FuNGI

A0A0D0AFC1

Protein Details

Accession

A0A0D0AFC1

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-28	AESLLFHKKKAIKKEPSTPSTTS	Hydrophilic
158-183	AQPKDKGKAGGRKKFQKKTRQVFLVP	Hydrophilic
235-254	VPANRWYKFQKKPKHHVPGL	Hydrophilic
589-611	AAVNGVPKPKKRRALPTVPPPDG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
160-176	PKDKGKAGGRKKFQKKT
596-601	KPKKRR

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MAPKSAESLLFHKKKAIKKEPSTPSTTSQGSQPSQSQQSLRKSVTPRVQPTPPVVDADDSSKLPDGEFSEFKLMSSALNGWKYDVMKFDSRKTVDISTWEEPIKLNRKELRREESGPSAQVPAGHMLGPDGKPVVGTDGNIVMVDADGRPIAKDGGEAQPKDKGKAGGRKKFQKKTRQVFLVPEATRQLRREERYPWVMEDAKQNEMWVGKLEEVARAETHALFMPAAQEVFKFVPANRWYKFQKKPKHHVPGLEEAEALMAKIQKNKDPERWLLHRRKGQGPSSATSEMFKAEAENRVVPGSSSLVYSSGQSRAMGGRALRTTNRGAHGGGDDDDDEGGPRRKKEENDMEGDLDEQLFDDEFADDDEAGPADMDEEEAKELEERLKREYKSANKTREGYVDESESEDGESQLTKDGKSLKKLMRKLEKNAAYDSDEERNPYASSNDEEEEEEPSPPQEPPQETKSRSASQQPTPKSSQAPTSTAQNGSAVGSRATSPAPASMGGHSVVAKRATSPKAPKLKTTSTSSGRVTSVQGTGSRATSPVTGSRATSPSAPIKSPGSPKPNGQPISNKRKATDDLSGNAASAGAAVNGVPKPKKRRALPTVPPPDGELEEKMLVEWLQNKPNATTRDCIQYFTPYLTTDAKKAKFTAMVKEVAQMRGGILILRNREASAAASPAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.62
3	0.66
4	0.66
5	0.7
6	0.8
7	0.82
8	0.82
9	0.81
10	0.74
11	0.68
12	0.63
13	0.57
14	0.47
15	0.42
16	0.43
17	0.39
18	0.39
19	0.39
20	0.4
21	0.43
22	0.46
23	0.47
24	0.47
25	0.54
26	0.57
27	0.55
28	0.56
29	0.56
30	0.61
31	0.64
32	0.65
33	0.63
34	0.63
35	0.65
36	0.62
37	0.63
38	0.6
39	0.53
40	0.46
41	0.4
42	0.35
43	0.31
44	0.32
45	0.29
46	0.22
47	0.22
48	0.21
49	0.2
50	0.18
51	0.19
52	0.18
53	0.21
54	0.22
55	0.23
56	0.26
57	0.26
58	0.26
59	0.24
60	0.21
61	0.16
62	0.17
63	0.18
64	0.19
65	0.22
66	0.22
67	0.22
68	0.26
69	0.27
70	0.26
71	0.26
72	0.26
73	0.31
74	0.34
75	0.38
76	0.44
77	0.44
78	0.45
79	0.45
80	0.42
81	0.36
82	0.38
83	0.39
84	0.32
85	0.34
86	0.32
87	0.29
88	0.27
89	0.33
90	0.38
91	0.34
92	0.4
93	0.44
94	0.51
95	0.6
96	0.67
97	0.66
98	0.63
99	0.65
100	0.62
101	0.63
102	0.59
103	0.51
104	0.44
105	0.38
106	0.32
107	0.28
108	0.24
109	0.19
110	0.16
111	0.14
112	0.13
113	0.12
114	0.16
115	0.15
116	0.15
117	0.13
118	0.12
119	0.12
120	0.12
121	0.15
122	0.11
123	0.12
124	0.12
125	0.12
126	0.13
127	0.12
128	0.12
129	0.07
130	0.07
131	0.07
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.05
136	0.06
137	0.07
138	0.07
139	0.07
140	0.08
141	0.1
142	0.18
143	0.25
144	0.25
145	0.26
146	0.33
147	0.34
148	0.35
149	0.35
150	0.33
151	0.34
152	0.44
153	0.53
154	0.55
155	0.63
156	0.72
157	0.78
158	0.82
159	0.84
160	0.85
161	0.85
162	0.86
163	0.86
164	0.83
165	0.76
166	0.71
167	0.68
168	0.66
169	0.56
170	0.48
171	0.42
172	0.38
173	0.39
174	0.35
175	0.36
176	0.35
177	0.39
178	0.41
179	0.42
180	0.46
181	0.49
182	0.5
183	0.44
184	0.41
185	0.39
186	0.36
187	0.4
188	0.35
189	0.31
190	0.29
191	0.27
192	0.23
193	0.21
194	0.2
195	0.14
196	0.12
197	0.1
198	0.12
199	0.13
200	0.14
201	0.14
202	0.15
203	0.13
204	0.12
205	0.13
206	0.11
207	0.12
208	0.1
209	0.09
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.07
214	0.07
215	0.06
216	0.06
217	0.08
218	0.08
219	0.1
220	0.1
221	0.1
222	0.18
223	0.23
224	0.29
225	0.28
226	0.33
227	0.37
228	0.45
229	0.55
230	0.56
231	0.62
232	0.66
233	0.75
234	0.8
235	0.85
236	0.79
237	0.76
238	0.71
239	0.71
240	0.64
241	0.54
242	0.43
243	0.33
244	0.3
245	0.23
246	0.17
247	0.09
248	0.08
249	0.08
250	0.13
251	0.15
252	0.18
253	0.25
254	0.3
255	0.36
256	0.39
257	0.44
258	0.46
259	0.52
260	0.59
261	0.61
262	0.64
263	0.62
264	0.62
265	0.64
266	0.64
267	0.6
268	0.58
269	0.52
270	0.46
271	0.46
272	0.42
273	0.35
274	0.29
275	0.25
276	0.18
277	0.15
278	0.12
279	0.09
280	0.09
281	0.12
282	0.13
283	0.14
284	0.14
285	0.14
286	0.14
287	0.12
288	0.11
289	0.09
290	0.07
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.08
295	0.08
296	0.09
297	0.09
298	0.09
299	0.09
300	0.1
301	0.1
302	0.1
303	0.11
304	0.09
305	0.11
306	0.12
307	0.14
308	0.13
309	0.16
310	0.17
311	0.19
312	0.2
313	0.18
314	0.17
315	0.17
316	0.16
317	0.15
318	0.12
319	0.1
320	0.08
321	0.07
322	0.07
323	0.06
324	0.06
325	0.07
326	0.11
327	0.12
328	0.13
329	0.16
330	0.2
331	0.21
332	0.3
333	0.38
334	0.38
335	0.41
336	0.42
337	0.39
338	0.35
339	0.34
340	0.25
341	0.14
342	0.1
343	0.05
344	0.04
345	0.03
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.03
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.03
359	0.03
360	0.03
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.1
370	0.13
371	0.14
372	0.19
373	0.25
374	0.25
375	0.29
376	0.36
377	0.41
378	0.48
379	0.56
380	0.58
381	0.57
382	0.59
383	0.56
384	0.53
385	0.47
386	0.39
387	0.32
388	0.27
389	0.22
390	0.21
391	0.19
392	0.15
393	0.12
394	0.09
395	0.08
396	0.07
397	0.06
398	0.05
399	0.1
400	0.1
401	0.1
402	0.12
403	0.2
404	0.23
405	0.27
406	0.35
407	0.37
408	0.44
409	0.5
410	0.57
411	0.6
412	0.62
413	0.64
414	0.66
415	0.66
416	0.6
417	0.57
418	0.5
419	0.41
420	0.38
421	0.34
422	0.29
423	0.23
424	0.22
425	0.2
426	0.19
427	0.18
428	0.16
429	0.14
430	0.12
431	0.13
432	0.15
433	0.15
434	0.14
435	0.15
436	0.15
437	0.17
438	0.16
439	0.14
440	0.12
441	0.11
442	0.12
443	0.11
444	0.12
445	0.15
446	0.18
447	0.22
448	0.29
449	0.36
450	0.38
451	0.43
452	0.47
453	0.45
454	0.44
455	0.49
456	0.48
457	0.48
458	0.54
459	0.53
460	0.53
461	0.54
462	0.54
463	0.48
464	0.44
465	0.43
466	0.39
467	0.38
468	0.34
469	0.35
470	0.35
471	0.32
472	0.31
473	0.24
474	0.2
475	0.18
476	0.18
477	0.13
478	0.1
479	0.1
480	0.1
481	0.11
482	0.11
483	0.1
484	0.09
485	0.09
486	0.1
487	0.1
488	0.11
489	0.1
490	0.12
491	0.11
492	0.11
493	0.11
494	0.11
495	0.14
496	0.14
497	0.13
498	0.14
499	0.21
500	0.24
501	0.31
502	0.37
503	0.44
504	0.53
505	0.54
506	0.58
507	0.59
508	0.63
509	0.6
510	0.6
511	0.6
512	0.54
513	0.58
514	0.54
515	0.49
516	0.42
517	0.38
518	0.33
519	0.27
520	0.23
521	0.2
522	0.19
523	0.19
524	0.19
525	0.19
526	0.17
527	0.15
528	0.15
529	0.14
530	0.14
531	0.16
532	0.17
533	0.17
534	0.18
535	0.22
536	0.23
537	0.23
538	0.23
539	0.23
540	0.27
541	0.3
542	0.29
543	0.28
544	0.29
545	0.34
546	0.39
547	0.43
548	0.43
549	0.43
550	0.47
551	0.53
552	0.59
553	0.56
554	0.53
555	0.55
556	0.58
557	0.66
558	0.7
559	0.63
560	0.55
561	0.59
562	0.59
563	0.53
564	0.52
565	0.45
566	0.4
567	0.42
568	0.4
569	0.34
570	0.3
571	0.25
572	0.16
573	0.11
574	0.09
575	0.04
576	0.04
577	0.04
578	0.07
579	0.09
580	0.14
581	0.18
582	0.26
583	0.35
584	0.45
585	0.54
586	0.59
587	0.69
588	0.73
589	0.8
590	0.83
591	0.85
592	0.86
593	0.78
594	0.71
595	0.62
596	0.55
597	0.47
598	0.4
599	0.3
600	0.24
601	0.23
602	0.22
603	0.2
604	0.18
605	0.15
606	0.15
607	0.19
608	0.21
609	0.26
610	0.29
611	0.3
612	0.32
613	0.4
614	0.43
615	0.4
616	0.39
617	0.36
618	0.44
619	0.43
620	0.42
621	0.37
622	0.38
623	0.36
624	0.36
625	0.34
626	0.25
627	0.28
628	0.32
629	0.33
630	0.33
631	0.4
632	0.4
633	0.41
634	0.42
635	0.43
636	0.44
637	0.45
638	0.47
639	0.43
640	0.44
641	0.41
642	0.45
643	0.45
644	0.39
645	0.37
646	0.27
647	0.22
648	0.2
649	0.2
650	0.15
651	0.16
652	0.2
653	0.22
654	0.25
655	0.25
656	0.24
657	0.24
658	0.23
659	0.21
660	0.19

A0A0D0AFC1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer