Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HDH5

Protein Details
Accession C6HDH5    Localization Confidence Low Confidence Score 6.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MPSCPPIPVHPSNRRHRFFDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 13, cyto_nucl 7, nucl 6, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001261  ArgE/DapE_CS  
IPR017149  GSH_degradosome_Dug2  
IPR002933  Peptidase_M20  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0006751  P:glutathione catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF01546  Peptidase_M20  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00758  ARGE_DAPE_CPG2_1  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MPSCPPIPVHPSNRRHRFFDSKGPGGIVTLNPDAGEAVQKLGLGGQSLSFKRDQHKLYAHNGYIYCMLLVRGLEEWANGDEILLTGSGDGSVKLWELSKCPEGSPVELAELKNGSDSVLSIAVDGAFLYCGLSGGAVYIWNLDSRQIIRKLTAHSGDIWAIDVVGNVIITGDSSGIIRKFNSRFEEVGSWIAHEGTMLASAAGVFKDRRIYATGGNDNTVAIWDLTDHPQDFQEMPAVGNDEMVNTLAKFVSFKTVSARPKFAGECNQGAAFLRRHCNYLGAKTKLLATGPNTNPIVFARFDAASKSSANKTVLFYGHYDVVGADTNHLKWNTDPFQLCSINGFLYGRGVSDNKGPVLAALYAAAELAQKKKLSCNVVFLIEGEEESGSQGFSYAVRKHKDLIGEVDWILLANSYWLDDHIPCLTYGLRGVVHANFVVTSSNPDLHSGIDGSSLLDEPLKDLTMLLGTLVGAKGKINIPGFHEPVLPLTEAERRRYDAIAKALLPHHPEIEDYEAFTDSLMHRWPWSSAKGDRHYNYPPVNPSNQLSRREPLRTNSTDSVASNIGRIISSSSSVPKTRSGHRLSAPTVPTSSTLTHGSDLPGTKPASRLPAPCLHNASPSPCDVISAAAATASGTMRSNDHGSQQSHTRESTSTSHAPLSIARPCQLIQPIYIREGGSIPTIRYLEKEFNAPAAHLPCGQASDHAHLDNERLRVENLYKSREIMARVFRDLGKDVNVNGNDGVLEDDSAGSETEGGWLPEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.78
3 0.77
4 0.77
5 0.73
6 0.74
7 0.72
8 0.67
9 0.63
10 0.59
11 0.5
12 0.41
13 0.37
14 0.27
15 0.23
16 0.19
17 0.18
18 0.16
19 0.16
20 0.16
21 0.13
22 0.16
23 0.11
24 0.11
25 0.12
26 0.12
27 0.12
28 0.12
29 0.12
30 0.1
31 0.1
32 0.11
33 0.17
34 0.18
35 0.21
36 0.23
37 0.25
38 0.3
39 0.38
40 0.39
41 0.41
42 0.49
43 0.52
44 0.58
45 0.63
46 0.59
47 0.56
48 0.53
49 0.47
50 0.4
51 0.34
52 0.26
53 0.17
54 0.16
55 0.12
56 0.12
57 0.11
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.12
63 0.11
64 0.12
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.07
71 0.05
72 0.04
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.06
79 0.07
80 0.08
81 0.11
82 0.11
83 0.14
84 0.19
85 0.24
86 0.24
87 0.24
88 0.3
89 0.29
90 0.3
91 0.3
92 0.26
93 0.24
94 0.26
95 0.26
96 0.23
97 0.21
98 0.18
99 0.16
100 0.15
101 0.12
102 0.09
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.09
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.06
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.11
131 0.13
132 0.21
133 0.24
134 0.25
135 0.28
136 0.31
137 0.35
138 0.39
139 0.39
140 0.32
141 0.3
142 0.31
143 0.28
144 0.24
145 0.21
146 0.14
147 0.11
148 0.1
149 0.08
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.07
162 0.08
163 0.09
164 0.1
165 0.17
166 0.2
167 0.26
168 0.31
169 0.32
170 0.32
171 0.35
172 0.37
173 0.31
174 0.33
175 0.27
176 0.22
177 0.19
178 0.18
179 0.13
180 0.1
181 0.09
182 0.05
183 0.06
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.08
193 0.12
194 0.13
195 0.15
196 0.17
197 0.19
198 0.22
199 0.3
200 0.35
201 0.31
202 0.32
203 0.3
204 0.27
205 0.24
206 0.2
207 0.13
208 0.07
209 0.05
210 0.06
211 0.08
212 0.1
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.15
218 0.14
219 0.13
220 0.14
221 0.12
222 0.12
223 0.12
224 0.13
225 0.11
226 0.12
227 0.11
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.06
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.18
242 0.25
243 0.33
244 0.36
245 0.38
246 0.32
247 0.36
248 0.37
249 0.35
250 0.37
251 0.33
252 0.31
253 0.3
254 0.29
255 0.25
256 0.25
257 0.25
258 0.19
259 0.19
260 0.23
261 0.22
262 0.24
263 0.24
264 0.29
265 0.27
266 0.33
267 0.38
268 0.35
269 0.35
270 0.34
271 0.35
272 0.3
273 0.28
274 0.22
275 0.16
276 0.23
277 0.23
278 0.28
279 0.27
280 0.26
281 0.26
282 0.24
283 0.24
284 0.14
285 0.14
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.12
290 0.13
291 0.12
292 0.12
293 0.14
294 0.14
295 0.17
296 0.19
297 0.19
298 0.19
299 0.2
300 0.2
301 0.19
302 0.19
303 0.16
304 0.16
305 0.14
306 0.12
307 0.09
308 0.09
309 0.1
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.09
314 0.12
315 0.12
316 0.12
317 0.11
318 0.18
319 0.2
320 0.23
321 0.24
322 0.22
323 0.28
324 0.28
325 0.27
326 0.21
327 0.19
328 0.14
329 0.14
330 0.12
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.1
339 0.11
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.09
344 0.09
345 0.09
346 0.06
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.04
353 0.05
354 0.06
355 0.09
356 0.1
357 0.1
358 0.13
359 0.18
360 0.23
361 0.23
362 0.26
363 0.25
364 0.25
365 0.25
366 0.22
367 0.19
368 0.13
369 0.12
370 0.08
371 0.06
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.04
380 0.08
381 0.12
382 0.18
383 0.2
384 0.21
385 0.22
386 0.24
387 0.25
388 0.23
389 0.23
390 0.19
391 0.19
392 0.18
393 0.17
394 0.14
395 0.12
396 0.1
397 0.06
398 0.04
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.04
404 0.05
405 0.05
406 0.07
407 0.07
408 0.08
409 0.07
410 0.08
411 0.08
412 0.07
413 0.08
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.08
418 0.08
419 0.09
420 0.08
421 0.08
422 0.06
423 0.07
424 0.07
425 0.05
426 0.08
427 0.08
428 0.1
429 0.1
430 0.11
431 0.11
432 0.11
433 0.12
434 0.09
435 0.08
436 0.07
437 0.07
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.05
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.04
453 0.04
454 0.03
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.06
461 0.07
462 0.12
463 0.13
464 0.15
465 0.2
466 0.25
467 0.27
468 0.25
469 0.25
470 0.2
471 0.2
472 0.2
473 0.15
474 0.1
475 0.1
476 0.16
477 0.18
478 0.22
479 0.22
480 0.23
481 0.25
482 0.26
483 0.27
484 0.26
485 0.28
486 0.27
487 0.25
488 0.26
489 0.25
490 0.27
491 0.27
492 0.22
493 0.19
494 0.16
495 0.16
496 0.16
497 0.19
498 0.17
499 0.14
500 0.14
501 0.14
502 0.13
503 0.13
504 0.13
505 0.08
506 0.1
507 0.11
508 0.1
509 0.11
510 0.12
511 0.14
512 0.16
513 0.19
514 0.22
515 0.27
516 0.35
517 0.41
518 0.48
519 0.47
520 0.49
521 0.5
522 0.51
523 0.49
524 0.44
525 0.44
526 0.4
527 0.41
528 0.39
529 0.37
530 0.4
531 0.43
532 0.44
533 0.42
534 0.42
535 0.45
536 0.48
537 0.49
538 0.45
539 0.48
540 0.46
541 0.49
542 0.46
543 0.44
544 0.4
545 0.36
546 0.33
547 0.26
548 0.23
549 0.16
550 0.15
551 0.13
552 0.1
553 0.11
554 0.1
555 0.08
556 0.1
557 0.11
558 0.14
559 0.18
560 0.2
561 0.21
562 0.26
563 0.29
564 0.35
565 0.43
566 0.44
567 0.47
568 0.5
569 0.54
570 0.5
571 0.54
572 0.48
573 0.41
574 0.37
575 0.31
576 0.28
577 0.24
578 0.23
579 0.18
580 0.19
581 0.18
582 0.18
583 0.18
584 0.18
585 0.19
586 0.19
587 0.18
588 0.2
589 0.2
590 0.2
591 0.21
592 0.23
593 0.26
594 0.29
595 0.3
596 0.31
597 0.38
598 0.4
599 0.43
600 0.47
601 0.41
602 0.43
603 0.42
604 0.41
605 0.35
606 0.33
607 0.31
608 0.24
609 0.24
610 0.19
611 0.18
612 0.14
613 0.12
614 0.11
615 0.07
616 0.08
617 0.06
618 0.07
619 0.06
620 0.07
621 0.07
622 0.08
623 0.1
624 0.13
625 0.16
626 0.16
627 0.22
628 0.27
629 0.28
630 0.31
631 0.37
632 0.4
633 0.39
634 0.38
635 0.35
636 0.29
637 0.32
638 0.33
639 0.33
640 0.31
641 0.3
642 0.31
643 0.29
644 0.29
645 0.27
646 0.28
647 0.27
648 0.26
649 0.25
650 0.26
651 0.26
652 0.3
653 0.33
654 0.29
655 0.26
656 0.3
657 0.32
658 0.32
659 0.34
660 0.29
661 0.24
662 0.24
663 0.22
664 0.2
665 0.19
666 0.18
667 0.2
668 0.21
669 0.2
670 0.22
671 0.25
672 0.27
673 0.27
674 0.31
675 0.27
676 0.3
677 0.3
678 0.28
679 0.29
680 0.25
681 0.25
682 0.22
683 0.22
684 0.19
685 0.2
686 0.2
687 0.19
688 0.2
689 0.23
690 0.25
691 0.24
692 0.25
693 0.24
694 0.28
695 0.29
696 0.28
697 0.24
698 0.23
699 0.24
700 0.27
701 0.3
702 0.34
703 0.35
704 0.39
705 0.39
706 0.39
707 0.42
708 0.41
709 0.41
710 0.39
711 0.42
712 0.4
713 0.42
714 0.44
715 0.4
716 0.41
717 0.39
718 0.35
719 0.31
720 0.29
721 0.27
722 0.33
723 0.32
724 0.3
725 0.28
726 0.25
727 0.2
728 0.18
729 0.18
730 0.1
731 0.1
732 0.08
733 0.08
734 0.08
735 0.09
736 0.09
737 0.07
738 0.07
739 0.07
740 0.09
741 0.11