Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D0A5N4

Protein Details
Accession A0A0D0A5N4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
259-282DGQKWHRGGRGRGRGRGRRNGGERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
262-280KWHRGGRGRGRGRGRRNGG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.833, cyto 11.5, cyto_mito 9.832, nucl 8, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSLLERLNVPIDNGAGAPSIGPVRTKSGSRSSPYTRPNRTPKGDPDAQWSHDLYEDPEKPSLSSRLTLSAAQPRKPDSRLAQRALRDAAGDSKTSGLGLSIKGASAVPLGNVVEVRGLVRGTTAADVEAIFKRCGTIVSSETASPKASENVIVRITFKLPAQADAAVNKFNGQPADGKILQVSIVGTKAVGLSGRLAGVDVVDDSVDVLMEGGDEGNSSKMRSDSIIASDPRASVLVAPPGADPKQYSQQHSHSNSRPDGQKWHRGGRGRGRGRGRRNGGERGTGMDIDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.1
3 0.09
4 0.08
5 0.08
6 0.09
7 0.09
8 0.11
9 0.12
10 0.17
11 0.21
12 0.23
13 0.26
14 0.34
15 0.4
16 0.44
17 0.5
18 0.51
19 0.57
20 0.64
21 0.69
22 0.68
23 0.71
24 0.76
25 0.78
26 0.78
27 0.77
28 0.75
29 0.74
30 0.73
31 0.64
32 0.63
33 0.59
34 0.55
35 0.5
36 0.43
37 0.35
38 0.3
39 0.29
40 0.23
41 0.26
42 0.26
43 0.26
44 0.27
45 0.27
46 0.26
47 0.28
48 0.3
49 0.23
50 0.23
51 0.22
52 0.23
53 0.25
54 0.25
55 0.26
56 0.31
57 0.33
58 0.34
59 0.36
60 0.37
61 0.39
62 0.4
63 0.42
64 0.41
65 0.47
66 0.52
67 0.55
68 0.55
69 0.53
70 0.55
71 0.5
72 0.43
73 0.32
74 0.25
75 0.25
76 0.21
77 0.19
78 0.15
79 0.14
80 0.14
81 0.13
82 0.12
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.05
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.04
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.07
115 0.1
116 0.11
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.11
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.12
127 0.13
128 0.14
129 0.14
130 0.13
131 0.11
132 0.1
133 0.09
134 0.09
135 0.12
136 0.12
137 0.14
138 0.15
139 0.14
140 0.15
141 0.14
142 0.15
143 0.13
144 0.12
145 0.14
146 0.13
147 0.14
148 0.14
149 0.15
150 0.15
151 0.16
152 0.17
153 0.12
154 0.12
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.1
159 0.09
160 0.1
161 0.11
162 0.17
163 0.17
164 0.16
165 0.15
166 0.15
167 0.14
168 0.12
169 0.11
170 0.05
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.02
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.04
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.13
211 0.13
212 0.17
213 0.23
214 0.22
215 0.24
216 0.24
217 0.23
218 0.21
219 0.2
220 0.16
221 0.11
222 0.13
223 0.15
224 0.14
225 0.15
226 0.15
227 0.18
228 0.19
229 0.19
230 0.18
231 0.19
232 0.28
233 0.32
234 0.37
235 0.4
236 0.46
237 0.55
238 0.59
239 0.63
240 0.6
241 0.64
242 0.62
243 0.62
244 0.61
245 0.54
246 0.59
247 0.57
248 0.6
249 0.59
250 0.65
251 0.65
252 0.67
253 0.73
254 0.73
255 0.76
256 0.74
257 0.76
258 0.78
259 0.81
260 0.82
261 0.84
262 0.81
263 0.8
264 0.79
265 0.79
266 0.73
267 0.7
268 0.61
269 0.56
270 0.5