Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D0BNM0

Protein Details
Accession A0A0D0BNM0    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
198-223MAPESLRKERKEKKKKKVIQVKIEDPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-95RRKKEEEAPPPTAPSASTDRGRGRGRGRGRGGEGRGAAPRP
204-215RKERKEKKKKKV
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MADSGSTSNTGTPSTPSGTPGPSVPKAIGSLAKKPTDVTRQGTQKLKFVPTLPSRRKKEEEAPPPTAPSASTDRGRGRGRGRGRGGEGRGAAPRPPPVEMTASGPFAMGPALAGTSARRSAPRSNFAPIVPLGPGNAASLGAGLSGSAGPLLKREKGSTQNVLVEKETKSEIDDDYYSDPDEGVEIIDMENVRQMDWMAPESLRKERKEKKKKKVIQVKIEDPSSPSGIKKKEEAMDIEEVDLANALDLSESEEEEELEDLIDDFALQGEADQDADIRQERLYFFQFPEPFPTFVSDIPSTSPTTMSVDEPPSDSRPRKVSFAADTKPPGPSGDLAGASTGPDADQAKDTPKIDGVIGQLEVYRSGAVKMRLSNGILMDVTGATQPSFLQQAVHLDLQNKRLHVMGEVNKRFVVSPDIDTLLHAMELRDQAEANDMPIDDTNLIKMD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.23
4 0.25
5 0.26
6 0.26
7 0.28
8 0.31
9 0.3
10 0.31
11 0.29
12 0.27
13 0.27
14 0.28
15 0.31
16 0.28
17 0.33
18 0.38
19 0.4
20 0.38
21 0.39
22 0.43
23 0.46
24 0.48
25 0.46
26 0.48
27 0.53
28 0.6
29 0.66
30 0.61
31 0.59
32 0.58
33 0.56
34 0.51
35 0.45
36 0.48
37 0.49
38 0.58
39 0.62
40 0.66
41 0.69
42 0.74
43 0.78
44 0.75
45 0.75
46 0.75
47 0.75
48 0.73
49 0.73
50 0.67
51 0.63
52 0.57
53 0.47
54 0.37
55 0.3
56 0.29
57 0.27
58 0.27
59 0.31
60 0.34
61 0.41
62 0.44
63 0.46
64 0.45
65 0.49
66 0.53
67 0.57
68 0.59
69 0.57
70 0.6
71 0.61
72 0.58
73 0.55
74 0.49
75 0.42
76 0.4
77 0.35
78 0.31
79 0.27
80 0.29
81 0.25
82 0.25
83 0.24
84 0.23
85 0.25
86 0.24
87 0.27
88 0.24
89 0.24
90 0.22
91 0.2
92 0.17
93 0.14
94 0.12
95 0.07
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.05
102 0.08
103 0.1
104 0.11
105 0.13
106 0.17
107 0.26
108 0.32
109 0.39
110 0.39
111 0.42
112 0.43
113 0.4
114 0.4
115 0.31
116 0.26
117 0.2
118 0.17
119 0.12
120 0.11
121 0.11
122 0.08
123 0.08
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.04
136 0.04
137 0.07
138 0.1
139 0.13
140 0.14
141 0.16
142 0.21
143 0.29
144 0.34
145 0.35
146 0.36
147 0.39
148 0.39
149 0.39
150 0.34
151 0.3
152 0.25
153 0.22
154 0.2
155 0.14
156 0.14
157 0.14
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.13
162 0.14
163 0.14
164 0.14
165 0.12
166 0.11
167 0.08
168 0.08
169 0.06
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.07
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.1
188 0.12
189 0.19
190 0.24
191 0.25
192 0.33
193 0.42
194 0.53
195 0.63
196 0.71
197 0.75
198 0.81
199 0.87
200 0.89
201 0.9
202 0.88
203 0.87
204 0.83
205 0.78
206 0.71
207 0.63
208 0.53
209 0.43
210 0.35
211 0.27
212 0.2
213 0.15
214 0.17
215 0.19
216 0.2
217 0.21
218 0.23
219 0.24
220 0.25
221 0.26
222 0.24
223 0.23
224 0.22
225 0.2
226 0.17
227 0.14
228 0.11
229 0.1
230 0.06
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.02
235 0.02
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.09
268 0.12
269 0.15
270 0.16
271 0.17
272 0.23
273 0.25
274 0.24
275 0.3
276 0.3
277 0.28
278 0.26
279 0.27
280 0.22
281 0.2
282 0.25
283 0.19
284 0.16
285 0.17
286 0.18
287 0.17
288 0.16
289 0.16
290 0.12
291 0.14
292 0.14
293 0.14
294 0.16
295 0.17
296 0.17
297 0.19
298 0.2
299 0.22
300 0.28
301 0.28
302 0.3
303 0.34
304 0.36
305 0.38
306 0.38
307 0.39
308 0.39
309 0.44
310 0.42
311 0.4
312 0.41
313 0.39
314 0.38
315 0.33
316 0.27
317 0.21
318 0.19
319 0.17
320 0.16
321 0.15
322 0.14
323 0.14
324 0.13
325 0.12
326 0.11
327 0.08
328 0.05
329 0.07
330 0.08
331 0.09
332 0.11
333 0.12
334 0.16
335 0.21
336 0.21
337 0.2
338 0.21
339 0.21
340 0.19
341 0.2
342 0.18
343 0.15
344 0.15
345 0.14
346 0.13
347 0.12
348 0.13
349 0.11
350 0.09
351 0.08
352 0.09
353 0.13
354 0.15
355 0.19
356 0.21
357 0.24
358 0.26
359 0.27
360 0.28
361 0.24
362 0.23
363 0.19
364 0.16
365 0.13
366 0.1
367 0.1
368 0.08
369 0.08
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.11
378 0.16
379 0.19
380 0.22
381 0.22
382 0.25
383 0.29
384 0.34
385 0.36
386 0.32
387 0.29
388 0.28
389 0.27
390 0.25
391 0.3
392 0.32
393 0.4
394 0.43
395 0.44
396 0.43
397 0.43
398 0.4
399 0.33
400 0.31
401 0.23
402 0.23
403 0.25
404 0.27
405 0.26
406 0.26
407 0.25
408 0.19
409 0.17
410 0.14
411 0.11
412 0.12
413 0.15
414 0.15
415 0.15
416 0.15
417 0.14
418 0.19
419 0.19
420 0.16
421 0.16
422 0.15
423 0.16
424 0.17
425 0.19
426 0.14
427 0.14