Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HNV9

Protein Details
Accession C6HNV9    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
397-419LCTYDKVQRVKSKWKCTLKDGILHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004855  TFIIA_asu/bsu  
IPR009088  TFIIA_b-brl  
Gene Ontology GO:0005672  C:transcription factor TFIIA complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF03153  TFIIA  
Amino Acid Sequences MSNQQVEVCDSSQIDFEEGGVDQQTLEDLRKGWRKKLSSLGVAHFPWDPAPQPAPAPPQQVPQPPPPQQAQGPAPIPPPPTTVPSNGPGTTPPPQPRPQQQPQFSQQPPQSHQQTPSQQFSQVPTSAPLPSAGNVRIKTEGGYQPTIQGQPPVNPSTLAQQRAANALHQRYGAAAANQVHQLQAQSQAAALSLPGAQKVPNRPGPFPQDQKPPLQQPQQYQNPAQQQPLQQLQQLQHQQRPQVNNSQTDGSSDSLQEWKAEVARRREAAEKCNKNSSGGDDDHFIRSYVESRGLQLEAGGLLVPLNEQPSIAKGTKRKAHMMNDPSSSTSPAMPSTSSNSSVATSSALAQYDGVDNYNGNTGREEADEDAINSDLDDSEDMLDDSNDGDDAVGQVMLCTYDKVQRVKSKWKCTLKDGILTSGGKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.14
3 0.13
4 0.12
5 0.12
6 0.12
7 0.1
8 0.1
9 0.08
10 0.08
11 0.09
12 0.09
13 0.11
14 0.11
15 0.12
16 0.21
17 0.3
18 0.34
19 0.41
20 0.49
21 0.52
22 0.56
23 0.65
24 0.64
25 0.63
26 0.65
27 0.61
28 0.59
29 0.54
30 0.49
31 0.4
32 0.33
33 0.26
34 0.23
35 0.2
36 0.18
37 0.2
38 0.2
39 0.21
40 0.25
41 0.3
42 0.33
43 0.37
44 0.34
45 0.38
46 0.43
47 0.49
48 0.5
49 0.52
50 0.57
51 0.57
52 0.6
53 0.58
54 0.56
55 0.5
56 0.53
57 0.47
58 0.44
59 0.39
60 0.37
61 0.35
62 0.34
63 0.34
64 0.28
65 0.29
66 0.24
67 0.28
68 0.28
69 0.3
70 0.31
71 0.32
72 0.35
73 0.31
74 0.3
75 0.27
76 0.29
77 0.31
78 0.34
79 0.36
80 0.38
81 0.44
82 0.5
83 0.58
84 0.63
85 0.68
86 0.71
87 0.71
88 0.72
89 0.73
90 0.75
91 0.68
92 0.66
93 0.6
94 0.58
95 0.55
96 0.55
97 0.55
98 0.49
99 0.51
100 0.51
101 0.56
102 0.54
103 0.56
104 0.49
105 0.45
106 0.43
107 0.43
108 0.39
109 0.31
110 0.26
111 0.22
112 0.22
113 0.2
114 0.19
115 0.17
116 0.13
117 0.13
118 0.15
119 0.16
120 0.2
121 0.2
122 0.21
123 0.22
124 0.21
125 0.21
126 0.24
127 0.25
128 0.23
129 0.25
130 0.24
131 0.24
132 0.26
133 0.26
134 0.21
135 0.21
136 0.18
137 0.19
138 0.23
139 0.23
140 0.21
141 0.2
142 0.2
143 0.24
144 0.28
145 0.27
146 0.24
147 0.23
148 0.24
149 0.27
150 0.27
151 0.22
152 0.22
153 0.21
154 0.21
155 0.19
156 0.18
157 0.15
158 0.17
159 0.15
160 0.1
161 0.12
162 0.12
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.12
167 0.11
168 0.11
169 0.09
170 0.12
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.07
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.11
185 0.15
186 0.2
187 0.25
188 0.28
189 0.29
190 0.33
191 0.39
192 0.42
193 0.42
194 0.41
195 0.44
196 0.44
197 0.47
198 0.47
199 0.45
200 0.45
201 0.47
202 0.45
203 0.41
204 0.48
205 0.51
206 0.5
207 0.45
208 0.45
209 0.46
210 0.44
211 0.41
212 0.36
213 0.31
214 0.32
215 0.35
216 0.3
217 0.24
218 0.25
219 0.25
220 0.28
221 0.34
222 0.32
223 0.32
224 0.34
225 0.37
226 0.39
227 0.42
228 0.38
229 0.4
230 0.4
231 0.39
232 0.38
233 0.35
234 0.31
235 0.28
236 0.26
237 0.18
238 0.16
239 0.13
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.11
244 0.1
245 0.1
246 0.12
247 0.17
248 0.22
249 0.26
250 0.3
251 0.31
252 0.33
253 0.4
254 0.39
255 0.43
256 0.48
257 0.5
258 0.49
259 0.55
260 0.54
261 0.49
262 0.47
263 0.42
264 0.37
265 0.3
266 0.28
267 0.23
268 0.24
269 0.24
270 0.23
271 0.19
272 0.14
273 0.13
274 0.14
275 0.14
276 0.16
277 0.15
278 0.16
279 0.17
280 0.17
281 0.16
282 0.14
283 0.12
284 0.08
285 0.08
286 0.06
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.06
296 0.08
297 0.13
298 0.15
299 0.19
300 0.23
301 0.32
302 0.38
303 0.42
304 0.48
305 0.5
306 0.56
307 0.6
308 0.62
309 0.6
310 0.57
311 0.54
312 0.49
313 0.43
314 0.38
315 0.29
316 0.23
317 0.19
318 0.17
319 0.17
320 0.15
321 0.15
322 0.19
323 0.21
324 0.22
325 0.22
326 0.21
327 0.21
328 0.2
329 0.19
330 0.15
331 0.12
332 0.11
333 0.12
334 0.12
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.12
339 0.12
340 0.12
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.16
345 0.16
346 0.14
347 0.15
348 0.15
349 0.16
350 0.17
351 0.19
352 0.14
353 0.16
354 0.16
355 0.16
356 0.16
357 0.14
358 0.13
359 0.11
360 0.1
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.07
365 0.07
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.08
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.06
374 0.06
375 0.05
376 0.05
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.05
381 0.06
382 0.06
383 0.07
384 0.08
385 0.08
386 0.1
387 0.16
388 0.22
389 0.28
390 0.36
391 0.44
392 0.51
393 0.61
394 0.69
395 0.74
396 0.78
397 0.84
398 0.81
399 0.78
400 0.82
401 0.76
402 0.75
403 0.67
404 0.61
405 0.56