FuNGI

C6HME1

Protein Details

Accession

C6HME1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
100-127	QMLYKLKHPPRESKPKSPTRTPAKPTRT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
110-115	RESKPK

Subcellular Location(s)

cyto 11, nucl 8, mito 4, plas 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039900 Pat1-like IPR019167 PAT1_dom
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0016853 F:isomerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0000290 P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA
Pfam	View protein in Pfam PF09770 PAT1

Amino Acid Sequences

MSFFGFDTTLPRDRPSGQQTRGIFENPDPFAHVAHAVVQDDEEAIDFEDTYDGLGDQLDEDQDAFNDDTFGGGADEKSVGKDFDFYGKTAQMSNVLDEEQMLYKLKHPPRESKPKSPTRTPAKPTRTGYELYQDPGYIPEIQAKSAVWGTGVGQKSKAEDDTQPLKPAAPAKKIMSLEEVEAQMRAQSKKLQATEQLSAPPPPLPTIPQFPVAAAQVAAPLTMPLHDRPAPPPDGMLPLSLQEFPPLDQGQYAQLGKDARAAQAFQRQQPFPPMETMLPRPGMPPTPNHHQNRLPPNPAPQYPMRQAQHHHPKPQASMGPPGPLPATSGMPPNMVPMTEEQRKANLIEDAKRAKRNHKIFLLSKGNGLMTPQDKNFITRIQLQQLVAATGNVTDPESEASLSEDFYYQVYSQIRGAPRQHPRQPLDHERNMPPPPDESDLESVERHMEWRQKMQSLNQKLWADMKILEPIVPGSSTPHPFIAFLSYPKGKKAIPRIFRQIDQEQRVTILTMIIVHLDSLDVVQRAQLQSGESQPPLPVREEVDLFSHAVMPSLLGYVNEAPINIITGLLGLVIGQTHVQTVAKTRVGLGVLTMLLSRAELVKEAGGVEDEQWKPWTELYNTLFDRLEPVFGDIFPGTINSGDDMYVWQFLAAVGIGASPEQQQRLVIAVKDRVMETVAQSKTLPADMASQRLGNVNLFMRAIGLDVELLG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.46
3	0.5
4	0.48
5	0.55
6	0.55
7	0.56
8	0.56
9	0.5
10	0.43
11	0.37
12	0.41
13	0.35
14	0.34
15	0.32
16	0.29
17	0.28
18	0.27
19	0.23
20	0.16
21	0.18
22	0.19
23	0.17
24	0.16
25	0.16
26	0.14
27	0.13
28	0.13
29	0.09
30	0.07
31	0.07
32	0.07
33	0.07
34	0.07
35	0.07
36	0.07
37	0.07
38	0.07
39	0.06
40	0.06
41	0.06
42	0.06
43	0.06
44	0.07
45	0.07
46	0.07
47	0.07
48	0.07
49	0.07
50	0.1
51	0.1
52	0.09
53	0.1
54	0.09
55	0.09
56	0.09
57	0.09
58	0.07
59	0.07
60	0.07
61	0.07
62	0.09
63	0.09
64	0.11
65	0.12
66	0.12
67	0.11
68	0.14
69	0.14
70	0.21
71	0.22
72	0.21
73	0.23
74	0.25
75	0.25
76	0.25
77	0.24
78	0.22
79	0.21
80	0.22
81	0.2
82	0.18
83	0.17
84	0.16
85	0.17
86	0.12
87	0.13
88	0.13
89	0.12
90	0.17
91	0.26
92	0.32
93	0.39
94	0.43
95	0.51
96	0.6
97	0.71
98	0.74
99	0.76
100	0.81
101	0.82
102	0.85
103	0.83
104	0.83
105	0.82
106	0.84
107	0.81
108	0.81
109	0.78
110	0.79
111	0.75
112	0.7
113	0.63
114	0.56
115	0.5
116	0.47
117	0.41
118	0.35
119	0.31
120	0.26
121	0.23
122	0.22
123	0.22
124	0.15
125	0.13
126	0.18
127	0.18
128	0.18
129	0.19
130	0.17
131	0.18
132	0.18
133	0.17
134	0.1
135	0.1
136	0.11
137	0.17
138	0.19
139	0.17
140	0.18
141	0.19
142	0.21
143	0.22
144	0.22
145	0.19
146	0.19
147	0.25
148	0.31
149	0.33
150	0.34
151	0.32
152	0.31
153	0.3
154	0.35
155	0.35
156	0.33
157	0.35
158	0.35
159	0.41
160	0.42
161	0.4
162	0.36
163	0.31
164	0.27
165	0.25
166	0.24
167	0.17
168	0.16
169	0.15
170	0.13
171	0.17
172	0.16
173	0.15
174	0.19
175	0.24
176	0.31
177	0.33
178	0.34
179	0.36
180	0.4
181	0.41
182	0.37
183	0.36
184	0.31
185	0.29
186	0.27
187	0.22
188	0.18
189	0.17
190	0.16
191	0.16
192	0.18
193	0.23
194	0.24
195	0.25
196	0.24
197	0.23
198	0.24
199	0.21
200	0.18
201	0.12
202	0.1
203	0.08
204	0.08
205	0.08
206	0.06
207	0.05
208	0.05
209	0.06
210	0.08
211	0.07
212	0.12
213	0.15
214	0.17
215	0.2
216	0.25
217	0.26
218	0.24
219	0.24
220	0.21
221	0.22
222	0.21
223	0.19
224	0.13
225	0.12
226	0.13
227	0.13
228	0.12
229	0.1
230	0.1
231	0.1
232	0.14
233	0.13
234	0.12
235	0.12
236	0.12
237	0.12
238	0.15
239	0.15
240	0.1
241	0.13
242	0.13
243	0.13
244	0.18
245	0.17
246	0.15
247	0.16
248	0.16
249	0.17
250	0.25
251	0.27
252	0.26
253	0.32
254	0.31
255	0.31
256	0.37
257	0.36
258	0.29
259	0.28
260	0.26
261	0.22
262	0.24
263	0.26
264	0.23
265	0.21
266	0.2
267	0.18
268	0.18
269	0.2
270	0.18
271	0.21
272	0.23
273	0.31
274	0.4
275	0.43
276	0.47
277	0.48
278	0.54
279	0.59
280	0.6
281	0.55
282	0.48
283	0.52
284	0.51
285	0.48
286	0.44
287	0.36
288	0.36
289	0.36
290	0.42
291	0.37
292	0.34
293	0.36
294	0.42
295	0.5
296	0.5
297	0.52
298	0.48
299	0.48
300	0.47
301	0.49
302	0.43
303	0.33
304	0.33
305	0.29
306	0.27
307	0.24
308	0.23
309	0.19
310	0.15
311	0.14
312	0.1
313	0.1
314	0.09
315	0.11
316	0.11
317	0.11
318	0.11
319	0.12
320	0.1
321	0.09
322	0.09
323	0.09
324	0.14
325	0.18
326	0.19
327	0.18
328	0.2
329	0.21
330	0.2
331	0.2
332	0.17
333	0.15
334	0.17
335	0.22
336	0.27
337	0.3
338	0.36
339	0.37
340	0.4
341	0.47
342	0.49
343	0.51
344	0.5
345	0.53
346	0.49
347	0.56
348	0.55
349	0.47
350	0.41
351	0.36
352	0.31
353	0.24
354	0.22
355	0.16
356	0.11
357	0.12
358	0.12
359	0.14
360	0.14
361	0.16
362	0.17
363	0.15
364	0.16
365	0.2
366	0.22
367	0.22
368	0.24
369	0.22
370	0.22
371	0.21
372	0.19
373	0.14
374	0.11
375	0.08
376	0.06
377	0.06
378	0.05
379	0.05
380	0.04
381	0.04
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.07
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.07
392	0.07
393	0.08
394	0.06
395	0.1
396	0.11
397	0.11
398	0.12
399	0.16
400	0.17
401	0.21
402	0.24
403	0.28
404	0.37
405	0.45
406	0.5
407	0.54
408	0.56
409	0.58
410	0.62
411	0.65
412	0.65
413	0.62
414	0.6
415	0.55
416	0.59
417	0.54
418	0.47
419	0.38
420	0.31
421	0.28
422	0.27
423	0.25
424	0.21
425	0.22
426	0.22
427	0.22
428	0.21
429	0.18
430	0.15
431	0.14
432	0.12
433	0.13
434	0.18
435	0.19
436	0.26
437	0.29
438	0.32
439	0.33
440	0.4
441	0.46
442	0.46
443	0.46
444	0.46
445	0.44
446	0.4
447	0.41
448	0.35
449	0.27
450	0.22
451	0.21
452	0.16
453	0.16
454	0.15
455	0.12
456	0.12
457	0.11
458	0.1
459	0.08
460	0.09
461	0.14
462	0.16
463	0.17
464	0.17
465	0.17
466	0.17
467	0.18
468	0.19
469	0.16
470	0.15
471	0.2
472	0.23
473	0.23
474	0.24
475	0.27
476	0.23
477	0.28
478	0.38
479	0.42
480	0.44
481	0.51
482	0.59
483	0.6
484	0.62
485	0.62
486	0.59
487	0.58
488	0.56
489	0.51
490	0.41
491	0.38
492	0.36
493	0.29
494	0.22
495	0.13
496	0.08
497	0.07
498	0.07
499	0.06
500	0.06
501	0.05
502	0.05
503	0.04
504	0.04
505	0.04
506	0.06
507	0.06
508	0.06
509	0.07
510	0.1
511	0.1
512	0.11
513	0.12
514	0.11
515	0.13
516	0.18
517	0.2
518	0.18
519	0.18
520	0.19
521	0.2
522	0.21
523	0.21
524	0.18
525	0.17
526	0.19
527	0.2
528	0.2
529	0.2
530	0.19
531	0.17
532	0.16
533	0.16
534	0.13
535	0.12
536	0.11
537	0.09
538	0.08
539	0.08
540	0.08
541	0.05
542	0.07
543	0.08
544	0.09
545	0.09
546	0.09
547	0.09
548	0.09
549	0.1
550	0.08
551	0.07
552	0.05
553	0.05
554	0.05
555	0.05
556	0.04
557	0.03
558	0.03
559	0.03
560	0.03
561	0.04
562	0.04
563	0.04
564	0.06
565	0.06
566	0.07
567	0.11
568	0.17
569	0.19
570	0.19
571	0.19
572	0.21
573	0.21
574	0.21
575	0.17
576	0.12
577	0.11
578	0.11
579	0.1
580	0.07
581	0.07
582	0.07
583	0.07
584	0.06
585	0.07
586	0.07
587	0.08
588	0.08
589	0.09
590	0.09
591	0.09
592	0.09
593	0.09
594	0.09
595	0.16
596	0.16
597	0.18
598	0.19
599	0.21
600	0.21
601	0.23
602	0.27
603	0.22
604	0.3
605	0.31
606	0.38
607	0.37
608	0.39
609	0.37
610	0.31
611	0.32
612	0.25
613	0.23
614	0.15
615	0.17
616	0.15
617	0.15
618	0.18
619	0.14
620	0.13
621	0.12
622	0.12
623	0.1
624	0.09
625	0.1
626	0.08
627	0.09
628	0.08
629	0.09
630	0.1
631	0.11
632	0.11
633	0.1
634	0.09
635	0.09
636	0.08
637	0.09
638	0.07
639	0.06
640	0.04
641	0.05
642	0.05
643	0.05
644	0.06
645	0.08
646	0.12
647	0.13
648	0.14
649	0.14
650	0.15
651	0.19
652	0.21
653	0.21
654	0.24
655	0.26
656	0.28
657	0.3
658	0.29
659	0.26
660	0.24
661	0.23
662	0.21
663	0.25
664	0.24
665	0.23
666	0.23
667	0.24
668	0.24
669	0.24
670	0.2
671	0.13
672	0.21
673	0.22
674	0.26
675	0.27
676	0.25
677	0.25
678	0.28
679	0.29
680	0.21
681	0.23
682	0.2
683	0.2
684	0.2
685	0.19
686	0.16
687	0.14
688	0.14
689	0.11
690	0.09

C6HME1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer