Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6H6Z7

Protein Details
Accession C6H6Z7    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-30SESSSPPYPKRPRPTDSNDDEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12, cyto 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MPDKRKDPSSESSSPPYPKRPRPTDSNDDEESYPPTPKTPTTARLQPKNDPVYGQKHAFPGLDDLGDEEQLCYGPPEDGIEYLRMVRSEARTLPAIFVSNTVRQDKDNSRTLEAQGNKTNDDDTMANEVESDQTGFYSDGVYVAYSSQNPQAEASHTSAPDAQEIYYNLLHHRFLLLRSTLKCTPPASVIASLDAERPISLPRSNKYARAEWEKIIQTMDPRMAQLACMDMESVLGLLAIVARLLSKTVRGNDRAQVKRLGAWAWGLLGRCRTVGEMGSEEVGDIRELGKRAARILVKIRESEVVEAQGLEGEFDMEGGEGGEEELEENQEKQEEQGVGTGENINRNGNGDDGQVDELDITNDAAISLRQVKFIGC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.62
3 0.64
4 0.65
5 0.69
6 0.74
7 0.76
8 0.76
9 0.78
10 0.81
11 0.81
12 0.78
13 0.75
14 0.67
15 0.62
16 0.57
17 0.49
18 0.44
19 0.35
20 0.31
21 0.24
22 0.24
23 0.23
24 0.23
25 0.28
26 0.3
27 0.34
28 0.39
29 0.48
30 0.55
31 0.62
32 0.66
33 0.67
34 0.7
35 0.7
36 0.63
37 0.57
38 0.54
39 0.52
40 0.53
41 0.48
42 0.41
43 0.38
44 0.39
45 0.36
46 0.31
47 0.27
48 0.22
49 0.2
50 0.16
51 0.16
52 0.15
53 0.15
54 0.14
55 0.1
56 0.09
57 0.08
58 0.09
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.12
67 0.12
68 0.12
69 0.13
70 0.14
71 0.12
72 0.12
73 0.15
74 0.17
75 0.2
76 0.21
77 0.22
78 0.24
79 0.25
80 0.25
81 0.22
82 0.2
83 0.16
84 0.17
85 0.18
86 0.19
87 0.23
88 0.24
89 0.24
90 0.23
91 0.3
92 0.34
93 0.37
94 0.4
95 0.39
96 0.4
97 0.42
98 0.43
99 0.43
100 0.4
101 0.4
102 0.38
103 0.37
104 0.34
105 0.32
106 0.31
107 0.23
108 0.22
109 0.17
110 0.12
111 0.15
112 0.14
113 0.13
114 0.13
115 0.13
116 0.11
117 0.11
118 0.1
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.08
134 0.11
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.13
139 0.14
140 0.16
141 0.18
142 0.16
143 0.16
144 0.16
145 0.17
146 0.16
147 0.15
148 0.13
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.13
153 0.12
154 0.12
155 0.12
156 0.13
157 0.13
158 0.11
159 0.12
160 0.1
161 0.1
162 0.12
163 0.13
164 0.16
165 0.17
166 0.22
167 0.24
168 0.24
169 0.26
170 0.23
171 0.23
172 0.2
173 0.21
174 0.18
175 0.16
176 0.15
177 0.13
178 0.13
179 0.12
180 0.11
181 0.1
182 0.08
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.09
187 0.11
188 0.14
189 0.15
190 0.23
191 0.24
192 0.29
193 0.32
194 0.34
195 0.36
196 0.41
197 0.43
198 0.36
199 0.41
200 0.37
201 0.34
202 0.3
203 0.25
204 0.18
205 0.18
206 0.18
207 0.13
208 0.12
209 0.12
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.09
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.03
222 0.03
223 0.02
224 0.02
225 0.02
226 0.02
227 0.02
228 0.02
229 0.02
230 0.03
231 0.04
232 0.04
233 0.07
234 0.11
235 0.16
236 0.21
237 0.25
238 0.28
239 0.33
240 0.43
241 0.43
242 0.43
243 0.42
244 0.38
245 0.37
246 0.36
247 0.31
248 0.22
249 0.19
250 0.16
251 0.13
252 0.14
253 0.12
254 0.12
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.12
259 0.12
260 0.12
261 0.12
262 0.13
263 0.13
264 0.13
265 0.13
266 0.12
267 0.11
268 0.1
269 0.09
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.08
274 0.09
275 0.11
276 0.14
277 0.14
278 0.16
279 0.22
280 0.23
281 0.24
282 0.32
283 0.38
284 0.39
285 0.39
286 0.39
287 0.37
288 0.37
289 0.34
290 0.28
291 0.22
292 0.19
293 0.18
294 0.16
295 0.14
296 0.12
297 0.09
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.03
308 0.04
309 0.04
310 0.03
311 0.04
312 0.05
313 0.06
314 0.08
315 0.08
316 0.09
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.17
321 0.16
322 0.15
323 0.18
324 0.18
325 0.17
326 0.18
327 0.22
328 0.18
329 0.22
330 0.23
331 0.21
332 0.2
333 0.23
334 0.22
335 0.19
336 0.18
337 0.15
338 0.15
339 0.15
340 0.16
341 0.13
342 0.12
343 0.11
344 0.1
345 0.1
346 0.09
347 0.08
348 0.07
349 0.06
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.1
354 0.17
355 0.18
356 0.19