FuNGI

C6H9Y5

Protein Details

Accession

C6H9Y5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
109-138	AEIRGEDDKRNPKRRKKALDTPRKREKQSG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
117-153	KRNPKRRKKALDTPRKREKQSGKMKSSPPASSKETPR

Subcellular Location(s)

nucl 25, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MVSRRPDSSYASNLQTEHNYRGGAPLSQAGGRLINHRESVSGHSASTSRKNKPEPATDDEPLSSTDESEQLNTHSEVSLSPEPEPRRKSNGWSQTETTGRLDKQPQSEAEIRGEDDKRNPKRRKKALDTPRKREKQSGKMKSSPPASSKETPRRPTFKMESDALFSCPRPPPMKSFYGSANLHTALKKKPSKQFKVPLSTADEDSAIHSSQISSDGPKFKTPLSFPNEVTSSSSFFNGTSPFDDDDGSSLSSLSSVSSSVSLQLSQAEKQALESATLRAKAIICPMCDQAVDPRFIDELRSNQGLSYRKKAQFCRDHRIKAAKHQWTERGYPKIDWENLHKRIEKHYAELDEILTRKKPSFYRNVLESSRTGKKKGSLRLTVDGDGVEKISPGYYGPWGAKAMMDAIIGHFAGKFKRLAPTDTLIKAAGVSGFVQSVMVPELTVMLVKDDMDIEDADARQVMRDSTEIGNLINEQPDDIIKQAVRI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.42
3	0.41
4	0.38
5	0.35
6	0.31
7	0.29
8	0.32
9	0.31
10	0.24
11	0.22
12	0.21
13	0.2
14	0.2
15	0.21
16	0.18
17	0.19
18	0.19
19	0.23
20	0.24
21	0.26
22	0.27
23	0.27
24	0.27
25	0.26
26	0.31
27	0.31
28	0.28
29	0.24
30	0.24
31	0.26
32	0.3
33	0.38
34	0.39
35	0.41
36	0.48
37	0.54
38	0.61
39	0.67
40	0.72
41	0.68
42	0.69
43	0.68
44	0.62
45	0.58
46	0.5
47	0.43
48	0.34
49	0.3
50	0.22
51	0.16
52	0.15
53	0.16
54	0.16
55	0.16
56	0.16
57	0.14
58	0.17
59	0.17
60	0.17
61	0.14
62	0.14
63	0.13
64	0.19
65	0.21
66	0.2
67	0.21
68	0.27
69	0.32
70	0.4
71	0.46
72	0.44
73	0.48
74	0.49
75	0.55
76	0.58
77	0.64
78	0.62
79	0.62
80	0.59
81	0.57
82	0.57
83	0.52
84	0.45
85	0.4
86	0.35
87	0.35
88	0.39
89	0.37
90	0.39
91	0.42
92	0.39
93	0.4
94	0.45
95	0.41
96	0.38
97	0.34
98	0.3
99	0.31
100	0.32
101	0.29
102	0.31
103	0.39
104	0.46
105	0.56
106	0.65
107	0.69
108	0.78
109	0.86
110	0.88
111	0.88
112	0.88
113	0.89
114	0.91
115	0.91
116	0.9
117	0.9
118	0.87
119	0.81
120	0.79
121	0.78
122	0.77
123	0.77
124	0.78
125	0.75
126	0.75
127	0.76
128	0.73
129	0.69
130	0.63
131	0.55
132	0.5
133	0.5
134	0.48
135	0.54
136	0.58
137	0.62
138	0.64
139	0.68
140	0.69
141	0.65
142	0.67
143	0.64
144	0.6
145	0.55
146	0.51
147	0.44
148	0.42
149	0.4
150	0.34
151	0.29
152	0.22
153	0.22
154	0.22
155	0.25
156	0.25
157	0.26
158	0.29
159	0.34
160	0.38
161	0.35
162	0.34
163	0.32
164	0.37
165	0.36
166	0.31
167	0.28
168	0.24
169	0.24
170	0.24
171	0.25
172	0.2
173	0.29
174	0.33
175	0.38
176	0.45
177	0.54
178	0.61
179	0.67
180	0.73
181	0.71
182	0.74
183	0.68
184	0.63
185	0.58
186	0.52
187	0.43
188	0.34
189	0.26
190	0.18
191	0.18
192	0.16
193	0.1
194	0.08
195	0.07
196	0.07
197	0.07
198	0.08
199	0.08
200	0.08
201	0.12
202	0.17
203	0.18
204	0.2
205	0.2
206	0.2
207	0.23
208	0.23
209	0.28
210	0.29
211	0.31
212	0.3
213	0.33
214	0.32
215	0.29
216	0.29
217	0.22
218	0.18
219	0.15
220	0.15
221	0.12
222	0.11
223	0.11
224	0.1
225	0.1
226	0.09
227	0.11
228	0.11
229	0.11
230	0.11
231	0.1
232	0.1
233	0.1
234	0.09
235	0.07
236	0.06
237	0.06
238	0.05
239	0.06
240	0.05
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.05
245	0.05
246	0.06
247	0.07
248	0.07
249	0.06
250	0.09
251	0.1
252	0.1
253	0.12
254	0.11
255	0.11
256	0.11
257	0.14
258	0.11
259	0.11
260	0.11
261	0.12
262	0.14
263	0.14
264	0.14
265	0.12
266	0.12
267	0.12
268	0.18
269	0.18
270	0.17
271	0.19
272	0.2
273	0.19
274	0.18
275	0.18
276	0.19
277	0.19
278	0.19
279	0.17
280	0.17
281	0.17
282	0.17
283	0.19
284	0.14
285	0.14
286	0.16
287	0.17
288	0.16
289	0.16
290	0.22
291	0.27
292	0.28
293	0.32
294	0.37
295	0.41
296	0.47
297	0.52
298	0.57
299	0.61
300	0.64
301	0.69
302	0.68
303	0.67
304	0.68
305	0.71
306	0.64
307	0.63
308	0.66
309	0.63
310	0.6
311	0.6
312	0.6
313	0.55
314	0.59
315	0.56
316	0.52
317	0.46
318	0.43
319	0.43
320	0.43
321	0.42
322	0.38
323	0.4
324	0.43
325	0.47
326	0.52
327	0.51
328	0.46
329	0.5
330	0.57
331	0.49
332	0.44
333	0.43
334	0.39
335	0.37
336	0.36
337	0.3
338	0.24
339	0.23
340	0.21
341	0.19
342	0.18
343	0.19
344	0.23
345	0.27
346	0.31
347	0.4
348	0.45
349	0.49
350	0.51
351	0.56
352	0.53
353	0.51
354	0.46
355	0.42
356	0.44
357	0.4
358	0.38
359	0.35
360	0.4
361	0.45
362	0.52
363	0.55
364	0.54
365	0.57
366	0.62
367	0.62
368	0.56
369	0.49
370	0.4
371	0.32
372	0.24
373	0.19
374	0.12
375	0.08
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.06
380	0.08
381	0.09
382	0.12
383	0.13
384	0.15
385	0.16
386	0.16
387	0.15
388	0.14
389	0.14
390	0.11
391	0.11
392	0.09
393	0.09
394	0.1
395	0.1
396	0.09
397	0.09
398	0.09
399	0.11
400	0.13
401	0.14
402	0.14
403	0.23
404	0.25
405	0.28
406	0.31
407	0.36
408	0.4
409	0.4
410	0.39
411	0.32
412	0.29
413	0.25
414	0.21
415	0.15
416	0.1
417	0.09
418	0.08
419	0.08
420	0.08
421	0.08
422	0.07
423	0.08
424	0.08
425	0.08
426	0.07
427	0.06
428	0.07
429	0.07
430	0.08
431	0.07
432	0.07
433	0.08
434	0.08
435	0.09
436	0.08
437	0.09
438	0.1
439	0.1
440	0.1
441	0.13
442	0.13
443	0.13
444	0.13
445	0.13
446	0.13
447	0.14
448	0.13
449	0.12
450	0.13
451	0.16
452	0.16
453	0.19
454	0.18
455	0.17
456	0.18
457	0.18
458	0.19
459	0.19
460	0.17
461	0.14
462	0.15
463	0.16
464	0.16
465	0.15
466	0.18

C6H9Y5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer