0.16
316	0.15
317	0.14
318	0.16
319	0.15
320	0.13
321	0.11
322	0.11
323	0.11
324	0.12
325	0.11
326	0.11
327	0.13
328	0.13
329	0.16
330	0.16
331	0.17
332	0.16
333	0.16
334	0.16
335	0.14
336	0.17
337	0.15
338	0.18
339	0.18
340	0.21
341	0.21
342	0.21
343	0.21
344	0.18
345	0.17
346	0.13
347	0.1
348	0.08
349	0.1
350	0.11
351	0.17
352	0.19
353	0.19
354	0.2
355	0.24
356	0.25
357	0.26
358	0.27
359	0.24
360	0.22
361	0.22
362	0.21
363	0.17
364	0.15
365	0.12
366	0.09
367	0.09
368	0.09
369	0.07
370	0.07
371	0.09
372	0.12
373	0.15
374	0.17
375	0.2
376	0.23
377	0.33
378	0.43
379	0.49
380	0.54
381	0.59
382	0.66
383	0.69
384	0.73
385	0.71
386	0.71
387	0.65
388	0.63
389	0.59
390	0.51
391	0.46
392	0.41
393	0.36
394	0.28
395	0.31
396	0.33
397	0.37
398	0.39
399	0.43
400	0.49
401	0.57
402	0.62
403	0.63
404	0.63
405	0.58
406	0.57
407	0.55
408	0.48
409	0.46
410	0.45
411	0.44
412	0.44
413	0.43
414	0.44
415	0.41
416	0.43
417	0.36
418	0.32
419	0.29
420	0.22
421	0.22
422	0.23
423	0.23
424	0.18
425	0.19
426	0.17
427	0.17
428	0.17
429	0.13
430	0.08
431	0.08
432	0.07
433	0.06
434	0.06
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.06
443	0.06
444	0.1
445	0.14
446	0.18
447	0.22
448	0.26
449	0.35
450	0.45
451	0.54
452	0.58
453	0.64
454	0.65
455	0.63
456	0.69
457	0.65
458	0.57
459	0.52
460	0.51
461	0.43
462	0.39
463	0.4
464	0.32
465	0.28
466	0.31
467	0.34
468	0.32
469	0.33
470	0.34
471	0.29
472	0.29
473	0.28
474	0.23
475	0.19
476	0.17
477	0.16
478	0.14
479	0.14
480	0.14
481	0.14
482	0.14
483	0.14
484	0.13
485	0.12
486	0.15
487	0.19
488	0.2
489	0.2
490	0.2
491	0.2
492	0.26
493	0.26
494	0.24
495	0.23
496	0.23
497	0.22
498	0.21
499	0.18
500	0.12
501	0.15
502	0.21
503	0.19
504	0.21
505	0.25
506	0.29
507	0.31
508	0.33
509	0.33
510	0.31
511	0.37
512	0.34
513	0.33
514	0.28
515	0.26
516	0.25
517	0.21
518	0.16
519	0.09
520	0.09
521	0.07
522	0.08
523	0.08
524	0.07
525	0.11
526	0.11
527	0.12
528	0.15
529	0.16
530	0.18
531	0.19
532	0.21
533	0.18
534	0.17
535	0.16
536	0.13
537	0.12
538	0.08
539	0.07
540	0.05
541	0.05
542	0.05
543	0.04
544	0.04
545	0.05
546	0.04
547	0.05
548	0.04
549	0.04
550	0.04
551	0.04
552	0.04
553	0.03
554	0.04
555	0.03
556	0.04
557	0.04
558	0.04
559	0.04
560	0.1
561	0.12
562	0.13
563	0.15
564	0.18
565	0.22
566	0.23
567	0.24
568	0.2
569	0.19
570	0.17
571	0.16
572	0.13
573	0.08
574	0.07
575	0.06
576	0.05
577	0.04
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.05
582	0.04
583	0.05
584	0.05
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.06
589	0.05
590	0.06
591	0.07
592	0.08
593	0.08
594	0.09
595	0.13
596	0.13
597	0.14
598	0.15
599	0.16
600	0.19
601	0.22
602	0.21
603	0.2
604	0.21
605	0.2
606	0.21
607	0.21
608	0.19
609	0.23
610	0.23
611	0.21
612	0.23
613	0.25
614	0.27
615	0.3
616	0.3
617	0.28
618	0.28
619	0.28
620	0.26
621	0.25
622	0.29
623	0.31
624	0.31
625	0.28
626	0.33
627	0.35
628	0.36
629	0.36
630	0.36
631	0.29
632	0.29
633	0.3
634	0.25
635	0.23
636	0.22
637	0.22
638	0.14
639	0.16
640	0.16
641	0.14
642	0.15
643	0.15
644	0.14
645	0.16
646	0.21
647	0.19
648	0.19
649	0.19
650	0.19
651	0.19
652	0.19
653	0.18
654	0.15
655	0.15
656	0.14
657	0.13
658	0.19
659	0.2
660	0.23
661	0.22
662	0.23
663	0.24
664	0.24
665	0.25
666	0.18
667	0.2
668	0.2
669	0.21
670	0.17
671	0.16
672	0.15
673	0.13
674	0.13
675	0.14
676	0.13
677	0.13
678	0.14
679	0.16
680	0.16
681	0.16
682	0.15
683	0.12
684	0.11
685	0.11
686	0.11
687	0.11
688	0.13
689	0.13
690	0.14
691	0.13
692	0.15
693	0.14
694	0.17
695	0.16
696	0.17
697	0.16
698	0.19
699	0.19
700	0.15
701	0.13
702	0.11
703	0.1
704	0.08
705	0.11
706	0.1
707	0.1
708	0.17
709	0.18
710	0.2
711	0.2
712	0.2
713	0.17
714	0.19
715	0.19
716	0.12
717	0.12
718	0.1
719	0.09
720	0.09
721	0.09
722	0.06
723	0.06
724	0.06
725	0.08
726	0.09
727	0.12
728	0.12
729	0.14
730	0.15
731	0.18
732	0.18
733	0.17
734	0.17
735	0.18
736	0.23
737	0.24
738	0.28
739	0.26
740	0.25
741	0.23
742	0.22
743	0.2
744	0.14
745	0.1
746	0.07
747	0.05
748	0.05
749	0.05
750	0.05
751	0.05
752	0.05
753	0.04
754	0.04
755	0.04
756	0.04
757	0.05
758	0.05
759	0.05
760	0.07
761	0.07
762	0.07
763	0.09
764	0.12
765	0.13
766	0.17
767	0.21
768	0.24
769	0.26
770	0.26
771	0.26
772	0.23
773	0.25
774	0.22
775	0.19
776	0.14
777	0.14
778	0.13
779	0.11
780	0.12
781	0.07
782	0.06
783	0.06
784	0.05
785	0.04
786	0.04
787	0.04
788	0.03
789	0.03
790	0.03
791	0.03
792	0.03
793	0.04
794	0.04
795	0.05
796	0.06
797	0.06
798	0.08
799	0.13
800	0.12
801	0.14
802	0.14
803	0.15
804	0.15
805	0.15
806	0.13
807	0.1
808	0.11
809	0.11
810	0.1
811	0.09
812	0.09
813	0.1
814	0.12
815	0.12
816	0.16
817	0.19
818	0.21
819	0.23
820	0.25
821	0.28
822	0.28
823	0.29
824	0.26
825	0.27
826	0.25
827	0.23
828	0.21
829	0.2
830	0.18
831	0.21
832	0.23
833	0.2
834	0.25
835	0.31
836	0.31
837	0.31
838	0.39
839	0.39
840	0.41
841	0.42
842	0.4
843	0.41
844	0.44
845	0.41
846	0.33
847	0.29
848	0.23
849	0.2
850	0.16
851	0.08
852	0.05
853	0.05
854	0.06
855	0.08
856	0.09
857	0.11
858	0.14
859	0.16
860	0.18
861	0.2
862	0.2
863	0.26
864	0.32
865	0.35
866	0.33
867	0.33
868	0.32
869	0.3
870	0.3
871	0.23
872	0.15
873	0.1
874	0.09
875	0.07
876	0.07
877	0.07
878	0.05
879	0.04
880	0.05
881	0.05
882	0.05
883	0.06
884	0.06
885	0.07
886	0.07
887	0.09
888	0.1
889	0.1
890	0.12
891	0.11
892	0.11
893	0.11
894	0.12
895	0.1
896	0.09
897	0.1
898	0.08
899	0.08
900	0.07
901	0.06
902	0.06
903	0.07
904	0.08
905	0.08
906	0.09
907	0.09
908	0.1
909	0.12
910	0.14
911	0.13
912	0.14
913	0.14
914	0.14
915	0.16
916	0.17
917	0.17
918	0.17
919	0.17
920	0.16
921	0.15
922	0.14
923	0.12
924	0.11
925	0.09
926	0.1
927	0.11
928	0.11
929	0.12
930	0.12
931	0.13
932	0.15
933	0.19
934	0.21
935	0.23
936	0.27
937	0.27
938	0.36
939	0.38
940	0.41
941	0.38
942	0.45
943	0.46
944	0.48
945	0.56
946	0.57
947	0.62
948	0.66
949	0.68
950	0.69
951	0.72
952	0.7
953	0.63
954	0.57
955	0.54
956	0.51
957	0.55
958	0.47
959	0.42
960	0.39
961	0.41
962	0.4
963	0.36
964	0.32
965	0.24
966	0.23
967	0.3
968	0.35
969	0.32
970	0.3
971	0.32
972	0.33
973	0.34
974	0.33
975	0.25
976	0.23
977	0.23
978	0.22
979	0.22
980	0.2
981	0.18
982	0.25
983	0.24
984	0.22
985	0.25
986	0.26
987	0.25
988	0.32
989	0.32
990	0.25
991	0.26
992	0.24
993	0.23
994	0.24
995	0.29
996	0.31
997	0.39
998	0.43
999	0.45
1000	0.47
1001	0.49
1002	0.51
1003	0.51
1004	0.52
1005	0.52
1006	0.52
1007	0.55
1008	0.55
1009	0.52
1010	0.5
1011	0.43
1012	0.35
1013	0.25
1014	0.22
1015	0.19
1016	0.18
1017	0.16
1018	0.15
1019	0.14
1020	0.12
1021	0.15
1022	0.13
1023	0.13
1024	0.13
1025	0.12
1026	0.12
1027	0.12
1028	0.12
1029	0.1
1030	0.11
1031	0.1
1032	0.09
1033	0.09
1034	0.1
1035	0.13
1036	0.12
1037	0.11
1038	0.1
1039	0.11
1040	0.11
1041	0.13
1042	0.13
1043	0.1
1044	0.12
1045	0.13
1046	0.14
1047	0.13
1048	0.14
1049	0.15
1050	0.15
1051	0.16
1052	0.13
1053	0.13
1054	0.12
1055	0.14
1056	0.18
1057	0.2
1058	0.25
1059	0.28
1060	0.34
1061	0.35
1062	0.37
1063	0.39
1064	0.4
1065	0.41
1066	0.44
1067	0.51
1068	0.52
1069	0.52
1070	0.51
1071	0.53
1072	0.5
1073	0.44
1074	0.39
1075	0.3
1076	0.28
1077	0.3
1078	0.4
1079	0.41
1080	0.44
1081	0.51
1082	0.58
1083	0.64
1084	0.65
1085	0.72
1086	0.72
1087	0.75
1088	0.77
1089	0.8
1090	0.75
1091	0.75
1092	0.73
1093	0.67
1094	0.57
1095	0.48
1096	0.41
1097	0.32
1098	0.3
1099	0.28
1100	0.25
1101	0.24
1102	0.24
1103	0.23
1104	0.25
1105	0.25
1106	0.25
1107	0.29
1108	0.36
1109	0.44
1110	0.53
1111	0.57
1112	0.61
1113	0.64
1114	0.65
1115	0.64
1116	0.63
1117	0.55
1118	0.51
1119	0.51
1120	0.46
1121	0.42
1122	0.38
1123	0.39
1124	0.32
1125	0.3
1126	0.25
1127	0.18
1128	0.16
1129	0.15
1130	0.17
1131	0.11
1132	0.11
1133	0.11
1134	0.14
1135	0.14
1136	0.14
1137	0.14
1138	0.12
1139	0.1
1140	0.1
1141	0.08
1142	0.06
1143	0.05
1144	0.05
1145	0.06
1146	0.05
1147	0.05
1148	0.04
1149	0.05
1150	0.08
1151	0.08
1152	0.07
1153	0.07
1154	0.08
1155	0.1
1156	0.12
1157	0.13
1158	0.14
1159	0.2
1160	0.27
1161	0.3
1162	0.33
1163	0.38
1164	0.41
1165	0.42
1166	0.44
1167	0.46
1168	0.42
1169	0.42
1170	0.41
1171	0.35
1172	0.31
1173	0.29
1174	0.24
1175	0.16
1176	0.14
1177	0.11
1178	0.09
1179	0.09
1180	0.08
1181	0.08
1182	0.06
1183	0.06
1184	0.06
1185	0.07
1186	0.09
1187	0.09
1188	0.11
1189	0.15
1190	0.2
1191	0.24
1192	0.24
1193	0.23
1194	0.23
1195	0.26
1196	0.26
1197	0.24
1198	0.2
1199	0.16
1200	0.16
1201	0.15
1202	0.14
1203	0.1
1204	0.08
1205	0.06
1206	0.06
1207	0.07
1208	0.08
1209	0.14
1210	0.2
1211	0.25
1212	0.29
1213	0.39
1214	0.49
1215	0.59
1216	0.69
1217	0.73
1218	0.78
1219	0.82
1220	0.82
1221	0.76
1222	0.71
1223	0.65
1224	0.59
1225	0.51
1226	0.44
1227	0.37
1228	0.37
1229	0.33
1230	0.3
1231	0.32
1232	0.29
1233	0.31
1234	0.33
1235	0.36
1236	0.32
1237	0.36
1238	0.35
1239	0.32
1240	0.4
1241	0.38
1242	0.42
1243	0.39
1244	0.42
1245	0.43

C6HMP3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer