FuNGI

C6HT62

Protein Details

Accession

C6HT62

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
536-559	KAESLKYRSKKLTRAEKEARVQEK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
527-552	GPKKTKEEWKAESLKYRSKKLTRAEK

Subcellular Location(s)

nucl 9, cyto 8.5, cyto_mito 6.5, pero 5, mito 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036412 HAD-like_sf IPR023214 HAD_sf IPR023198 PGP-like_dom2 IPR005485 Rbsml_L5_euk/L18_arc IPR025607 Rbsml_L5e_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:1990904 C:ribonucleoprotein complex GO:0005840 C:ribosome GO:0008097 F:5S rRNA binding GO:0016791 F:phosphatase activity GO:0003735 F:structural constituent of ribosome GO:0006412 P:translation
Pfam	View protein in Pfam PF14204 Ribosomal_L18_c PF17144 Ribosomal_L5e
CDD	cd00432 Ribosomal_L18_L5e

Amino Acid Sequences

MAGTKRPKGLLFDIGGVCVVSPFQAILDYEIANKIPIGWVNYSIQQTSPHGAWHKIERGEVKLDAAFFREFNSDFQHQHLWKSFHALRQRKDNQSSSSSTFILPPLPKVDAEYLFWEMMRVARCPDPFMFPALEKLQASGQFILGALSNTTILPADSPVGPPVDVKPFFDFFISSAHVGLRKPDPKVYALALKEMNDAAKKKELPGLVEPNDIVFLDDIGINLKWAKKAGFRTIKVDLGKSWDAVKELEEVTGSVATRRTKPIGKMPFTKLVKNSAYFSRYQTKFKRRREGKTDYYARKRLITQAKNKYNAPKYRMVVRFTNRDIITQIVTAEMTGDKVFASAYSHELKRYGIKHGLTNWAAAYATGLLLARRALKKLSLDEDFVGVEEPEGEYSLTEAAETDEGTRRPFKVVLDVGLQRTSTGARVFAAMKGASDGGILIPHSESRFPGYDIETKELDAETLRRYIFGGHVAEYMETLADDDEERYKSQFQKYIDDDVDAGDLEEIYAEAHKGIRADPLKKDEDAGPKKTKEEWKAESLKYRSKKLTRAEKEARVQEKIRELA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.33
3	0.26
4	0.21
5	0.14
6	0.12
7	0.06
8	0.06
9	0.05
10	0.05
11	0.07
12	0.08
13	0.11
14	0.13
15	0.13
16	0.14
17	0.16
18	0.16
19	0.14
20	0.14
21	0.11
22	0.12
23	0.14
24	0.17
25	0.17
26	0.2
27	0.22
28	0.27
29	0.29
30	0.27
31	0.26
32	0.25
33	0.26
34	0.27
35	0.25
36	0.26
37	0.27
38	0.3
39	0.32
40	0.37
41	0.41
42	0.39
43	0.44
44	0.42
45	0.42
46	0.43
47	0.4
48	0.35
49	0.29
50	0.28
51	0.24
52	0.23
53	0.2
54	0.16
55	0.17
56	0.18
57	0.18
58	0.18
59	0.24
60	0.25
61	0.25
62	0.29
63	0.35
64	0.33
65	0.38
66	0.43
67	0.4
68	0.36
69	0.44
70	0.44
71	0.42
72	0.51
73	0.54
74	0.52
75	0.6
76	0.68
77	0.69
78	0.73
79	0.73
80	0.68
81	0.65
82	0.65
83	0.58
84	0.52
85	0.44
86	0.36
87	0.32
88	0.27
89	0.28
90	0.23
91	0.22
92	0.22
93	0.22
94	0.21
95	0.23
96	0.26
97	0.21
98	0.22
99	0.23
100	0.23
101	0.21
102	0.21
103	0.18
104	0.14
105	0.16
106	0.16
107	0.14
108	0.14
109	0.19
110	0.2
111	0.23
112	0.24
113	0.26
114	0.25
115	0.27
116	0.26
117	0.21
118	0.26
119	0.24
120	0.25
121	0.2
122	0.2
123	0.2
124	0.2
125	0.22
126	0.18
127	0.17
128	0.14
129	0.14
130	0.13
131	0.1
132	0.09
133	0.06
134	0.06
135	0.06
136	0.06
137	0.06
138	0.06
139	0.05
140	0.05
141	0.06
142	0.07
143	0.07
144	0.08
145	0.09
146	0.1
147	0.1
148	0.1
149	0.12
150	0.19
151	0.19
152	0.2
153	0.22
154	0.23
155	0.23
156	0.23
157	0.21
158	0.14
159	0.16
160	0.16
161	0.13
162	0.12
163	0.12
164	0.14
165	0.14
166	0.16
167	0.21
168	0.23
169	0.25
170	0.28
171	0.29
172	0.29
173	0.31
174	0.3
175	0.29
176	0.25
177	0.27
178	0.25
179	0.23
180	0.23
181	0.21
182	0.2
183	0.17
184	0.18
185	0.17
186	0.21
187	0.21
188	0.21
189	0.25
190	0.25
191	0.25
192	0.3
193	0.34
194	0.3
195	0.31
196	0.29
197	0.25
198	0.24
199	0.2
200	0.15
201	0.07
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.05
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.07
210	0.08
211	0.09
212	0.1
213	0.11
214	0.15
215	0.19
216	0.29
217	0.36
218	0.37
219	0.41
220	0.43
221	0.46
222	0.42
223	0.39
224	0.29
225	0.27
226	0.26
227	0.22
228	0.2
229	0.16
230	0.16
231	0.15
232	0.15
233	0.11
234	0.11
235	0.1
236	0.09
237	0.08
238	0.08
239	0.09
240	0.08
241	0.06
242	0.1
243	0.11
244	0.13
245	0.16
246	0.18
247	0.21
248	0.24
249	0.32
250	0.37
251	0.41
252	0.45
253	0.46
254	0.52
255	0.51
256	0.51
257	0.43
258	0.41
259	0.39
260	0.34
261	0.32
262	0.27
263	0.27
264	0.25
265	0.27
266	0.3
267	0.3
268	0.36
269	0.43
270	0.5
271	0.58
272	0.65
273	0.72
274	0.7
275	0.77
276	0.78
277	0.78
278	0.74
279	0.74
280	0.75
281	0.73
282	0.73
283	0.69
284	0.61
285	0.55
286	0.49
287	0.47
288	0.48
289	0.47
290	0.5
291	0.55
292	0.61
293	0.62
294	0.63
295	0.63
296	0.62
297	0.6
298	0.56
299	0.52
300	0.47
301	0.53
302	0.55
303	0.5
304	0.49
305	0.47
306	0.48
307	0.43
308	0.48
309	0.39
310	0.35
311	0.32
312	0.27
313	0.23
314	0.17
315	0.16
316	0.08
317	0.08
318	0.07
319	0.07
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.04
325	0.05
326	0.05
327	0.04
328	0.06
329	0.06
330	0.09
331	0.14
332	0.14
333	0.15
334	0.16
335	0.17
336	0.2
337	0.21
338	0.24
339	0.25
340	0.26
341	0.28
342	0.3
343	0.36
344	0.31
345	0.3
346	0.25
347	0.2
348	0.19
349	0.15
350	0.13
351	0.06
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.04
356	0.05
357	0.06
358	0.11
359	0.12
360	0.13
361	0.14
362	0.16
363	0.19
364	0.23
365	0.27
366	0.24
367	0.24
368	0.24
369	0.24
370	0.21
371	0.18
372	0.15
373	0.1
374	0.07
375	0.06
376	0.06
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.04
381	0.05
382	0.06
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.06
388	0.06
389	0.08
390	0.11
391	0.12
392	0.15
393	0.18
394	0.17
395	0.2
396	0.21
397	0.2
398	0.24
399	0.25
400	0.24
401	0.27
402	0.29
403	0.28
404	0.28
405	0.27
406	0.19
407	0.18
408	0.16
409	0.14
410	0.12
411	0.11
412	0.1
413	0.12
414	0.13
415	0.13
416	0.15
417	0.13
418	0.12
419	0.12
420	0.12
421	0.1
422	0.09
423	0.08
424	0.05
425	0.06
426	0.06
427	0.06
428	0.06
429	0.08
430	0.09
431	0.1
432	0.11
433	0.14
434	0.16
435	0.17
436	0.19
437	0.21
438	0.26
439	0.28
440	0.31
441	0.27
442	0.26
443	0.25
444	0.23
445	0.19
446	0.15
447	0.14
448	0.13
449	0.16
450	0.16
451	0.15
452	0.15
453	0.16
454	0.16
455	0.19
456	0.19
457	0.16
458	0.17
459	0.18
460	0.17
461	0.16
462	0.14
463	0.09
464	0.07
465	0.06
466	0.05
467	0.05
468	0.06
469	0.07
470	0.11
471	0.13
472	0.14
473	0.16
474	0.21
475	0.27
476	0.33
477	0.38
478	0.37
479	0.44
480	0.47
481	0.52
482	0.48
483	0.43
484	0.36
485	0.31
486	0.29
487	0.2
488	0.16
489	0.09
490	0.07
491	0.06
492	0.06
493	0.05
494	0.05
495	0.05
496	0.05
497	0.06
498	0.07
499	0.08
500	0.09
501	0.1
502	0.19
503	0.25
504	0.3
505	0.36
506	0.42
507	0.45
508	0.44
509	0.46
510	0.44
511	0.49
512	0.51
513	0.53
514	0.54
515	0.53
516	0.56
517	0.61
518	0.64
519	0.61
520	0.63
521	0.61
522	0.62
523	0.68
524	0.71
525	0.72
526	0.7
527	0.71
528	0.68
529	0.71
530	0.71
531	0.7
532	0.73
533	0.74
534	0.78
535	0.77
536	0.81
537	0.82
538	0.81
539	0.82
540	0.83
541	0.79
542	0.75
543	0.7
544	0.66

C6HT62

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer