Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HN04

Protein Details
Accession C6HN04    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
480-505GSSANGRTMRTRRRKGKQKVGEAAGDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-274SQKGQRRSSLGRRGRR
489-498RTRRRKGKQK
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 9, cyto_nucl 8.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013218  Dsn1/Mis13  
Gene Ontology GO:0000444  C:MIS12/MIND type complex  
GO:0051301  P:cell division  
GO:0007059  P:chromosome segregation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08202  MIS13  
Amino Acid Sequences MTATIAAPAATISTRSTHHIIDFGDSRPNRYKQGTTHSRVPLTTINPAMSQARGRLANGNGTKKSMKGGDGYAEGGANGWGGKRKAVEYDEDVEGFQFTRATVPKKSKSVTIEENSVPPLPRDEDTQQQPVQKQKGRGRPPKSTEAPRNVTFETPNGKLPTRPLRRTSKRLAEEEPTATMTEKSLKPRRKSSDIAPAPTMVQRKRGSSKAKGSQTEPLREETEGQVTTPLADVNTQKIALPFADTPVIQKNKEMRMEKSQKGQRRSSLGRRGRRASWLIESGVSNALPHDQVDTAHFYKHIECEGLSEPKRMRQLLTWCATRALGEKPSGSRSGDESARLAARVIQEELLEDFANRPELSDWFGRQETTPPAVVVKKPNPRNIQNAEKIKELEEQIHKLQLERQSLTSLLRPPSIPKIKPPSSTSAQQSENQQPSTCTPQTELFRRAADDVAGQVLAICARLLEERDQLRQKRIGGEELGSSANGRTMRTRRRKGKQKVGEAAGDNEGAGDGGDADGDEKDDLRIEKEDLAIVLAALKVDDSAHLEPVNIISHAYPPIVFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.18
3 0.21
4 0.22
5 0.23
6 0.26
7 0.26
8 0.29
9 0.3
10 0.27
11 0.33
12 0.32
13 0.37
14 0.41
15 0.44
16 0.45
17 0.47
18 0.51
19 0.49
20 0.59
21 0.64
22 0.62
23 0.68
24 0.68
25 0.66
26 0.6
27 0.57
28 0.52
29 0.45
30 0.44
31 0.38
32 0.32
33 0.3
34 0.32
35 0.3
36 0.26
37 0.25
38 0.21
39 0.24
40 0.23
41 0.25
42 0.28
43 0.29
44 0.35
45 0.4
46 0.45
47 0.41
48 0.44
49 0.44
50 0.38
51 0.41
52 0.35
53 0.31
54 0.26
55 0.28
56 0.27
57 0.27
58 0.27
59 0.23
60 0.2
61 0.17
62 0.14
63 0.11
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.11
68 0.12
69 0.15
70 0.16
71 0.18
72 0.23
73 0.25
74 0.28
75 0.28
76 0.32
77 0.32
78 0.3
79 0.29
80 0.23
81 0.22
82 0.17
83 0.13
84 0.09
85 0.07
86 0.11
87 0.16
88 0.2
89 0.27
90 0.35
91 0.42
92 0.48
93 0.5
94 0.51
95 0.51
96 0.54
97 0.55
98 0.51
99 0.5
100 0.45
101 0.44
102 0.41
103 0.38
104 0.32
105 0.23
106 0.23
107 0.2
108 0.19
109 0.23
110 0.24
111 0.3
112 0.35
113 0.41
114 0.41
115 0.43
116 0.46
117 0.48
118 0.54
119 0.51
120 0.55
121 0.57
122 0.64
123 0.7
124 0.76
125 0.76
126 0.77
127 0.78
128 0.79
129 0.78
130 0.77
131 0.76
132 0.75
133 0.74
134 0.67
135 0.65
136 0.56
137 0.5
138 0.42
139 0.36
140 0.32
141 0.27
142 0.29
143 0.28
144 0.27
145 0.27
146 0.33
147 0.39
148 0.44
149 0.48
150 0.5
151 0.58
152 0.66
153 0.73
154 0.75
155 0.74
156 0.72
157 0.7
158 0.67
159 0.6
160 0.55
161 0.49
162 0.41
163 0.32
164 0.26
165 0.22
166 0.18
167 0.14
168 0.17
169 0.18
170 0.26
171 0.34
172 0.42
173 0.47
174 0.56
175 0.63
176 0.64
177 0.65
178 0.62
179 0.64
180 0.61
181 0.58
182 0.5
183 0.43
184 0.37
185 0.37
186 0.37
187 0.26
188 0.29
189 0.28
190 0.32
191 0.36
192 0.42
193 0.46
194 0.48
195 0.57
196 0.57
197 0.62
198 0.6
199 0.57
200 0.58
201 0.56
202 0.54
203 0.47
204 0.41
205 0.35
206 0.33
207 0.32
208 0.25
209 0.23
210 0.17
211 0.16
212 0.13
213 0.12
214 0.12
215 0.1
216 0.09
217 0.05
218 0.07
219 0.08
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.09
227 0.11
228 0.09
229 0.09
230 0.11
231 0.1
232 0.11
233 0.18
234 0.2
235 0.18
236 0.21
237 0.25
238 0.29
239 0.37
240 0.38
241 0.34
242 0.42
243 0.5
244 0.49
245 0.53
246 0.54
247 0.55
248 0.58
249 0.59
250 0.52
251 0.52
252 0.56
253 0.56
254 0.6
255 0.61
256 0.63
257 0.65
258 0.65
259 0.59
260 0.57
261 0.51
262 0.43
263 0.38
264 0.32
265 0.26
266 0.23
267 0.22
268 0.17
269 0.15
270 0.12
271 0.09
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.06
279 0.07
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.12
284 0.12
285 0.13
286 0.14
287 0.13
288 0.09
289 0.08
290 0.11
291 0.14
292 0.2
293 0.2
294 0.23
295 0.22
296 0.26
297 0.3
298 0.27
299 0.25
300 0.24
301 0.3
302 0.34
303 0.38
304 0.35
305 0.32
306 0.32
307 0.31
308 0.26
309 0.22
310 0.17
311 0.15
312 0.15
313 0.16
314 0.17
315 0.19
316 0.2
317 0.19
318 0.17
319 0.17
320 0.19
321 0.19
322 0.19
323 0.17
324 0.16
325 0.16
326 0.15
327 0.13
328 0.11
329 0.11
330 0.12
331 0.12
332 0.11
333 0.1
334 0.11
335 0.11
336 0.1
337 0.09
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.1
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.1
346 0.13
347 0.15
348 0.15
349 0.16
350 0.17
351 0.17
352 0.17
353 0.2
354 0.2
355 0.2
356 0.2
357 0.16
358 0.18
359 0.2
360 0.23
361 0.27
362 0.31
363 0.38
364 0.44
365 0.52
366 0.57
367 0.59
368 0.65
369 0.64
370 0.65
371 0.65
372 0.67
373 0.6
374 0.56
375 0.52
376 0.45
377 0.42
378 0.34
379 0.31
380 0.28
381 0.3
382 0.28
383 0.31
384 0.3
385 0.27
386 0.3
387 0.3
388 0.31
389 0.28
390 0.28
391 0.26
392 0.27
393 0.27
394 0.27
395 0.26
396 0.23
397 0.23
398 0.22
399 0.24
400 0.33
401 0.4
402 0.37
403 0.4
404 0.48
405 0.52
406 0.57
407 0.58
408 0.55
409 0.52
410 0.57
411 0.53
412 0.49
413 0.47
414 0.44
415 0.47
416 0.49
417 0.48
418 0.44
419 0.39
420 0.35
421 0.35
422 0.41
423 0.36
424 0.28
425 0.26
426 0.31
427 0.37
428 0.42
429 0.42
430 0.37
431 0.36
432 0.37
433 0.35
434 0.3
435 0.24
436 0.18
437 0.15
438 0.13
439 0.11
440 0.09
441 0.08
442 0.07
443 0.06
444 0.06
445 0.05
446 0.04
447 0.05
448 0.07
449 0.09
450 0.12
451 0.18
452 0.21
453 0.29
454 0.38
455 0.41
456 0.46
457 0.48
458 0.48
459 0.49
460 0.49
461 0.46
462 0.4
463 0.37
464 0.32
465 0.3
466 0.27
467 0.2
468 0.18
469 0.13
470 0.14
471 0.14
472 0.14
473 0.2
474 0.28
475 0.39
476 0.5
477 0.6
478 0.67
479 0.77
480 0.87
481 0.9
482 0.92
483 0.92
484 0.91
485 0.9
486 0.84
487 0.8
488 0.71
489 0.63
490 0.54
491 0.43
492 0.32
493 0.23
494 0.18
495 0.11
496 0.09
497 0.06
498 0.04
499 0.03
500 0.04
501 0.04
502 0.05
503 0.05
504 0.06
505 0.06
506 0.07
507 0.07
508 0.11
509 0.12
510 0.14
511 0.17
512 0.18
513 0.19
514 0.2
515 0.21
516 0.17
517 0.18
518 0.15
519 0.12
520 0.11
521 0.09
522 0.08
523 0.07
524 0.07
525 0.06
526 0.06
527 0.07
528 0.11
529 0.13
530 0.15
531 0.16
532 0.16
533 0.17
534 0.18
535 0.19
536 0.14
537 0.14
538 0.12
539 0.14
540 0.16
541 0.16
542 0.14