Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HBN6

Protein Details
Accession C6HBN6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-253RDSFYWWKMGTKKKKRRSCGEHDKEVCKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
237-241KKKKR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 10, cyto_nucl 9, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040351  RAB3IL/RAB3IP/Sec2  
IPR009449  Sec2_N  
Gene Ontology GO:0005085  F:guanyl-nucleotide exchange factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF06428  Sec2p  
Amino Acid Sequences MISTVAKRTTTTAAATDCPNCGYDVFLADDHAHQRISELEAQIRFLNKRAAETADKLADYEDEIRLLRSKASAARTTTTQPTTTIPPTTPTLPPSQTTDHHIHPASPPTPQSRLGTFASLLPYGRRNATTPPPQNRSPSPTSTTRPPTSHSTSSHAPQPSTALQDALTREQTLRKEAESRLTQANSELEELTAQLFSQANEMVAQERKARAKLEERVEFLLSLWWRDSFYWWKMGTKKKKRRSCGEHDKEVCKIGVDLCGYPAVNNAYPMGIGKYVELENGVPDGWGIDIIYTDICK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.3
3 0.28
4 0.25
5 0.24
6 0.22
7 0.19
8 0.16
9 0.16
10 0.13
11 0.14
12 0.15
13 0.14
14 0.15
15 0.15
16 0.18
17 0.18
18 0.18
19 0.16
20 0.14
21 0.15
22 0.15
23 0.18
24 0.2
25 0.2
26 0.24
27 0.24
28 0.26
29 0.27
30 0.29
31 0.26
32 0.24
33 0.29
34 0.24
35 0.27
36 0.27
37 0.3
38 0.3
39 0.33
40 0.35
41 0.31
42 0.31
43 0.28
44 0.26
45 0.21
46 0.19
47 0.18
48 0.13
49 0.12
50 0.12
51 0.13
52 0.15
53 0.15
54 0.14
55 0.12
56 0.15
57 0.18
58 0.23
59 0.27
60 0.27
61 0.29
62 0.31
63 0.34
64 0.36
65 0.34
66 0.29
67 0.26
68 0.25
69 0.28
70 0.28
71 0.26
72 0.21
73 0.22
74 0.24
75 0.26
76 0.25
77 0.23
78 0.25
79 0.25
80 0.26
81 0.27
82 0.28
83 0.26
84 0.3
85 0.31
86 0.28
87 0.31
88 0.3
89 0.27
90 0.26
91 0.3
92 0.25
93 0.23
94 0.24
95 0.23
96 0.26
97 0.28
98 0.27
99 0.23
100 0.26
101 0.25
102 0.24
103 0.2
104 0.19
105 0.17
106 0.16
107 0.15
108 0.12
109 0.13
110 0.13
111 0.14
112 0.14
113 0.13
114 0.17
115 0.24
116 0.32
117 0.38
118 0.45
119 0.49
120 0.5
121 0.53
122 0.51
123 0.51
124 0.46
125 0.41
126 0.38
127 0.37
128 0.38
129 0.4
130 0.44
131 0.41
132 0.38
133 0.38
134 0.4
135 0.41
136 0.42
137 0.37
138 0.35
139 0.34
140 0.35
141 0.37
142 0.32
143 0.26
144 0.22
145 0.23
146 0.19
147 0.2
148 0.18
149 0.13
150 0.12
151 0.14
152 0.16
153 0.15
154 0.14
155 0.12
156 0.12
157 0.16
158 0.16
159 0.17
160 0.17
161 0.16
162 0.2
163 0.21
164 0.27
165 0.26
166 0.28
167 0.29
168 0.28
169 0.27
170 0.24
171 0.24
172 0.18
173 0.17
174 0.14
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.06
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.11
191 0.12
192 0.14
193 0.18
194 0.21
195 0.22
196 0.24
197 0.26
198 0.32
199 0.39
200 0.44
201 0.45
202 0.45
203 0.45
204 0.44
205 0.39
206 0.32
207 0.29
208 0.21
209 0.18
210 0.16
211 0.14
212 0.14
213 0.15
214 0.19
215 0.2
216 0.22
217 0.28
218 0.28
219 0.33
220 0.4
221 0.5
222 0.56
223 0.61
224 0.7
225 0.74
226 0.82
227 0.86
228 0.9
229 0.89
230 0.89
231 0.89
232 0.87
233 0.87
234 0.84
235 0.79
236 0.7
237 0.63
238 0.52
239 0.41
240 0.33
241 0.24
242 0.22
243 0.2
244 0.18
245 0.16
246 0.18
247 0.17
248 0.16
249 0.18
250 0.18
251 0.17
252 0.17
253 0.17
254 0.15
255 0.15
256 0.16
257 0.15
258 0.11
259 0.11
260 0.1
261 0.13
262 0.13
263 0.13
264 0.14
265 0.12
266 0.12
267 0.12
268 0.12
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.06