Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HCZ4

Protein Details
Accession C6HCZ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-112FQSWRYRYLNKVKDRPRPVAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR021661  Rap1_C  
IPR038104  Rap1_C_sf  
IPR015010  Rap1_Myb_dom  
IPR039595  TE2IP/Rap1  
Gene Ontology GO:0000781  C:chromosome, telomeric region  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:0010833  P:telomere maintenance via telomere lengthening  
Pfam View protein in Pfam  
PF08914  Myb_DNA-bind_2  
PF11626  Rap1_C  
CDD cd11655  rap1_myb-like  
cd11653  rap1_RCT  
Amino Acid Sequences MAFVHLDNMSYIEKSIRSGKRESLEDHRAGPQVGYFRPVGSTTIRQKGHRSAFTARDDQILYDWVKPFEEKGGHIGGNKIYQQLSEKYPHHTFQSWRYRYLNKVKDRPRPVAPEPTVRETDEEPRSDERPQADTSNTRTPGSGSNRYKHFTEEEKEDLLHHIKDILNIDDGKEDEAWSAYAENTDKSVAEWKSFFQNVILPEYRSRKSRNTASHQALPVAHHDIAATSSIRAKSPKKQRSENYSLTSFSESGSQQNLAPLDKQRIDIRKRRRSATHLPATEGESESRKRKTVEATARATTCPSIARQQLDRAMAFTASPTNSPGSSIREPSTHSKSRFPYPSNNENSTSASRAVSATTTNSASDDRFETAPQFRQDTLESHYQTPPQILDRRHEFNGSPTPRPTPIAETNAHAGDNPSSSPNDQPSIERLDKWIASKTAGPKASTEQQVLEALACTTMDPDLADTVLEAMATGKGIPDNIRGVWTKEDDECLEASDSRGIEALIQKHGDELFNERFEYIMTRKEVMMQMQKPAD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.27
3 0.31
4 0.34
5 0.38
6 0.45
7 0.49
8 0.53
9 0.55
10 0.55
11 0.57
12 0.55
13 0.53
14 0.51
15 0.46
16 0.42
17 0.37
18 0.31
19 0.28
20 0.26
21 0.26
22 0.22
23 0.2
24 0.21
25 0.22
26 0.21
27 0.21
28 0.29
29 0.34
30 0.42
31 0.46
32 0.47
33 0.53
34 0.6
35 0.64
36 0.6
37 0.57
38 0.56
39 0.6
40 0.63
41 0.62
42 0.53
43 0.48
44 0.43
45 0.38
46 0.32
47 0.29
48 0.24
49 0.23
50 0.25
51 0.22
52 0.23
53 0.23
54 0.22
55 0.24
56 0.25
57 0.21
58 0.23
59 0.26
60 0.27
61 0.27
62 0.29
63 0.25
64 0.27
65 0.27
66 0.25
67 0.21
68 0.21
69 0.24
70 0.25
71 0.27
72 0.31
73 0.31
74 0.36
75 0.4
76 0.41
77 0.42
78 0.43
79 0.42
80 0.45
81 0.55
82 0.5
83 0.51
84 0.54
85 0.54
86 0.58
87 0.65
88 0.64
89 0.62
90 0.69
91 0.73
92 0.78
93 0.81
94 0.78
95 0.75
96 0.74
97 0.69
98 0.7
99 0.65
100 0.64
101 0.62
102 0.61
103 0.56
104 0.48
105 0.45
106 0.37
107 0.41
108 0.37
109 0.33
110 0.31
111 0.32
112 0.34
113 0.33
114 0.34
115 0.29
116 0.28
117 0.29
118 0.28
119 0.28
120 0.3
121 0.35
122 0.39
123 0.38
124 0.35
125 0.33
126 0.32
127 0.36
128 0.39
129 0.44
130 0.41
131 0.45
132 0.49
133 0.51
134 0.5
135 0.45
136 0.42
137 0.39
138 0.37
139 0.36
140 0.35
141 0.34
142 0.33
143 0.31
144 0.3
145 0.26
146 0.22
147 0.17
148 0.17
149 0.16
150 0.18
151 0.19
152 0.17
153 0.17
154 0.17
155 0.17
156 0.15
157 0.15
158 0.13
159 0.12
160 0.11
161 0.08
162 0.09
163 0.08
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.16
175 0.15
176 0.16
177 0.16
178 0.17
179 0.21
180 0.22
181 0.21
182 0.15
183 0.18
184 0.17
185 0.22
186 0.22
187 0.18
188 0.23
189 0.28
190 0.29
191 0.3
192 0.34
193 0.34
194 0.4
195 0.47
196 0.51
197 0.55
198 0.62
199 0.63
200 0.64
201 0.58
202 0.53
203 0.45
204 0.37
205 0.31
206 0.25
207 0.2
208 0.14
209 0.13
210 0.12
211 0.11
212 0.12
213 0.09
214 0.06
215 0.09
216 0.1
217 0.11
218 0.16
219 0.18
220 0.26
221 0.37
222 0.44
223 0.48
224 0.56
225 0.62
226 0.67
227 0.72
228 0.7
229 0.63
230 0.57
231 0.51
232 0.44
233 0.39
234 0.29
235 0.21
236 0.17
237 0.13
238 0.13
239 0.13
240 0.12
241 0.11
242 0.12
243 0.13
244 0.1
245 0.12
246 0.12
247 0.15
248 0.16
249 0.17
250 0.2
251 0.27
252 0.34
253 0.4
254 0.49
255 0.55
256 0.58
257 0.61
258 0.61
259 0.61
260 0.65
261 0.66
262 0.64
263 0.55
264 0.53
265 0.49
266 0.46
267 0.39
268 0.3
269 0.21
270 0.16
271 0.18
272 0.2
273 0.21
274 0.22
275 0.22
276 0.24
277 0.28
278 0.34
279 0.4
280 0.43
281 0.45
282 0.46
283 0.45
284 0.43
285 0.38
286 0.29
287 0.2
288 0.14
289 0.12
290 0.15
291 0.17
292 0.19
293 0.2
294 0.24
295 0.27
296 0.27
297 0.26
298 0.21
299 0.19
300 0.16
301 0.14
302 0.12
303 0.1
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.1
308 0.1
309 0.12
310 0.13
311 0.17
312 0.19
313 0.21
314 0.21
315 0.21
316 0.25
317 0.29
318 0.36
319 0.37
320 0.37
321 0.41
322 0.43
323 0.5
324 0.54
325 0.51
326 0.53
327 0.53
328 0.6
329 0.6
330 0.6
331 0.54
332 0.49
333 0.5
334 0.41
335 0.36
336 0.27
337 0.21
338 0.18
339 0.16
340 0.15
341 0.12
342 0.11
343 0.1
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.12
348 0.12
349 0.12
350 0.13
351 0.13
352 0.13
353 0.13
354 0.13
355 0.16
356 0.19
357 0.24
358 0.24
359 0.25
360 0.23
361 0.25
362 0.26
363 0.25
364 0.26
365 0.28
366 0.28
367 0.29
368 0.3
369 0.3
370 0.29
371 0.28
372 0.25
373 0.23
374 0.27
375 0.27
376 0.31
377 0.35
378 0.4
379 0.4
380 0.41
381 0.35
382 0.35
383 0.43
384 0.41
385 0.39
386 0.36
387 0.38
388 0.37
389 0.39
390 0.35
391 0.32
392 0.34
393 0.36
394 0.35
395 0.33
396 0.35
397 0.33
398 0.31
399 0.24
400 0.19
401 0.15
402 0.15
403 0.13
404 0.12
405 0.13
406 0.14
407 0.18
408 0.2
409 0.21
410 0.21
411 0.22
412 0.24
413 0.3
414 0.31
415 0.28
416 0.28
417 0.3
418 0.31
419 0.31
420 0.33
421 0.26
422 0.26
423 0.31
424 0.34
425 0.37
426 0.38
427 0.37
428 0.33
429 0.38
430 0.43
431 0.42
432 0.38
433 0.31
434 0.3
435 0.3
436 0.28
437 0.23
438 0.16
439 0.12
440 0.11
441 0.09
442 0.07
443 0.07
444 0.06
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.07
449 0.07
450 0.07
451 0.06
452 0.07
453 0.06
454 0.06
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.08
463 0.1
464 0.13
465 0.15
466 0.16
467 0.2
468 0.21
469 0.23
470 0.27
471 0.28
472 0.28
473 0.27
474 0.3
475 0.27
476 0.28
477 0.25
478 0.22
479 0.21
480 0.19
481 0.19
482 0.19
483 0.17
484 0.15
485 0.15
486 0.13
487 0.14
488 0.2
489 0.21
490 0.22
491 0.23
492 0.23
493 0.25
494 0.26
495 0.24
496 0.2
497 0.24
498 0.25
499 0.27
500 0.27
501 0.25
502 0.24
503 0.23
504 0.27
505 0.23
506 0.24
507 0.25
508 0.26
509 0.27
510 0.32
511 0.35
512 0.37
513 0.44
514 0.4