Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HJS8

Protein Details
Accession C6HJS8    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
511-537PTANPTAKSKSKPKPRTPPLPPPNKDLHydrophilic
643-662SGHGHGRGRRGKRIYCCRACBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
204-224AAKPARASVSGPPRRGRKPKD
519-526SKSKPKPR
591-600GGEARRKRLR
644-654GHGHGRGRRGK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036609  LCCL_sf  
IPR013951  Rxt3  
Gene Ontology GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08642  Rxt3  
Amino Acid Sequences MQQQQARFGPHLETGTGGAPAANEFGGLQSYAKSHESQLSGPRSTPGSHLQHHQQRPEPLQHNDSVGGSNLGKFQQPSRIFSPTPGSSSQRPFGGMGEDQKRKDSDEPFQHRSLLNINAENKREGRSSPLPQAVQGAQAQIIGPAEEAGIKSELGRVFSGIGSGVGVSTAGHPGSGPPTPMTSSPFKRDAIVARSTGGEMKEPAAKPARASVSGPPRRGRKPKDDDAKGEGESSVGPWGGGTTRGRRPRHVHHHHHHGHQHKLDDEAPGSIAVQNTIPPTGVANFQRSPILPESGVVSSPNVGPHHHHHHHHHHHHHVPRPTNGGVPPSTSTPAAPIREYSTVVNLQPLLRSVAHRPRYHLGSTLYAPKIGIPTSRASPESSKFGYVSTPVPIPRFEGKENCTYTIRVPRFRIDASHREEICARRALWGTGVYTDDSDPVAAAIHSGFIRGEWGEDVDVSLLDLEIKEEHQHAPNGKNGTTSTFHKVSSLDESPTKGPTTATPKPVDEVEPTANPTAKSKSKPKPRTPPLPPPNKDLHITLLILPTLERYDSTVMYGLKSRAWGDNHDGMSFKVERIDWVDEGGSKGEERGGEARRKRLRNMMRSGRICTPDGLKGRGGVELRNGTKVGGVGHGRGSGSGSGSGHGHGRGRRGKRIYCCRACVVTREVWCWVICSIPLFL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.2
3 0.19
4 0.15
5 0.11
6 0.1
7 0.1
8 0.1
9 0.08
10 0.07
11 0.07
12 0.07
13 0.08
14 0.08
15 0.08
16 0.08
17 0.1
18 0.13
19 0.15
20 0.16
21 0.18
22 0.23
23 0.26
24 0.28
25 0.36
26 0.4
27 0.39
28 0.39
29 0.38
30 0.35
31 0.34
32 0.34
33 0.34
34 0.34
35 0.36
36 0.42
37 0.49
38 0.57
39 0.62
40 0.65
41 0.63
42 0.64
43 0.67
44 0.71
45 0.68
46 0.65
47 0.63
48 0.57
49 0.53
50 0.46
51 0.41
52 0.32
53 0.26
54 0.22
55 0.18
56 0.17
57 0.17
58 0.16
59 0.17
60 0.18
61 0.19
62 0.27
63 0.29
64 0.34
65 0.36
66 0.41
67 0.4
68 0.41
69 0.47
70 0.39
71 0.4
72 0.38
73 0.39
74 0.39
75 0.44
76 0.44
77 0.38
78 0.37
79 0.34
80 0.31
81 0.3
82 0.26
83 0.29
84 0.34
85 0.39
86 0.38
87 0.41
88 0.41
89 0.41
90 0.44
91 0.41
92 0.42
93 0.47
94 0.55
95 0.57
96 0.57
97 0.57
98 0.51
99 0.48
100 0.42
101 0.38
102 0.33
103 0.33
104 0.38
105 0.4
106 0.42
107 0.43
108 0.4
109 0.37
110 0.34
111 0.3
112 0.32
113 0.34
114 0.37
115 0.42
116 0.47
117 0.44
118 0.43
119 0.46
120 0.38
121 0.34
122 0.29
123 0.22
124 0.15
125 0.15
126 0.15
127 0.11
128 0.11
129 0.08
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.12
140 0.13
141 0.14
142 0.14
143 0.13
144 0.13
145 0.13
146 0.13
147 0.09
148 0.08
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.1
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.13
166 0.14
167 0.16
168 0.19
169 0.24
170 0.27
171 0.31
172 0.34
173 0.33
174 0.33
175 0.35
176 0.36
177 0.34
178 0.33
179 0.28
180 0.25
181 0.25
182 0.24
183 0.24
184 0.18
185 0.15
186 0.12
187 0.13
188 0.18
189 0.18
190 0.22
191 0.25
192 0.25
193 0.24
194 0.3
195 0.31
196 0.26
197 0.28
198 0.31
199 0.36
200 0.42
201 0.46
202 0.46
203 0.5
204 0.57
205 0.65
206 0.65
207 0.65
208 0.68
209 0.73
210 0.78
211 0.77
212 0.73
213 0.68
214 0.64
215 0.53
216 0.45
217 0.35
218 0.25
219 0.19
220 0.14
221 0.1
222 0.07
223 0.06
224 0.05
225 0.06
226 0.06
227 0.09
228 0.11
229 0.16
230 0.23
231 0.32
232 0.35
233 0.41
234 0.48
235 0.55
236 0.64
237 0.69
238 0.71
239 0.7
240 0.79
241 0.78
242 0.78
243 0.75
244 0.7
245 0.67
246 0.6
247 0.54
248 0.44
249 0.41
250 0.35
251 0.3
252 0.24
253 0.17
254 0.14
255 0.11
256 0.11
257 0.1
258 0.08
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.06
266 0.07
267 0.08
268 0.11
269 0.12
270 0.16
271 0.16
272 0.17
273 0.18
274 0.18
275 0.21
276 0.19
277 0.19
278 0.14
279 0.14
280 0.15
281 0.14
282 0.14
283 0.11
284 0.09
285 0.08
286 0.09
287 0.11
288 0.1
289 0.1
290 0.13
291 0.18
292 0.27
293 0.3
294 0.34
295 0.38
296 0.48
297 0.57
298 0.63
299 0.65
300 0.63
301 0.66
302 0.68
303 0.68
304 0.64
305 0.58
306 0.51
307 0.49
308 0.42
309 0.37
310 0.32
311 0.28
312 0.22
313 0.19
314 0.18
315 0.15
316 0.16
317 0.13
318 0.12
319 0.13
320 0.16
321 0.16
322 0.15
323 0.14
324 0.16
325 0.17
326 0.18
327 0.15
328 0.14
329 0.14
330 0.14
331 0.14
332 0.12
333 0.11
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.09
338 0.11
339 0.15
340 0.23
341 0.31
342 0.31
343 0.34
344 0.36
345 0.39
346 0.38
347 0.36
348 0.29
349 0.24
350 0.25
351 0.28
352 0.24
353 0.21
354 0.2
355 0.17
356 0.16
357 0.14
358 0.14
359 0.09
360 0.11
361 0.13
362 0.15
363 0.15
364 0.16
365 0.19
366 0.2
367 0.23
368 0.21
369 0.21
370 0.19
371 0.18
372 0.17
373 0.16
374 0.15
375 0.12
376 0.13
377 0.13
378 0.14
379 0.14
380 0.17
381 0.2
382 0.22
383 0.23
384 0.26
385 0.28
386 0.34
387 0.36
388 0.35
389 0.32
390 0.29
391 0.31
392 0.35
393 0.36
394 0.34
395 0.35
396 0.35
397 0.37
398 0.36
399 0.38
400 0.35
401 0.39
402 0.4
403 0.45
404 0.42
405 0.4
406 0.43
407 0.4
408 0.38
409 0.33
410 0.27
411 0.23
412 0.24
413 0.23
414 0.21
415 0.21
416 0.17
417 0.15
418 0.15
419 0.12
420 0.12
421 0.11
422 0.1
423 0.08
424 0.08
425 0.06
426 0.05
427 0.05
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.05
432 0.05
433 0.06
434 0.05
435 0.05
436 0.06
437 0.06
438 0.07
439 0.06
440 0.07
441 0.06
442 0.06
443 0.07
444 0.06
445 0.06
446 0.05
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.05
454 0.07
455 0.08
456 0.11
457 0.14
458 0.18
459 0.21
460 0.23
461 0.27
462 0.29
463 0.28
464 0.27
465 0.25
466 0.26
467 0.25
468 0.26
469 0.28
470 0.27
471 0.26
472 0.26
473 0.26
474 0.24
475 0.27
476 0.25
477 0.22
478 0.21
479 0.24
480 0.24
481 0.26
482 0.24
483 0.18
484 0.17
485 0.2
486 0.27
487 0.3
488 0.35
489 0.36
490 0.35
491 0.37
492 0.38
493 0.34
494 0.28
495 0.26
496 0.24
497 0.22
498 0.24
499 0.24
500 0.25
501 0.23
502 0.23
503 0.25
504 0.28
505 0.33
506 0.41
507 0.49
508 0.59
509 0.69
510 0.76
511 0.81
512 0.85
513 0.89
514 0.88
515 0.89
516 0.88
517 0.89
518 0.81
519 0.76
520 0.74
521 0.66
522 0.59
523 0.5
524 0.44
525 0.35
526 0.34
527 0.29
528 0.23
529 0.2
530 0.18
531 0.16
532 0.13
533 0.11
534 0.1
535 0.08
536 0.09
537 0.12
538 0.12
539 0.13
540 0.16
541 0.16
542 0.17
543 0.2
544 0.19
545 0.17
546 0.19
547 0.2
548 0.22
549 0.24
550 0.27
551 0.3
552 0.36
553 0.36
554 0.35
555 0.33
556 0.28
557 0.31
558 0.27
559 0.21
560 0.17
561 0.16
562 0.17
563 0.21
564 0.25
565 0.2
566 0.2
567 0.21
568 0.19
569 0.2
570 0.19
571 0.15
572 0.11
573 0.12
574 0.12
575 0.11
576 0.14
577 0.19
578 0.24
579 0.33
580 0.38
581 0.47
582 0.55
583 0.59
584 0.62
585 0.66
586 0.7
587 0.7
588 0.76
589 0.77
590 0.78
591 0.77
592 0.77
593 0.73
594 0.67
595 0.59
596 0.51
597 0.44
598 0.42
599 0.42
600 0.4
601 0.34
602 0.33
603 0.32
604 0.34
605 0.31
606 0.25
607 0.28
608 0.33
609 0.33
610 0.33
611 0.33
612 0.28
613 0.28
614 0.27
615 0.21
616 0.19
617 0.2
618 0.18
619 0.2
620 0.22
621 0.21
622 0.2
623 0.21
624 0.16
625 0.15
626 0.16
627 0.15
628 0.14
629 0.15
630 0.16
631 0.16
632 0.18
633 0.22
634 0.22
635 0.31
636 0.39
637 0.45
638 0.53
639 0.59
640 0.65
641 0.7
642 0.79
643 0.81
644 0.8
645 0.79
646 0.76
647 0.75
648 0.69
649 0.64
650 0.59
651 0.55
652 0.5
653 0.48
654 0.44
655 0.4
656 0.37
657 0.33
658 0.28
659 0.22
660 0.19