FuNGI

A0A0D0BJH8

Protein Details

Accession

A0A0D0BJH8

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
278-312	SDSDTSTRKKRKRSSSKKKKQARIETRKRRRTEES	Basic
325-370	DESEEEERQKRKRKRSKKEKSDDEEDRRSRKKKKRKGLEQEDESES	Basic
373-400	GGDRRSSTSKHKSKGKGKGKKRDDSSDD	Basic
407-443	DSDDHRSKSRSKSKSKKAKTKAKKKTSSSSKRAKFES	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
285-308	RKKRKRSSSKKKKQARIETRKRRR
332-361	RQKRKRKRSKKEKSDDEEDRRSRKKKKRKG
377-394	RSSTSKHKSKGKGKGKKR
412-440	RSKSRSKSKSKKAKTKAKKKTSSSSKRAK

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSGRKLNPEEQRLHQAALSSTDKILTSKEAEKIIPDVSARTAAVNFLLGAGMLKVLSNAAGVVSFRAVMKKEIEVKKDMSGEEAMVLGHIQASANEGIWTKHLKAKTELHQTVIDRCLKSLVQKQLVKAIKAVRHPTRKIYMLAHLEPSVELTGGPWYTDNELDTEFIKLLSTACLHYVRDRSFPKQSSKASSQNDYRLYSISAAPSYPSAQHIQHFLSKSKITETQLGVEHVEMLLRVLELDGEIEKLPAFTASAWDPTVDSDNSDSGSSSDSDSDSDSDTSTRKKRKRSSSKKKKQARIETRKRRRTEESDSTGESDSDNDDDESEEEERQKRKRKRSKKEKSDDEEDRRSRKKKKRKGLEQEDESESSDGGDRRSSTSKHKSKGKGKGKKRDDSSDDDSESESDSDDHRSKSRSKSKSKKAKTKAKKKTSSSSKRAKFESPAADDDTNIGGAFVYRAIRQERVALGWSQAPCGRCPVFDFCRDKGPTNPQECVYYEEWLNFKGTGEGAPGVLKAEV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.42
3	0.36
4	0.36
5	0.33
6	0.25
7	0.23
8	0.23
9	0.23
10	0.21
11	0.21
12	0.19
13	0.21
14	0.24
15	0.28
16	0.3
17	0.3
18	0.31
19	0.31
20	0.28
21	0.26
22	0.21
23	0.19
24	0.18
25	0.2
26	0.18
27	0.17
28	0.16
29	0.15
30	0.14
31	0.13
32	0.11
33	0.09
34	0.08
35	0.06
36	0.06
37	0.06
38	0.05
39	0.05
40	0.05
41	0.05
42	0.05
43	0.05
44	0.05
45	0.05
46	0.05
47	0.05
48	0.06
49	0.06
50	0.07
51	0.07
52	0.08
53	0.11
54	0.13
55	0.15
56	0.17
57	0.22
58	0.31
59	0.37
60	0.4
61	0.42
62	0.43
63	0.45
64	0.46
65	0.4
66	0.33
67	0.28
68	0.24
69	0.2
70	0.18
71	0.13
72	0.09
73	0.09
74	0.06
75	0.05
76	0.05
77	0.05
78	0.04
79	0.07
80	0.08
81	0.08
82	0.09
83	0.1
84	0.1
85	0.13
86	0.16
87	0.16
88	0.21
89	0.23
90	0.26
91	0.31
92	0.39
93	0.45
94	0.52
95	0.51
96	0.49
97	0.51
98	0.49
99	0.48
100	0.46
101	0.43
102	0.33
103	0.32
104	0.31
105	0.27
106	0.32
107	0.35
108	0.38
109	0.41
110	0.43
111	0.44
112	0.5
113	0.53
114	0.48
115	0.44
116	0.42
117	0.38
118	0.42
119	0.49
120	0.49
121	0.55
122	0.57
123	0.59
124	0.58
125	0.57
126	0.53
127	0.48
128	0.46
129	0.43
130	0.42
131	0.38
132	0.32
133	0.29
134	0.26
135	0.24
136	0.17
137	0.1
138	0.08
139	0.06
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.07
144	0.08
145	0.1
146	0.11
147	0.1
148	0.09
149	0.1
150	0.11
151	0.11
152	0.1
153	0.09
154	0.08
155	0.08
156	0.07
157	0.07
158	0.07
159	0.08
160	0.07
161	0.1
162	0.12
163	0.12
164	0.16
165	0.22
166	0.22
167	0.29
168	0.32
169	0.35
170	0.41
171	0.45
172	0.48
173	0.5
174	0.52
175	0.51
176	0.54
177	0.58
178	0.53
179	0.55
180	0.52
181	0.51
182	0.51
183	0.45
184	0.4
185	0.32
186	0.29
187	0.25
188	0.22
189	0.16
190	0.13
191	0.11
192	0.11
193	0.11
194	0.11
195	0.1
196	0.11
197	0.12
198	0.13
199	0.14
200	0.16
201	0.17
202	0.21
203	0.22
204	0.21
205	0.22
206	0.22
207	0.22
208	0.22
209	0.24
210	0.22
211	0.25
212	0.25
213	0.24
214	0.24
215	0.25
216	0.22
217	0.17
218	0.15
219	0.1
220	0.09
221	0.06
222	0.04
223	0.04
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.04
232	0.04
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.04
238	0.04
239	0.03
240	0.05
241	0.06
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.08
247	0.1
248	0.09
249	0.09
250	0.08
251	0.08
252	0.09
253	0.09
254	0.09
255	0.06
256	0.07
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.08
263	0.08
264	0.08
265	0.08
266	0.08
267	0.08
268	0.1
269	0.15
270	0.22
271	0.3
272	0.35
273	0.44
274	0.53
275	0.63
276	0.74
277	0.8
278	0.84
279	0.87
280	0.92
281	0.93
282	0.94
283	0.92
284	0.9
285	0.9
286	0.9
287	0.9
288	0.9
289	0.91
290	0.92
291	0.92
292	0.85
293	0.8
294	0.77
295	0.73
296	0.71
297	0.69
298	0.65
299	0.59
300	0.56
301	0.52
302	0.44
303	0.36
304	0.27
305	0.18
306	0.12
307	0.09
308	0.09
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.08
313	0.09
314	0.09
315	0.1
316	0.12
317	0.17
318	0.22
319	0.29
320	0.39
321	0.46
322	0.56
323	0.66
324	0.74
325	0.81
326	0.87
327	0.92
328	0.93
329	0.95
330	0.95
331	0.91
332	0.89
333	0.88
334	0.84
335	0.83
336	0.77
337	0.74
338	0.72
339	0.72
340	0.73
341	0.74
342	0.77
343	0.78
344	0.83
345	0.86
346	0.89
347	0.93
348	0.93
349	0.93
350	0.88
351	0.83
352	0.75
353	0.65
354	0.56
355	0.44
356	0.33
357	0.23
358	0.2
359	0.16
360	0.12
361	0.13
362	0.13
363	0.16
364	0.21
365	0.23
366	0.3
367	0.4
368	0.47
369	0.53
370	0.61
371	0.67
372	0.72
373	0.81
374	0.82
375	0.82
376	0.84
377	0.87
378	0.88
379	0.87
380	0.84
381	0.82
382	0.77
383	0.75
384	0.72
385	0.67
386	0.59
387	0.5
388	0.44
389	0.35
390	0.31
391	0.23
392	0.16
393	0.11
394	0.11
395	0.16
396	0.18
397	0.2
398	0.22
399	0.26
400	0.32
401	0.42
402	0.51
403	0.55
404	0.63
405	0.71
406	0.79
407	0.86
408	0.91
409	0.91
410	0.92
411	0.93
412	0.93
413	0.94
414	0.94
415	0.94
416	0.93
417	0.89
418	0.9
419	0.9
420	0.9
421	0.88
422	0.88
423	0.85
424	0.82
425	0.79
426	0.73
427	0.68
428	0.65
429	0.64
430	0.58
431	0.53
432	0.51
433	0.47
434	0.42
435	0.38
436	0.31
437	0.22
438	0.17
439	0.13
440	0.07
441	0.07
442	0.08
443	0.08
444	0.08
445	0.09
446	0.14
447	0.17
448	0.19
449	0.2
450	0.25
451	0.25
452	0.25
453	0.27
454	0.24
455	0.23
456	0.26
457	0.25
458	0.24
459	0.26
460	0.25
461	0.23
462	0.29
463	0.28
464	0.24
465	0.28
466	0.33
467	0.35
468	0.43
469	0.48
470	0.43
471	0.52
472	0.54
473	0.53
474	0.53
475	0.58
476	0.58
477	0.58
478	0.6
479	0.52
480	0.53
481	0.51
482	0.49
483	0.4
484	0.34
485	0.3
486	0.3
487	0.29
488	0.27
489	0.27
490	0.21
491	0.2
492	0.18
493	0.18
494	0.15
495	0.16
496	0.15
497	0.14
498	0.14
499	0.14

A0A0D0BJH8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer