FuNGI

C6HD39

Protein Details

Accession

C6HD39

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
97-120	SAGNRRGHDRRPRHPEDRPKSKHA	Basic
377-402	ATPKLYWPEFKRKYRKEPEMKDNKLS	Hydrophilic
490-511	EEQAARDKRRAEREKREKAFAE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
94-118	RRDSAGNRRGHDRRPRHPEDRPKSK
496-507	DKRRAEREKREK

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 5, mito 1, pero 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002713 FF_domain IPR036517 FF_domain_sf IPR045148 TCRG1-like IPR001202 WW_dom IPR036020 WW_dom_sf
Gene Ontology	GO:0070063 F:RNA polymerase binding GO:0003712 F:transcription coregulator activity
Pfam	View protein in Pfam PF01846 FF PF00397 WW
PROSITE	View protein in PROSITE PS01159 WW_DOMAIN_1 PS50020 WW_DOMAIN_2
CDD	cd00201 WW

Amino Acid Sequences

MLKSTYSALNPLPPGWTEHKAPSGHSYYYNAQTKQSTYKRPAPLPPDSPPTGAPAQPPFGFPAAFTGVPIPAFAHQSHYGPIPFNIAGHFDKSRRDSAGNRRGHDRRPRHPEDRPKSKHAIPGCHPWLLVKTKLGRRFVHNPDTNDSFWKFPPDVLKGVVEYDRLERERTERRERGELSGEEQPEAGIPGSVSQEREQLPSIGRNKPREEEDSDEYEEVEVTDEEGEEGTIPYKRERTDKEASETGPIEFNEGDIEYQLAAMGEEYGLDPGEYGEPGEEGWEDGAEGLPLTEEDSVALFRDLLDDFRINPYMPWEKLIEEGKIIDDSRYTIMPNMRSRREAWTDWSRDRIQELKERREKEEKKDPRIRFLAFLQEYATPKLYWPEFKRKYRKEPEMKDNKLSDKDREKLYRDHVSRLKLSESTRKSDLSTLLKSIPIHELNRSSTPDTLPASILADLRYISLPPNVRDSLIQAYILTLSPAPEPDNISAEEQAARDKRRAEREKREKAFAERELLVQEQKRKQRGALMHGRDMLRQGEAELEMAMRVGKEGLKSHLEPKMATQVHSDDNDG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.3
3	0.33
4	0.31
5	0.35
6	0.41
7	0.39
8	0.41
9	0.43
10	0.42
11	0.4
12	0.39
13	0.39
14	0.38
15	0.46
16	0.51
17	0.44
18	0.43
19	0.44
20	0.45
21	0.5
22	0.53
23	0.54
24	0.54
25	0.62
26	0.67
27	0.7
28	0.74
29	0.71
30	0.72
31	0.68
32	0.66
33	0.65
34	0.59
35	0.55
36	0.47
37	0.45
38	0.4
39	0.35
40	0.34
41	0.3
42	0.33
43	0.31
44	0.32
45	0.29
46	0.27
47	0.26
48	0.21
49	0.21
50	0.2
51	0.19
52	0.19
53	0.17
54	0.16
55	0.16
56	0.17
57	0.13
58	0.11
59	0.14
60	0.14
61	0.18
62	0.19
63	0.21
64	0.22
65	0.24
66	0.24
67	0.23
68	0.23
69	0.22
70	0.2
71	0.19
72	0.18
73	0.19
74	0.19
75	0.21
76	0.24
77	0.21
78	0.28
79	0.32
80	0.35
81	0.34
82	0.36
83	0.41
84	0.48
85	0.56
86	0.57
87	0.55
88	0.61
89	0.63
90	0.68
91	0.7
92	0.68
93	0.69
94	0.72
95	0.78
96	0.77
97	0.82
98	0.84
99	0.84
100	0.86
101	0.83
102	0.8
103	0.77
104	0.74
105	0.71
106	0.66
107	0.64
108	0.58
109	0.61
110	0.57
111	0.52
112	0.47
113	0.41
114	0.41
115	0.36
116	0.34
117	0.29
118	0.34
119	0.4
120	0.47
121	0.53
122	0.5
123	0.53
124	0.6
125	0.62
126	0.64
127	0.63
128	0.6
129	0.58
130	0.6
131	0.53
132	0.48
133	0.42
134	0.34
135	0.28
136	0.3
137	0.25
138	0.23
139	0.28
140	0.27
141	0.28
142	0.27
143	0.27
144	0.22
145	0.24
146	0.22
147	0.17
148	0.15
149	0.15
150	0.19
151	0.19
152	0.2
153	0.19
154	0.24
155	0.33
156	0.39
157	0.47
158	0.47
159	0.5
160	0.57
161	0.57
162	0.56
163	0.53
164	0.46
165	0.39
166	0.4
167	0.36
168	0.28
169	0.26
170	0.21
171	0.15
172	0.15
173	0.11
174	0.05
175	0.05
176	0.06
177	0.08
178	0.09
179	0.11
180	0.11
181	0.15
182	0.16
183	0.18
184	0.18
185	0.17
186	0.18
187	0.24
188	0.28
189	0.31
190	0.36
191	0.4
192	0.42
193	0.44
194	0.46
195	0.44
196	0.43
197	0.41
198	0.4
199	0.39
200	0.37
201	0.34
202	0.3
203	0.25
204	0.2
205	0.14
206	0.11
207	0.06
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.04
215	0.04
216	0.05
217	0.07
218	0.08
219	0.1
220	0.13
221	0.15
222	0.21
223	0.25
224	0.32
225	0.37
226	0.4
227	0.43
228	0.43
229	0.42
230	0.39
231	0.35
232	0.28
233	0.23
234	0.19
235	0.16
236	0.12
237	0.12
238	0.09
239	0.09
240	0.08
241	0.06
242	0.06
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.03
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.03
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.03
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.02
275	0.02
276	0.02
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.04
282	0.04
283	0.05
284	0.05
285	0.04
286	0.04
287	0.05
288	0.05
289	0.06
290	0.07
291	0.07
292	0.08
293	0.1
294	0.11
295	0.1
296	0.1
297	0.14
298	0.17
299	0.16
300	0.17
301	0.17
302	0.16
303	0.2
304	0.21
305	0.17
306	0.13
307	0.13
308	0.12
309	0.12
310	0.12
311	0.09
312	0.07
313	0.08
314	0.09
315	0.09
316	0.09
317	0.11
318	0.13
319	0.19
320	0.26
321	0.31
322	0.32
323	0.34
324	0.36
325	0.39
326	0.41
327	0.37
328	0.37
329	0.4
330	0.43
331	0.43
332	0.47
333	0.41
334	0.37
335	0.38
336	0.36
337	0.3
338	0.33
339	0.39
340	0.43
341	0.5
342	0.52
343	0.55
344	0.61
345	0.62
346	0.62
347	0.66
348	0.65
349	0.68
350	0.75
351	0.71
352	0.68
353	0.68
354	0.61
355	0.53
356	0.46
357	0.45
358	0.36
359	0.35
360	0.28
361	0.26
362	0.27
363	0.25
364	0.25
365	0.15
366	0.15
367	0.19
368	0.19
369	0.24
370	0.28
371	0.38
372	0.45
373	0.55
374	0.66
375	0.7
376	0.79
377	0.81
378	0.86
379	0.85
380	0.85
381	0.87
382	0.87
383	0.83
384	0.79
385	0.74
386	0.68
387	0.65
388	0.59
389	0.56
390	0.53
391	0.53
392	0.54
393	0.55
394	0.54
395	0.52
396	0.56
397	0.58
398	0.53
399	0.56
400	0.54
401	0.53
402	0.52
403	0.48
404	0.44
405	0.38
406	0.4
407	0.41
408	0.4
409	0.4
410	0.39
411	0.38
412	0.37
413	0.36
414	0.39
415	0.35
416	0.33
417	0.31
418	0.29
419	0.31
420	0.3
421	0.28
422	0.28
423	0.26
424	0.26
425	0.27
426	0.29
427	0.3
428	0.34
429	0.36
430	0.31
431	0.29
432	0.29
433	0.29
434	0.27
435	0.25
436	0.21
437	0.18
438	0.18
439	0.17
440	0.17
441	0.13
442	0.12
443	0.1
444	0.11
445	0.11
446	0.1
447	0.1
448	0.15
449	0.18
450	0.19
451	0.25
452	0.25
453	0.25
454	0.25
455	0.27
456	0.27
457	0.24
458	0.23
459	0.16
460	0.16
461	0.16
462	0.16
463	0.13
464	0.08
465	0.08
466	0.09
467	0.1
468	0.11
469	0.12
470	0.15
471	0.16
472	0.19
473	0.19
474	0.21
475	0.2
476	0.2
477	0.2
478	0.17
479	0.22
480	0.25
481	0.27
482	0.28
483	0.34
484	0.41
485	0.5
486	0.6
487	0.63
488	0.69
489	0.78
490	0.85
491	0.84
492	0.84
493	0.78
494	0.76
495	0.74
496	0.67
497	0.62
498	0.52
499	0.48
500	0.43
501	0.4
502	0.38
503	0.35
504	0.39
505	0.42
506	0.49
507	0.55
508	0.55
509	0.55
510	0.58
511	0.59
512	0.6
513	0.62
514	0.6
515	0.59
516	0.62
517	0.61
518	0.53
519	0.49
520	0.41
521	0.31
522	0.25
523	0.19
524	0.16
525	0.16
526	0.15
527	0.12
528	0.11
529	0.09
530	0.09
531	0.1
532	0.07
533	0.07
534	0.08
535	0.09
536	0.13
537	0.16
538	0.2
539	0.26
540	0.29
541	0.35
542	0.39
543	0.39
544	0.36
545	0.38
546	0.44
547	0.39
548	0.38
549	0.36
550	0.34
551	0.38

C6HD39

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer