FuNGI

C6HEN3

Protein Details

Accession

C6HEN3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1142-1165	YNALNDIKKRFRDKKINWERQHGL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 11, mito 3, cyto 1.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MATPRTPRSGVDFNLLIFNLNATYNLDLPNPPVSTPRQRPIEGRTLPERCVGLAKFLYYDDPVNFQRVIDSFSEWAMAFFSGWVQKPKQEPEVLPSSRSFIRSNTISMARNITPEQRARVLDELWKVLSDEEYIVTRGASRIPRGASVSSPAGARSGPGCDSGAAATTTGDPMAGSGTKSNGAPKVPPTTPAKMPPSPTKRKEVVDHSEVFSTAPSTPSNPLHMMSSSSSDDEFENSDLDDLDINLDIPSLGLADSSDNNQGPKAPKQRRIDEYMTTSKNVRKSVSSPSGKPLSNENTSFQTVTTEQSNSFGASFGASTPATSFSRSFETGQFDLNEASTCSSTARPPPDAKFSGLWGNANTTNRRKLPEYEDFWKSLHNGKQERLEKTAPEPWDMAVDQYKDRKLTGDVVTLSCELTWCSQKEPGYFKLTLKPLKLMRGYRFCRRFGSDRFLELTYPILTEPPAHLVRKGNAVEKEILIDAISRWMATSEHHLVGRVWKVLYLEDIQNKQKKAKKYDSGEIRAGGSAIETPHKQKAYFFATDGIDFRKARDPLEIPPQGETSGQRTSMSIDALIDWHMPRAKNSHQSDMKLFQRLHLGLSRTLATVILRREEIIYVKDPPGTVMNDGCALMSKSLGMAVASALGLDGHPAIFQARISGAKGVWMVDLDDSRFKTGDRGFWLQITQSQLKIYPAPPHDTKPMDDTQLTFEVVQWSRPLSPASLNMQLLNILQHGGIRNDHIRNLIRQEMSSFYDEFLRTLLCSSGVECRSWLQKMKWITNESSKRQSKRTDNFFPPQYAEQAIMLLDAGFLPLKLPYLTKIFRRLLQDYLDNLKKLKITVSQSTFAYCVADPFGVLRPDEVHLGFSREWEHGSASTELHDIDVLLARLPAHLATDIQKRRSVYKNELRHMKDVIVFPTTGDTPLASLLSGGDYDGDQCWVCWDPIIVREFKSTEFDPGTVPSAESLGLRSCSTLMSKIGSTEEFLTNAFRFNVKPSKLGQCTIERETYCYHENNITSPMAVKLAWLLSYLVDSKKAGLELTDDAWEYLKPKYSKVITEKQPLVPAYKSLSRGFKPLVWNSCNIIDYLLFDVIVAESDQMLVRFDKFCSEHCELPLDHDLLSEWGKVEKRGIKEKDEMNPVLYNALNDIKKRFRDKKINWERQHGLNSETPYSRKILEAAQSLQELTPPNFDHPLSHTWANSTYEWKRLRALCAYKDCRSDFVWYAVGPVLCEIKAKAMGQCRIVLPNIHKVLHVNRNVAKRVAEDVMRRNAGELSGDEGGGEDDYDDDDEFFDIDPFSFPEDLERDIDDTESHNSFP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.35
3	0.28
4	0.21
5	0.19
6	0.14
7	0.13
8	0.13
9	0.11
10	0.13
11	0.13
12	0.15
13	0.16
14	0.16
15	0.18
16	0.23
17	0.23
18	0.21
19	0.24
20	0.3
21	0.39
22	0.46
23	0.53
24	0.54
25	0.56
26	0.61
27	0.64
28	0.67
29	0.61
30	0.59
31	0.6
32	0.56
33	0.55
34	0.54
35	0.47
36	0.38
37	0.4
38	0.34
39	0.31
40	0.29
41	0.28
42	0.25
43	0.25
44	0.26
45	0.22
46	0.25
47	0.19
48	0.23
49	0.24
50	0.26
51	0.26
52	0.23
53	0.25
54	0.22
55	0.24
56	0.2
57	0.22
58	0.19
59	0.19
60	0.21
61	0.17
62	0.16
63	0.14
64	0.12
65	0.09
66	0.09
67	0.11
68	0.15
69	0.18
70	0.24
71	0.25
72	0.3
73	0.37
74	0.43
75	0.47
76	0.49
77	0.47
78	0.48
79	0.56
80	0.52
81	0.48
82	0.43
83	0.4
84	0.37
85	0.38
86	0.33
87	0.25
88	0.31
89	0.3
90	0.32
91	0.34
92	0.36
93	0.35
94	0.36
95	0.39
96	0.33
97	0.34
98	0.34
99	0.34
100	0.35
101	0.37
102	0.4
103	0.39
104	0.4
105	0.4
106	0.41
107	0.37
108	0.36
109	0.36
110	0.33
111	0.29
112	0.27
113	0.24
114	0.21
115	0.2
116	0.15
117	0.13
118	0.12
119	0.13
120	0.13
121	0.13
122	0.12
123	0.12
124	0.12
125	0.16
126	0.19
127	0.21
128	0.25
129	0.26
130	0.29
131	0.32
132	0.33
133	0.29
134	0.29
135	0.28
136	0.24
137	0.23
138	0.2
139	0.18
140	0.16
141	0.16
142	0.12
143	0.13
144	0.13
145	0.14
146	0.15
147	0.14
148	0.15
149	0.14
150	0.14
151	0.12
152	0.11
153	0.09
154	0.09
155	0.1
156	0.08
157	0.08
158	0.06
159	0.06
160	0.08
161	0.08
162	0.08
163	0.09
164	0.11
165	0.13
166	0.14
167	0.18
168	0.2
169	0.21
170	0.23
171	0.26
172	0.32
173	0.31
174	0.36
175	0.38
176	0.4
177	0.43
178	0.49
179	0.51
180	0.48
181	0.53
182	0.58
183	0.62
184	0.67
185	0.67
186	0.67
187	0.66
188	0.67
189	0.69
190	0.67
191	0.65
192	0.61
193	0.59
194	0.53
195	0.48
196	0.43
197	0.35
198	0.27
199	0.2
200	0.14
201	0.13
202	0.12
203	0.13
204	0.18
205	0.2
206	0.24
207	0.23
208	0.23
209	0.24
210	0.23
211	0.24
212	0.2
213	0.22
214	0.19
215	0.19
216	0.18
217	0.17
218	0.17
219	0.15
220	0.16
221	0.12
222	0.11
223	0.1
224	0.11
225	0.1
226	0.1
227	0.09
228	0.07
229	0.07
230	0.07
231	0.07
232	0.06
233	0.06
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.04
238	0.04
239	0.03
240	0.04
241	0.06
242	0.07
243	0.09
244	0.13
245	0.14
246	0.14
247	0.15
248	0.19
249	0.22
250	0.3
251	0.39
252	0.44
253	0.52
254	0.6
255	0.68
256	0.7
257	0.73
258	0.69
259	0.64
260	0.62
261	0.62
262	0.56
263	0.49
264	0.47
265	0.43
266	0.44
267	0.41
268	0.36
269	0.32
270	0.33
271	0.41
272	0.47
273	0.49
274	0.45
275	0.49
276	0.53
277	0.5
278	0.48
279	0.45
280	0.42
281	0.41
282	0.41
283	0.37
284	0.35
285	0.36
286	0.35
287	0.28
288	0.24
289	0.2
290	0.2
291	0.2
292	0.17
293	0.15
294	0.17
295	0.17
296	0.15
297	0.14
298	0.12
299	0.09
300	0.08
301	0.08
302	0.07
303	0.09
304	0.08
305	0.08
306	0.09
307	0.13
308	0.13
309	0.15
310	0.15
311	0.14
312	0.19
313	0.21
314	0.23
315	0.22
316	0.27
317	0.26
318	0.28
319	0.26
320	0.22
321	0.21
322	0.19
323	0.16
324	0.11
325	0.12
326	0.09
327	0.09
328	0.1
329	0.11
330	0.13
331	0.19
332	0.23
333	0.26
334	0.3
335	0.34
336	0.4
337	0.41
338	0.41
339	0.35
340	0.33
341	0.34
342	0.31
343	0.29
344	0.22
345	0.23
346	0.25
347	0.27
348	0.31
349	0.3
350	0.36
351	0.37
352	0.4
353	0.4
354	0.41
355	0.45
356	0.48
357	0.5
358	0.49
359	0.49
360	0.47
361	0.44
362	0.41
363	0.35
364	0.33
365	0.31
366	0.33
367	0.34
368	0.35
369	0.45
370	0.5
371	0.51
372	0.49
373	0.46
374	0.4
375	0.41
376	0.44
377	0.36
378	0.31
379	0.28
380	0.23
381	0.24
382	0.22
383	0.2
384	0.17
385	0.18
386	0.19
387	0.22
388	0.25
389	0.22
390	0.23
391	0.22
392	0.21
393	0.25
394	0.24
395	0.24
396	0.24
397	0.24
398	0.25
399	0.24
400	0.22
401	0.15
402	0.13
403	0.09
404	0.1
405	0.14
406	0.13
407	0.15
408	0.2
409	0.22
410	0.27
411	0.31
412	0.33
413	0.34
414	0.35
415	0.34
416	0.37
417	0.41
418	0.41
419	0.37
420	0.39
421	0.36
422	0.4
423	0.45
424	0.43
425	0.45
426	0.5
427	0.54
428	0.58
429	0.6
430	0.56
431	0.55
432	0.54
433	0.53
434	0.49
435	0.52
436	0.44
437	0.42
438	0.43
439	0.39
440	0.33
441	0.27
442	0.23
443	0.15
444	0.13
445	0.11
446	0.08
447	0.08
448	0.08
449	0.09
450	0.12
451	0.15
452	0.15
453	0.18
454	0.2
455	0.22
456	0.28
457	0.29
458	0.29
459	0.27
460	0.3
461	0.29
462	0.25
463	0.25
464	0.18
465	0.16
466	0.11
467	0.09
468	0.07
469	0.08
470	0.07
471	0.06
472	0.06
473	0.06
474	0.07
475	0.07
476	0.13
477	0.15
478	0.17
479	0.17
480	0.18
481	0.17
482	0.22
483	0.23
484	0.19
485	0.15
486	0.14
487	0.15
488	0.14
489	0.16
490	0.14
491	0.15
492	0.18
493	0.22
494	0.27
495	0.32
496	0.33
497	0.38
498	0.41
499	0.45
500	0.5
501	0.56
502	0.58
503	0.59
504	0.67
505	0.69
506	0.68
507	0.62
508	0.54
509	0.45
510	0.36
511	0.3
512	0.21
513	0.13
514	0.08
515	0.07
516	0.09
517	0.09
518	0.12
519	0.16
520	0.17
521	0.17
522	0.17
523	0.23
524	0.26
525	0.26
526	0.24
527	0.23
528	0.23
529	0.23
530	0.24
531	0.2
532	0.18
533	0.17
534	0.18
535	0.22
536	0.22
537	0.22
538	0.25
539	0.25
540	0.24
541	0.33
542	0.34
543	0.28
544	0.28
545	0.28
546	0.24
547	0.23
548	0.21
549	0.16
550	0.15
551	0.15
552	0.13
553	0.13
554	0.14
555	0.15
556	0.14
557	0.1
558	0.08
559	0.08
560	0.08
561	0.08
562	0.07
563	0.06
564	0.08
565	0.1
566	0.1
567	0.11
568	0.16
569	0.2
570	0.29
571	0.31
572	0.38
573	0.39
574	0.41
575	0.43
576	0.45
577	0.42
578	0.39
579	0.36
580	0.29
581	0.3
582	0.28
583	0.27
584	0.24
585	0.24
586	0.18
587	0.2
588	0.19
589	0.14
590	0.14
591	0.12
592	0.09
593	0.11
594	0.11
595	0.11
596	0.1
597	0.11
598	0.11
599	0.11
600	0.12
601	0.11
602	0.12
603	0.13
604	0.14
605	0.14
606	0.13
607	0.13
608	0.14
609	0.13
610	0.12
611	0.1
612	0.1
613	0.1
614	0.1
615	0.09
616	0.07
617	0.07
618	0.06
619	0.05
620	0.05
621	0.04
622	0.04
623	0.04
624	0.03
625	0.03
626	0.03
627	0.03
628	0.03
629	0.03
630	0.03
631	0.03
632	0.03
633	0.03
634	0.03
635	0.02
636	0.03
637	0.03
638	0.03
639	0.04
640	0.04
641	0.04
642	0.05
643	0.06
644	0.06
645	0.07
646	0.07
647	0.08
648	0.08
649	0.08
650	0.07
651	0.06
652	0.06
653	0.06
654	0.07
655	0.06
656	0.08
657	0.08
658	0.09
659	0.09
660	0.09
661	0.13
662	0.14
663	0.17
664	0.19
665	0.22
666	0.22
667	0.23
668	0.23
669	0.19
670	0.2
671	0.21
672	0.17
673	0.14
674	0.14
675	0.14
676	0.15
677	0.17
678	0.16
679	0.17
680	0.18
681	0.23
682	0.24
683	0.26
684	0.3
685	0.29
686	0.29
687	0.27
688	0.27
689	0.24
690	0.22
691	0.2
692	0.19
693	0.19
694	0.18
695	0.13
696	0.12
697	0.15
698	0.15
699	0.15
700	0.12
701	0.12
702	0.12
703	0.13
704	0.13
705	0.09
706	0.1
707	0.13
708	0.16
709	0.19
710	0.18
711	0.17
712	0.17
713	0.16
714	0.15
715	0.12
716	0.09
717	0.05
718	0.05
719	0.06
720	0.07
721	0.07
722	0.08
723	0.09
724	0.13
725	0.14
726	0.15
727	0.18
728	0.18
729	0.19
730	0.22
731	0.25
732	0.21
733	0.2
734	0.2
735	0.19
736	0.2
737	0.2
738	0.17
739	0.13
740	0.16
741	0.16
742	0.14
743	0.12
744	0.1
745	0.08
746	0.09
747	0.08
748	0.06
749	0.06
750	0.06
751	0.13
752	0.13
753	0.14
754	0.13
755	0.15
756	0.17
757	0.2
758	0.23
759	0.18
760	0.23
761	0.28
762	0.33
763	0.37
764	0.37
765	0.37
766	0.43
767	0.49
768	0.48
769	0.53
770	0.55
771	0.52
772	0.55
773	0.6
774	0.6
775	0.62
776	0.66
777	0.65
778	0.65
779	0.67
780	0.64
781	0.58
782	0.51
783	0.43
784	0.36
785	0.27
786	0.22
787	0.15
788	0.13
789	0.11
790	0.08
791	0.07
792	0.05
793	0.04
794	0.03
795	0.03
796	0.03
797	0.03
798	0.03
799	0.03
800	0.04
801	0.05
802	0.05
803	0.07
804	0.13
805	0.16
806	0.19
807	0.27
808	0.28
809	0.32
810	0.37
811	0.38
812	0.35
813	0.35
814	0.35
815	0.3
816	0.35
817	0.33
818	0.28
819	0.26
820	0.25
821	0.23
822	0.21
823	0.2
824	0.19
825	0.21
826	0.28
827	0.32
828	0.33
829	0.32
830	0.33
831	0.3
832	0.24
833	0.21
834	0.14
835	0.1
836	0.09
837	0.09
838	0.07
839	0.08
840	0.12
841	0.11
842	0.11
843	0.11
844	0.11
845	0.12
846	0.14
847	0.13
848	0.11
849	0.11
850	0.15
851	0.14
852	0.14
853	0.15
854	0.14
855	0.14
856	0.13
857	0.14
858	0.11
859	0.14
860	0.14
861	0.12
862	0.13
863	0.12
864	0.12
865	0.1
866	0.09
867	0.06
868	0.06
869	0.07
870	0.06
871	0.06
872	0.07
873	0.06
874	0.07
875	0.07
876	0.06
877	0.05
878	0.06
879	0.07
880	0.11
881	0.2
882	0.24
883	0.26
884	0.3
885	0.3
886	0.36
887	0.43
888	0.45
889	0.46
890	0.52
891	0.59
892	0.63
893	0.71
894	0.68
895	0.63
896	0.58
897	0.49
898	0.44
899	0.37
900	0.32
901	0.25
902	0.21
903	0.18
904	0.19
905	0.17
906	0.13
907	0.11
908	0.09
909	0.07
910	0.08
911	0.08
912	0.06
913	0.05
914	0.05
915	0.05
916	0.05
917	0.05
918	0.04
919	0.04
920	0.05
921	0.06
922	0.07
923	0.06
924	0.06
925	0.08
926	0.09
927	0.09
928	0.09
929	0.09
930	0.09
931	0.14
932	0.17
933	0.17
934	0.17
935	0.2
936	0.2
937	0.21
938	0.24
939	0.2
940	0.22
941	0.22
942	0.21
943	0.19
944	0.2
945	0.22
946	0.17
947	0.17
948	0.12
949	0.11
950	0.11
951	0.1
952	0.1
953	0.09
954	0.1
955	0.1
956	0.1
957	0.1
958	0.11
959	0.12
960	0.13
961	0.12
962	0.13
963	0.13
964	0.14
965	0.15
966	0.14
967	0.15
968	0.15
969	0.15
970	0.13
971	0.14
972	0.16
973	0.14
974	0.15
975	0.15
976	0.13
977	0.13
978	0.18
979	0.27
980	0.25
981	0.28
982	0.31
983	0.4
984	0.41
985	0.43
986	0.41
987	0.39
988	0.43
989	0.44
990	0.46
991	0.36
992	0.36
993	0.36
994	0.36
995	0.32
996	0.28
997	0.27
998	0.25
999	0.26
1000	0.25
1001	0.26
1002	0.22
1003	0.19
1004	0.18
1005	0.17
1006	0.13
1007	0.12
1008	0.1
1009	0.09
1010	0.09
1011	0.09
1012	0.09
1013	0.09
1014	0.08
1015	0.1
1016	0.12
1017	0.11
1018	0.12
1019	0.12
1020	0.12
1021	0.13
1022	0.14
1023	0.12
1024	0.1
1025	0.12
1026	0.12
1027	0.14
1028	0.14
1029	0.13
1030	0.12
1031	0.13
1032	0.13
1033	0.12
1034	0.12
1035	0.19
1036	0.18
1037	0.19
1038	0.27
1039	0.3
1040	0.37
1041	0.44
1042	0.51
1043	0.52
1044	0.6
1045	0.63
1046	0.58
1047	0.6
1048	0.53
1049	0.49
1050	0.4
1051	0.35
1052	0.31
1053	0.31
1054	0.32
1055	0.32
1056	0.37
1057	0.35
1058	0.39
1059	0.39
1060	0.39
1061	0.41
1062	0.45
1063	0.49
1064	0.44
1065	0.45
1066	0.43
1067	0.43
1068	0.39
1069	0.32
1070	0.25
1071	0.17
1072	0.16
1073	0.17
1074	0.14
1075	0.1
1076	0.09
1077	0.1
1078	0.08
1079	0.09
1080	0.07
1081	0.05
1082	0.05
1083	0.06
1084	0.07
1085	0.06
1086	0.08
1087	0.08
1088	0.1
1089	0.12
1090	0.12
1091	0.17
1092	0.18
1093	0.21
1094	0.28
1095	0.31
1096	0.32
1097	0.32
1098	0.37
1099	0.31
1100	0.35
1101	0.37
1102	0.3
1103	0.25
1104	0.22
1105	0.21
1106	0.19
1107	0.2
1108	0.15
1109	0.11
1110	0.14
1111	0.16
1112	0.17
1113	0.24
1114	0.27
1115	0.32
1116	0.42
1117	0.46
1118	0.47
1119	0.53
1120	0.58
1121	0.59
1122	0.61
1123	0.55
1124	0.49
1125	0.46
1126	0.4
1127	0.36
1128	0.3
1129	0.22
1130	0.17
1131	0.22
1132	0.22
1133	0.22
1134	0.28
1135	0.33
1136	0.39
1137	0.5
1138	0.56
1139	0.6
1140	0.69
1141	0.75
1142	0.8
1143	0.84
1144	0.88
1145	0.84
1146	0.84
1147	0.79
1148	0.75
1149	0.74
1150	0.64
1151	0.57
1152	0.51
1153	0.48
1154	0.44
1155	0.42
1156	0.36
1157	0.32
1158	0.32
1159	0.29
1160	0.24
1161	0.23
1162	0.23
1163	0.26
1164	0.29
1165	0.3
1166	0.3
1167	0.3
1168	0.3
1169	0.28
1170	0.26
1171	0.23
1172	0.19
1173	0.22
1174	0.21
1175	0.23
1176	0.25
1177	0.26
1178	0.25
1179	0.26
1180	0.3
1181	0.3
1182	0.31
1183	0.28
1184	0.28
1185	0.31
1186	0.33
1187	0.3
1188	0.33
1189	0.31
1190	0.37
1191	0.4
1192	0.39
1193	0.43
1194	0.43
1195	0.47
1196	0.48
1197	0.53
1198	0.53
1199	0.61
1200	0.66
1201	0.64
1202	0.67
1203	0.64
1204	0.57
1205	0.52
1206	0.49
1207	0.41
1208	0.38
1209	0.35
1210	0.28
1211	0.29
1212	0.29
1213	0.26
1214	0.2
1215	0.19
1216	0.17
1217	0.14
1218	0.16
1219	0.14
1220	0.15
1221	0.19
1222	0.2
1223	0.24
1224	0.3
1225	0.35
1226	0.36
1227	0.39
1228	0.37
1229	0.36
1230	0.37
1231	0.38
1232	0.34
1233	0.39
1234	0.41
1235	0.38
1236	0.37
1237	0.38
1238	0.45
1239	0.48
1240	0.49
1241	0.47
1242	0.48
1243	0.55
1244	0.58
1245	0.56
1246	0.5
1247	0.42
1248	0.42
1249	0.39
1250	0.38
1251	0.37
1252	0.41
1253	0.47
1254	0.47
1255	0.45
1256	0.41
1257	0.38
1258	0.33
1259	0.29
1260	0.22
1261	0.18
1262	0.17
1263	0.17
1264	0.15
1265	0.14
1266	0.14
1267	0.12
1268	0.11
1269	0.06
1270	0.05
1271	0.07
1272	0.08
1273	0.08
1274	0.08
1275	0.08
1276	0.08
1277	0.09
1278	0.09
1279	0.09
1280	0.08
1281	0.09
1282	0.1
1283	0.1
1284	0.14
1285	0.13
1286	0.13
1287	0.18
1288	0.2
1289	0.22
1290	0.22
1291	0.23
1292	0.21
1293	0.21
1294	0.22
1295	0.17
1296	0.17
1297	0.2

C6HEN3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer