Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D0B4E6

Protein Details
Accession A0A0D0B4E6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
191-212EIGHRKARQLEKDLKKNRGKPYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-84RGGAGGKLAKGGKRTT
194-211HRKARQLEKDLKKNRGKP
Subcellular Location(s) nucl 9.5, cyto_nucl 9.5, cyto 8.5, pero 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034215  RBM42_RRM  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12383  RRM_RBM42  
Amino Acid Sequences MDSQYSQFSQQQQAYDVNPYHQPYQGPMYPLPGSSSNHSAPVPANAYEYDVGILAQQSVYVPGAMIDKRGGAGGKLAKGGKRTTVLRKGGGKVWEDQTLLEWNPSWFRLFVGDLSNDVSDDVLANAFNQYTSFQKARVIRDRLSQKAKYGFVAFSDPEDFLKAWKEMDGKYVGNRPVKLKKADDTAIRPVEIGHRKARQLEKDLKKNRGKPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.36
3 0.33
4 0.28
5 0.3
6 0.32
7 0.31
8 0.3
9 0.29
10 0.26
11 0.32
12 0.33
13 0.31
14 0.29
15 0.32
16 0.29
17 0.29
18 0.29
19 0.26
20 0.25
21 0.25
22 0.3
23 0.26
24 0.28
25 0.27
26 0.25
27 0.22
28 0.24
29 0.23
30 0.18
31 0.19
32 0.16
33 0.19
34 0.17
35 0.17
36 0.12
37 0.1
38 0.09
39 0.08
40 0.08
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.04
45 0.05
46 0.06
47 0.05
48 0.05
49 0.05
50 0.08
51 0.08
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.06
59 0.1
60 0.12
61 0.13
62 0.16
63 0.17
64 0.18
65 0.21
66 0.21
67 0.2
68 0.22
69 0.26
70 0.31
71 0.38
72 0.39
73 0.41
74 0.44
75 0.43
76 0.43
77 0.42
78 0.36
79 0.3
80 0.29
81 0.27
82 0.23
83 0.21
84 0.18
85 0.17
86 0.16
87 0.13
88 0.11
89 0.09
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.07
94 0.07
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.11
102 0.11
103 0.09
104 0.08
105 0.07
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.03
110 0.03
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.05
117 0.07
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.18
122 0.23
123 0.3
124 0.38
125 0.41
126 0.38
127 0.46
128 0.52
129 0.54
130 0.57
131 0.52
132 0.48
133 0.49
134 0.48
135 0.42
136 0.38
137 0.31
138 0.25
139 0.26
140 0.21
141 0.17
142 0.18
143 0.16
144 0.14
145 0.16
146 0.14
147 0.12
148 0.15
149 0.13
150 0.12
151 0.15
152 0.17
153 0.16
154 0.2
155 0.23
156 0.21
157 0.24
158 0.3
159 0.34
160 0.36
161 0.39
162 0.41
163 0.47
164 0.52
165 0.55
166 0.52
167 0.52
168 0.53
169 0.56
170 0.56
171 0.53
172 0.55
173 0.51
174 0.47
175 0.41
176 0.35
177 0.39
178 0.39
179 0.39
180 0.38
181 0.41
182 0.44
183 0.52
184 0.6
185 0.58
186 0.6
187 0.66
188 0.69
189 0.74
190 0.79
191 0.82
192 0.83