Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1W2TNB6

Protein Details
Accession A0A1W2TNB6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
484-513RNGIPLKKIPPKAPPPRRKGRLKTVASASEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
439-450PPPPNRAKKIPP
488-506PLKKIPPKAPPPRRKGRLK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030125  SPIN90/Ldb17  
IPR018556  SPIN90/Ldb17_LRD  
Pfam View protein in Pfam  
PF09431  SPIN90_LRD  
Amino Acid Sequences MADFGGDYVDKESEERLWNEVSDVVATNCPSYAHEAIDDALRTWLSLAARCRTDFALSEDDVAVCSQHLLQGTLFITNPEYVRTQIIYSLLQDDEAAHLYPIASFLLLDGRANETTFRNMIEENCFHRLVDLISSHQEGDPPLHRLLLELVYEMSRIQKLRSQDLIHVDDSFVAYLFELTENFSDDVHDPCHYPIVRVLLVLNEQYMVASATAVSELAPLTTPLTNRVVKCLSLYGTQYKTFGENLILLLNRETETSMQLLILKLLYLLFTTKATYEYFYTNDLHVLLDVIIRNLLDLPNELTSLRHTYLRVLYPLLAHTPLNQPPHYKKKEIQKVMTLLAGSGNVHFEAADETTLRLVDRVVKVKWLSEDATSAGEIARRSLGISLSPTDTASTISVEDVAEVMEKPGVQTRSRKAEGEAGLDVSPTEEKTIRVKPVPPPPNRAKKIPPAVPKHRYGNPFVSAAQQTKANENGDGNGNGNGNRNGIPLKKIPPKAPPPRRKGRLKTVASASEQPGPVSQDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.24
4 0.25
5 0.25
6 0.25
7 0.24
8 0.2
9 0.16
10 0.16
11 0.14
12 0.15
13 0.16
14 0.15
15 0.14
16 0.14
17 0.14
18 0.19
19 0.19
20 0.18
21 0.18
22 0.18
23 0.19
24 0.21
25 0.21
26 0.15
27 0.15
28 0.13
29 0.13
30 0.12
31 0.15
32 0.13
33 0.17
34 0.22
35 0.26
36 0.3
37 0.31
38 0.33
39 0.31
40 0.32
41 0.29
42 0.29
43 0.28
44 0.25
45 0.27
46 0.25
47 0.23
48 0.21
49 0.19
50 0.14
51 0.08
52 0.09
53 0.07
54 0.08
55 0.09
56 0.1
57 0.1
58 0.14
59 0.14
60 0.15
61 0.15
62 0.13
63 0.14
64 0.15
65 0.15
66 0.14
67 0.15
68 0.14
69 0.17
70 0.17
71 0.16
72 0.16
73 0.18
74 0.17
75 0.16
76 0.18
77 0.15
78 0.14
79 0.14
80 0.12
81 0.12
82 0.12
83 0.11
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.07
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.12
98 0.13
99 0.13
100 0.15
101 0.14
102 0.17
103 0.17
104 0.17
105 0.15
106 0.15
107 0.17
108 0.21
109 0.23
110 0.25
111 0.28
112 0.28
113 0.26
114 0.25
115 0.23
116 0.19
117 0.19
118 0.15
119 0.13
120 0.15
121 0.17
122 0.17
123 0.16
124 0.16
125 0.13
126 0.16
127 0.17
128 0.19
129 0.18
130 0.18
131 0.18
132 0.17
133 0.19
134 0.17
135 0.14
136 0.1
137 0.11
138 0.1
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.12
145 0.15
146 0.18
147 0.24
148 0.29
149 0.29
150 0.31
151 0.36
152 0.38
153 0.35
154 0.32
155 0.27
156 0.21
157 0.2
158 0.15
159 0.09
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.12
174 0.12
175 0.13
176 0.11
177 0.11
178 0.17
179 0.16
180 0.15
181 0.16
182 0.19
183 0.18
184 0.17
185 0.17
186 0.13
187 0.13
188 0.13
189 0.11
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.03
199 0.04
200 0.04
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.07
209 0.07
210 0.09
211 0.14
212 0.18
213 0.18
214 0.22
215 0.21
216 0.2
217 0.21
218 0.2
219 0.17
220 0.15
221 0.17
222 0.18
223 0.2
224 0.2
225 0.2
226 0.18
227 0.18
228 0.16
229 0.15
230 0.11
231 0.09
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.06
250 0.05
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.03
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.08
262 0.09
263 0.1
264 0.11
265 0.11
266 0.13
267 0.14
268 0.13
269 0.13
270 0.12
271 0.1
272 0.09
273 0.08
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.07
290 0.09
291 0.12
292 0.13
293 0.13
294 0.13
295 0.15
296 0.19
297 0.2
298 0.2
299 0.17
300 0.16
301 0.15
302 0.16
303 0.15
304 0.12
305 0.1
306 0.12
307 0.16
308 0.2
309 0.23
310 0.23
311 0.27
312 0.33
313 0.44
314 0.47
315 0.46
316 0.47
317 0.54
318 0.63
319 0.66
320 0.63
321 0.59
322 0.57
323 0.54
324 0.5
325 0.39
326 0.28
327 0.21
328 0.17
329 0.11
330 0.08
331 0.07
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.06
346 0.12
347 0.15
348 0.2
349 0.2
350 0.24
351 0.25
352 0.27
353 0.28
354 0.25
355 0.22
356 0.19
357 0.2
358 0.16
359 0.16
360 0.14
361 0.13
362 0.1
363 0.11
364 0.1
365 0.1
366 0.09
367 0.08
368 0.09
369 0.1
370 0.1
371 0.09
372 0.12
373 0.13
374 0.14
375 0.14
376 0.14
377 0.13
378 0.13
379 0.12
380 0.11
381 0.1
382 0.08
383 0.08
384 0.09
385 0.08
386 0.08
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.07
395 0.13
396 0.16
397 0.19
398 0.26
399 0.32
400 0.41
401 0.44
402 0.45
403 0.41
404 0.46
405 0.44
406 0.41
407 0.35
408 0.28
409 0.25
410 0.24
411 0.21
412 0.14
413 0.13
414 0.09
415 0.11
416 0.1
417 0.12
418 0.18
419 0.25
420 0.29
421 0.33
422 0.38
423 0.43
424 0.53
425 0.61
426 0.6
427 0.64
428 0.68
429 0.75
430 0.75
431 0.74
432 0.71
433 0.72
434 0.76
435 0.76
436 0.75
437 0.74
438 0.8
439 0.8
440 0.79
441 0.75
442 0.73
443 0.69
444 0.66
445 0.62
446 0.55
447 0.5
448 0.44
449 0.43
450 0.39
451 0.37
452 0.32
453 0.3
454 0.28
455 0.3
456 0.34
457 0.3
458 0.28
459 0.27
460 0.27
461 0.28
462 0.27
463 0.24
464 0.22
465 0.22
466 0.21
467 0.25
468 0.23
469 0.21
470 0.21
471 0.21
472 0.23
473 0.24
474 0.28
475 0.29
476 0.37
477 0.45
478 0.5
479 0.54
480 0.6
481 0.68
482 0.74
483 0.79
484 0.81
485 0.81
486 0.86
487 0.91
488 0.91
489 0.9
490 0.9
491 0.9
492 0.85
493 0.84
494 0.81
495 0.78
496 0.72
497 0.68
498 0.6
499 0.56
500 0.5
501 0.43
502 0.37