Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D0A6S8

Protein Details
Accession A0A0D0A6S8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
282-310LPILGKRKSHHSHRRGEQREKRARREEEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
287-306KRKSHHSHRRGEQREKRARR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 12.333, cyto 11, cyto_mito 7.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MAPTQTAAPVAAPAPAPIAVTKKPSDGTTRDYKYTQEISQMMFVFGEIQDPNPETVNLVEDIVRSQLIELILQARLHANRRGVRYITAEDLIFLIRHDRSKVNRLRTYLSWKDVRKHAKDSGGEGGGGVEVENLEDGADEKLTTKAQKITIKLPWEISTIYSEVLRQSGHQSDDEEDEDDIEAHEASIQRLKEADDATRQMTREEYQHYSDCRQASFTYRKAKRFRDFLNLPAHLDLKANDDTVDIVGFLAFEMVRSLTLAGLDVKKALEESYLRDDYLGSLPILGKRKSHHSHRRGEQREKRARREEEEEEEAPLPTSSLFLPPPEARTALRPEHIQDAFARMQGDWSHHRSAGMHNFHGGLVRTRVSLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.12
4 0.13
5 0.17
6 0.18
7 0.24
8 0.25
9 0.27
10 0.28
11 0.31
12 0.36
13 0.35
14 0.39
15 0.44
16 0.47
17 0.48
18 0.47
19 0.46
20 0.46
21 0.46
22 0.41
23 0.38
24 0.35
25 0.32
26 0.36
27 0.35
28 0.28
29 0.23
30 0.22
31 0.16
32 0.14
33 0.15
34 0.1
35 0.11
36 0.13
37 0.15
38 0.16
39 0.16
40 0.16
41 0.13
42 0.14
43 0.15
44 0.12
45 0.12
46 0.11
47 0.1
48 0.11
49 0.11
50 0.11
51 0.08
52 0.08
53 0.1
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.1
58 0.12
59 0.12
60 0.12
61 0.13
62 0.17
63 0.21
64 0.25
65 0.3
66 0.33
67 0.38
68 0.42
69 0.4
70 0.4
71 0.4
72 0.38
73 0.34
74 0.3
75 0.26
76 0.21
77 0.2
78 0.17
79 0.13
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.13
84 0.15
85 0.2
86 0.25
87 0.35
88 0.42
89 0.49
90 0.52
91 0.53
92 0.56
93 0.55
94 0.59
95 0.55
96 0.53
97 0.51
98 0.49
99 0.52
100 0.55
101 0.6
102 0.55
103 0.56
104 0.55
105 0.54
106 0.52
107 0.5
108 0.46
109 0.38
110 0.33
111 0.26
112 0.21
113 0.14
114 0.12
115 0.09
116 0.04
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.07
129 0.08
130 0.09
131 0.11
132 0.14
133 0.2
134 0.25
135 0.26
136 0.3
137 0.34
138 0.36
139 0.35
140 0.33
141 0.29
142 0.26
143 0.24
144 0.19
145 0.16
146 0.13
147 0.12
148 0.11
149 0.1
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.07
154 0.1
155 0.12
156 0.13
157 0.13
158 0.14
159 0.15
160 0.17
161 0.16
162 0.14
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.09
167 0.07
168 0.05
169 0.05
170 0.03
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.12
180 0.12
181 0.14
182 0.13
183 0.15
184 0.17
185 0.18
186 0.18
187 0.15
188 0.16
189 0.15
190 0.15
191 0.18
192 0.19
193 0.2
194 0.23
195 0.25
196 0.26
197 0.28
198 0.27
199 0.22
200 0.21
201 0.19
202 0.23
203 0.27
204 0.31
205 0.38
206 0.42
207 0.5
208 0.56
209 0.64
210 0.64
211 0.65
212 0.62
213 0.62
214 0.59
215 0.57
216 0.57
217 0.5
218 0.44
219 0.38
220 0.35
221 0.25
222 0.24
223 0.18
224 0.14
225 0.14
226 0.13
227 0.12
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.1
232 0.06
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.13
259 0.2
260 0.21
261 0.21
262 0.21
263 0.21
264 0.2
265 0.21
266 0.18
267 0.1
268 0.11
269 0.12
270 0.17
271 0.23
272 0.22
273 0.22
274 0.24
275 0.34
276 0.41
277 0.51
278 0.57
279 0.6
280 0.69
281 0.76
282 0.85
283 0.84
284 0.88
285 0.86
286 0.86
287 0.88
288 0.87
289 0.87
290 0.86
291 0.83
292 0.79
293 0.77
294 0.72
295 0.68
296 0.66
297 0.57
298 0.5
299 0.44
300 0.38
301 0.31
302 0.24
303 0.17
304 0.1
305 0.11
306 0.08
307 0.11
308 0.11
309 0.11
310 0.17
311 0.19
312 0.22
313 0.24
314 0.25
315 0.23
316 0.28
317 0.34
318 0.33
319 0.35
320 0.34
321 0.35
322 0.41
323 0.4
324 0.36
325 0.3
326 0.32
327 0.29
328 0.29
329 0.27
330 0.18
331 0.22
332 0.22
333 0.27
334 0.27
335 0.31
336 0.34
337 0.33
338 0.35
339 0.33
340 0.4
341 0.44
342 0.44
343 0.39
344 0.37
345 0.37
346 0.36
347 0.38
348 0.32
349 0.26
350 0.24
351 0.24