Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D0BXC6

Protein Details
Accession A0A0D0BXC6    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-32VAPPDCRPTKRPRLSKSTHRVLNVHydrophilic
389-410APRTPSPSISTNKKKSKAKRKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
346-373DRRRRRSMSHIGSRNDARKIERRKSARF
385-410ARGRAPRTPSPSISTNKKKSKAKRKS
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 10.5, mito 7, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018465  Scm3/HJURP  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042393  F:histone binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10384  Scm3  
Amino Acid Sequences MAPHASPSVAPPDCRPTKRPRLSKSTHRVLNVWAQLAERYNKRLDEDDIVDLYSGTIISDRGVLKNGKDYDFGHFTPDDSPDDQDQEQEQEPGEQDQDDDVDELDTLPIRRAPGTDGTMASTSELLRAVPPLSATTDADDLNDFLEAEKRRRELLGDEDSEDDMSMEELAALRKALNESEEDQEQTETETVDPEHAAVIEDESEDELNSIWQHDEASAVYHIARNESEQDVAEASTRFASLTPQTQVYPFATPSVDPTQPPQLLLYQAMHQLSYALSATMLTYGSPHMPPPPTAPWGAYPPGFAHPWGPQGTAKTSHSFTLSDDEHDDDWLDDTPVDHDGSALEKDRRRRRSMSHIGSRNDARKIERRKSARFYEEKNPDQHIVARGRAPRTPSPSISTNKKKSKAKRKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.54
3 0.56
4 0.64
5 0.73
6 0.79
7 0.78
8 0.8
9 0.83
10 0.88
11 0.87
12 0.86
13 0.82
14 0.75
15 0.68
16 0.62
17 0.62
18 0.56
19 0.47
20 0.38
21 0.33
22 0.32
23 0.35
24 0.37
25 0.32
26 0.32
27 0.34
28 0.35
29 0.37
30 0.38
31 0.37
32 0.36
33 0.36
34 0.35
35 0.31
36 0.29
37 0.26
38 0.23
39 0.19
40 0.13
41 0.09
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.05
46 0.1
47 0.11
48 0.12
49 0.17
50 0.19
51 0.19
52 0.28
53 0.31
54 0.28
55 0.3
56 0.3
57 0.33
58 0.36
59 0.35
60 0.31
61 0.27
62 0.27
63 0.26
64 0.27
65 0.24
66 0.2
67 0.23
68 0.2
69 0.24
70 0.23
71 0.23
72 0.21
73 0.22
74 0.21
75 0.19
76 0.18
77 0.16
78 0.16
79 0.16
80 0.15
81 0.12
82 0.11
83 0.1
84 0.11
85 0.09
86 0.09
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.07
94 0.08
95 0.1
96 0.1
97 0.11
98 0.11
99 0.14
100 0.17
101 0.2
102 0.21
103 0.2
104 0.21
105 0.21
106 0.2
107 0.18
108 0.13
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.11
121 0.11
122 0.11
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.11
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.06
131 0.05
132 0.11
133 0.12
134 0.15
135 0.19
136 0.2
137 0.21
138 0.22
139 0.23
140 0.2
141 0.25
142 0.29
143 0.26
144 0.26
145 0.26
146 0.26
147 0.25
148 0.21
149 0.14
150 0.07
151 0.06
152 0.05
153 0.03
154 0.03
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.08
165 0.11
166 0.13
167 0.14
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.12
172 0.11
173 0.09
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.1
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.08
227 0.09
228 0.12
229 0.13
230 0.14
231 0.14
232 0.15
233 0.17
234 0.16
235 0.16
236 0.13
237 0.13
238 0.12
239 0.12
240 0.16
241 0.18
242 0.17
243 0.16
244 0.19
245 0.24
246 0.24
247 0.25
248 0.21
249 0.18
250 0.18
251 0.19
252 0.18
253 0.13
254 0.15
255 0.15
256 0.14
257 0.13
258 0.12
259 0.1
260 0.1
261 0.08
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.04
269 0.05
270 0.06
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.13
275 0.14
276 0.16
277 0.2
278 0.23
279 0.24
280 0.24
281 0.25
282 0.23
283 0.26
284 0.27
285 0.22
286 0.2
287 0.19
288 0.21
289 0.2
290 0.18
291 0.17
292 0.16
293 0.21
294 0.21
295 0.21
296 0.2
297 0.22
298 0.26
299 0.28
300 0.28
301 0.27
302 0.27
303 0.26
304 0.26
305 0.24
306 0.22
307 0.24
308 0.22
309 0.21
310 0.21
311 0.22
312 0.2
313 0.2
314 0.19
315 0.13
316 0.13
317 0.12
318 0.11
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.11
323 0.11
324 0.09
325 0.08
326 0.08
327 0.1
328 0.12
329 0.16
330 0.2
331 0.25
332 0.35
333 0.45
334 0.53
335 0.57
336 0.61
337 0.64
338 0.69
339 0.76
340 0.77
341 0.77
342 0.78
343 0.74
344 0.74
345 0.74
346 0.68
347 0.62
348 0.55
349 0.51
350 0.52
351 0.6
352 0.62
353 0.65
354 0.67
355 0.71
356 0.76
357 0.79
358 0.8
359 0.78
360 0.75
361 0.76
362 0.77
363 0.75
364 0.71
365 0.66
366 0.58
367 0.53
368 0.51
369 0.49
370 0.43
371 0.41
372 0.42
373 0.43
374 0.45
375 0.47
376 0.48
377 0.49
378 0.52
379 0.55
380 0.52
381 0.52
382 0.56
383 0.6
384 0.64
385 0.67
386 0.69
387 0.73
388 0.78
389 0.82
390 0.85