Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6H887

Protein Details
Accession C6H887    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-27FIADCYRSKIRNKRLAKLGSQHydrophilic
197-216LLPCWKRVTRLYKGFRKQNAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10.5, cyto 6.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MAIFFEFIADCYRSKIRNKRLAKLGSQASSTTQSSSQSPSGDNDSEAITSSPVREPTSQRPQINISSNQAPSYPPTSSQSDMRQPNEEAPRIRIGAQPSQSKAKSPDVSGTTTPRVPPRSSETVEDFEDKTLRAVFRVTLDESRRVDVQGQKLSYLVGLVQELQEQGQALRMNIDVLDQALLEAASNTDNGKPMEYLLPCWKRVTRLYKGFRKQNADDRKYVIVSEARRLCMSYCIFAATIPEMFGLGTPPSSTLKPHLLRDPEDDLGLCHDFITEAVKRSNEDETILPAFVGAVEEMSHDLSSLTLNMDYKPYVMALRNLVRFPPLAVAITESELLNTSVNAEQFETATLLGPWFRLSPLQRDVPLNYFSSPKTRDHGFIVNSQRAVRMMQQLLSSDLLDIINQLIRASKSARERVLDWFAASVNLNHKRRALQVDHKTVSSDGFMFNITTCLDQLCEPFMDAAFTKVPNFPPAAIDRIDIGYLKRNPRVNMRDETKINADQHASDAFYDQVEEGTSNFITEIFFLTVAAHHYGSESLTAKLEQLEKDLRHMETQIDKLELERHKWKSNPIQLRMFEDALKKYKDKFDLGLSFKYTLQGILLDDIWQARSMQVMRYVIVWLLRIASGRNFPTEALKLPLPEKQPENFKCLPEYFVDDVVSSFKFIMWSMPHVVTSTQGDELIMLCITFLQSSEYIKNPYLKAGLVTILYRGTWRRRNVELRREGSNMEQNVRQQKEEQLAAAQGRAKSYMQLTNETVAMLKLFTEALADSFTMPEIVQRLADMLDYNLDAMVGPKSANLRVDNLVEYGFKPRSLLSEIVDVYLNLMDKENFVVAVARDGRSYKPSNFEKAAEILRKWALKPQEDLSKWEQLQTKFRVAKEADEQAEEDLGDIPDEFLDPLVYTLMEDPVILPSSKVSIDRSTIRSHLLSDPNDPFNRAPLSIEDVIPDTETKAKIEAFKAERKAAKLAAMTASALETMDTTDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.49
3 0.55
4 0.64
5 0.71
6 0.76
7 0.8
8 0.82
9 0.77
10 0.75
11 0.72
12 0.65
13 0.6
14 0.51
15 0.45
16 0.42
17 0.38
18 0.31
19 0.25
20 0.24
21 0.25
22 0.29
23 0.29
24 0.26
25 0.27
26 0.28
27 0.32
28 0.31
29 0.29
30 0.25
31 0.23
32 0.21
33 0.2
34 0.17
35 0.12
36 0.12
37 0.14
38 0.17
39 0.19
40 0.22
41 0.26
42 0.32
43 0.41
44 0.51
45 0.57
46 0.56
47 0.57
48 0.59
49 0.61
50 0.62
51 0.57
52 0.52
53 0.5
54 0.49
55 0.46
56 0.41
57 0.35
58 0.31
59 0.31
60 0.26
61 0.22
62 0.26
63 0.29
64 0.31
65 0.36
66 0.39
67 0.44
68 0.5
69 0.5
70 0.51
71 0.48
72 0.53
73 0.56
74 0.55
75 0.48
76 0.45
77 0.46
78 0.43
79 0.43
80 0.38
81 0.36
82 0.38
83 0.41
84 0.44
85 0.43
86 0.5
87 0.49
88 0.5
89 0.5
90 0.51
91 0.48
92 0.44
93 0.48
94 0.42
95 0.46
96 0.45
97 0.46
98 0.41
99 0.4
100 0.41
101 0.41
102 0.42
103 0.39
104 0.41
105 0.43
106 0.47
107 0.47
108 0.48
109 0.46
110 0.45
111 0.46
112 0.44
113 0.37
114 0.31
115 0.3
116 0.25
117 0.21
118 0.21
119 0.19
120 0.17
121 0.17
122 0.17
123 0.18
124 0.22
125 0.24
126 0.27
127 0.3
128 0.36
129 0.37
130 0.38
131 0.36
132 0.33
133 0.35
134 0.35
135 0.39
136 0.39
137 0.38
138 0.35
139 0.34
140 0.33
141 0.28
142 0.21
143 0.14
144 0.08
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.12
155 0.12
156 0.11
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.07
175 0.08
176 0.11
177 0.11
178 0.13
179 0.12
180 0.14
181 0.19
182 0.19
183 0.22
184 0.29
185 0.33
186 0.33
187 0.37
188 0.38
189 0.37
190 0.45
191 0.49
192 0.49
193 0.55
194 0.63
195 0.7
196 0.77
197 0.8
198 0.79
199 0.79
200 0.75
201 0.74
202 0.76
203 0.71
204 0.65
205 0.6
206 0.56
207 0.48
208 0.43
209 0.36
210 0.3
211 0.27
212 0.32
213 0.32
214 0.3
215 0.3
216 0.31
217 0.28
218 0.29
219 0.29
220 0.22
221 0.18
222 0.18
223 0.18
224 0.17
225 0.18
226 0.12
227 0.11
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.08
238 0.1
239 0.11
240 0.12
241 0.15
242 0.24
243 0.27
244 0.31
245 0.36
246 0.38
247 0.4
248 0.44
249 0.44
250 0.36
251 0.33
252 0.29
253 0.23
254 0.22
255 0.2
256 0.15
257 0.1
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.13
262 0.12
263 0.13
264 0.16
265 0.16
266 0.17
267 0.19
268 0.22
269 0.18
270 0.17
271 0.16
272 0.17
273 0.18
274 0.17
275 0.15
276 0.12
277 0.11
278 0.09
279 0.09
280 0.05
281 0.03
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.08
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.11
303 0.13
304 0.17
305 0.22
306 0.24
307 0.24
308 0.24
309 0.23
310 0.22
311 0.2
312 0.17
313 0.12
314 0.1
315 0.1
316 0.11
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.09
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.07
325 0.06
326 0.07
327 0.08
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.1
345 0.12
346 0.17
347 0.22
348 0.24
349 0.26
350 0.27
351 0.29
352 0.28
353 0.29
354 0.24
355 0.21
356 0.2
357 0.19
358 0.23
359 0.24
360 0.23
361 0.24
362 0.25
363 0.26
364 0.27
365 0.32
366 0.28
367 0.32
368 0.36
369 0.35
370 0.34
371 0.32
372 0.29
373 0.24
374 0.23
375 0.19
376 0.19
377 0.17
378 0.18
379 0.18
380 0.18
381 0.19
382 0.19
383 0.16
384 0.1
385 0.09
386 0.08
387 0.07
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.06
394 0.07
395 0.08
396 0.1
397 0.14
398 0.19
399 0.25
400 0.27
401 0.27
402 0.28
403 0.32
404 0.34
405 0.3
406 0.24
407 0.19
408 0.17
409 0.17
410 0.15
411 0.12
412 0.15
413 0.23
414 0.25
415 0.25
416 0.27
417 0.28
418 0.31
419 0.36
420 0.34
421 0.36
422 0.43
423 0.5
424 0.49
425 0.48
426 0.45
427 0.39
428 0.33
429 0.24
430 0.16
431 0.08
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.06
449 0.07
450 0.06
451 0.08
452 0.07
453 0.08
454 0.09
455 0.1
456 0.11
457 0.12
458 0.12
459 0.11
460 0.12
461 0.13
462 0.14
463 0.13
464 0.13
465 0.12
466 0.12
467 0.12
468 0.1
469 0.09
470 0.13
471 0.17
472 0.2
473 0.24
474 0.27
475 0.29
476 0.37
477 0.41
478 0.39
479 0.42
480 0.42
481 0.43
482 0.41
483 0.41
484 0.36
485 0.35
486 0.31
487 0.25
488 0.22
489 0.17
490 0.17
491 0.16
492 0.12
493 0.08
494 0.08
495 0.07
496 0.06
497 0.06
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.04
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.06
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.06
516 0.07
517 0.08
518 0.07
519 0.06
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.09
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.09
528 0.09
529 0.1
530 0.12
531 0.1
532 0.12
533 0.17
534 0.16
535 0.19
536 0.21
537 0.2
538 0.19
539 0.19
540 0.19
541 0.17
542 0.19
543 0.18
544 0.16
545 0.15
546 0.15
547 0.21
548 0.2
549 0.21
550 0.27
551 0.3
552 0.34
553 0.36
554 0.42
555 0.44
556 0.52
557 0.56
558 0.54
559 0.57
560 0.54
561 0.57
562 0.53
563 0.45
564 0.38
565 0.32
566 0.3
567 0.27
568 0.29
569 0.25
570 0.25
571 0.29
572 0.31
573 0.29
574 0.28
575 0.3
576 0.35
577 0.37
578 0.37
579 0.33
580 0.31
581 0.29
582 0.28
583 0.22
584 0.14
585 0.11
586 0.09
587 0.08
588 0.07
589 0.07
590 0.07
591 0.07
592 0.07
593 0.07
594 0.07
595 0.07
596 0.06
597 0.08
598 0.08
599 0.09
600 0.13
601 0.14
602 0.13
603 0.14
604 0.14
605 0.13
606 0.12
607 0.11
608 0.07
609 0.08
610 0.08
611 0.07
612 0.08
613 0.09
614 0.13
615 0.13
616 0.15
617 0.14
618 0.14
619 0.18
620 0.18
621 0.18
622 0.17
623 0.17
624 0.17
625 0.17
626 0.22
627 0.21
628 0.24
629 0.25
630 0.26
631 0.35
632 0.36
633 0.43
634 0.41
635 0.39
636 0.39
637 0.37
638 0.35
639 0.27
640 0.3
641 0.24
642 0.22
643 0.21
644 0.17
645 0.17
646 0.17
647 0.15
648 0.1
649 0.08
650 0.07
651 0.08
652 0.08
653 0.11
654 0.1
655 0.13
656 0.16
657 0.16
658 0.16
659 0.16
660 0.16
661 0.15
662 0.15
663 0.14
664 0.11
665 0.1
666 0.1
667 0.09
668 0.1
669 0.09
670 0.07
671 0.05
672 0.04
673 0.04
674 0.05
675 0.05
676 0.04
677 0.06
678 0.07
679 0.09
680 0.12
681 0.14
682 0.16
683 0.19
684 0.23
685 0.21
686 0.23
687 0.22
688 0.2
689 0.18
690 0.17
691 0.15
692 0.12
693 0.12
694 0.11
695 0.1
696 0.1
697 0.11
698 0.15
699 0.21
700 0.28
701 0.33
702 0.38
703 0.45
704 0.56
705 0.63
706 0.69
707 0.71
708 0.66
709 0.65
710 0.62
711 0.55
712 0.5
713 0.47
714 0.39
715 0.32
716 0.32
717 0.32
718 0.4
719 0.4
720 0.37
721 0.32
722 0.34
723 0.36
724 0.35
725 0.3
726 0.23
727 0.24
728 0.23
729 0.23
730 0.22
731 0.17
732 0.17
733 0.18
734 0.17
735 0.16
736 0.19
737 0.22
738 0.21
739 0.24
740 0.25
741 0.25
742 0.25
743 0.22
744 0.19
745 0.14
746 0.12
747 0.08
748 0.06
749 0.06
750 0.05
751 0.05
752 0.06
753 0.05
754 0.06
755 0.07
756 0.07
757 0.07
758 0.07
759 0.07
760 0.07
761 0.07
762 0.08
763 0.08
764 0.09
765 0.08
766 0.08
767 0.09
768 0.08
769 0.09
770 0.08
771 0.07
772 0.07
773 0.07
774 0.08
775 0.07
776 0.06
777 0.06
778 0.06
779 0.07
780 0.06
781 0.06
782 0.08
783 0.1
784 0.12
785 0.16
786 0.17
787 0.19
788 0.21
789 0.23
790 0.23
791 0.21
792 0.2
793 0.17
794 0.17
795 0.2
796 0.18
797 0.17
798 0.16
799 0.16
800 0.19
801 0.22
802 0.23
803 0.19
804 0.24
805 0.24
806 0.24
807 0.24
808 0.2
809 0.17
810 0.16
811 0.15
812 0.09
813 0.1
814 0.09
815 0.09
816 0.11
817 0.1
818 0.09
819 0.09
820 0.1
821 0.09
822 0.15
823 0.17
824 0.17
825 0.18
826 0.2
827 0.22
828 0.26
829 0.31
830 0.28
831 0.35
832 0.4
833 0.46
834 0.47
835 0.47
836 0.43
837 0.43
838 0.47
839 0.43
840 0.38
841 0.35
842 0.37
843 0.38
844 0.35
845 0.37
846 0.37
847 0.36
848 0.4
849 0.41
850 0.47
851 0.46
852 0.51
853 0.49
854 0.51
855 0.47
856 0.49
857 0.5
858 0.44
859 0.51
860 0.51
861 0.55
862 0.51
863 0.52
864 0.54
865 0.49
866 0.5
867 0.48
868 0.51
869 0.43
870 0.39
871 0.4
872 0.32
873 0.31
874 0.25
875 0.19
876 0.13
877 0.11
878 0.09
879 0.09
880 0.08
881 0.07
882 0.08
883 0.08
884 0.06
885 0.06
886 0.06
887 0.07
888 0.07
889 0.07
890 0.07
891 0.08
892 0.09
893 0.08
894 0.08
895 0.08
896 0.1
897 0.12
898 0.12
899 0.11
900 0.11
901 0.13
902 0.15
903 0.16
904 0.17
905 0.19
906 0.24
907 0.3
908 0.33
909 0.36
910 0.36
911 0.38
912 0.36
913 0.35
914 0.38
915 0.39
916 0.38
917 0.4
918 0.44
919 0.47
920 0.48
921 0.48
922 0.4
923 0.38
924 0.39
925 0.32
926 0.29
927 0.24
928 0.3
929 0.29
930 0.29
931 0.25
932 0.24
933 0.24
934 0.23
935 0.2
936 0.15
937 0.18
938 0.19
939 0.18
940 0.19
941 0.22
942 0.26
943 0.28
944 0.36
945 0.37
946 0.44
947 0.49
948 0.54
949 0.56
950 0.54
951 0.56
952 0.49
953 0.48
954 0.41
955 0.39
956 0.34
957 0.3
958 0.27
959 0.22
960 0.2
961 0.15
962 0.13
963 0.1
964 0.07