Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BJE2

Protein Details
Accession Q6BJE2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
349-385LYSYTKIDRPSKSKNKNKNKNTKKSTKPKQINGVVSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
357-377RPSKSKNKNKNKNTKKSTKPK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002716  PIN_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
KEGG dha:DEHA2G03080g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13638  PIN_4  
Amino Acid Sequences MSLYPYNSDEDEARKNSNYHDFDELVPSEEIENASKPSDTFPGRKSRNINVILDHSAFVRGIGNIKRWFNQEYIKAHIDPNADEEIYLNIYIPSYTLHEFDYVKKGTSMMATNAREAIRFIDKIFEKELNGEDETDPMNPDSKPGKKSIIYDLYIESPNESGPSWSECLNYKVHSPKIKEFPNFKTKFDSNLIGQHPIPQGESLESHNSFDETNYNNSSAYKQNNKLNDIQYENSQSYQNALANADELAEMPTRLRYLIRSCIYKRFIERKSFNSPLEEWKLVTEDPITKVWAKSFGIDCMNVNEAELLIFQSYDINQYQLYDPRHTFSVDDESHAPNSILQNTIDTTLYSYTKIDRPSKSKNKNKNKNTKKSTKPKQINGVVSDGCTGANGDFVKKERFDAINYAPRGTGDLWKP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.36
3 0.39
4 0.46
5 0.45
6 0.4
7 0.42
8 0.4
9 0.38
10 0.42
11 0.37
12 0.31
13 0.27
14 0.24
15 0.19
16 0.19
17 0.19
18 0.15
19 0.16
20 0.14
21 0.15
22 0.15
23 0.15
24 0.17
25 0.23
26 0.26
27 0.3
28 0.34
29 0.44
30 0.48
31 0.54
32 0.58
33 0.59
34 0.63
35 0.63
36 0.59
37 0.53
38 0.53
39 0.5
40 0.45
41 0.37
42 0.28
43 0.24
44 0.21
45 0.17
46 0.14
47 0.11
48 0.15
49 0.19
50 0.25
51 0.29
52 0.32
53 0.35
54 0.37
55 0.39
56 0.37
57 0.4
58 0.41
59 0.39
60 0.43
61 0.43
62 0.41
63 0.39
64 0.4
65 0.35
66 0.28
67 0.28
68 0.24
69 0.2
70 0.18
71 0.18
72 0.15
73 0.14
74 0.14
75 0.1
76 0.07
77 0.08
78 0.08
79 0.07
80 0.07
81 0.09
82 0.1
83 0.11
84 0.12
85 0.14
86 0.16
87 0.18
88 0.25
89 0.23
90 0.22
91 0.22
92 0.21
93 0.19
94 0.21
95 0.2
96 0.17
97 0.24
98 0.24
99 0.25
100 0.28
101 0.27
102 0.24
103 0.23
104 0.22
105 0.18
106 0.17
107 0.17
108 0.21
109 0.22
110 0.24
111 0.26
112 0.25
113 0.21
114 0.22
115 0.24
116 0.2
117 0.19
118 0.19
119 0.16
120 0.16
121 0.16
122 0.14
123 0.13
124 0.1
125 0.12
126 0.1
127 0.14
128 0.18
129 0.23
130 0.25
131 0.27
132 0.32
133 0.32
134 0.35
135 0.4
136 0.41
137 0.36
138 0.35
139 0.34
140 0.32
141 0.3
142 0.27
143 0.19
144 0.13
145 0.12
146 0.11
147 0.1
148 0.07
149 0.07
150 0.1
151 0.1
152 0.11
153 0.12
154 0.13
155 0.15
156 0.16
157 0.16
158 0.18
159 0.23
160 0.28
161 0.33
162 0.35
163 0.4
164 0.46
165 0.51
166 0.52
167 0.53
168 0.54
169 0.59
170 0.57
171 0.52
172 0.5
173 0.45
174 0.44
175 0.41
176 0.36
177 0.26
178 0.31
179 0.31
180 0.26
181 0.26
182 0.25
183 0.23
184 0.21
185 0.2
186 0.14
187 0.13
188 0.11
189 0.12
190 0.1
191 0.13
192 0.13
193 0.13
194 0.13
195 0.13
196 0.12
197 0.11
198 0.13
199 0.11
200 0.13
201 0.14
202 0.14
203 0.14
204 0.14
205 0.16
206 0.17
207 0.21
208 0.25
209 0.29
210 0.33
211 0.37
212 0.39
213 0.42
214 0.41
215 0.39
216 0.35
217 0.31
218 0.29
219 0.28
220 0.26
221 0.22
222 0.2
223 0.16
224 0.15
225 0.16
226 0.14
227 0.12
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.08
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.09
244 0.13
245 0.21
246 0.24
247 0.3
248 0.32
249 0.4
250 0.43
251 0.43
252 0.47
253 0.48
254 0.5
255 0.54
256 0.56
257 0.54
258 0.59
259 0.61
260 0.55
261 0.5
262 0.46
263 0.43
264 0.44
265 0.39
266 0.31
267 0.26
268 0.27
269 0.22
270 0.21
271 0.16
272 0.14
273 0.15
274 0.16
275 0.18
276 0.18
277 0.19
278 0.19
279 0.21
280 0.19
281 0.2
282 0.21
283 0.22
284 0.23
285 0.23
286 0.22
287 0.2
288 0.21
289 0.17
290 0.15
291 0.12
292 0.09
293 0.09
294 0.08
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.06
301 0.09
302 0.09
303 0.1
304 0.1
305 0.12
306 0.14
307 0.2
308 0.23
309 0.25
310 0.26
311 0.27
312 0.29
313 0.28
314 0.26
315 0.22
316 0.28
317 0.23
318 0.25
319 0.26
320 0.27
321 0.27
322 0.27
323 0.24
324 0.18
325 0.2
326 0.19
327 0.18
328 0.16
329 0.17
330 0.17
331 0.18
332 0.16
333 0.13
334 0.13
335 0.14
336 0.15
337 0.14
338 0.14
339 0.17
340 0.21
341 0.28
342 0.34
343 0.39
344 0.45
345 0.55
346 0.66
347 0.73
348 0.79
349 0.82
350 0.86
351 0.9
352 0.94
353 0.94
354 0.94
355 0.94
356 0.94
357 0.94
358 0.94
359 0.94
360 0.94
361 0.94
362 0.93
363 0.91
364 0.9
365 0.89
366 0.85
367 0.77
368 0.72
369 0.62
370 0.52
371 0.44
372 0.34
373 0.25
374 0.18
375 0.15
376 0.08
377 0.12
378 0.12
379 0.13
380 0.16
381 0.2
382 0.26
383 0.26
384 0.28
385 0.31
386 0.32
387 0.34
388 0.38
389 0.43
390 0.46
391 0.47
392 0.46
393 0.39
394 0.37
395 0.37
396 0.32